cluster # 7053

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 7053 cluster # 7053 Sequences # 4 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7053#0 length = 3063 sequences # 4
consensusID : consensus_7053#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 3063
fasta sequence
                              [TTTTTTCGGCGATAGCCCACGAAGTTCGCCGTCTCCCCTCCACAAGTGCGTCACCGAGATCCTCCGCCGCCACCACCGCCGCATAGCCAACATCCGCCGCCGCAGCCGCCGCCGCCGCTGGTGCTACAGATCCGGCAGTCCCCAGCTTCGGCGGTGCCAAATCCGGCCTCAAGATGAGCCGGCGGCGCCTCCCACTCCAGGCGCTACCCCTTCCCTCCTCGCCGCCCCCTCCTCGCCGGCTCGTCCCTGCGTCAGGTCTCGGGTGAGGGCGACCGTACCCTGTTTCCCTTCTCCTCTGGCGCCTGCTGCCCCTTCCTTGCCCAAGCGCCGACTGCCTCCGCAGTGCCTCGTCGCAGCGACGACGGGTGAGCAGCACCGGCCAACAACGCGTCCCCTGCTCGCCCCTCCTCTTATGGCTGCAAATACCTTCCAGATCTGATGATTAGTCCTGCAAATCCCTCTCAGATATGATGCTTGATTTGTTCGTGAAGGTACGGTGCTACTCCTGTCTCCTGTGTCCGATTAATTAAGTTTGTTAGGTGTTAATTGTTGTGTGCATTAGTATTCTCCAGTGAGCCTGCAATGTTGTTATGTCCAGATGTGATGAGTCGGGCAAAGCTGAAGTGTCATTGCTATGTTTATTATACCTTGCCAGGGCAAGCTAAACTGTTGATGCATGTTAGTAGCTTATTATTAAAGGAACTCATCGAGTAGTAGTAATTTTTCTCAATATACAGAAACGAACCCATGCACTTTGCTGGAAGGGACACCTAGACTTTGCCTGTTTTTCAGTGCTACGACTAAATAATTTATATTTCTCAGTGGTACTACCGAATAAGTTAATCTCATGATTTTTTTTCCCTGAGATTGATCAGTGATTTCTACTTATATATTTATTCCTTTTGAATATTCTAAATGATGTGATTTGTAAAGTAAGGTCATAGCTCAGTTATACTTTAGCGTGGTTGTTTCTTTATCAACAGGAGTTAGGAATGAAATAAGTGAGTTTTGATGTAGCTCAACTCAATGTAGTACAAATAACTGCTCAAGTGATTTTTTTTCTCTTTTGAGAATGGGACAATGCACAGATTAGTATGAGTGCATTCTCCAATTGCTTCCTAGTAAAATTTCTGCACCATGGTTATCACTCCTCCAAATATGATTCTGCCCTCTTGATAAAAAAATATTGTCTTCAGGTTTGCTTTGCATAAATTTTAGATTTTTCTTGATTGCATATTATTGCTATATGGCACTGAACAATGAAATTTATTTCTAAATTTGTAGGAAGTCTGAAAATATCTAAACATAAGTCAGAAACTAATGTACATGTCCAGATTGAGCCCTGGGTTATTCCCTGTACTTTACCCATTCTCCTTATCTACTTGTCTTGAAAATTAATGAGACATCACCAGCAATTCTTTGTATGATTTTGGCCATGTTACTCATGGTTTAAATGGAGCTGCTGGCGTCTCTT-AAAAAATAATTTGGTCATGCACTATAGAAGAAAATCATGGTGTTTGTTTCTGCTTTTTTTCTTGTCTCTGGAGGTAATATATTGTTGGCTCAGATTGTCAGACAGATTTTGCATACTTCATTGTTGACGGCCCGAGGAGTCGGGGAGTGGATGATGTTGTGGTCGGTCGCCGTTGTCTGCAGCTTCTGGGAAGGCTCATTCTGATCATACTTACCCTTGTGCTTCCACCTAGTTTTAATTAGGTGATGATGTTCGTTTGAGTTTATAAAATTTATAAAATTTTATAAAACTTATAATAGAACTTTTATCTGTTTATATATTCCTGTTCACTGAGTAAACATTCTGTGGCATTTTAGTTGATTTTTCTTATCTTTTGCTGATCAGATATGCTCATTTTACATAAGATGGCTACTCATCTTATCTTACATAAATTGCATATATGGAGTATAAGCTATAAGCTTATATGTGTGTTACTTTATTCTGGTTCAGAGATTAAAAACTCAAGCCCTCGAGATAAAATCCAAGTAGCTGTAAGGTAAAATGGAAGAGATGAAATAAAGGTGGTCTCATTAGTACTACTTTTATTTTGTCTAAACTCTAAAGTACAAATCTAGAAGGAAGATGCTGCTGGTTATTGGTTATGAATTGGCATAAACCTATGAGCATATAACATTATTCTTCGACCGAAAGAATAACACACTCCTGTCTATCACCAAATAGTACCGTCCTAACCCCTAAAAAAGGTATTGATCATGAGTAATGACACACTTATTTGATTGGCAAGACTTTTATGGTCATTGTGAGGTACAGAGAGGTATTTTTTGATTGTCAAGAAACATTTATTTTGGGATGCCTTTTGCATTTTTGTACAGGAGACATGCCCCTTTCTTATTGTAAGATTTGTTAGCATCTGTTTGAGCATATGATTTGTATAGCTATTTCTTCTATGTACAAGGCATTTTTTATTAAATGGATAGTGCAAGATTTAGAATGTGAGCATTGGGAACTATTGCAAGTTTTTGCCTTGTAACTACAACTTTAACTACAAGTGAAATCCCCCTGTCACATGGAAGCTAAGTTAGTCTTCAGTATTTGTAGTACTCATTGAGCTTGTAGTGCTCGATACTAATGCATTTCTGTTTGACCAGTAGGGAATCGAATTTGTTTGAACTATATAGTTATATTCCATACAAGCAATTCCTTTTTGCATCGATTTTATGCTTGCCTCTTATCGAAAGAGCTTCTCCTTTTCTTATCTCAGCTATACCTTATATATCTGACTTGTATATCTGAGCAATACACTTTATTTACATTACAGGTGATGTATCATGTGAACTTTTGACAAGGGTGAAGCGTGTACCCGTGTTCTCCATTTCGATGCTTTTTAGGATATTTTCTACTATTATGTGTATGTAATCTATATACGACATGTAAGCCCGGATAAAATAGCGATTTTAGCATCTTTTTCCTTGCATACCATTATGACTCATCTTTTGTCATTTAAAATGCGCTAGTGCACTCTGATGTTATTGTATGTTGAATTATGTAATCTACTAAAATGTGTGCGAGGGCTCCATGCATGTCACAGT]

[+] EMBL AK100385             [TTTTTTCGGCGATAGCCCACGAAGTTCGCCGTCTCCCCTCCACAAGTGCGTCACCGAGATCCTCCGCCGCCACCACCGCCGCATAGCCAACATCCGCCGCCGCAGCCGCCGCCGCCGCTGGTGCTACAGATCCGGCAGTCCCCAGCTTCGGCGGTGCCAAATCCGGCCTCAAGATGAGCCGGCGGCGCCTCCCACTCCAGGCGCTACCCCTTCCCTCCTCGCCGCCCCCTCCTCGCCGGCTCGTCCCTGCGTCAGGTCTCGGGTGAGGGCGACCGTACCCTGTTTCCCTTCTCCTCTGGCGCCTGCTGCCCCTTCCTTGCCCAAGCGCCGACTGCCTCCGCAGTGCCTCGTCGCAGCGACGACGGGTGAGCAGCACCGGCCAACAACGCGTCCCCTGCTCGCCCCTCCTCTTATGGCTGCAAATACCTTCCAGATCTGATGATTAGTCCTGCAAATCCCTCTCAGATATGATGCTTGATTTGTTCGTGAAGGTACGGTGCTACTCCTGTCTCCTGTGTCCGATTAATTAAGTTTGTTAGGTGTTAATTGTTGTGTGCATTAGTATTCTCCAGTGAGCCTGCAATGTTGTTATGTCCAGATGTGATGAGTCGGGCAAAGCTGAAGTGTCATTGCTATGTTTATTATACCTTGCCAGGGCAAGCTAAACTGTTGATGCATGTTAGTAGCTTATTATTAAAGGAACTCATCGAGTAGTAGTAATTTTTCTCAATATACAGAAACGAACCCATGCACTTTGCTGGAAGGGACACCTAGACTTTGCCTGTTTTTCAGTGCTACGACTAAATAATTTATATTTCTCAGTGGTACTACCGAATAAGTTAATCTCATGATTTTTTTTCCCTGAGATTGATCAGTGATTTCTACTTATATATTTATTCCTTTTGAATATTCTAAATGATGTGATTTGTAAAGTAAGGTCATAGCTCAGTTATACTTTAGCGTGGTTGTTTCTTTATCAACAGGAGTTAGGAATGAAATAAGTGAGTTTTGATGTAGCTCAACTCAATGTAGTACAAATAACTGCTCAAGTGATTTTTTTTCTCTTTTGAGAATGGGACAATGCACAGATTAGTATGAGTGCATTCTCCAATTGCTTCCTAGTAAAATTTCTGCACCATGGTTATCACTCCTCCAAATATGATTCTGCCCTCTTGATAAAAAAATATTGTCTTCAGGTTTGCTTTGCATAAATTTTAGATTTTTCTTGATTGCATATTATTGCTATATGGCACTGAACAATGAAATTTATTTCTAAATTTGTAGGAAGTCTGAAAATATCTAAACATAAGTCAGAAACTAATGTACATGTCCAGATTGAGCCCTGGGTTATTCCCTGTACTTTACCCATTCTCCTTATCTACTTGTCTTGAAAATTAATGAGACATCACCAGCAATTCTTTGTATGATTTTGGCCATGTTACTCATGGTTTAAATGGAGCTGCTGGCGTCTCTTAAAAAAATAATTTGGTCATGCACTATAGAAGAAAATCATGGTGTTTGTTTCTGCTTTTTTTCTTGTCTCTGGAGGTAATATATTGTTGGCTCAGATTGTCAGACAGATTTTGCATACTTCATTGTTGACGGCCCGAGGAGTCGGGGAGTGGATGATGTTGTGGTCGGTCGCCGTTGTCTGCAGCTTCTGGGAAGGCTCATTCTGATCATACTTACCCTTGTGCTTCCACCTAGTTTTAATTAGGTGATGATGTTCGTTTGAGTTTATAAAATTTATAAAATTTTATAAAACTTATAATAGAACTTTTATCTGTTTATATATTCCTGTTCACTGAGTAAACATTCTGTGGCATTTTAGTTGATTTTTCTTATCTTTTGCTGATCAGATATGCTCATTTTACATAAGATGGCTACTCATCTTATCTTACATAAATTGCATATATGGAGTATAAGCTATAAGCTTATATGTGTGTTACTTTATTCTGGTTCAGAGATTAAAAACTCAAGCCCTCGAGATAAAATCCAAGTAGCTGTAAGGTAAAATGGAAGAGATGAAATAAAGGTGGTCTCATTAGTACTACTTTTATTTTGTCTAAACTCTAAAGTACAAATCTAGAAGGAAGATGCTGCTGGTTATTGGTTATGAATTGGCATAAACCTATGAGCATATAACATTATTCTTCGACCGAAAGAATAACACACTCCTGTCTATCACCAAATAGTACCGTCCTAACCCCTAAAAAAGGTATTGATCATGAGTAATGACACACTTATTTGATTGGCAAGACTTTTATGGTCATTGTGAGGTACAGAGAGGTATTTTTTGATTGTCAAGAAACATTTATTTTGGGATGCCTTTTGCATTTTTGTACAGGAGACATGCCCCTTTCTTATTGTAAGATTTGTTAGCATCTGTTTGAGCATATGATTTGTATAGCTATTTCTTCTATGTACAAGGCATTTTTTATTAAATGGATAGTGCAAGATTTAGAATGTGAGCATTGGGAACTATTGCAAGTTTTTGCCTTGTAACTACAACTTTAACTACAAGTGAAATCCCCCTGTCACATGGAAGCTAAGTTAGTCTTCAGTATTTGTAGTACTCATTGAGCTTGTAGTGCTCGATACTAATGCATTTCTGTTTGACCAGTAGGGAATCGAATTTGTTTGAACTATATAGTTATATTCCATACAAGCAATTCCTTTTTGCATCGATTTTATGCTTGCCTCTTATCGAAAGAGCTTCTCCTTTTCTTATCTCAGCTATACCTTATATATCTGACTTGTATATCTGAGCAATACACTTTATTTACATTACAGGTGATGTATCATGTGAACTTTTGACAAGGGTGAAGCGTGTACCCGTGTTCTCCATTTCGATGCTTTTTAGGATATTTTCTACTATTATGTGTATGTAATCTATATACGACATGTAAGCCCGGATAAAATAGCGATTTTAGCATCTTTTTCCTTGCATACCATTATGACTCATCTTTTGTCATTTAAAATGCGCTAGTGCACTCTGATGTTATTGTATGTTGAATTATGTAATCTACTAAAATGTGTGCGAGGGCTCCATGCATGTCACAGT]
[+] EMBL CF306505             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CCGCAGTGCCTCGTCGCAGCGACGACGGGTGAGCAGCACCGGCCAACAACGCGTCCCCTGCTCGCCCCTCCTCTTATGGCTGCAAATACCTTCCAGATCTGATGATTAGTCCTGCAAATCCCTCTCAGATATGATGCTTGATTTGTTCGTGAAGGTACGGTGCTACTCCTGTCTCCTGTGTCCGATTAATTAAGTTTGTTAGGTGTTAATTGTTGTGTGCATTAGTATTCTCCAGTGAGCCTGCAATGTTGTTATGTCCAGATGTGATGAGTCGGGCAAAGCTGAAGTGTCATTGCTATGTTTATTATACCTTGCCAGGGCAAGCTAAACTGTTGATGCATGTTAGTAGCTTATTATTAAAGGAACTCATCGAGTAGTAGTAATTTTTCTCAATATACAGAAACGAACCCATGCACTTTGCTGGAAGGGACACCTAGACTTTGCCTGTTTTTCAGTGCTACGACTAAATAATTTATATTTCTCAGTGGTACTACCGAATAAGTTAATCTCATGATTTTTTTTCCCTGAGATTGATCAGTGATTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CB641214             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AGCTGCTGGCGTCTCTT AAAAAATAATTTGGTCATGCACTATAGAAGAAAATCATGGTGTTTGTTTCTGCTTTTTTTCTTGTCTCTGGAGGTAATATATTGTTGGCTCAGATTGTCAGACAGATTTTGCATACTTCATTGTTGACGGCCCGAGGAGTCGGGGAGTGGATGATGTTGTGGTCGGTCGCCGTTGTCTGCAGCTTCTGGGAAGGCTCATTCTGATCATACTTACCCTTGTGCTTCCACCTAGTTTTAATTAGGTGATGATGTTCGTTTGAGTTTATAAAATTTATAAAATTTTATAAAACTTATAATAGAACTTTTATCTGTTTATATATTCCTGTTCACTGAGTAAACATTCTGTGGCATTTTAGTTGATTTTTCTTATCTTTTGCTGATCAGATATGCTCATTTTACATAAGATGGCTACTCATCTTATCTTACATAAATTGCATATATGGAGTATAAGCTATAAGCTTATATGTGTGTTACTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CB641276             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AGCTGCTGGCGTCTCTT AAAAAATAATTTGGTCATGCACTATAGAAGAAAATCATGGTGTTTGTTTCTGCTTTTTTTCTTGTCTCTGGAGGTAATATATTGTTGGCTCAGATTGTCAGACAGATTTTGCATACTTCATTGTTGACGGCCCGAGGAGTCGGGGAGTGGATGATGTTGTGGTCGGTCTCTTTTGTTTGCAGCTTCTGGGAAGGCTCATTCTGATCATACTTACCCTTGTGCTTCCACCTACCCCTAATTAGGTGATGATGTTCGTTTGAGTTTATAAAATTTATAAAATTTTATAAAACTTATAATAGAACTTTTATCTGTCTATATATTCCTGTTCACTGAGTAAACATTCTGTGGCATTTCAGTTGATTTTTCTTATCTTTTGCTGATCAGATATGCTCATTTTACATAAGATGGCTACTCATCTTAccc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]




>consensus_7053#0
TTTTTTCGGCGATAGCCCACGAAGTTCGCCGTCTCCCCTCCACAAGTGCGTCACCGAGAT
CCTCCGCCGCCACCACCGCCGCATAGCCAACATCCGCCGCCGCAGCCGCCGCCGCCGCTG
GTGCTACAGATCCGGCAGTCCCCAGCTTCGGCGGTGCCAAATCCGGCCTCAAGATGAGCC
GGCGGCGCCTCCCACTCCAGGCGCTACCCCTTCCCTCCTCGCCGCCCCCTCCTCGCCGGC
TCGTCCCTGCGTCAGGTCTCGGGTGAGGGCGACCGTACCCTGTTTCCCTTCTCCTCTGGC
GCCTGCTGCCCCTTCCTTGCCCAAGCGCCGACTGCCTCCGCAGTGCCTCGTCGCAGCGAC
GACGGGTGAGCAGCACCGGCCAACAACGCGTCCCCTGCTCGCCCCTCCTCTTATGGCTGC
AAATACCTTCCAGATCTGATGATTAGTCCTGCAAATCCCTCTCAGATATGATGCTTGATT
TGTTCGTGAAGGTACGGTGCTACTCCTGTCTCCTGTGTCCGATTAATTAAGTTTGTTAGG
TGTTAATTGTTGTGTGCATTAGTATTCTCCAGTGAGCCTGCAATGTTGTTATGTCCAGAT
GTGATGAGTCGGGCAAAGCTGAAGTGTCATTGCTATGTTTATTATACCTTGCCAGGGCAA
GCTAAACTGTTGATGCATGTTAGTAGCTTATTATTAAAGGAACTCATCGAGTAGTAGTAA
TTTTTCTCAATATACAGAAACGAACCCATGCACTTTGCTGGAAGGGACACCTAGACTTTG
CCTGTTTTTCAGTGCTACGACTAAATAATTTATATTTCTCAGTGGTACTACCGAATAAGT
TAATCTCATGATTTTTTTTCCCTGAGATTGATCAGTGATTTCTACTTATATATTTATTCC
TTTTGAATATTCTAAATGATGTGATTTGTAAAGTAAGGTCATAGCTCAGTTATACTTTAG
CGTGGTTGTTTCTTTATCAACAGGAGTTAGGAATGAAATAAGTGAGTTTTGATGTAGCTC
AACTCAATGTAGTACAAATAACTGCTCAAGTGATTTTTTTTCTCTTTTGAGAATGGGACA
ATGCACAGATTAGTATGAGTGCATTCTCCAATTGCTTCCTAGTAAAATTTCTGCACCATG
GTTATCACTCCTCCAAATATGATTCTGCCCTCTTGATAAAAAAATATTGTCTTCAGGTTT
GCTTTGCATAAATTTTAGATTTTTCTTGATTGCATATTATTGCTATATGGCACTGAACAA
TGAAATTTATTTCTAAATTTGTAGGAAGTCTGAAAATATCTAAACATAAGTCAGAAACTA
ATGTACATGTCCAGATTGAGCCCTGGGTTATTCCCTGTACTTTACCCATTCTCCTTATCT
ACTTGTCTTGAAAATTAATGAGACATCACCAGCAATTCTTTGTATGATTTTGGCCATGTT
ACTCATGGTTTAAATGGAGCTGCTGGCGTCTCTTAAAAAATAATTTGGTCATGCACTATA
GAAGAAAATCATGGTGTTTGTTTCTGCTTTTTTTCTTGTCTCTGGAGGTAATATATTGTT
GGCTCAGATTGTCAGACAGATTTTGCATACTTCATTGTTGACGGCCCGAGGAGTCGGGGA
GTGGATGATGTTGTGGTCGGTCGCCGTTGTCTGCAGCTTCTGGGAAGGCTCATTCTGATC
ATACTTACCCTTGTGCTTCCACCTAGTTTTAATTAGGTGATGATGTTCGTTTGAGTTTAT
AAAATTTATAAAATTTTATAAAACTTATAATAGAACTTTTATCTGTTTATATATTCCTGT
TCACTGAGTAAACATTCTGTGGCATTTTAGTTGATTTTTCTTATCTTTTGCTGATCAGAT
ATGCTCATTTTACATAAGATGGCTACTCATCTTATCTTACATAAATTGCATATATGGAGT
ATAAGCTATAAGCTTATATGTGTGTTACTTTATTCTGGTTCAGAGATTAAAAACTCAAGC
CCTCGAGATAAAATCCAAGTAGCTGTAAGGTAAAATGGAAGAGATGAAATAAAGGTGGTC
TCATTAGTACTACTTTTATTTTGTCTAAACTCTAAAGTACAAATCTAGAAGGAAGATGCT
GCTGGTTATTGGTTATGAATTGGCATAAACCTATGAGCATATAACATTATTCTTCGACCG
AAAGAATAACACACTCCTGTCTATCACCAAATAGTACCGTCCTAACCCCTAAAAAAGGTA
TTGATCATGAGTAATGACACACTTATTTGATTGGCAAGACTTTTATGGTCATTGTGAGGT
ACAGAGAGGTATTTTTTGATTGTCAAGAAACATTTATTTTGGGATGCCTTTTGCATTTTT
GTACAGGAGACATGCCCCTTTCTTATTGTAAGATTTGTTAGCATCTGTTTGAGCATATGA
TTTGTATAGCTATTTCTTCTATGTACAAGGCATTTTTTATTAAATGGATAGTGCAAGATT
TAGAATGTGAGCATTGGGAACTATTGCAAGTTTTTGCCTTGTAACTACAACTTTAACTAC
AAGTGAAATCCCCCTGTCACATGGAAGCTAAGTTAGTCTTCAGTATTTGTAGTACTCATT
GAGCTTGTAGTGCTCGATACTAATGCATTTCTGTTTGACCAGTAGGGAATCGAATTTGTT
TGAACTATATAGTTATATTCCATACAAGCAATTCCTTTTTGCATCGATTTTATGCTTGCC
TCTTATCGAAAGAGCTTCTCCTTTTCTTATCTCAGCTATACCTTATATATCTGACTTGTA
TATCTGAGCAATACACTTTATTTACATTACAGGTGATGTATCATGTGAACTTTTGACAAG
GGTGAAGCGTGTACCCGTGTTCTCCATTTCGATGCTTTTTAGGATATTTTCTACTATTAT
GTGTATGTAATCTATATACGACATGTAAGCCCGGATAAAATAGCGATTTTAGCATCTTTT
TCCTTGCATACCATTATGACTCATCTTTTGTCATTTAAAATGCGCTAGTGCACTCTGATG
TTATTGTATGTTGAATTATGTAATCTACTAAAATGTGTGCGAGGGCTCCATGCATGTCAC
AGT
clustalw multiple alignements is not computed in this case