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Oryza sativa
cluster # 7031 cluster # 7031       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7031#0 length = 1361 sequences # 4  

consensusID : consensus_7031#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1361
fasta sequence
                              [GAGCCCACCTCCCTCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCCTACCCTACCACCATGGCGTCCGCCGAGACCCCCAACCCCGACGCCGAAATCCCCAACACCGACGCCGCCGCCGCCGCCGACCCAGCTGCCGCCGCCCCAGCTGCCGCCGCCACCGACCCCGCCGCCGCTGGATCGCCGTCGCCCCCGCTCCCGCCACGCAAACGCCGCCTCTCCCCTACGCCCTCCCCCACCCGCCGCTCCTCCCGCTCCCGCTCCCGCTCCCCGCGCCGCGGCCGCAGCCGCAGCCGCTCCCGGAGCAGGAGCCGCGGGCGGAGCGCCAGCCCGCGGTACCCCGATGGGAAGCGGAGGCGGCACAACGACCTCAACGTCGAGGTGTGCCGCGACTTCCTCCGCGACAGGTGCGCCCGCGCCGACATCGAGTGCAAGTACGCGCACCCGCACCCCACCGTCGCCGTCGACAGGGACAGCAAGGTGACGGCGTGCGCGGACTCGCTGCGGAACAACTGCTTCCGGGGAAGGACCTGCCGCTACTACCACCCGCCCCCTCATATCCAGGAGTCATTATTGAGATCAATTGGT-GTGGAAGACCCAAAGGTGAAGATGCAGGTTTGCAGAGATTTTACACGTGGACGATGTTCAAGATCAGCAAACGAGTGCCGATTCTTGCACCATTCACCCCTTG-AGGATTGTGCAATTGTTTGCCAAGATTTCTTGCGTGGGAGGTGTGATCGTAAATCATGTAGATACTCTCATGTTATGGCCCATCCAATGCCACCCCCAATGAGGGATATTCCCATGCAATACCCTGATATGGTTTACATGCCACCACCAGCACCCCTTGGAGTACCTATGATGATGCCTCCCCCTTCAGCCCCTGCAGCCTTTTCTGGTAATAACTACGGAGTGGAAGTTTGCAGGGACTACTTGAAGAACATGTGTAATAGAGAATCCTGCAGATTTGCACACCCGGATTTGAATAATGAGGTGATGAATACCCAAGTTGAAGTTTGCCGTGATTTTAAGCGAGGAGAATGCAATCGACCTGCCTGTCGCTTTTACCATCCACCTGCAAGCTCAAATTCTATTGGATAAATATTGAGTGCCCTGCCCTGCTGCCGCTGCTACCGCTCTGCTGCTGCTAAATCTGCTACTGCTGCCAAAGAGCTGCTGCGCTGGCTGTTGTGCTGCTTGCTAAGATGTCATAGACAATGAAAAGCCTAAAAAAGTTCTATGTAACAGAAGAGATTATCATCGTGTGATGTTTCAGAGGTTGCTTAAACTTGACTCAGTTCTTTCTCTCTTTAAAAA-GGGGATTGCACGAGTGGTTGTGTACTAGCCTTCATAAAGATGTTTTAATTTTGAGTT]

[+] EMBL AK060634             [GAGCCCACCTCCCTCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCCTACCCTACCACCATGGCGTCCGCCGAGACCCCCAACCCCGACGCCGAAATCCCCAACACCGACGCCGCCGCCGCCGCCGACCCAGCTGCCGCCGCCCCAGCTGCCGCCGCCACCGACCCCGCCGCCGCTGGATCGCCGTCGCCCCCGCTCCCGCCACGCAAACGCCGCCTCTCCCCTACGCCCTCCCCCACCCGCCGCTCCTCCCGCTCCCGCTCCCGCTCCCCGCGCCGCGGCCGCAGCCGCAGCCGCTCCCGGAGCAGGAGCCGCGGGCGGAGCGCCAGCCCGCGGTACCCCGATGGGAAGCGGAGGCGGCACAACGACCTCAACGTCGAGGTGTGCCGCGACTTCCTCCGCGACAGGCGCGCCCGCGCCGACATCGAGTGCAAGTACGCGCACCCGCACCCCACCGTCGCCGTCGACAGGGACAGCAAGGTGACGGCGTGCGCGGACTCGCTGCGGAACAACTGCTTCCGGGGAAGGACCTGCCGCTACTACCACCCGCCCCCTCATATCCAGGAGTCATTATTGAGATCAATTGGT GTGGAAGACCCAAAGGTGAAGATGCAGGTTTGCAGAGATTTTACACGTGGACGATGTTCAAGATCAGCAAACGAGTGCCGATTCTTGCACCATTCACCCCTTG AGGATTGTGCAATTGTTTGCCAAGATTTCTTGCGTGGGAGGTGTGATCGTAAATCATGTAGATACTCTCATGTTATGGCCCATCCAATGCCACCCCCAATGAGGGATATTCCCATGCAATACCCTGATATGGTTTACATGCCACCACCAGCACCCCTTGGAGTACCTATGATGATGCCTCCCCCTTCAGCCCCTGCAGCCTTTTCTGGTAATAACTACGGAGTGGAAGTTTGCAGGGACTACTTGAAGAACATGTGTAATAGAGAATCCTGCAGATTTGCACACCCGGATTTGAATAATGAGGTGATGAATACCCAAGTTGAAGTTTGCCGTGATTTTAAGCGAGGAGAATGCAATCGACCTGCCTGTCGCTTTTACCATCCACCTGCAAGCTCAAATTCTATTGGATAAATATTGAGTGCCCTGCCCTGCTGCCGCTGCTACCGCTCTGCTGCTGCTAAATCTGCTACTGCTGCCAAAGAGCTGCTGCGCTGGCTGTTGTGCTGCTTGCTAAGATGTCATAGACAATGAAAAGCCTAAAAAAGTTCTATGTAACAGAAGAGATTATCATCGTGTGATGTTTCAGAGGTTGCTTAAACTTGACTCAGTTCTTTCTCTCTTTAAAAA GGGGATTGCACGAGTGGTTGTGTACTAGCCTTCATAAAGATGTTTTAATTTTGAGTT]
[+] EMBL CB639945             [                                                                    AACCCCGACGCCGAAATCCCCAACACCGACGCCGCCGCCGCCGCCGACCCAGCTGCCGCCGCCCCAGCTGCCGCCGCCACCGACCCCGCCGCCGCTGGATCGCCGTCGCCCCCGCTCCCGCCACGCAAACGCCGCCTCTCCCCTACGCCCTCCCCCACCCGCCGCTCCTCCCGCTCCCGCTCCCGCTCCCCGCGCCGCGGCCGCAGCCGCAGCCGCTCCCGGAGCAGGAGCCGCGGGCGGAGCGCCAGCCCGCGGTACCCCGATGGGAAGCGGAGGCGGCACAACGACCTCAACGTCGAGGTGTGCCGCGACTTCCTCCGCGACAGGTGCGCCCGCGCCGACATCGAGTGCAAGTACGCGCACCCGCACCCCACCGTCGCCGTCGACAGGGACAGCAAGGTGACGGCGTGCGCGGACTCGCTGCGGAACAACTGCTTCCGGGGAAGGACCTGCCGCTACTACCACCCGCCCCCTCATATCCAGGAGTCATTATTGAGATCAATTGGTGGTGGAAGACCCAAAGGTGAAGATGCAGGTTTGCAGAGATTTTACACGTGGACGATGTTCAAGATCAGCAAACGAGTGCCGATTCTTGCACCATTCACCCCTTGNAGGATTGTGCAATTGTTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CB639961             [                                                                    AACCCCGACGCCGAAATCCCCAACACCGACGCCGCCGCCGCCGCCGACCCAGCTGCCGCCGCCCCAGCTGCCGCCGCCACCGACCCCGCCGCCGCTGGATCGCCGTCGCCCCCGCTCCCGCCACGCAAACGCCGCCTCTCCCCTACGCCCTCCCCCACCCGCCGCTCCTCCCGCTCCCGCTCCCGCTCCCCGCGCCGCGGCCGCAGCCGCAGCCGCTCCCGGAGCAGGAGCCGCGGGCGGAGCGCCAGCCCGCGGTACCCCGATGGGAAGCGGAGGCGGCACAACGACCTCAACGTCGAGGTGTGCCGCGACTTCCTCCGCGACAGGTGCGCCCGCGCCGACATCGAGTGCAAGTACGCGCACCCGCACCCCACCGTCGCCGTCGACAGGGACAGCAAGGTGACGGCGTGCGCGGACTCGCTGCGGAACAACTGCTTCCGGGGAAGGACCTGCCGCTACTACCACCCGCCCCCTCATATCCAGGAGTCATTATTGAGATCAATTGGT GTGGAAGACCCAAAGGTGAAGATGCAGGTTTGCAGAGATTTTACACGTGGACGATGTTCAAGATCAGCAAACGAGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CB659035             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTACACGTGGACGATGTCAAAGATCAGCAAACGAGTGCCGATTCTTGCACCATTCACCCCTTG AGGATTGTGCAATTGTTTGCCAAGATTTCTTGCGTGGGAGGTGTGATCGTAAATCATGTAGATACTCTCATGTTATGGCCCATCCAATGCCACCCCCAATGAGGGATATTCCCATGCAATACCCTGATATGGTTTACATGCCACCACCAGCACCCCTTGGAGTACCTATGATGATGCCTCCCCCTTCAGCCCCTGCAGCCTTTTCTGGTAATAACTACGGAGTGGAAGTTTGCAGGGACTACTTGAAGAACATGTGTAATAGAGAATCCTGCAGATTTGCACACCCGGATTTGAATAATGAGGTGATGAATACCCAAGTTGAAGTTTGCCGTGATTTTAAGCGAGGAGAATGCAATCGACCTGCCTGTCGCTTTTACCATCCACCTGCAAGCTCAAATTCTATTGGATAAATATTGAGTGCCCTGCCCTGCTGCCGCTGCTACCGCTCTGCTGCTGCTAAATCTGCTACTGCTGCCAAAGAGCTGCTGCGCTGGCTGTTGTGCTGCTTGCTAAGATGTCATAGACAATGAAAAGCCTAAAAAAGTTCTATGTAACAGAAGAGATTATCATCGTGTGATGTTTCAGAGGTTGCTTAAACTTGACTCAGTTCTTTCTCTCTTTAAAAACGGGGATTGCACGAGTGGTTGTGTACTAGCCTTCATACATATATGGGAATTTCGAG  ]


>consensus_7031#0 GAGCCCACCTCCCTCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCCTACCCTACCACCATGGCGTCCGCCG AGACCCCCAACCCCGACGCCGAAATCCCCAACACCGACGCCGCCGCCGCCGCCGACCCAG CTGCCGCCGCCCCAGCTGCCGCCGCCACCGACCCCGCCGCCGCTGGATCGCCGTCGCCCC CGCTCCCGCCACGCAAACGCCGCCTCTCCCCTACGCCCTCCCCCACCCGCCGCTCCTCCC GCTCCCGCTCCCGCTCCCCGCGCCGCGGCCGCAGCCGCAGCCGCTCCCGGAGCAGGAGCC GCGGGCGGAGCGCCAGCCCGCGGTACCCCGATGGGAAGCGGAGGCGGCACAACGACCTCA ACGTCGAGGTGTGCCGCGACTTCCTCCGCGACAGGTGCGCCCGCGCCGACATCGAGTGCA AGTACGCGCACCCGCACCCCACCGTCGCCGTCGACAGGGACAGCAAGGTGACGGCGTGCG CGGACTCGCTGCGGAACAACTGCTTCCGGGGAAGGACCTGCCGCTACTACCACCCGCCCC CTCATATCCAGGAGTCATTATTGAGATCAATTGGTGTGGAAGACCCAAAGGTGAAGATGC AGGTTTGCAGAGATTTTACACGTGGACGATGTTCAAGATCAGCAAACGAGTGCCGATTCT TGCACCATTCACCCCTTGAGGATTGTGCAATTGTTTGCCAAGATTTCTTGCGTGGGAGGT GTGATCGTAAATCATGTAGATACTCTCATGTTATGGCCCATCCAATGCCACCCCCAATGA GGGATATTCCCATGCAATACCCTGATATGGTTTACATGCCACCACCAGCACCCCTTGGAG TACCTATGATGATGCCTCCCCCTTCAGCCCCTGCAGCCTTTTCTGGTAATAACTACGGAG TGGAAGTTTGCAGGGACTACTTGAAGAACATGTGTAATAGAGAATCCTGCAGATTTGCAC ACCCGGATTTGAATAATGAGGTGATGAATACCCAAGTTGAAGTTTGCCGTGATTTTAAGC GAGGAGAATGCAATCGACCTGCCTGTCGCTTTTACCATCCACCTGCAAGCTCAAATTCTA TTGGATAAATATTGAGTGCCCTGCCCTGCTGCCGCTGCTACCGCTCTGCTGCTGCTAAAT CTGCTACTGCTGCCAAAGAGCTGCTGCGCTGGCTGTTGTGCTGCTTGCTAAGATGTCATA GACAATGAAAAGCCTAAAAAAGTTCTATGTAACAGAAGAGATTATCATCGTGTGATGTTT CAGAGGTTGCTTAAACTTGACTCAGTTCTTTCTCTCTTTAAAAAGGGGATTGCACGAGTG GTTGTGTACTAGCCTTCATAAAGATGTTTTAATTTTGAGTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)