cluster # 6672

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 6672 cluster # 6672 Sequences # 4 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6672#0 length = 2187 sequences # 4
consensusID : consensus_6672#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 2187
fasta sequence
                              [GAAAATCGACAGCAAGTGGAAAGCCGAGTGCCTATGGTGCCATAAGAGGCTCGGAGGGGACACTAAGAATGGCACCAAACATTTGCACGATCATCTCAGCAAATGTCCTCGTCGCAGGAGTAATAAAGTCAGCAAGCCAACTCCCTCCAAATGTACAAAGGATATTGATCAGGAACCCACTGTTGCTTCTTTAGAAAGCTCCACCTTTAGCCAGGATGTTGCCAGGATGGAGCTTGCGAGAATGATTATCTTGCATGAATATCCTTTGTCTATTATGGAGCATTACGGTTTCCAAAGGTTTGTTAGGGCTCTTCAACCATTGTTCCAGCTGGTTCCCAACAGTAGTCTTAAGAAGGATGTTATCAGCATTTATGAGACGGAGAGGGTCAGAACCAGGGAAATTTTGTGGGAGGCTAAAGGTCGGATTGCAATAACAGCAGATATATGGACATCAGATGATCAAAATAGAGGTTATGTGGCTGTCAGAGCTCATTTTATCGACCAATCCTGGACATTCCAGTGCCGTCTACTGAGCTTTATACATGTGCCATGGCCGCATACAGCTCAAGCAATTTCTGAAACTCTGTCTTCTTGTTTGAACGAATGGAATCTTGGAAGGAGGGTATCAATGGTGATGGCTGATGATTGTTCTACAGATGATACGGTTACGGGGCTCTTAAAGCAAAGGCTGGATACCGAACAACTTTTGTTAGGTGGGTCTTTGCTGAACATGAGATGCTGCGCCTATGTGCTAAGTAGAATTGCCAATAGTTGCCTGGGTGTGATGGGAGGTGCTGTTGATAGGATCCGCGCCAGTGTTGATTTCTGGACAGCAACAACTGAAAGAGATGTAGTGTTTGCTGATGTTGCTCGTGGTTTGAATGTTAATCTCGACAAGAAGTTGACTCTTGATTGTAATAATAGATGGTACTCTACCTTATCCATGTTAAATGTTGCCATAAGCTACAAGCAAGTCTTTGATCACTTAAGGCAAATAGAGGAACAGTATATTTGTGCTCCTGATGATGATGACTGGAAATTAGCAAAAGAGGTCTGCAGTAAGTTGAAACTGTTTTCTGACATTGCAGAACTAATTTCAGAGGCTAAGTATGTTACTGCTAATATGTACTTCCCCAAGATTTGTGGAATTCGGATGGCCATGAGGAGATGGCCTGGGTGTGAGGATGAACTGATAGGAAGGATGAGAAATGAAATAGCCGAATTGTTTGAGAAATATTGCGTTGAAGTTCATGATCTCATGGCTGTGGCAACTGTCCTAGACCCCAGATATAAGCTTGAGCTACTGCAGTTTTATTTCCCCTCAATTTTTGGTGATGAGGCATACAATGAGATAAATAGAGTCCGGCAGCTCTGTTATGATTTGATCAAACAGTATCAGGGTCCCCAATCAAAAGTCGGTGCAATGCAGCCTTGTGGGGGGGAGGAAGAGGGTCCAGATCAGTTATCTAGCTTCGATCTATATATCGCTTTCAAGTTCTCCAGTGCAGATGTCAAGTCAGAACTAGACAAATACTTGGACGAGCCTGTTATCCCTAGAGCAGTAGACTTTGACATAATAGATTGGTGGAAGATTATGGGGAAGAGGTTTCCAACTCTGCAGATGTTAGCAAGAGACATTTTAGCGGTTCCTGTCTCAAGGGTAGTTTCTGAATCGGCGTTTAGCATTGCTGGAAGGGTTTTGAGTCCACAGCGTAGCAAGCTTTTACCTGATACACTGGAGGCCTTGATGTGCTCACAAGATTGGCTTCATGCAGAAAACAGAGGTGCAGGATCGTCAGGGCTCTTGAGCTGCCTCACTTGCCTGGAAGATGCTGATGTAACTACAAAGGAGTGAAGTTTGGACGCCTGTTGATTGTTTGCTACAAATATATGCTGAAGTTGATCTCGCACATTCACCAGCTGAATTAAAGCGCTGAGATCTGGGTTAGCTTTTTTTTTGGTTTATCTCAAGAGTATTGTGGGTAAGGAAGGTGGTGTGTATGTTGGAACTGTGAGGAGTCTACTAAAATGAAGAAAGCATTCAGTTGATCATTCTTTTCAGGAAAGATTAGTTGCAAAATTCTGTGCGTAAGCTTGCTGTTGTAACTGATGGGCGTTATTGTGTTGATGGATGGGAGATTAGGGGAGTTTGGATGGTGCTGNTTAATTTAGGTGCTGGTATTAATT]

[+] EMBL AK106387             [GAAAATCGACAGCAAGTGGAAAGCCGAGTGCCTATGGTGCCATAAGAGGCTCGGAGGGGACACTAAGAATGGCACCAAACATTTGCACGATCATCTCAGCAAATGTCCTCGTCGCAGGAGTAATAAAGTCAGCAAGCCAACTCCCTCCAAATGTACAAAGGATATTGATCAGGAACCCACTGTTGCTTCTTTAGAAAGCTCCACCTTTAGCCAGGATGTTGCCAGGATGGAGCTTGCGAGAATGATTATCTTGCATGAATATCCTTTGTCTATTATGGAGCATTACGGTTTCCAAAGGTTTGTTAGGGCTCTTCAACCATTGTTCCAGCTGGTTCCCAACAGTAGTCTTAAGAAGGATGTTATCAGCATTTATGAGACGGAGAGGGTCAGAACCAGGGAAATTTTGTGGGAGGCTAAAGGTCGGATTGCAATAACAGCAGATATATGGACATCAGATGATCAAAATAGAGGTTATGTGGCTGTCAGAGCTCATTTTATCGACCAATCCTGGACATTCCAGTGCCGTCTACTGAGCTTTATACATGTGCCATGGCCGCATACAGCTCAAGCAATTTCTGAAACTCTGTCTTCTTGTTTGAACGAATGGAATCTTGGAAGGAGGGTATCAATGGTGATGGCTGATGATTGTTCTACAGATGATACGGTTACGGGGCTCTTAAAGCAAAGGCTGGATACCGAACAACTTTTGTTAGGTGGGTCTTTGCTGAACATGAGATGCTGCGCCTATGTGCTAAGTAGAATTGCCAATAGTTGCCTGGGTGTGATGGGAGGTGCTGTTGATAGGATCCGCGCCAGTGTTGATTTCTGGACAGCAACAACTGAAAGAGATGTAGTGTTTGCTGATGTTGCTCGTGGTTTGAATGTTAATCTCGACAAGAAGTTGACTCTTGATTGTAATAATAGATGGTACTCTACCTTATCCATGTTAAATGTTGCCATAAGCTACAAGCAAGTCTTTGATCACTTAAGGCAAATAGAGGAACAGTATATTTGTGCTCCTGATGATGATGACTGGAAATTAGCAAAAGAGGTCTGCAGTAAGTTGAAACTGTTTTCTGACATTGCAGAACTAATTTCAGAGGCTAAGTATGTTACTGCTAATATGTACTTCCCCAAGATTTGTGGAATTCGGATGGCCATGAGGAGATGGCCTGGGTGTGAGGATGAACTGATAGGAAGGATGAGAAATGAAATAGCCGAATTGTTTGAGAAATATTGCGTTGAAGTTCATGATCTCATGGCTGTGGCAACTGTCCTAGACCCCAGATATAAGCTTGAGCTACTGCAGTTTTATTTCCCCTCAATTTTTGGTGATGAGGCATACAATGAGATAAATAGAGTCCGGCAGCTCTGTTATGATTTGATCAAACAGTATCAGGGTCCCCAATCAAAAGTCGGTGCAATGCAGCCTTGTGGGGGGGAGGAAGAGGGTCCAGATCAGTTATCTAGCTTCGATCTATATATCGCTTTCAAGTTCTCCAGTGCAGATGTCAAGTCAGAACTAGACAAATACTTGGACGAGCCTGTTATCCCTAGAGCAGTAGACTTTGACATAATAGATTGGTGGAAGATTATGGGGAAGAGGTTTCCAACTCTGCAGATGTTAGCAAGAGACATTTTAGCGGTTCCTGTCTCAAGGGTAGTTTCTGAATCGGCGTTTAGCATTGCTGGAAGGGTTTTGAGTCCACAGCGTAGCAAGCTTTTACCTGATACACTGGAGGCCTTGATGTGCTCACAAGATTGGCTTCATGCAGAAAACAGAGGTGCAGGATCGTCAGGGCTCTTGAGCTGCCTCACTTGCCTGGAAGATGCTGATGTAACTACAAAGGAGTGAAGTTTGGACGCCTGTTGATTGTTTGCTACAAATATATGCTGAAGTTGATCTCGCACATTCACCAGCTGAATTAAAGCGCTGAGATCTGGGTTAGCTTTTTTTTTGGTTTATCTCAAGAGTATTGTGGGTAAGGAAGGTGGTGTGTATGTTGGAACTGTGAGGAGTCTACTAAAATGAAGAAAGCATTCAGTTGATCATTCTTTTCAGGAAA                                                                                                                         ]
[+] EMBL BF430911             [                  GAAAGCCGAGTGCCTATGGTGCCATAAGAGGCTCGGAGGGGACACTAAGAATGGCACCAAACATTTGCACGATCATCTCAGCAAATGTCCTCGTCGCAGGAGTAATAAAGTCAGCAAGCCAACTCCCTCCAAATGTACAAAGGATACTGATCAGGAACCCACTGTTGCTTCTTTAGAAAGCTCCACCTTTAGCCAGGATGTTGCCAGGATGGAGCTTGCGAGAATGATTATCTTGCATGAATATCCTTTGTCTATTATGGAGCATTACGGTTTCCAAAGGTTTGTTAGGGCTCTTCAACCATTGTTCCAGCTGGTTCCCAACAGTAGTCTTAAGAAGGATGTTATCAGCATTTATGAGACGGAGAGGGTCAGAACCAGGGAAATTTTGTGGGAGGCTAAAGGTCGGATTGCAATAACAGCAGATATATGGACATCAGATGATCAAAATAGAGGTTATGTGGCTGTCAGAGCTCATTTTATCGACCAATCCTGGACATTCCAGTGCCGTCTACTGAGCTTTATACATGTGCCATGGCCGCATACAGCTCAAGCAATTTCTGAAACTCTGTCTTCTTGTTTGAACGAATGGAATCTTGGAAGGAGGGTATCAATGGTGATGGCTGATGATTGTTCTACAGATGATACGGTACCGGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CB619165             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TAACGGTCGGATTGCAATAACAGCAGATATATGGACATCAGATGATCAAAATAGAGGTTATGTGGCTGTCAGAGCTCATTTTATCGACCAATCCTGGACATTCCAGTGCCGTCTACTGAGCTTTATACATGTGCCATGGCCGCATACAGCTCAAGCAATTTCTGAAACTCTGTCTTCTTGTTTGAACGAATGGAATCTTGGAAGGAGGGTATCAATGGTGATGGCTGATGATTGTTCTACAGATGATACGGTTACGGGGCTCTTAAAGCAAAGGCTGGATACCGAACAACTTTTGTTAGGTGGGTCTTTGCTGAACATGAGATGCTGCGCCTATGTGCTAAGTAGAATTGCCAATAGTTGCCTGGGTGTGATGGGAGGTGCTGTTGATAGGATCCGCGCCAGTGTTGATTTCTGGACAGCAACAACTGAAAGAGATGTAGTGTTTGCTGATGTTGCTCGTGGTTTGAATGTTAATCTCGACAAGAAGTTGACTCTTGATCGTAATAATAGATGGTACTCTACCTTATCCATGTTAAATGTTGCCATAAGCTACAAGCAAGTCTTTGATCACTTAAGGCAAATAGAGGAACAGTATATTTGTGCTCCTGATGATGATGACTGGAAAATAGCAAAAGAGTTCTGCAGTAAGTTGAAACTGTTTTCTGACATTGCAGAACTAATTTCAGAGGCTAAGTATGTTACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CA766678             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGATTATGGGGAAGAGGTTTCCAACTCTGCAGATGTTAGCAAGAGACATTTTAGCGGTTCCTGTCTCAAGGGTAGTTTCTGAATCGGCGTTTAGCATTGCTGGAAGGGTTTTGAGTCCACAGCGTAGCAATCTTTTACCTGATACACTGGAGGCCTTGATGTGCTCACAAGATTGGCTTCGTGCAGAAAACAGAGGTGCAGGATCGTCAGGGCTCTTGAGCTGCCTCACTTGCCTGGAAGATGCTGATGTAATTACAAAGGAGTGAAGTTTGGACGCCTGTTGATTGTTTGCTACAAATATATGCTGAAGTTGATCTCGCACATTCACCAGCTGGATTAAAGCGCTGAGATCTGGGTTAGC TTTTTTTTGGTTTATCTCAAGAGTATTGTGGGTAAGGAAGGTGGTGTGTATGTTGGAACTGTGAGGAGTCTACTAAAATGAAGAAAGCATTCAGTTGATCATTCTTTTCAGGAAAGATTAGTTGCAAAATTCTGTGCGTAAGCTTGCTGTTGTAACTGATGGGCGTTATTGTGTTGATGGATGGGAGATTAGGGGAGTTTGGATGGTGCTGNTTAATTTAGGTGCTGGTATTAATT]




>consensus_6672#0
GAAAATCGACAGCAAGTGGAAAGCCGAGTGCCTATGGTGCCATAAGAGGCTCGGAGGGGA
CACTAAGAATGGCACCAAACATTTGCACGATCATCTCAGCAAATGTCCTCGTCGCAGGAG
TAATAAAGTCAGCAAGCCAACTCCCTCCAAATGTACAAAGGATATTGATCAGGAACCCAC
TGTTGCTTCTTTAGAAAGCTCCACCTTTAGCCAGGATGTTGCCAGGATGGAGCTTGCGAG
AATGATTATCTTGCATGAATATCCTTTGTCTATTATGGAGCATTACGGTTTCCAAAGGTT
TGTTAGGGCTCTTCAACCATTGTTCCAGCTGGTTCCCAACAGTAGTCTTAAGAAGGATGT
TATCAGCATTTATGAGACGGAGAGGGTCAGAACCAGGGAAATTTTGTGGGAGGCTAAAGG
TCGGATTGCAATAACAGCAGATATATGGACATCAGATGATCAAAATAGAGGTTATGTGGC
TGTCAGAGCTCATTTTATCGACCAATCCTGGACATTCCAGTGCCGTCTACTGAGCTTTAT
ACATGTGCCATGGCCGCATACAGCTCAAGCAATTTCTGAAACTCTGTCTTCTTGTTTGAA
CGAATGGAATCTTGGAAGGAGGGTATCAATGGTGATGGCTGATGATTGTTCTACAGATGA
TACGGTTACGGGGCTCTTAAAGCAAAGGCTGGATACCGAACAACTTTTGTTAGGTGGGTC
TTTGCTGAACATGAGATGCTGCGCCTATGTGCTAAGTAGAATTGCCAATAGTTGCCTGGG
TGTGATGGGAGGTGCTGTTGATAGGATCCGCGCCAGTGTTGATTTCTGGACAGCAACAAC
TGAAAGAGATGTAGTGTTTGCTGATGTTGCTCGTGGTTTGAATGTTAATCTCGACAAGAA
GTTGACTCTTGATTGTAATAATAGATGGTACTCTACCTTATCCATGTTAAATGTTGCCAT
AAGCTACAAGCAAGTCTTTGATCACTTAAGGCAAATAGAGGAACAGTATATTTGTGCTCC
TGATGATGATGACTGGAAATTAGCAAAAGAGGTCTGCAGTAAGTTGAAACTGTTTTCTGA
CATTGCAGAACTAATTTCAGAGGCTAAGTATGTTACTGCTAATATGTACTTCCCCAAGAT
TTGTGGAATTCGGATGGCCATGAGGAGATGGCCTGGGTGTGAGGATGAACTGATAGGAAG
GATGAGAAATGAAATAGCCGAATTGTTTGAGAAATATTGCGTTGAAGTTCATGATCTCAT
GGCTGTGGCAACTGTCCTAGACCCCAGATATAAGCTTGAGCTACTGCAGTTTTATTTCCC
CTCAATTTTTGGTGATGAGGCATACAATGAGATAAATAGAGTCCGGCAGCTCTGTTATGA
TTTGATCAAACAGTATCAGGGTCCCCAATCAAAAGTCGGTGCAATGCAGCCTTGTGGGGG
GGAGGAAGAGGGTCCAGATCAGTTATCTAGCTTCGATCTATATATCGCTTTCAAGTTCTC
CAGTGCAGATGTCAAGTCAGAACTAGACAAATACTTGGACGAGCCTGTTATCCCTAGAGC
AGTAGACTTTGACATAATAGATTGGTGGAAGATTATGGGGAAGAGGTTTCCAACTCTGCA
GATGTTAGCAAGAGACATTTTAGCGGTTCCTGTCTCAAGGGTAGTTTCTGAATCGGCGTT
TAGCATTGCTGGAAGGGTTTTGAGTCCACAGCGTAGCAAGCTTTTACCTGATACACTGGA
GGCCTTGATGTGCTCACAAGATTGGCTTCATGCAGAAAACAGAGGTGCAGGATCGTCAGG
GCTCTTGAGCTGCCTCACTTGCCTGGAAGATGCTGATGTAACTACAAAGGAGTGAAGTTT
GGACGCCTGTTGATTGTTTGCTACAAATATATGCTGAAGTTGATCTCGCACATTCACCAG
CTGAATTAAAGCGCTGAGATCTGGGTTAGCTTTTTTTTTGGTTTATCTCAAGAGTATTGT
GGGTAAGGAAGGTGGTGTGTATGTTGGAACTGTGAGGAGTCTACTAAAATGAAGAAAGCA
TTCAGTTGATCATTCTTTTCAGGAAAGATTAGTTGCAAAATTCTGTGCGTAAGCTTGCTG
TTGTAACTGATGGGCGTTATTGTGTTGATGGATGGGAGATTAGGGGAGTTTGGATGGTGC
TGNTTAATTTAGGTGCTGGTATTAATT
clustalw multiple alignements is not computed in this case