These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6787#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1558 fasta sequence [TTTGCAAGTGATCAACAGCTGACTTGTTTGCCTCTGCCATGGAGAAGAATTGTGCATGCCCACCACCAAGCAAGGGAAACATGATCACAATTCTGAGTATTGATGGAGGTGGGGTGAAGGGTATCATTCCTGCTGTCATCCTCTCATTCCTGGAATCTAAACTTCAGGAGCTTGATGGGAAGGATGCTCGGATTGCAAACTACTTTGATGCCATTGCTGGCACAAGCACAGGTGGTCTTATTGCAGGCATGCTAGCAGCTCCATCACTGGGCGATGCCAATCAACCATGCTATGCCAAGGATATTGTCCCATTTTACCTCAAGCATTCCCCCCACATCTTTCCGCACAGGACTGGATTTTTTGGTTGGTTCTTCAACATCCTGGGCATCATAAAGATGGCCATTGGGCCAAAGTATGATGGAAAATACCTTCACAGACTAATCAATGATCTTCTTGGCGAGACGAGGATGAAAGAAACATTGACAAATGTTGTGATTCCCACTTTTGATGTGAAGTGTGTGAAGCCAATAATATTCAGCACATTCAAGGCGAGACGTAAGCCCTTGAAGAATGCTTGTCTTGCTGATGTATGTATTGGTACATCTGCAGCACCAACCTTTCTCCCTGCACACTATTTTGAAACCGTGGATCACACGGGTGCATCGCAAAGCTTCAACATTATTGATGGTGGCATGGCAGCAAACAATCCAACTTTGGTGACTATGGGTGAGATAACAAAGCAGATCAAGCGGAAGAGCGAGGAGTTCCCGAAAGCCGAGCCCTTGGATTACCGCAAGTATCTGGTGATATCTTTGGGCACGGGTCTGCCTGAGCACGATATCATGTTTGATGCAAGAAATGTTGCCAAATGGGGCATTTTTCGATGGCTAGTTGATAAGGATACAATGCCGTTGCTCAACATGTTCTTTCATGCCAGCTCAGATATGGCCGATACTCTCGTTGCAGACCTCTTTCAAGCAATCGGATGTTCACACCAACTATTGCGCATTC-AGGATCACAACATCCCAATAGGGG-CAATATCCAATGACCTCTCGACGAAGGATCATCTTCA-ACTGTTGGTTAAGATAGGCGAAAACCTTCTCAAGAAGCCACTAAGCAAGGAAGAGTGTGAGAAGAACAACATTGAGCCAGAGCCAAACCTTCATGGTGACCATGTGACGACCTATGCAGATATGCTCACACGGTTTGCAAAGCTACTTTCAGACGAGAGGAAGCTAAGGCTCCACAACATGAAGCTGGATGCTAAGCCCTAGCACAATTGAAACGTGAGATCCTTGGAACAGATGTCTCATGTTCATCTATAGGATTGCGTGTCCCCTACTAAGCCAATTAATTTTGTATTGTGAAATAGCTGTCTGAACTGTTA-AAAATAAGAACTTTGTACAGTAGTGGTAATGTTGCTTTTATTTGCTTCAAAAAACACTAGTTGGTAAAGTTTATACTACCTATATCTGTGTGATGTGTGGTGTCTGTTCAGAATGTAGAACTATGTATTGTAATGGTGAATT-TATGAAAAACGATGTATTTGCATAAAAAA] [+] EMBL AK106563 [TTTGCAAGTGATCAACAGCTGACTTGTTTGCCTCTGCCATGGAGAAGAATTGTGCATGCCCACCACCAAGCAAGGGAAACATGATCACAATTCTGAGTATTGATGGAGGTGGGGTGAAGGGTATCATTCCTGCTGTCATCCTCTCATTCCTGGAATCTAAACTTCAGGAGCTTGATGGGAAGGATGCTCGGATTGCAAACTACTTTGATGCCATTGCTGGCACAAGCACAGGTGGTCTTATTGCAGGCATGCTAGCAGCTCCATCACTGGGCGATGCCAATCAACCATGCTATGCCAAGGATATTGTCCCATTTTACCTCAAGCATTCCCCCCACATCTTTCCGCACAGGACTGGATTTTTTGGTTGGTTCTTCAACATCCTGGGCATCATAAAGATGGCCATTGGGCCAAAGTATGATGGAAAATACCTTCACAGACTAATCAATGATCTTCTTGGCGAGACGAGGATGAAAGAAACATTGACAAATGTTGTGATTCCCACTTTTGATGTGAAGTGTGTGAAGCCAATAATATTCAGCACATTCAAGGCGAGACGTAAGCCCTTGAAGAATGCTTGTCTTGCTGATGTATGTATTGGTACATCTGCAGCACCAACCTTTCTCCCTGCACACTATTTTGAAACCGTGGATCACACGGGTGCATCGCAAAGCTTCAACATTATTGATGGTGGCATGGCAGCAAACAATCCAACTTTGGTGACTATGGGTGAGATAACAAAGCAGATCAAGCGGAAGAGCGAGGAGTTCCCGAAAGCCGAGCCCTTGGATTACCGCAAGTATCTGGTGATATCTTTGGGCACGGGTCTGCCTGAGCACGATATCATGTTTGATGCAAGAAATGTTGCCAAATGGGGCATTTTTCGATGGCTAGTTGATAAGGATACAATGCCGTTGCTCAACATGTTCTTTCATGCCAGCTCAGATATGGCCGATACTCTCGTTGCAGACCTCTTTCAAGCAATCGGATGTTCACACCAACTATTGCGCATTC AGGATCACAACATCCCAATAGGGG CAATATCCAATGACCTCTCGACGAAGGATCATCTTCA ACTGTTGGTTAAGATAGGCGAAAACCTTCTCAAGAAGCCACTAAGCAAGGAAGAGTGTGAGAAGAACAACATTGAGCCAGAGCCAAACCTTCATGGTGACCATGTGACGACCTATGCAGATATGCTCACACGGTTTGCAAAGCTACTTTCAGACGAGAGGAAGCTAAGGCTCCACAACATGAAGCTGGATGCTAAGCCCTAGCACAATTGAAACGTGAGATCCTTGGAACAGATGTCTCATGTTCATCTATAGGATTGCGTGTCCCCTACTAAGCCAATTAATTTTGTATTGTGAAATAGCTGTCTGAACTGTTA AAAATAAGAACTTTGTACAGTAGTGGTAATGTTGCTTTTATTTGCTTCAAAAAACACTAGTTGGTAAAGTTTATACTACCTATATCTGTGTGATGTGTGGTGTCTGTTCAGAATGTAGAACTATGTATTGTAATGGTGAATT TATGAAAAACGATGTATTTG ] [+] EMBL CA764288 [ aggggGGGGCATTTTTCGATGGCTAGTTGATAAGGATACAATGCCGTTGCTCAACATGTTCTTTCATGCCAGCTCAGATATGGCCGATACTCTCGTTGCAGACCTCTTTCAAGCAATCGGATGTTCACACCAACTATTGCGCATTC AGGATCACAACATCCCAATAGGGG CAATATCCAATGACCTCTCGACGAAGGATCATCTTCA ACTGTTGGTTAAGATAGGCGAAAACCTTCTCAAGAAGCCACTAAGCAAGGAAGAGTGTGAGAAGAACAACATTGAGCCAGAGCCAAACCTTCATGGTGACCATGTGACGACCTATGCAGATATGCTCACACGGTTTGCAAAGCTACTTTCAGACGAGAGGAAGCTAAGGCTCCACAACATGAAGCTGGATGCTAAGCCCTAGCACAATTGAAACGTGAGATCCTTGGAACAGATGTCTCATGTTCATCTATAGGATTGCGTGTCCCCTACTAAGCCAATTAATTTTGTATTGTGAAATAGCTGTCTGAACTGTTA AAAATAAGAACTTTGTACAGTAGTGGTAATGTTGCTTTTATTTGCTTCAAAAAACACTAGTTGGTAAAGTTTATACTACCTATATCTGTGTGATGTGTGGTGTCTGTTCAGAATGTAGAACTATGTATTGTAATGGTGAATT TATGAAAAACGATGTATTTGCATAtat ] [+] EMBL BI801419 [ GGATGTTCACACCAACTATTGCGCATTCAAGGATCACAACATCCCAATAGGGGCCCATATCCCATGACCTCTCGACGAAGGATCATCTTCACACTGTTGGTTAAGATAGGCGAAAACCTTCTCAAGAAGCC CTAAGCAAGGAAGAGTGTGAGAAGAAC ACATTGAGCCAGAGCC AACCTTCATGGTGACCATGTGACGACCTATGCAGATATGCTCACACGGTTTGC AAGCTACTTTCAGACGAGAGGAAGCTAAGGCTCCACAACATGAAGCTGGATGCTAAGCCCTAGCAC ATTGAAACGTGAGATCCTTGGAACAGATGTCTCATGTTCATCTATAGGATTGCGTGTCCCCTACTAAGCC ATTAATTTTGTATTGTGAAATAGCTGTCTGAACTGTTA AAAATAAGAACTTTGTACAGTAGTGGTAATGTTGCTTTTATTTGCTTCAAAAAACACTAGTTGGTAAAGTTTATACTACCTATATCTGTGTGATGTGTGGTGTCTGTTCAGAATGTAGAACTATGTATTGTAATGGTGAATT TATGAAAAACGATGTATTTGCATAAAAAA] [+] EMBL BI800640 [ TGGTGACCATGTGACGACCTATGCAGATATGCTCACACGGTTTGCAAAGCTACTTTCAGACGAGAGGAAGCTAAGGCTCCACAACATGAAGCTGGATGCTAAGCCCTAGCACAATTGAAACGTGAGATCCTTGGAACAGATGTCTCATGTTCATCTATAGGATTGCGTGTCCCCTACTAAGCC ATTAATTTTGTATTGTGAAATAGCTGTCTGCCCTGTTAGAAAATAAGAACTTTGTACAGTAGTGGTAATGTTGCTTTTATTTGCTTCAAAAAACACTAGTTGGTAAAGTTTATACTACCTATATCTGTGTGATGTGTGGTGTCTGTTCAGAATGTAGAACTATGTATTGTAATGGTGAATTCTA CAAAAACGATGTATTTGCATAAAAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||