These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6824#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 585 fasta sequence [TACTCTATTTGGTTGGTGGATTGCCAAAAAAAAAGTGAGGTTAGAATGATATGCAGGTAAAATTAGCCAAAAAGTAAGTCTATGACATGTGGGCCACAAGAATAAAAAAGAGAGGGGAGACCGGTTTGTGATAGTGAACTAAACATTTTTCTGTAGAAATTTGCCAGGATTTAGGTTGGCACTGTTAGTCACGTGATGATGTGCCATCTCTGGCTAATAGTATCTTGATTTTTTTTCTGAAATGTTTGGTTCTAGTAATTCAAGCCTGTTATTAAACACTAACCGATGCAGTTCTAGGCAAAATTAAAACTGCACAACAGAACAAGTTGTTCTTCACGCAGAATGTCACAAACCTCATTTTTCAGTAGTTTTTTTTTAATTGGTGGTTCTAGAGGTTTTGAGGTTCGTATAGGAGTACCCCATCCTTTTAAATTTGATGAAAATTTTGATGAAATAAATGTAAATTTAATATTATGAAATTTCAAAGTATGAGGTAGGACCATCTAACGAAAATTTCTTCCGCCACTGGTTTTTTTTCAAAGTCTTTTATATCAGTCTCCCTGCCCTGAACCACGATTACAAAAA] [+] EMBL AU101639 [TACTCTATTTGGTTGGTGGATTGCCAAAAAAAAAGTGAGGTTAGAATGATATGCAGGTAAAATTAGCCAAAAAGTAAGTCTATGACATGTGGGCCACAAGAATAAAAAAGAGAGGGGAGACCGGTTTGTGATAGTGAACTAAACATTTTTCTGTAGAAATTTGCCAGGATTTAGGTTGGCACTGTTAGTCACGTGATGATGTGCCATCTCTGGCTAATAGTATCTTGATTTTTTTTCTGAAATGTTTGGTTCTAGTAATTCAAGCCTGTTATTAAACACTAACCGATGCAGTTCTAGGCAAAATTAAAACTGCACAACAGAACAAGTTGTTCTTCACGCAGAATGTCACAAACCTCATTTTTCAGTAGTTTTTTTTTAATTGGTGGTTCTAGAGGTTTTGAGGTTCGTATAGGAGTACCCCATCCTTTTAAATTTGATGAAAATTTTGATGAAATAAATGTAAATTTAATATTATGAAATTTCAAAGTATGAGGTAGGACCATCTAACGAAAATTTCTTCCGCCACTGGTTTTTTTTCAAAGTCTTTTATATCAGTCTCCCTGCCCTGAACCACGATTACAAAAA] [+] EMBL AU184102 [TACTCTATTTGGTTGGTGGATTGCCAAAAAAAAAGTGAGGTTAGAATGATATGCAGGTAAAATTAGCCAAAAAGTAAGTCTATGACATGTGGGCCACAAGAATAAAAAAGAGAGGGGAGACCGGTTTGTGATAGTGAACTAAACATTTTTCTGTAGAAATTTGCCAGGATTTAGGTTGGCACTGTTAGTCACGTGATGATGTGCCATCTCTGGCTAATAGTATCTTGATTTTTTTTCTGAAATGTTTGGTTCTAGTAATTCAAGCCTGTTATTAAACACTAACCGATGCAGTTCTAGGCAAAATTAAAACTGCACAACAGAACAAGTTGTTCTTCACGCAGAATGTCACAAACCTCATTTTTCAGTAGTTTTTTTTTAATTGGTGGTTCTAGAGGTTTTGAGGTT ] [+] EMBL OSR09082A [TACTCTATTTGGTTGGTGGATTGCCAAAAAAAAAGTGAGGTTAGAATGATATGCAGGTAAAATTAGCCAAAAAGTAAGTCTATGACATGTGGGCCACAAGAATAAAAAAGAGAGGGGAGACCGGTTTGTGATAGTGAACTAAACATTTTTCTGTAGAAATTTGCCAGGATTTAGGTTGGCACTGTTAGTCACGTGATGATGTGCCATCTCTGGCTAATAGTATCTTGATTTTTTTTCTGAAATGTTTGGTTCTAGTAATTCAAGCCTGTTATTAAACACTAACCGNTGCAGTTCTAGGCAAAATTAAAAC ] [+] EMBL AU184103 [ TGCCAGGATTTAGGTTGGCACTGTTAGTCACGTGATGATGTGCCATCTCTGGCTAATAGTATCTTGATTTTTTTTCTGAAATGTTTGGTTCTAGTAATTCAAGCCTGTTATTAAACACTAACCGATGCAGTTCTAGGCAAAATTAAAACTGCACAACAGAACAAGTTGTTCTTCACGCAGAATGTCACAAACCTCATTTTTCAGTAGTTTTTTTTTAATTGGTGGTTCTAGAGGTTTTGAGGTTCGTATAGGAGTACCCCATCCTTTTAAATTTGATGAAAATTTTGATGAAATAAATGTAAATTTAATATTATGAAATTTCAAAGTATGAGGTAGGACCATCTAACGAAAATTTCTTCCGCCACTGGTTTTTTTTCAAAGTCTTTTATATCAGTCTCCCTGCCCTGAACCACGATTACAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||