These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6991#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1846 fasta sequence [AACTCTTTGCAGCCAATGCACAAATCTCTCTCACCTTTGCGTCGTCCGGTCTCCTCTTCCGGAAGCTGCCTCCGCCGCCGCTGCTGCCGCTGCCGTTGCTGGCCTCCGGCGCCAGCGGCGGCTCGCCGCCTAAGCCCCCGTAAAACATGCTTGCAAGGTCCTGCAACT-CCTGGAGGTAGCCGAACATGGCGCGGCACTTGTCGTCGTCGAGCATGACGTCGTCGAGTAGCCCCTGGCAGAGGCTCTCGACGGTGTCAAGGTGACCCTTCCGGTGTCGTGAAACGTCGCCGCCGCCGCATTGCGCCATATTACTAACCACTTAGCAAGAAGAGAAGACGATCAATTCTAGGAACAAAGCTAAGATTTGGTTGGTTCTTCCTATCCTTTGATGCAAATAGGTAGTATGTGACCCTTTCAAGGTAAGCAACAGGATGGTAGCTAATGTGTAAGCTTAAGGGGAGGGTTCTTGTGCCTGAAGTTTGCGTGTCCCTTTCTCTCCCTCCCTCTTTTGCTCTTCAGGAGTTTTTTCCTAATCCATATATATAGAGTGGACGATAGGTGGATAGAGAGGAGGAACCTTTCATTGTGTAATCGTACTTTTGGTATGAGATTGGATTTGGCCCTTTAGGTATGTTCATGTGAGGTAGGGCTGGATAAAGTAGTGCGGGTCCCTGTGTTTCAGCTGGCATATGCATTGGCTAGAACGTCTCATCAATTGGCCCTCCTGTAATCCACAAATTAGCAATTATGCTCTTGCTTTCATTTCCTCTACAAAAGAACATATAAATGTGAGAATCAATGGGATTGCTTTAGTTATGGGCATATGAATCAACACCATATCAGGCAATAAGATGTTGGCTCTTGAACCACTCCATATTATTTACTCATTATATACTGCATCATCCTTTTCAATTTGCTTTTGAATCATAGTCATAGCCATTCTCAAGTATCAACTTAAGTGATGATCATGCTCCATGCACTTAGCTAACCTTTTTCTAAAGGAATAACATGCACAAGGTTTTATTTGTGCATATACTGAAATAAGAGGTGGCTTCTGAACATTTGCTGATGCTGCAAAAGGACGATTGGGGAGGTGACAGCTGCTCCATTAACCTGTATGGACAGCTCTATCTTCTCTGCACTGACCCTTGTCCCACCACACCATACTCGCCACGTGTACATTTGCATTAAGAAATAAGATGCTCAGATTAGTGATAACCCGTTGGCCATATTACTGAACAGAACCGGACTTTGCATTCCAGTTCGTTAACACGAGTATTCCTTAATGAGCAGTGCACGTGAACATCGGCTTAATTTTTGTCCACTGACAATCTCCTGGTGATTGTCTGGAAGCATGCATTGCACCCCATCTTGGTGTCTGTTGTCTAGCACATTATGGAAGCAGGATATTGAGGGGAACTGTTAGTTTAAGTAGAAGAGACTATTTTCTTTTGAAGGGCAAGTAATGCTGCTATAGATCATGATTAGATGGAATTGTGCAACAGTTAGTGGTTGTTCAAAGACAGGAGTGGATTCGAAAAAACCTGGAGTGCTTCTGTTCGTTTTGCGGCTAGGCGGTTTTCAGTTTAGCATTCAACTATATTAGCTCCCTGTCTAATTAATGAACGTTTGTGTGGATCTGCTGATGATCTTATTAAGCTGTTCCTGCAGTTTTATGATTTTTTTAGCAAACAAATGCTCCAAATAGTCGACGTCCACTTGACCATTGCAACTAACTAAATCTATTATATTACTATCGGTGTCCATCATGTATGTATGTCTTGCTTACATAGATCTGCACCTATATATTATGAGTATATAGTTGGCATACACAGTTCATTCGGCT] [+] EMBL AK107038 [AACTCTTTGCAGCCAATGCACAAATCTCTCTCACCTTTGCGTCGTCCGGTCTCCTCTTCCGGAAGCTGCCTCCGCCGCCGCTGCTGCCGCTGCCGTTGCTGGCCTCCGGCGCCAGCGGCGGCTCGCCGCCTAAGCTCCCGTAACACATGCTTGCCAGGTCCTGCCACT CCTGGAGGTAGCCGAACATGGCGCGGCACTTGTCGTCGTCGAGCATGACGTCGTCGAGTAGCCCCTGGCAGAGGCTCTCGACGGTGTCAAGGTGACCCTTCCGGCGTCGTGAAACGTCGCCGCCGCCGCATTGCGCCATATTACTAACCACTTAGCAAGAAGAGAAGACGATCAATTCTAGGAACAAAGCTAAGATTTGGTTGGTTCTTCCTATCCTTTGATGCAAATAGGTAGTATGTGACCCTTTCAAGGTAAGCAACAGGATGGTAGCTAATGTGTAAGCTTAAGGGGAGGGTTCTTGTGCCTGAAGTTTGCGTGTCCCTTTCTCTCCCTCCCTCTTTTGCTCTTCAGGAGTTTTTTCCTAATCCATATATATAGAGTGGACGATAGGTGGATAGAGAGGAGGAACCTTTCATTGTGTAATCGTACTTTTGGTATGAGATTGGATTTGGCCCTTTAGGTATGTTCATGTGAGGTAGGGCTGGATAAAGTAGTGCGGGTCCCTGTGTTTCAGCTGGCATATGCATTGGCTAGAACGTCTCATCAATTGGCCCTCCTGTAATCCACAAATTAGCAATTATGCTCTTGCTTTCATTTCCTCTACAAAAGAACATATAAATGTGAGAATCAATGGGATTGCTTTAGTTATGGGCATATGAATCAACACCATATCAGGCAATAAGATGTTGGCTCTTGAACCACTCCATATTATTTACTCATTATATACTGCATCATCCTTTTCAATTTGCTTTTGAATCATAGTCATAGCCATTCTCAAGTATCAACTTAAGTGATGATCATGCTCCATGCACTTAGCTAACCTTTTTCTAAAGGAATAACATGCACAAGGTTTTATTTGTGCATATACTGAAATAAGAGGTGGCTTCTGAACATTTGCTGATGCTGCAAAAGGACGATTGGGGAGGTGACAGCTGCTCCATTAACCTGTATGGACAGCTCTATCTTCTCTGCACTGACCCTTGTCCCACCACACCATACTCGCCACGTGTACATTTGCATTAAGAAATAAGATGCTCAGATTAGTGATAACCCGTTGGCCATATTACTGAACAGAACCGGACTTTGCATTCCAGTTCGTTAACACGAGTATTCCTTAATGAGCAGTGCACGTGAACATCGGCTTAATTTTTGTCCACTGACAATCTCCTGGTGATTGTCTGGAAGCATGCATTGCACCCCATCTTGGTGTCTGTTGTCTAGCACATTATGGAAGCAGGATATTGAGGGGAACTGTTAGTTTAAGTAGAAGAGACTATTTTCTTTTGAAGGGCAAGTAATGCTGCTATAGATCATGATTAGATGGAATTGTGCAACAGTTAGTGGTTGTTCAAAGACAGGAGTGGATTCGAAAAAACCTGGAGTGCTTCTGTTCGTTTTGCGGCTAGGCGGTTTTCAGTTTAGCATTCAACTATATTAGCTCCCTGTCTAATTAATGAACGTTTGTGTGGATCTGCTGATGATCTTATTAAGCTGTTCCTGCAGTTTTATGATTTTTTTAGCAAACAAATGCTCCAAATAGTCGACGTCCACTTGACCATTGCAACTAACTAAATCTATTATATTACTATCGGTGTCCATCATGTATGTATGTCTTGCTTACATAGATCTGCACCTATATATTATGAGTATATAGTTGGCATACACAGTTCATTCGGCT] [-] EMBL OSS3984A [ GCCNAAGCCCCCGTAAAACATGCTTNCAAGGTCCTGCAACTCCCTGNAGGTAGCCGAACATGNCGCGGCACTTGNCGNCGTCGAGCATGACGTCGTCGAGTAGCCCCTGGCAGAGGCTCTCGACGGTGTCAAGGTGACCCTTCCGGTGTCGTGAAACGTCGCCGCCGCCGCATTGCGCCATATTACTAACCACTTAGCAAGAAGAGAAGACGATCAATTCTAGGAACAAAGCTAAGATTTGGTTGGTTCTTCCTATCCTTTGATGCAAATAGGTAGTATGTGACCCTTTCAAGGTAAGCAACAGGATGGTAGCTAATGTGTAAGCTTAAGGGGAGGGTTCTTGTGCCT ] [-] EMBL OSS3983A [ AGCCCCCGTAAAACATGCTTNCAAGGTCCTGCAACC CCTGAAGNTAGCCGAACATGCCNCGGCACTTGNCGNCGTCGAGCATGACGTCGTCGAGTAGCCCCTGGCAGAGGCTCTCGACGGTGTCAAGGTGACCCTTCCGGTGTCGTGAAACGTCGCCGCCGCCGCATTGCGCCATATTACTAACCACTTAGCAAGAAGAGAAGACGATCAATTCTAGGAACAAAGCTAAGATTTGGTTGGTTCTTCCTATCCTTTGATGCAAATAGGTAGTATGTGACCCTTTCAAGGTAAGCAACAGGATGGTAGCTAATGTGTAAGCTTAAGGGGAGGGTTCTTGTGCCT ] [-] EMBL OSS3230A [ ACATGCTTGCAAGGTCCTGCAACT CCTGGAGGTAGCCGAACATGGCGCGGCACTTGTCGTCGTCGAGCATGACGTCGTCGAGTAGCCCCTGGCAGAGGCTCTCGACGGTGTCAAGGTGACCCTTCCGGTGTCGTGAAACGTCGCCGCCGCCGCATTGCGCCATATTACTAACCACTTAGCAAGAAGAGAAGACGATCAATTCTAGGAACAAAGCTAAGATTTGGTTGGTTCTTCCTATCCTTTGATGCAAATAGGTAGTATGTGACCCTTTCAAGGTAAGCAACAGGATGGTAGCTAATGTGTAAGCTTAAGGGGAGGGTTCTTGTGCCT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||