These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7031#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1361 fasta sequence [GAGCCCACCTCCCTCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCCTACCCTACCACCATGGCGTCCGCCGAGACCCCCAACCCCGACGCCGAAATCCCCAACACCGACGCCGCCGCCGCCGCCGACCCAGCTGCCGCCGCCCCAGCTGCCGCCGCCACCGACCCCGCCGCCGCTGGATCGCCGTCGCCCCCGCTCCCGCCACGCAAACGCCGCCTCTCCCCTACGCCCTCCCCCACCCGCCGCTCCTCCCGCTCCCGCTCCCGCTCCCCGCGCCGCGGCCGCAGCCGCAGCCGCTCCCGGAGCAGGAGCCGCGGGCGGAGCGCCAGCCCGCGGTACCCCGATGGGAAGCGGAGGCGGCACAACGACCTCAACGTCGAGGTGTGCCGCGACTTCCTCCGCGACAGGTGCGCCCGCGCCGACATCGAGTGCAAGTACGCGCACCCGCACCCCACCGTCGCCGTCGACAGGGACAGCAAGGTGACGGCGTGCGCGGACTCGCTGCGGAACAACTGCTTCCGGGGAAGGACCTGCCGCTACTACCACCCGCCCCCTCATATCCAGGAGTCATTATTGAGATCAATTGGT-GTGGAAGACCCAAAGGTGAAGATGCAGGTTTGCAGAGATTTTACACGTGGACGATGTTCAAGATCAGCAAACGAGTGCCGATTCTTGCACCATTCACCCCTTG-AGGATTGTGCAATTGTTTGCCAAGATTTCTTGCGTGGGAGGTGTGATCGTAAATCATGTAGATACTCTCATGTTATGGCCCATCCAATGCCACCCCCAATGAGGGATATTCCCATGCAATACCCTGATATGGTTTACATGCCACCACCAGCACCCCTTGGAGTACCTATGATGATGCCTCCCCCTTCAGCCCCTGCAGCCTTTTCTGGTAATAACTACGGAGTGGAAGTTTGCAGGGACTACTTGAAGAACATGTGTAATAGAGAATCCTGCAGATTTGCACACCCGGATTTGAATAATGAGGTGATGAATACCCAAGTTGAAGTTTGCCGTGATTTTAAGCGAGGAGAATGCAATCGACCTGCCTGTCGCTTTTACCATCCACCTGCAAGCTCAAATTCTATTGGATAAATATTGAGTGCCCTGCCCTGCTGCCGCTGCTACCGCTCTGCTGCTGCTAAATCTGCTACTGCTGCCAAAGAGCTGCTGCGCTGGCTGTTGTGCTGCTTGCTAAGATGTCATAGACAATGAAAAGCCTAAAAAAGTTCTATGTAACAGAAGAGATTATCATCGTGTGATGTTTCAGAGGTTGCTTAAACTTGACTCAGTTCTTTCTCTCTTTAAAAA-GGGGATTGCACGAGTGGTTGTGTACTAGCCTTCATAAAGATGTTTTAATTTTGAGTT] [+] EMBL AK060634 [GAGCCCACCTCCCTCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCCTACCCTACCACCATGGCGTCCGCCGAGACCCCCAACCCCGACGCCGAAATCCCCAACACCGACGCCGCCGCCGCCGCCGACCCAGCTGCCGCCGCCCCAGCTGCCGCCGCCACCGACCCCGCCGCCGCTGGATCGCCGTCGCCCCCGCTCCCGCCACGCAAACGCCGCCTCTCCCCTACGCCCTCCCCCACCCGCCGCTCCTCCCGCTCCCGCTCCCGCTCCCCGCGCCGCGGCCGCAGCCGCAGCCGCTCCCGGAGCAGGAGCCGCGGGCGGAGCGCCAGCCCGCGGTACCCCGATGGGAAGCGGAGGCGGCACAACGACCTCAACGTCGAGGTGTGCCGCGACTTCCTCCGCGACAGGCGCGCCCGCGCCGACATCGAGTGCAAGTACGCGCACCCGCACCCCACCGTCGCCGTCGACAGGGACAGCAAGGTGACGGCGTGCGCGGACTCGCTGCGGAACAACTGCTTCCGGGGAAGGACCTGCCGCTACTACCACCCGCCCCCTCATATCCAGGAGTCATTATTGAGATCAATTGGT GTGGAAGACCCAAAGGTGAAGATGCAGGTTTGCAGAGATTTTACACGTGGACGATGTTCAAGATCAGCAAACGAGTGCCGATTCTTGCACCATTCACCCCTTG AGGATTGTGCAATTGTTTGCCAAGATTTCTTGCGTGGGAGGTGTGATCGTAAATCATGTAGATACTCTCATGTTATGGCCCATCCAATGCCACCCCCAATGAGGGATATTCCCATGCAATACCCTGATATGGTTTACATGCCACCACCAGCACCCCTTGGAGTACCTATGATGATGCCTCCCCCTTCAGCCCCTGCAGCCTTTTCTGGTAATAACTACGGAGTGGAAGTTTGCAGGGACTACTTGAAGAACATGTGTAATAGAGAATCCTGCAGATTTGCACACCCGGATTTGAATAATGAGGTGATGAATACCCAAGTTGAAGTTTGCCGTGATTTTAAGCGAGGAGAATGCAATCGACCTGCCTGTCGCTTTTACCATCCACCTGCAAGCTCAAATTCTATTGGATAAATATTGAGTGCCCTGCCCTGCTGCCGCTGCTACCGCTCTGCTGCTGCTAAATCTGCTACTGCTGCCAAAGAGCTGCTGCGCTGGCTGTTGTGCTGCTTGCTAAGATGTCATAGACAATGAAAAGCCTAAAAAAGTTCTATGTAACAGAAGAGATTATCATCGTGTGATGTTTCAGAGGTTGCTTAAACTTGACTCAGTTCTTTCTCTCTTTAAAAA GGGGATTGCACGAGTGGTTGTGTACTAGCCTTCATAAAGATGTTTTAATTTTGAGTT] [+] EMBL CB639945 [ AACCCCGACGCCGAAATCCCCAACACCGACGCCGCCGCCGCCGCCGACCCAGCTGCCGCCGCCCCAGCTGCCGCCGCCACCGACCCCGCCGCCGCTGGATCGCCGTCGCCCCCGCTCCCGCCACGCAAACGCCGCCTCTCCCCTACGCCCTCCCCCACCCGCCGCTCCTCCCGCTCCCGCTCCCGCTCCCCGCGCCGCGGCCGCAGCCGCAGCCGCTCCCGGAGCAGGAGCCGCGGGCGGAGCGCCAGCCCGCGGTACCCCGATGGGAAGCGGAGGCGGCACAACGACCTCAACGTCGAGGTGTGCCGCGACTTCCTCCGCGACAGGTGCGCCCGCGCCGACATCGAGTGCAAGTACGCGCACCCGCACCCCACCGTCGCCGTCGACAGGGACAGCAAGGTGACGGCGTGCGCGGACTCGCTGCGGAACAACTGCTTCCGGGGAAGGACCTGCCGCTACTACCACCCGCCCCCTCATATCCAGGAGTCATTATTGAGATCAATTGGTGGTGGAAGACCCAAAGGTGAAGATGCAGGTTTGCAGAGATTTTACACGTGGACGATGTTCAAGATCAGCAAACGAGTGCCGATTCTTGCACCATTCACCCCTTGNAGGATTGTGCAATTGTTTG ] [+] EMBL CB639961 [ AACCCCGACGCCGAAATCCCCAACACCGACGCCGCCGCCGCCGCCGACCCAGCTGCCGCCGCCCCAGCTGCCGCCGCCACCGACCCCGCCGCCGCTGGATCGCCGTCGCCCCCGCTCCCGCCACGCAAACGCCGCCTCTCCCCTACGCCCTCCCCCACCCGCCGCTCCTCCCGCTCCCGCTCCCGCTCCCCGCGCCGCGGCCGCAGCCGCAGCCGCTCCCGGAGCAGGAGCCGCGGGCGGAGCGCCAGCCCGCGGTACCCCGATGGGAAGCGGAGGCGGCACAACGACCTCAACGTCGAGGTGTGCCGCGACTTCCTCCGCGACAGGTGCGCCCGCGCCGACATCGAGTGCAAGTACGCGCACCCGCACCCCACCGTCGCCGTCGACAGGGACAGCAAGGTGACGGCGTGCGCGGACTCGCTGCGGAACAACTGCTTCCGGGGAAGGACCTGCCGCTACTACCACCCGCCCCCTCATATCCAGGAGTCATTATTGAGATCAATTGGT GTGGAAGACCCAAAGGTGAAGATGCAGGTTTGCAGAGATTTTACACGTGGACGATGTTCAAGATCAGCAAACGAGTG ] [-] EMBL CB659035 [ TTACACGTGGACGATGTCAAAGATCAGCAAACGAGTGCCGATTCTTGCACCATTCACCCCTTG AGGATTGTGCAATTGTTTGCCAAGATTTCTTGCGTGGGAGGTGTGATCGTAAATCATGTAGATACTCTCATGTTATGGCCCATCCAATGCCACCCCCAATGAGGGATATTCCCATGCAATACCCTGATATGGTTTACATGCCACCACCAGCACCCCTTGGAGTACCTATGATGATGCCTCCCCCTTCAGCCCCTGCAGCCTTTTCTGGTAATAACTACGGAGTGGAAGTTTGCAGGGACTACTTGAAGAACATGTGTAATAGAGAATCCTGCAGATTTGCACACCCGGATTTGAATAATGAGGTGATGAATACCCAAGTTGAAGTTTGCCGTGATTTTAAGCGAGGAGAATGCAATCGACCTGCCTGTCGCTTTTACCATCCACCTGCAAGCTCAAATTCTATTGGATAAATATTGAGTGCCCTGCCCTGCTGCCGCTGCTACCGCTCTGCTGCTGCTAAATCTGCTACTGCTGCCAAAGAGCTGCTGCGCTGGCTGTTGTGCTGCTTGCTAAGATGTCATAGACAATGAAAAGCCTAAAAAAGTTCTATGTAACAGAAGAGATTATCATCGTGTGATGTTTCAGAGGTTGCTTAAACTTGACTCAGTTCTTTCTCTCTTTAAAAACGGGGATTGCACGAGTGGTTGTGTACTAGCCTTCATACATATATGGGAATTTCGAG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||