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Oryza sativa
cluster # 642 cluster # 642       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_642#0 length = 757 sequences # 2  

consensusID : consensus_642#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 757
fasta sequence
                              [TAAATTCTCCAGTGTTCATTGTCATTTGCCCAATATAATCAGGCTTGCTTCAAAAAATTGTTCTATGACCTTTGTGTACCTTAGATCAAGTTCAGTCACGATGCATGTTTGGATTTGGATTGCTTTGACATTTATGCATTTATATTTGAACAGATGGTTCTAATAACAATATGAAGCTTACATGCAATCATTTTTTGGTATCTAAATTTGAACGATCTGCTACTGATTTGCAGGATAAGTCACAGGAGATGCCACCAAAACCCCGGCATGTCAAGAAGGACGGGTCCTGGCATCCGGTAGGTGTTTTCTACATATGCACTCATTTCATTGTTATATTGCAATTGTCATGAGAAATTAAGCTTTGGGAATAAGTGTGGTTATCTGATTTCCATATGAGTGTGTGGGGCTATGGAGTATTCAAGACGATAATAGAGTCGCGGGTTTGTACTTGTCCAAGAAGCAGCGATAGATTCAGTGGAAGCATTAATATTTGTATGTTCTAACAAGAGATTAGTGCCATGGACATGCCTTTTCTTCTCTTATAAAATTGTCAGTTTGTTTGTCCTTGGACAGGAAGCGTTTGATGGTACTAGGCATGTGATCTCTATTGCCTGCTGTGCTAGATTGTCATTATGCATGTCTCAATTTTTTTTCGACTTCTTGTTCTTCTCTCAGGACAGCGTACGATATTTAAATTGCTGGTGTTAAAAGTTTTTATGGGCTACATCTGAATATCTGATCATTGGTCAAAAAAAAA]

[+] EMBL BM420883             [TAAATTCTCCAGTGTTCATTGTCATTTGCCCAATATAATCAGGCTTGCTTCAAAAAATTGTTCTATGACCTTTGTGTACCTTAGATCAAGTTCAGTCACGATGCATGTTTGGATTTGGATTGCTTTGACATTTATGCATTTATATTTGAACAGATGGTTCTAATAACAATATGAAGCTTACATGCAATCATTTTTTGGTATCTAAATTTGAACGATCTGCTACTGATTTGCAGGATAAGTCACAGGAGATGCCACCAAAACCCCGGCATGTCAAGAAGGACGGGTCCTGGCATCCGGTAGGTGTTTTCTACATATGCACTCATTTCATTGTTATATTGCAATTGTCATGAGAAATTAAGCTTTGGGAATAAGTGTGGTTATCTGATTTCCATATGAGTGTGTGGGGCTATGGAGTATTCAAGACGATAATAGAGTCGCGGGTTTGTACTTGTCCAAGAAGCAGCGATAGATTCAGTGGAAGCATTAATATTTGTATGTTCTAA                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BQ907117             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ccgGGAGTATTCAAGACGATAATAGA TCGCGGGTTTGTACTTGT CAAGAAGCAGCGATAGATTCAGTGGAAGCATTAATATTTGTATGTTCTCACAAGAGATTAGTGCCATGGACATGCCTTTTCTTCTCTTATAAAATTGTCAGTTTGTTTGTCCTTGGACAGGAAGCGTTTGATGGTACTAGGCATGTGATCTCTATTGCCTGCTGTGCTAGATTGTCATTATGCATGTCTCAATTTTTTTTCGACTTCTTGTTCTTCTCTCAGGACAGCGTACGATATTTAAATTGCTGGTGTTAAAAGTTTTTATGGGCTACATCTGAATATCTGATCATTGGTCAAAAAAAAA]


>consensus_642#0 TAAATTCTCCAGTGTTCATTGTCATTTGCCCAATATAATCAGGCTTGCTTCAAAAAATTG TTCTATGACCTTTGTGTACCTTAGATCAAGTTCAGTCACGATGCATGTTTGGATTTGGAT TGCTTTGACATTTATGCATTTATATTTGAACAGATGGTTCTAATAACAATATGAAGCTTA CATGCAATCATTTTTTGGTATCTAAATTTGAACGATCTGCTACTGATTTGCAGGATAAGT CACAGGAGATGCCACCAAAACCCCGGCATGTCAAGAAGGACGGGTCCTGGCATCCGGTAG GTGTTTTCTACATATGCACTCATTTCATTGTTATATTGCAATTGTCATGAGAAATTAAGC TTTGGGAATAAGTGTGGTTATCTGATTTCCATATGAGTGTGTGGGGCTATGGAGTATTCA AGACGATAATAGAGTCGCGGGTTTGTACTTGTCCAAGAAGCAGCGATAGATTCAGTGGAA GCATTAATATTTGTATGTTCTAACAAGAGATTAGTGCCATGGACATGCCTTTTCTTCTCT TATAAAATTGTCAGTTTGTTTGTCCTTGGACAGGAAGCGTTTGATGGTACTAGGCATGTG ATCTCTATTGCCTGCTGTGCTAGATTGTCATTATGCATGTCTCAATTTTTTTTCGACTTC TTGTTCTTCTCTCAGGACAGCGTACGATATTTAAATTGCTGGTGTTAAAAGTTTTTATGG GCTACATCTGAATATCTGATCATTGGTCAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)