cluster # 6912

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Oryza sativa
cluster # 6912 cluster # 6912 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6912#0 length = 370 sequences # 4

consensusID : consensus_6912#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 370
fasta sequence

                              [CGAACAGAGATCAGCTTGCCAAGTTCGCAAAGCAGCTCTCCGACGAGCGGCGCCGGCGCCAAAACGAGCCCTCAAATTAAATTGAATTAAGGAGTGATAAAAAAAATTAAAGTGATTTTACTGTTCTGCTAGGCCGTAAAATCTCTTTAAATTAAAATCTCGGTTATGTGTGATGGTCGAACTGCTTCTGATTGAATCGAATTGGTCTTCATGTGTGTGTTGGGGGTGGTTTGTTACTTTGAAACATGTTCCTCGTTCCATTTTTGTATATATCAGAAATAAAAACTTCCATTTCTCTAAACATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCTGTCATGCCGTTACGTACCGTAT]

[+] EMBL AU033142             [CGAACAGAGATCAGCTTGCCAAGTTCGCAAAGCAGCTCTCCGACGAGCGGCGCCGGCGCCAAAACGAGCCCTCAAATTAAATTGAATTAAGGAGTGATAAAAAAAATTAAAGTGATTTTACTGTTCTGCTAGGCCGTAAAATCTCTTTAAATTAAAATCTCGGTTATGTGTGATGGTCGAACTGCTTCTGATTGAATCGAATTGGTCTTCATGTGTGTGTTGGGGGTGGTTTGTTACTTTGAAACATGTTCCTCGTTCCATTTTTGTATATATCAGAAATAAAAACTTCCATTTCTCTAAAaaa                                                                  ]
[+] EMBL AU097309             [  nACAGAGATCAGCTTGCCAAGTTCGCAAAGCAGCTCTCCGACGAGCGGCGCCGGCGCCAAAACGAGCCCTCAAATTAAATTGAATTAAGGAGTGATAAAAAAAATTAAAGTGATTTTACTGTTCTGCTAGGCCGTAAAATCTCTTTAAATTAAAATCTCGGTTATGTGTGATGGTCGAACTGCTTCTGATTGAATCGAATTGGTCTTCATGTGTGTGTTGGGGGTGGTTTGTTACTTTGAAACATGTTCCTCGTTCCATTTTTGTATATATCAGAAATAAAAACTTCCATTTCTCTAAA                                                                     ]
[+] EMBL CF291525             [                                                                                ATGGACTGAAGGAGTGATAAAAAAAATTAAAGTGATTTTACTGTTCTGCTAGGCCGTAAAATCTCTTTAAATTAAAATCTCGGTTATGTGTGATGGTCGAACTGCTTCTGATTGAATCGAATTGGTCTTCATGTGTGTGTTGGGGGTGGTTTGTTACTTTGAAACATGTTCCTCGTTCCATTTTTGTATATATCAGAAATAAAAACTTCCATTTCTCTAATCATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCTGTCATGCCGTTACGTACCGTAT]
[-] EMBL CF291524             [                                                                                ATGGATTGAAGGAGTGATAAAAAAAATTAAAGTGATTTTACTGTTTTGGTAGGCCGTAAAATTTCTTTAAATTAAAATTTCGGTTATGTGTGATGGTCGAACTGCTTTTGATTGAATCGAATTGGTTTTCATGTGTGTGTTGGGGGTGGTTTGTTACTTTGAAACATGTTCCTCGTTCCATTTTTGTATATATCAGAAATAAAAACTTCCATTTTTTTAATCATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA                                      ]




>consensus_6912#0
CGAACAGAGATCAGCTTGCCAAGTTCGCAAAGCAGCTCTCCGACGAGCGGCGCCGGCGCC
AAAACGAGCCCTCAAATTAAATTGAATTAAGGAGTGATAAAAAAAATTAAAGTGATTTTA
CTGTTCTGCTAGGCCGTAAAATCTCTTTAAATTAAAATCTCGGTTATGTGTGATGGTCGA
ACTGCTTCTGATTGAATCGAATTGGTCTTCATGTGTGTGTTGGGGGTGGTTTGTTACTTT
GAAACATGTTCCTCGTTCCATTTTTGTATATATCAGAAATAAAAACTTCCATTTCTCTAA
ACATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCTGTCATGCCGTTA
CGTACCGTAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case