cluster # 6650

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 6650 cluster # 6650 Sequences # 4 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6650#0 length = 2265 sequences # 4
consensusID : consensus_6650#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 2265
fasta sequence
                              [GGGGCGCCGACATGGACGGCGGCGGCGGGGGCGATCCGGGCGGCCGGGTCGGAGAGGCCAAGGCGGATGCCACACGCGCTGCGAACAAGCGAAGGGCCCCATCGCCAGCCGGGGGTGGGGGAGTCGAGGCCAAGAGGAGGAGGAAGGACGCCATGGGCTCGTCGGTCTCCGGCAGCAGATCTGGTGGCGGTGGGGGCAGGAGGCTGCGACATGGTCGAGGTAGAAGAGCTCGTGCCTTCAGACGCAAGCTTGAGGAGGAAAATAAGAATTCAAATAATAGACCCCGTGCCTCAAATGTGGTTATTGCTTATACGCCTAACCTCATTCGGCGGTATGGGACTCTCTTGAGAAACATCTCATTTCTGCTTCCTTATGATGGTCAAGGAAAGGCATATGCTTGTCCTTCGGACAAAATCAATGTGTTTCTTAAATGGAGCAGATGCAACTTTTGTCTCTTCTTTGAGTGGGCAGAAGGTGATCAGATGATGATTTGTCATATGTTCAATACATTGAAAGAGATTCACATATCGTTTCTTATAAATCCAGCATTCCTAGATGAAAGTATGGAAGTGAAAGTAACAAATCCTTTACTTTCATTTTCATCCAATTTTGTTGAAGATGAAACTTGGGCTCTTGTGAAGGAGATGCTAATGATGATGTTTTCTCCAGTTCAAGAAGATGAGCGTGCAGCTTCAGATCTATATGTCTTCACAAAGAGTAGAGATTCTGTTTACTTCAGGATTTTCAAGATCACTAGTATCCCTGCAGGCGAGAGTGAAAATTCACTGGTTCTTGATGAGGTTGGGCTAAATTTTTGCCTCAAGCTTTTAGATGTCCACGGTGCTTTTGTTGGCTCAGACTGTGATCAAGCTCTGGATGGTCTTCAAAGTCAGACAAGAAATGAGTTGAAATTATCCCCAGATATATATTACTGTGTGCCAAATGATAAACTTGGATGCTGCACTCTCCACTCAGTTGCTTTGAATAATCAGAACTATTTATTTTTTTTGGAGAATGGCTTGGATTTATCACATTTTGAAGGTTTCTGTTTGACTTTGGAAGAATTTCTCGAGAGGAATTCTTTTCTGAAGATAAAGCATATTGTTGGGTCAAGGAATGATGAGGAATGTAATTTTGTTCGAAATATTGCTAAGGCAATTATTCGTTCCATGCTGTCACACCTTGTTAACTTGTTCTCTTTGGGGAAATGTTTGAGGATGGGAACAGACCTTCTGAGAAGGAGGAAAATTCTTTTAAAAGGATCTGATGTCAAGTTCTTTCAACTTGAAGTGATTGCATATGAGGAGGATGAAGCAATAAATAATGTGCTGCAGGTTGTTGAGTTGGTTAAAAGTTGTTTTGTTGGGGAAATGATACCGGCTTATCTGCAAGGTGATCTACATGATTTAGAGGAAAATCCTTTGAAGAGACTTGAATCAGTGATAGACAGCAGCTCATTAATGTCAGCTAAAGAGAAGAAAGGATTATTGGTCAATTTGCACACTGAATATAAAACCAATATTAGTCCAGCTATTAGCGAAGATGATCGTGATAGTTTATTTAAGCACATCCCGTATTTGGACTGCTGGATGAACAGAACGGAAGACAATGAGTATCTAAAGCTCGTTGCTAATTTGGATTCAAAAAAAGTGG-CTTTGAAAGTTAACAAGGTTGGAACGGATAAGAGAAAACCATCTAAAAATGGTATCTTACAGTTTGATTTTATGAGGAATTCCGATGTTCATATACCTGAAAAGGCATTAAAGGATGGTATCACCCCCTTTCGTTTGTCATGGACAGATTATATTTTAACTTCCCGCTACCCAACGTACTTGCGTGCCATTCAAAAAAGTTTGGAACCATACATGAAGTCAAGAAAGAAGTTAAAATGATGTTACCTCACACACAAAGAGGGCGGGCTGGATTTTCATTGGAACACAATGTGGTTGATTTGATGGAGAAACTGGGGTTGGCTATACATCCGCTGGGAGTAGGACCGATTGATTTTCTCATACATCTGCTATTCATGACAACTTGGATTGGCTGAATAGCATTTTTGTTGAGCATGCCTGAAAATCTGTGCAGACATCTGTTAATGTTTTTATTTGTTTGAACTCGTGGTAGCTTTGTGCGGAATCACGTTTTGGTTGAACTTGCCTGACAATATGTGTTCAGAACAGCCGCACAGCACAGGTGTAGTTTGCTCGATGTGTTCGGAATATGTGGTTTATCTCAGTTCGTGACAGCTTCGTGCTAATCACGTTT]

[+] EMBL AK099977             [GGGGCGCCGACATGGACGGCGGCGGCGGGGGCGATCCGGGCGGCCGGGTCGGAGAGGCCAAGGCGGATGCCACACGCGCTGCGAACAAGCGAAGGGCCCCATCGCCAGCCGGGGGTGGGGGAGTCGAGGCCAAGAGGAGGAGGAAGGACGCCATGGGCTCGTCGGTCTCCGGCAGCAGATCTGGTGGCGGTGGGGGCAGGAGGCTGCGACATGGTCGAGGTAGAAGAGCTCGTGCCTTCAGACGCAAGCTTGAGGAGGAAAATAAGAATTCAAATAATAGACCCCGTGCCTCAAATGTGGTTATTGCTTATACGCCTAACCTCATTCGGCGGTATGGGACTCTCTTGAGAAACATCTCATTTCTGCTTCCTTATGATGGTCAAGGAAAGGCATATGCTTGTCCTTCGGACAAAATCAATGTGTTTCTTAAATGGAGCAGATGCAACTTTTGTCTCTTCTTTGAGTGGGCAGAAGGTGATCAGATGATGATTTGTCATATGTTCAATACATTGAAAGAGATTCACATATCGTTTCTTATAAATCCAGCATTCCTAGATGAAAGTATGGAAGTGAAAGTAACAAATCCTTTACTTTCATTTTCATCCAATTTTGTTGAAGATGAAACTTGGGCTCTTGTGAAGGAGATGCTAATGATGATGTTTTCTCCAGTTCAAGAAGATGAGCGTGCAGCTTCAGATCTATATGTCTTCACAAAGAGTAGAGATTCTGTTTACTTCAGGATTTTCAAGATCACTAGTATCCCTGCAGGCGAGAGTGAAAATTCACTGGTTCTTGATGAGGTTGGGCTAAATTTTTGCCTCAAGCTTTTAGATGTCCACGGTGCTTTTGTTGGCTCAGACTGTGATCAAGCTCTGGATGGTCTTCAAAGTCAGACAAGAAATGAGTTGAAATTATCCCCAGATATATATTACTGTGTGCCAAATGATAAACTTGGATGCTGCACTCTCCACTCAGTTGCTTTGAATAATCAGAACTATTTATTTTTTTTGGAGAATGGCTTGGATTTATCACATTTTGAAGGTTTCTGTTTGACTTTGGAAGAATTTCTCGAGAGGAATTCTTTTCTGAAGATAAAGCATATTGTTGGGTCAAGGAATGATGAGGAATGTAATTTTGTTCGAAATATTGCTAAGGCAATTATTCGTTCCATGCTGTCACACCTTGTTAACTTGTTCTCTTTGGGGAAATGTTTGAGGATGGGAACAGACCTTCTGAGAAGGAGGAAAATTCTTTTAAAAGGATCTGATGTCAAGTTCTTTCAACTTGAAGTGATTGCATATGAGGAGGATGAAGCAATAAATAATGTGCTGCAGGTTGTTGAGTTGGTTAAAAGTTGTTTTGTTGGGGAAATGATACCGGCTGATCTGCAAGGTGATCTACATGATTTAAAGGAAAATCCTTTGAAGAGACTTGAATCAGTGATAGACAGCAGCTCATTAATGTCAGCTAAAGAGAAGAAAGGATTATTGGTCAATTTGCACACTGAATATAAAACCAATATTAGTCCAGCTATTAGCGAAGATGATCGTGATAGTTTATTTAAGCACATCCCGTATTTGGACTGCTGGATGAACAGAACGGAAGACAATGAGTATCTAAAGCTCGTTGCTAATTTGGATTCAAAAAAAGTGG CTTTGAAAGTTAACAAGGTTGGAACGGATAAGAGAAAACCATCTAAAAATGGTATCTTACAGTTTGATTTTATGAGGAATTCCGATGTTCATATACCTGAAAAGGCATTAAAGGATGGTATCACCCCCTTTCGTTTGTCATGGACAGATTATATTTTAACTTCCCGCTACCCAACGTACTTGCGTGCCATTCAAAAAAGTTTGGAACCATACATGAAGTCAAGAAAGAAGTTAAAATGATGTTACCTCACACACAAAGAGGGCGGGCTGGATTTTCATTGGAACACAATGTGGTTGATTTGATGGAGAAACTGGGGTTGGCTATACATCCGCTGGGAGTAGGACCGATTGATTTTCTCATACATCTGCTATTCATGACAACTTGGATTGGCTGAATAGCATTTTTGTTGAGCATGCCTGAAAATCTGTGCAGACATCTGTTAATGTTTTTATTTGTTTGAACTCGTGGTAGCTTTGTGCGGAATCACGTTTTGGTTGAACTTGCCTGACAATATGTGTTCAGAACAGCCGCACAGCACAGGTGTAGTTTGCTCGATGTGTTCGGAATATGTGGTTTATCTCAGTTCGTGACAGCTTCGTGCTAATCACGT  ]
[+] EMBL CA766335             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTTTTAAAAGGATCTGATGTCAAGTTCTTTCAACTTGAAGTGATTGCATATGAGGAGGATGAAGCAATAAATAATGTGCTGCAAGTTGTTGAGTTGGTTAAAAGTTGTTTTGTTGGGGAAATGATACCGGCTTATCTGCAAGGTGATCTACATGATTTAGAGGAAAATCCTTTGAAGAGACTCNTTTCAGTGATAGACAGCAGCTCATTAATGTCAGCTAAAGAGNNGAAAGGATTATTGCCCCCCNTGCACACTGAATATAAAACCAATATTAGTCCAGCTATTAGCGAAGATGANCAAAANANATNATTTAAGCACATCCCGTATTTGGACTGCTGGATGAACAGAACGGAAGACAATGAGTATCTAAAGCTCGTTGCTAATTTGGATTCAAAAAAAGTGGCCTTTGAAAGTTAACAAGGTTGGAACGGATAAGAGAAAACCATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL AA750824             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CCGGCTTATCTGCAAGGTGATCTACATGATTTAGAGGAAAATCCTTTGAAGAGACTTGAATCAGTGATAGACAGCAGCTCATTAATGTCAGCTAAAGAGAAGAAAGGATTATTGGTCAATTTGCACACTGAATATAAAACCAATATTAGTCC GCTATTg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CB633359             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GGATTATTGGTCAATTTGCACACTGAATATAAAACCAATATTAGTCCAGCTATTAGCGAAGATGATCGTGATAGTTTATTTAAGCACATCCCGTATTTGGACTGCTGGATGAACAGAACGGAAGACAATGAGTATCTAAAGCTCGTTGCTAATTTGGATTCAAAAAAAGTGG CTTTGAAAGTTAACAAGGTTGGAACGGATAAGAGAAAACCATCTAAAAATGGTATCTTACAGTTTGATTTTATGAGGAATTCCGATGTTCATATACCTGAAAAGGCATTAAAGGATGGTATCACCCCCTTTCGTTTGTCATGGACAGATTATATTTTAACTTCCCGCTACCCAACGTACTTGCGTGCCATTCAAAAAAGTTTGGAACCATACATGAAGTCAAAAAAGAAGTTAAAATGATGTTACCTCACACACAAAGAGGCCGGGCTGGATTTTCATTGGAACACAATGTGGTTGATTTGATGGAGAAACTGGGGTTGGCTATACATCCGCTGGGAGTAGGACCGATTGATTTTCTCATACATCTGCTATTCATGACAACTTGGATTGGCTGAATAGCATTTTTGTTGAGCATGCCTGAAAATCTGTGCAGACATCTGTTAATGTTTTTATTTGTTTGAACTCGTGGTAGCTTTGTGCGGAATCACGTTTTGGTTGAACTTGCCTGACAATATGTGTGCAGAACAGCCGCACAGCACAGGTGTAGTTTGCTCGATGTGTTCGGAATATGTGGTTTATCTCAGTTTGTGACGACTTCGTGCTAATCACGTTT]




>consensus_6650#0
GGGGCGCCGACATGGACGGCGGCGGCGGGGGCGATCCGGGCGGCCGGGTCGGAGAGGCCA
AGGCGGATGCCACACGCGCTGCGAACAAGCGAAGGGCCCCATCGCCAGCCGGGGGTGGGG
GAGTCGAGGCCAAGAGGAGGAGGAAGGACGCCATGGGCTCGTCGGTCTCCGGCAGCAGAT
CTGGTGGCGGTGGGGGCAGGAGGCTGCGACATGGTCGAGGTAGAAGAGCTCGTGCCTTCA
GACGCAAGCTTGAGGAGGAAAATAAGAATTCAAATAATAGACCCCGTGCCTCAAATGTGG
TTATTGCTTATACGCCTAACCTCATTCGGCGGTATGGGACTCTCTTGAGAAACATCTCAT
TTCTGCTTCCTTATGATGGTCAAGGAAAGGCATATGCTTGTCCTTCGGACAAAATCAATG
TGTTTCTTAAATGGAGCAGATGCAACTTTTGTCTCTTCTTTGAGTGGGCAGAAGGTGATC
AGATGATGATTTGTCATATGTTCAATACATTGAAAGAGATTCACATATCGTTTCTTATAA
ATCCAGCATTCCTAGATGAAAGTATGGAAGTGAAAGTAACAAATCCTTTACTTTCATTTT
CATCCAATTTTGTTGAAGATGAAACTTGGGCTCTTGTGAAGGAGATGCTAATGATGATGT
TTTCTCCAGTTCAAGAAGATGAGCGTGCAGCTTCAGATCTATATGTCTTCACAAAGAGTA
GAGATTCTGTTTACTTCAGGATTTTCAAGATCACTAGTATCCCTGCAGGCGAGAGTGAAA
ATTCACTGGTTCTTGATGAGGTTGGGCTAAATTTTTGCCTCAAGCTTTTAGATGTCCACG
GTGCTTTTGTTGGCTCAGACTGTGATCAAGCTCTGGATGGTCTTCAAAGTCAGACAAGAA
ATGAGTTGAAATTATCCCCAGATATATATTACTGTGTGCCAAATGATAAACTTGGATGCT
GCACTCTCCACTCAGTTGCTTTGAATAATCAGAACTATTTATTTTTTTTGGAGAATGGCT
TGGATTTATCACATTTTGAAGGTTTCTGTTTGACTTTGGAAGAATTTCTCGAGAGGAATT
CTTTTCTGAAGATAAAGCATATTGTTGGGTCAAGGAATGATGAGGAATGTAATTTTGTTC
GAAATATTGCTAAGGCAATTATTCGTTCCATGCTGTCACACCTTGTTAACTTGTTCTCTT
TGGGGAAATGTTTGAGGATGGGAACAGACCTTCTGAGAAGGAGGAAAATTCTTTTAAAAG
GATCTGATGTCAAGTTCTTTCAACTTGAAGTGATTGCATATGAGGAGGATGAAGCAATAA
ATAATGTGCTGCAGGTTGTTGAGTTGGTTAAAAGTTGTTTTGTTGGGGAAATGATACCGG
CTTATCTGCAAGGTGATCTACATGATTTAGAGGAAAATCCTTTGAAGAGACTTGAATCAG
TGATAGACAGCAGCTCATTAATGTCAGCTAAAGAGAAGAAAGGATTATTGGTCAATTTGC
ACACTGAATATAAAACCAATATTAGTCCAGCTATTAGCGAAGATGATCGTGATAGTTTAT
TTAAGCACATCCCGTATTTGGACTGCTGGATGAACAGAACGGAAGACAATGAGTATCTAA
AGCTCGTTGCTAATTTGGATTCAAAAAAAGTGGCTTTGAAAGTTAACAAGGTTGGAACGG
ATAAGAGAAAACCATCTAAAAATGGTATCTTACAGTTTGATTTTATGAGGAATTCCGATG
TTCATATACCTGAAAAGGCATTAAAGGATGGTATCACCCCCTTTCGTTTGTCATGGACAG
ATTATATTTTAACTTCCCGCTACCCAACGTACTTGCGTGCCATTCAAAAAAGTTTGGAAC
CATACATGAAGTCAAGAAAGAAGTTAAAATGATGTTACCTCACACACAAAGAGGGCGGGC
TGGATTTTCATTGGAACACAATGTGGTTGATTTGATGGAGAAACTGGGGTTGGCTATACA
TCCGCTGGGAGTAGGACCGATTGATTTTCTCATACATCTGCTATTCATGACAACTTGGAT
TGGCTGAATAGCATTTTTGTTGAGCATGCCTGAAAATCTGTGCAGACATCTGTTAATGTT
TTTATTTGTTTGAACTCGTGGTAGCTTTGTGCGGAATCACGTTTTGGTTGAACTTGCCTG
ACAATATGTGTTCAGAACAGCCGCACAGCACAGGTGTAGTTTGCTCGATGTGTTCGGAAT
ATGTGGTTTATCTCAGTTCGTGACAGCTTCGTGCTAATCACGTTT
clustalw multiple alignements is not computed in this case