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Oryza sativa
cluster # 7094 cluster # 7094       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7094#0 length = 951 sequences # 4  

consensusID : consensus_7094#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 951
fasta sequence
                              [CAACAGTATAGCTGAGATTGGTCATCTGACATCCTTATCTCCCTCTCCCTCCAAGTGCCTAACCCAACTCTTCCCGAGCCTTTTTCTGATCATTGGACAAATGGCCGTCTCTTCAGCCGTTCTCGTTGGGCTACTCGTCGTGAGTTGCGCCGCGGTGGCCGCAGCCACGAGGTACACCGTCGGCGACGGCGAGGGCTGGACGACCGGCGTCAACTACAACAACTGGGCCAACGGCAAGTTTTTCAGACAAGGAGACGAACTCGTGTTCAACTACCAGGCGAGGGCGCACACGGTGACGGAGGTGAGCCAGACCAACTTCGACAGCTGCAACGGCAACAGCCCGCTGAGCAACGACAACGGGGGATCGACCACCATCAGGCTCTCCTACCCGGGCATGCACTACTTCATCTGCACCATCCCCGGCCACTGCAGCAGCGGCATGAAGCTCGCCGTGAACGTCAACGGTGACCCGTCGTACTCTGCCGCCTCTTCGCCGGCGGCGGCGAGCGCTGTCGCCGCCGCGGCAGCGGGGGCCCTGATCAAGCTCGCGCTGTTCTGATGGCCGCGGTGCATGCGAGCCAGGGTAGAGACAGTGCGTGGAAGCCATGCAGGTTCTTGTCGATCGGCCGTTGCACGTTGGTGACTCGTGCAATGAAGCTGACCGTGTTTCTTCTCGTTTCTCGTGTGATTT-GGTCACCGTGCAACTCGTATGTAGTAAT-CACCTTAGTTTGTTGTGGTGATTCTAAATTT-GCTTGTGCCA-CTGG-TGTATCGTCGTGTCT-GGGGGCTCTGGTTATGCATGCCATGGTTTGTGTTGGTGAAATTTCTTATGGTGGGTATAAATAAAACCAAGCATGTTAAAAACATGCTGGTGGTAATGGTATAGTCGTGGTTGTATAACTATACCGAAGTTTAATTACTTGACCTTTGTAATCACAGCTTGACCCCTCAAAA]

[+] EMBL AK059930             [CAACAGTATAGCTGAGATTGGTCATCTGACATCCTTATCTCCCTCTCCCTCCAAGTGCCTAACCCAACTCTTCCCGAGCCTTTTTCTGATCATTGGACAAATGGCCGTCTCTTCAGCCGTTCTCGTTGGGCTACTCGTCGTGAGTTGCGCCGCGGTGGCCGCAGCCACGAGGTACACCGTCGGCGACGGCGAGGGCTGGACGACCGGCGTCAACTACAACAACTGGGCCAACGGCAAGTTTTTCAGACAAGGAGACGAACTCGTGTTCAACTACCAGGCGAGGGCGCACACGGTGACGGAGGTGAGCCAGACCAACTTCGACAGCTGCAACGGCAACAGCCCGCTGAGCAACGACAACGGGGGATCGACCACCATCAGGCTCTCCTACCCGGGCATGCACTACTTCATCTGCACCATCCCCGGCCACTGCAGCAGCGGCATGAAGCTCGCCGTGAACGTCAACGGTGACCCGTCGTACTCTGCCGCCTCTTCGCCGGCGGCGGCGAGCGCTGTCGCCGCCGCGGCAGCGGGGGCCCTGATCAAGCTCGCGCTGTTCTGATGGCCGCGGTGCATGCGAGCCAGGGTAGAGACAGTGCGTGGAAGCCATGCAGGTTCTTGTCGATCGGCCGTTGCACGTTGGTGACTCGTGCAATGAAGCTGACCGTGTTTCTTCTCGTTTCTCGTGTGATTT GGTCACCGTGCAACTCGTATGTAGTAAT CACCTTAGTTTGTTGTGGTGATTCTAAATTT GCTTGTGCCA CTGG TGTATCGTCGTGTCT GGGGGCTCTGGTTATGCATGCCATGGTTTGTGTTGGTGAAATTTCTTATGGTGGGTATAAATAAAACCAAGCATGTTAAAAACATGCTGGTGGTAATGGTATAGTCGTGGTTGTATAACTATACCGAAGTTTAATTACTTGACCTTTGTAATCACAGCTTGACCCCTC    ]
[+] EMBL BI806427             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GACC CCATCAGGCTCTCC ACCC GGCATGCACTACTTCATCT CACCAT CCCAGCCACTGCATCA CGTCATGAAGCTC CCGTGAACGTCAAC  TGACCC TC TACTCGTCCNCCTCTTCNCC GC GCGGCGAGC CTGTCNCCGCAAC GCA CGGGGGCCCTGATCAAGCTCGCGCTGTTCTGAT GCCCCGGTGCATGCGAGCCAGGGTAGAGACAGTGCGTGGAAGCCAT CAGGTTCTTGTCGATCGGCCGTTGCACGTTGGTGACTCGTGC ATGAAGCTGACCGTGTTTCTTCTCGTTTCTCGTGTGATTTGGGTCACCGTGC ACTCGTATGTAGTAATGCACCTTAGTTTGTTGTGGGGATTCTAAATTTGGCTTGTGCCACCTGGTTGTATCGTCGTGTCTCGGGGGCTCTGGTTATGCATGCCATGGTTTGTGTTGGTGAAATTTCTTATGGTGGGTATAAATAAAACCAAGCATGTTAAAAACATGCTGGTGGTAATGGTATAGTCGTGGTTGTATAACTATACCGAAGTTTAATTACTTGACCTTTGTAATCACAGCTTGACCCCTCAAAA]
[+] EMBL CB682676             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CATGAAGCTCGCCGTGAACGTCAACGGTGACCCGTCGTACTCTGCCGCCTCTTCGCCGGCGGCGGCGAGCGCTGTCGCCGCCGCGGCAGCGGGGGCCCTGATCAAGCTCGCGCTGTTCTGATGGCCGCGGTGCATGCGAGCCAGGGTAGAGACAGTGCGTGGAAGCCATGCAGGTTCTTGTCGATCGGCCGTTGCACGTTGGTGACTCGTGCAATGAAGCTGACCGTGTTTCTTCTCGTTTCTCGTGTGATTT GGTCACCGTGCAACTCGTATGTAGTAAT CACCTTAGTTTGTTGTGGTGATTCTAAATTT GCTTGTGCCA CTGG TGTATCGTCGTGTCT GGGGGCTCTGGTTATGCATGCCATGGTTTGTGTTGGTGAAATTTCTTATGGTGGGTATAAATAAAACCAAGCATGTTAAAAACATGCTGGTGGTAATGGTATAGTCGTGGGTGTATAACTAT                                                  ]
[+] EMBL CA757919             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCTGCCGCCTCTTCGCCGGCGGCTGCGAGCGCTGTCGCCGCCGCGGCAGCGGGGGCCCTGATCAAGCTCGCGCTGTTCTGATGGCCGCGGTGCATGCGAGCCAGGGTAGAGACAGTGCGTGGAAGCCATGCAGGTTCTTGTCGATCGGCCGTTGCACGTTGGTGACTCGTGCAATGAAGCTGACCGTGTTTCTTCTCGTTTCTCGTGTGATTT GGTCACCGTGCAACTCGTATGTAGTAAT CACGTTAGTTTGTTGTGGTGATTCTAAATTT GCTTGTGCCA CTGG TGTATCGTCGTGTCT GGGGGCTCTGGTTATGCATGCCATGGTTTGTGTTGGTGAAATTTCTTATGGTGGGTATAAATAAAACCAAGCATGTTAAAAACATGCTGGTGGTAATGGTATAGTCGTGGTTGTATAACTATACCGGAGTTT                                        ]


>consensus_7094#0 CAACAGTATAGCTGAGATTGGTCATCTGACATCCTTATCTCCCTCTCCCTCCAAGTGCCT AACCCAACTCTTCCCGAGCCTTTTTCTGATCATTGGACAAATGGCCGTCTCTTCAGCCGT TCTCGTTGGGCTACTCGTCGTGAGTTGCGCCGCGGTGGCCGCAGCCACGAGGTACACCGT CGGCGACGGCGAGGGCTGGACGACCGGCGTCAACTACAACAACTGGGCCAACGGCAAGTT TTTCAGACAAGGAGACGAACTCGTGTTCAACTACCAGGCGAGGGCGCACACGGTGACGGA GGTGAGCCAGACCAACTTCGACAGCTGCAACGGCAACAGCCCGCTGAGCAACGACAACGG GGGATCGACCACCATCAGGCTCTCCTACCCGGGCATGCACTACTTCATCTGCACCATCCC CGGCCACTGCAGCAGCGGCATGAAGCTCGCCGTGAACGTCAACGGTGACCCGTCGTACTC TGCCGCCTCTTCGCCGGCGGCGGCGAGCGCTGTCGCCGCCGCGGCAGCGGGGGCCCTGAT CAAGCTCGCGCTGTTCTGATGGCCGCGGTGCATGCGAGCCAGGGTAGAGACAGTGCGTGG AAGCCATGCAGGTTCTTGTCGATCGGCCGTTGCACGTTGGTGACTCGTGCAATGAAGCTG ACCGTGTTTCTTCTCGTTTCTCGTGTGATTTGGTCACCGTGCAACTCGTATGTAGTAATC ACCTTAGTTTGTTGTGGTGATTCTAAATTTGCTTGTGCCACTGGTGTATCGTCGTGTCTG GGGGCTCTGGTTATGCATGCCATGGTTTGTGTTGGTGAAATTTCTTATGGTGGGTATAAA TAAAACCAAGCATGTTAAAAACATGCTGGTGGTAATGGTATAGTCGTGGTTGTATAACTA TACCGAAGTTTAATTACTTGACCTTTGTAATCACAGCTTGACCCCTCAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)