cluster # 6787

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Oryza sativa
cluster # 6787 cluster # 6787 Sequences # 4 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_6787#0 length = 1558 sequences # 4
consensusID : consensus_6787#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1558
fasta sequence
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[+] EMBL CA764288             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aggggGGGGCATTTTTCGATGGCTAGTTGATAAGGATACAATGCCGTTGCTCAACATGTTCTTTCATGCCAGCTCAGATATGGCCGATACTCTCGTTGCAGACCTCTTTCAAGCAATCGGATGTTCACACCAACTATTGCGCATTC AGGATCACAACATCCCAATAGGGG CAATATCCAATGACCTCTCGACGAAGGATCATCTTCA ACTGTTGGTTAAGATAGGCGAAAACCTTCTCAAGAAGCCACTAAGCAAGGAAGAGTGTGAGAAGAACAACATTGAGCCAGAGCCAAACCTTCATGGTGACCATGTGACGACCTATGCAGATATGCTCACACGGTTTGCAAAGCTACTTTCAGACGAGAGGAAGCTAAGGCTCCACAACATGAAGCTGGATGCTAAGCCCTAGCACAATTGAAACGTGAGATCCTTGGAACAGATGTCTCATGTTCATCTATAGGATTGCGTGTCCCCTACTAAGCCAATTAATTTTGTATTGTGAAATAGCTGTCTGAACTGTTA AAAATAAGAACTTTGTACAGTAGTGGTAATGTTGCTTTTATTTGCTTCAAAAAACACTAGTTGGTAAAGTTTATACTACCTATATCTGTGTGATGTGTGGTGTCTGTTCAGAATGTAGAACTATGTATTGTAATGGTGAATT TATGAAAAACGATGTATTTGCATAtat  ]
[+] EMBL BI801419             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GGATGTTCACACCAACTATTGCGCATTCAAGGATCACAACATCCCAATAGGGGCCCATATCCCATGACCTCTCGACGAAGGATCATCTTCACACTGTTGGTTAAGATAGGCGAAAACCTTCTCAAGAAGCC CTAAGCAAGGAAGAGTGTGAGAAGAAC ACATTGAGCCAGAGCC AACCTTCATGGTGACCATGTGACGACCTATGCAGATATGCTCACACGGTTTGC AAGCTACTTTCAGACGAGAGGAAGCTAAGGCTCCACAACATGAAGCTGGATGCTAAGCCCTAGCAC ATTGAAACGTGAGATCCTTGGAACAGATGTCTCATGTTCATCTATAGGATTGCGTGTCCCCTACTAAGCC ATTAATTTTGTATTGTGAAATAGCTGTCTGAACTGTTA AAAATAAGAACTTTGTACAGTAGTGGTAATGTTGCTTTTATTTGCTTCAAAAAACACTAGTTGGTAAAGTTTATACTACCTATATCTGTGTGATGTGTGGTGTCTGTTCAGAATGTAGAACTATGTATTGTAATGGTGAATT TATGAAAAACGATGTATTTGCATAAAAAA]
[+] EMBL BI800640             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGGTGACCATGTGACGACCTATGCAGATATGCTCACACGGTTTGCAAAGCTACTTTCAGACGAGAGGAAGCTAAGGCTCCACAACATGAAGCTGGATGCTAAGCCCTAGCACAATTGAAACGTGAGATCCTTGGAACAGATGTCTCATGTTCATCTATAGGATTGCGTGTCCCCTACTAAGCC ATTAATTTTGTATTGTGAAATAGCTGTCTGCCCTGTTAGAAAATAAGAACTTTGTACAGTAGTGGTAATGTTGCTTTTATTTGCTTCAAAAAACACTAGTTGGTAAAGTTTATACTACCTATATCTGTGTGATGTGTGGTGTCTGTTCAGAATGTAGAACTATGTATTGTAATGGTGAATTCTA CAAAAACGATGTATTTGCATAAAAA ]




>consensus_6787#0
TTTGCAAGTGATCAACAGCTGACTTGTTTGCCTCTGCCATGGAGAAGAATTGTGCATGCC
CACCACCAAGCAAGGGAAACATGATCACAATTCTGAGTATTGATGGAGGTGGGGTGAAGG
GTATCATTCCTGCTGTCATCCTCTCATTCCTGGAATCTAAACTTCAGGAGCTTGATGGGA
AGGATGCTCGGATTGCAAACTACTTTGATGCCATTGCTGGCACAAGCACAGGTGGTCTTA
TTGCAGGCATGCTAGCAGCTCCATCACTGGGCGATGCCAATCAACCATGCTATGCCAAGG
ATATTGTCCCATTTTACCTCAAGCATTCCCCCCACATCTTTCCGCACAGGACTGGATTTT
TTGGTTGGTTCTTCAACATCCTGGGCATCATAAAGATGGCCATTGGGCCAAAGTATGATG
GAAAATACCTTCACAGACTAATCAATGATCTTCTTGGCGAGACGAGGATGAAAGAAACAT
TGACAAATGTTGTGATTCCCACTTTTGATGTGAAGTGTGTGAAGCCAATAATATTCAGCA
CATTCAAGGCGAGACGTAAGCCCTTGAAGAATGCTTGTCTTGCTGATGTATGTATTGGTA
CATCTGCAGCACCAACCTTTCTCCCTGCACACTATTTTGAAACCGTGGATCACACGGGTG
CATCGCAAAGCTTCAACATTATTGATGGTGGCATGGCAGCAAACAATCCAACTTTGGTGA
CTATGGGTGAGATAACAAAGCAGATCAAGCGGAAGAGCGAGGAGTTCCCGAAAGCCGAGC
CCTTGGATTACCGCAAGTATCTGGTGATATCTTTGGGCACGGGTCTGCCTGAGCACGATA
TCATGTTTGATGCAAGAAATGTTGCCAAATGGGGCATTTTTCGATGGCTAGTTGATAAGG
ATACAATGCCGTTGCTCAACATGTTCTTTCATGCCAGCTCAGATATGGCCGATACTCTCG
TTGCAGACCTCTTTCAAGCAATCGGATGTTCACACCAACTATTGCGCATTCAGGATCACA
ACATCCCAATAGGGGCAATATCCAATGACCTCTCGACGAAGGATCATCTTCAACTGTTGG
TTAAGATAGGCGAAAACCTTCTCAAGAAGCCACTAAGCAAGGAAGAGTGTGAGAAGAACA
ACATTGAGCCAGAGCCAAACCTTCATGGTGACCATGTGACGACCTATGCAGATATGCTCA
CACGGTTTGCAAAGCTACTTTCAGACGAGAGGAAGCTAAGGCTCCACAACATGAAGCTGG
ATGCTAAGCCCTAGCACAATTGAAACGTGAGATCCTTGGAACAGATGTCTCATGTTCATC
TATAGGATTGCGTGTCCCCTACTAAGCCAATTAATTTTGTATTGTGAAATAGCTGTCTGA
ACTGTTAAAAATAAGAACTTTGTACAGTAGTGGTAATGTTGCTTTTATTTGCTTCAAAAA
ACACTAGTTGGTAAAGTTTATACTACCTATATCTGTGTGATGTGTGGTGTCTGTTCAGAA
TGTAGAACTATGTATTGTAATGGTGAATTTATGAAAAACGATGTATTTGCATAAAAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case