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Oryza sativa
cluster # 6571 cluster # 6571       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6571#0 length = 1129 sequences # 4  
consensusID : consensus_6571#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1129
fasta sequence 
                              [CAGTAACCAAATCAAACCCTAGCTAGCTAGCTAGCTAAGCTAGCACGCACCCATGGCGTCGTCTTCCACCTCGAGCTCGCTCGCCGCGGCAGCGAT-GGTGGCCGTCGTCCTCCTCCTCCTGGGTGCCACCGCCACGTCCACCCAGGCGGCGCGCCTCCTCGACGAAGAACTCCCCACCGCCGCCATCCCGGCGATCCCCGGCGTCCCCGGAGTGCCGGCGGTCGGCCCC-GGGATCCCGGTGATCCCCGGCGTGCCCGGAGTGCCGGTGGTTGGCCCCGGGATCCCGTTCGTGCCGGTGATCCCCGGCGTGCCGGTG-ATCGTGCCGATCATCCCCGGCGTGCCGATGATCGCCGGCATGACAACCCTGCCAGTGCCGCCATTTGTGCCGCCGATTGATCCCGGCGCCGGCGCCGGATTCCCAGGCGTGCCGCCGGCGTCGTCGACCACCGTGCAGGAAGACCCACAGCCGCCGATGCCGTCCGTCGTTCCACCCGTGCCATAGGTGTTAATCAACTCCGGCGAGCCACCATGCCGTCGTTAAGTTATACCGTTGCTCACGCCGCCGCGATGTGTGTACTCCGGCGGCTTAATATAACGTGCCTCCTTACTGTGTGTTAATTAAGTACTCCTCCTGTCTAAAAAAAATTAACTTCTCTATGAATTTATAGACGTAGTTAGAAGTTGATTTTTTCTTGGATGGTAAGAGTACATGTGTTACCGTGTGTTGTTACGTTAAGTTGGTAATTTGTGTACTGATGAATCGTGTGTGTATGATGTGCACTGTGCAGTGCAGACCAGGTACGTACGTGTGGGTCGCGTCACCCAATCTCTGAGTGCTCGCAAAATTTAATGTGCTTAATGCACGAATTAATTATACGTCGAATATTATAGGTTTTAATTTAATCTTGTGTAACCCACTATTTTATCACTGTTTGAACTTTGAATCATACGTGTCTATTTTTGTTGGGATATTAGTCTTGCTAAGGTGCATAGGAATGAAAATCATATTAGTCATGTTTTAGTTAGTAAAGGCCGAGTTGAGGAACTACTCATTTCTGGCCGGACAATAGCTGTACTGCTATCGCACAACTTTGTTTGTGTCGATGCTTTGATTGAATAAAGTGGTCCC]

[+] EMBL AK070713             [CAGTAACCAAATCAAACCCTAGCTAGCTAGCTAGCTAAGCTAGCACGCACCCATGGCGTCGTCTTCCACCTCGAGCTCGCTCGCCGCGGCAGCGAT GGTGGCCGTCGTCCTCCTCCTCCTGGGTGCCACCGCCACGTCCACCCAGGCGGCGCGCCTCCTCGACGAAGAACTCCCCACCGCCGCCATCCCGGCGATCCCCGGCGTCCCCGGAGTGCCGGCGGTCGGCCCC GGGATCCCGGTGATCCCCGGCGTGCCCGGAGTGCCGGTGGTTGGCCCCGGGATCCCGTTCGTGCCGGTGATCCCCGGCGTGCCGGTG ATCGTGCCGATCATCCCCGGCGTGCCGATGATCGCCGGCATGACAACCCTGCCAGTGCCGCCATTTGTGCCGCCGATTGATCCCGGCGCCGGCGCCGGATTCCCAGGCGTGCCGCCGGCGTCGTCGACCACCGTGCAGGAAGACCCACAGCCGCCGATGCCGTCCGTCGTTCCACCCGTGCCATAGGTGTTAATCAACTCCGGCGAGCCACCATGCCGTCGTTAAGTTATACCGTTGCTCACGCCGCCGCGATGTGTGTACTCCGGCGGCTTAATATAACGTGCCTCCTTACTGTGTGTTAATTAAGTACTCCTCCTGTCTAAAAAAAATTAACTTCTCTATGAATTTATAGACGTAGTTAGAAGTTGATTTTTTCTTGGATGGTAAGAGTACATGTGTTACCGTGTGTTGTTACGTTAAGTTGGTAATTTGTGTACTGATGAATCGTGTGTGTATGATGTGCACTGTGCAGTGCAGACCAGGTACGTACGTGTGGGTCGCGTCACCCAATCTCTGAGTGCTCGCAAAATTTAATGTGCTTAATGCACGAATTAATTATACGTCGAATATTATAGGTTTTAATTTAATCTTGTGTAACCCACTATTTTATCACTGTTTGAACTTTGAATCATACGTGTCTATTTTTGTTGGGATATTAGTCTTGCTAAGGTGCATAGGAATGAAAATCATATTAGTCATGTTTTAGTTAGTAAAGGCCGAGTTGAGGAACTACTCATTTCTGGCCGGACAATAGCTGTACTGCTATCGCACAACTTTGTTTGTGTCGATGCTTTGATTGAATAAAGTGGTCCC]
[+] EMBL C93674               [                   TAGCTAGCTAGCTAGCTAAGCTAGCACGCACCCATGGCGTCGTCTTCCACCTCGAGCTCGCTCGCNGCGGCAG AATNGGTGGCCGTCGTCCTCCTCCTCCTGGGTGCNACCGCNACGTCCACCCAGGCGGCGCGCCTCCTCGACGAAGAACTCCCCACCGCCGCCATCCCGGCNATCCCCGGCGTCCCCGGAGTGCCGGCGGTCGGCCCC GGAATCCCGGTNATCCCCGGCGTGCCCGGAGTGCCGGTGGTTGGCCCCGGAATCCCGTTCGTNCCGGTAATCCNCGGCGTGCCGGTGAATCGTGCCGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AU091308             [                                                                                                                                                                                                                                GGCCCCGGGGATCCCGGTGATCCCCGGCGTGCCCGAAGTGCCGGTGGTTGGCCCCGGGATCCCGTTCGTGCCGGTGATCCCCGGCGTGCCGGTG ATCGTGCCGATCATCCCCGGCGTGCCGATGATCGCCGGCATGACAACCCTGCCAGTGCCGCCATTTGTGCCGCCGATTGATCCCGGCGCCGGCGCCGGATTCCCCGGCGTGCCGCCGGCGTCGTCGACCACCGTGCAGGAAGACCCACAGCCGCCGATGCCGTCCGTCGTTCCACCCGTGCCATAGGTGTTAATCAACTCCGGCGAGCCACCATGCCGTCGTTAAGTTATACCGTTGCTCACGCCGCCGCGATGTGTGTACTCCGGCGGCTTAATATAACGTGCCTCCTTACTGTGTGTTAATTAAGTACTCCTCCTGTCTAAAAAAAATTAACTTCTCTATGAATTTATAGACGTAGTTAGAAGTTGATTTTTTCTTGGATGGTAAGAGTACATGTGTTACCGTGTGTTGTTACGTTAAGTTGGTAATTTGTGTACTGATGAATCGTGTGTGTATGATGTGCACTGTGCAGTGCAGACCAGGTACGTACGTGTGGGTCGCGTCACCCAATCTCTGAGTGCTCGCAAAATTTAATGTGCTTAATGCACGAATTAATTATACGTCGAATATTATAGGTTTTAATTTAAaaa                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL AU225753             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ccgctCTTAATATAACGTGCCTCCTTACTGTGTGTTAATTAAGTACTCCTCCTGTCTAAAAAAAATTAACTTCTCTATGAATTTATAGACGTAGTTAGAAGTTGATTTTTTCTTGGATGGTAAGAGTACATGTGTTACCGTGTGTTGTTACGTTAAGTTGGTAATTTGTGTACTGATGAgcggc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]




>consensus_6571#0
CAGTAACCAAATCAAACCCTAGCTAGCTAGCTAGCTAAGCTAGCACGCACCCATGGCGTC
GTCTTCCACCTCGAGCTCGCTCGCCGCGGCAGCGATGGTGGCCGTCGTCCTCCTCCTCCT
GGGTGCCACCGCCACGTCCACCCAGGCGGCGCGCCTCCTCGACGAAGAACTCCCCACCGC
CGCCATCCCGGCGATCCCCGGCGTCCCCGGAGTGCCGGCGGTCGGCCCCGGGATCCCGGT
GATCCCCGGCGTGCCCGGAGTGCCGGTGGTTGGCCCCGGGATCCCGTTCGTGCCGGTGAT
CCCCGGCGTGCCGGTGATCGTGCCGATCATCCCCGGCGTGCCGATGATCGCCGGCATGAC
AACCCTGCCAGTGCCGCCATTTGTGCCGCCGATTGATCCCGGCGCCGGCGCCGGATTCCC
AGGCGTGCCGCCGGCGTCGTCGACCACCGTGCAGGAAGACCCACAGCCGCCGATGCCGTC
CGTCGTTCCACCCGTGCCATAGGTGTTAATCAACTCCGGCGAGCCACCATGCCGTCGTTA
AGTTATACCGTTGCTCACGCCGCCGCGATGTGTGTACTCCGGCGGCTTAATATAACGTGC
CTCCTTACTGTGTGTTAATTAAGTACTCCTCCTGTCTAAAAAAAATTAACTTCTCTATGA
ATTTATAGACGTAGTTAGAAGTTGATTTTTTCTTGGATGGTAAGAGTACATGTGTTACCG
TGTGTTGTTACGTTAAGTTGGTAATTTGTGTACTGATGAATCGTGTGTGTATGATGTGCA
CTGTGCAGTGCAGACCAGGTACGTACGTGTGGGTCGCGTCACCCAATCTCTGAGTGCTCG
CAAAATTTAATGTGCTTAATGCACGAATTAATTATACGTCGAATATTATAGGTTTTAATT
TAATCTTGTGTAACCCACTATTTTATCACTGTTTGAACTTTGAATCATACGTGTCTATTT
TTGTTGGGATATTAGTCTTGCTAAGGTGCATAGGAATGAAAATCATATTAGTCATGTTTT
AGTTAGTAAAGGCCGAGTTGAGGAACTACTCATTTCTGGCCGGACAATAGCTGTACTGCT
ATCGCACAACTTTGTTTGTGTCGATGCTTTGATTGAATAAAGTGGTCCC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)