cluster # 6979

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Oryza sativa
cluster # 6979 cluster # 6979 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6979#0 length = 417 sequences # 4

consensusID : consensus_6979#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 417
fasta sequence

                              [CCATCCGTNGCTTCCGTCCCCCGAGTTTACTACTGCTCCACGACGCCCCGCTCCCATCCACACCCGCAACCACCTCGCTCGCTAAAAATCCCCACGATTTGTCCTCACATGGCCACGCCCAGAACGGCCGGAACTAGCCCTCGCTCTCGTCGTCCTACTCCAGATTGCCGCTGCTCGACGGAGCCAGATCGTCGGTAGGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGTGGGGGTGATGGATCGGCAGAGGCAGCAGAGCTCCAGGGGCAATGCTACTNCAACGAGGGGTGGTGGGTCGTCGGGGAAGGGTGGTGGTNGTTGTGTCGGGAAGGCGGCGGGGAAGAAGCCATCAAGGTGGTGTACATNTCCAACCCCATGCGGGTNAAGACCAGCGCCGCCGGGTTCC]

[+] EMBL C91729               [CCATCCGTNGCTTCCGTCCCCCGAGTTTACTACTGCTCCACGACGCCCCGCTCCCATCCACACCCGCAACCACCTCGCTCGCTAAAAATCCCCACGATTTGTCCTCACATGGCCACGCCCAGAACGGCCGGAACTAGCCCTCGCTCTCGTCGTCCTACTCCAGATTGCCGCTGCTCGACGGAGCCAGATCGTCGGTAGGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGTGGGGGTGATGGATCGGCAGAGGCAGCAGAGCTCCAGGGGCAATGCTACTNCAACGAGGGGTGGTGGGTCGTCGGGGAAGGGTGGTGGTNGTTGTGTCGGGAAGGCGGCGGGGAAGAAGCCATCAAGGTGGTGTACATNTCCAACCCCATGCGGGTNAAGACCAGCGCCGCCGGGTTCC]
[+] EMBL OSR24311A            [       ccGCTTCCGTCCCCCGAGTTTACTACTGCTCCACGACGCCCCGCTCCCATCCACACCCGCAACCACCTCGCTCGCTAAAAATCCCCACGATTTGTCCTCACATGGCCACGCCCAGAACGGCCGGAACTAGCCCTCGCTCTCGTCGTCCTACTCCAGATTGCCGCTGCTCGACGGAGCCAGATCGTCGGTAG                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL OSR22151A            [                   CCCGAGTTTACTACTGCTCCACGACGCCCCGCTCCCATCCACACCCGCAACCACCTCGCTCGCTAAAAATCCCCACGATTTGTCCTCACATGGCCACGCCCAGAACGGCCGGAACTAGCCCTCGCTCTCGTCGTCCTACTCCAGATTGCCGCTGCTCGACGGAGCCAGATCGTCGGTAGGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGTGGGNGTNATGGATCNGCAGATGNAGCAGAGCTCCAGGGGCAATGCTACT                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AU184421             [                   CCCGAGTTTACTACTGCTCCACGACGCCCCGCTCCCATCCACACCCGCAACCACCTCGCTCGCTAAAAATCCCCACGATTTGTCCTCACATGGCCACGCCCAGAACGGCCGGAACTAGCCCTCGCTCTCGTCGTCCTACTCCAGATTGCCGCTGCTCGACGGAGCCAGATCGTCGGTAGGGAGGAGGAGGAGGAGG                                                                                                                                                                                                          ]




>consensus_6979#0
CCATCCGTNGCTTCCGTCCCCCGAGTTTACTACTGCTCCACGACGCCCCGCTCCCATCCA
CACCCGCAACCACCTCGCTCGCTAAAAATCCCCACGATTTGTCCTCACATGGCCACGCCC
AGAACGGCCGGAACTAGCCCTCGCTCTCGTCGTCCTACTCCAGATTGCCGCTGCTCGACG
GAGCCAGATCGTCGGTAGGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGTG
GGGGTGATGGATCGGCAGAGGCAGCAGAGCTCCAGGGGCAATGCTACTNCAACGAGGGGT
GGTGGGTCGTCGGGGAAGGGTGGTGGTNGTTGTGTCGGGAAGGCGGCGGGGAAGAAGCCA
TCAAGGTGGTGTACATNTCCAACCCCATGCGGGTNAAGACCAGCGCCGCCGGGTTCC

clustalw multiple alignements is not computed in this case