cluster # 7135

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 7135 cluster # 7135 Sequences # 4 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7135#0 length = 1593 sequences # 4
consensusID : consensus_7135#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1593
fasta sequence
                              [CACCTCCCCGGCGCGGGCGGCGGCCTGGACCTTCGCCGCCGCCACATGCGTCAAGCTCCTGCTCGTCCCCACCTACCGCTCCACCGACTTCGACGTGCACCGCTACTGGCTCGCCCTCACCCACGCCCTCCCCGCGCGGCGGTGGTACACCGACGCCTCGTCGCAGTGGACGCTCGACTACCCGCCCTTCTTCGCCTACTTCTCCCGCCTCCTCGCCCTCCCGGCGCCCCTCGTCGACGCCTCCCTCGTCTCCCTCCCCGTCCCCGACGCGCCGCCCTCCTTCGCCTACCTCCTCTACCTCCGCCTCACCGTCGCCTTCTCCGACCTCCTCCTCCTCCTCTCCTCCGTCCTCCTGCTGGCCACGGACGCGCTCACGCGGCGGCGGCGGCGGCCGTTCCTCTCCCTCGCGCTCGTCCTCTGGTCGCCGGCGCTGCTCGCCGTGGACCACGTACACTTCCAGTACAACGGGTTCCTGATGGGGCTGCTGCTGCTGTCGCTGCACTTCCTTGAGCAGGGGAGGGATCTCGCCGGCGGAGTCGTTTTTGCTGCTCTGCTGTGCTCGAAGCACCTGTTCCTAGTGGCGGCGCCGGTCTACTTCGTGTATCTTTTCCGGCATTATTGCTGTGGCCGGGGTGTGGTGAGGGGATTGGGAAGGTTGGTGCTGATGGGGGCTGGTGTGGCTGCTGTGTTTGCTGCTGCATTTGTGCCCTTCCTGTACTATGGGCAGATGCAACAGCTCTTTAACCGGTTGTTTCCCTTTGGTCGAGGCCTGTGCCATGCTTATTGGGCGCCAAATTTTTGGGTATTCTACATTTTACTTGACAAGATCTTCGCGTTTCTTCTTAGAAGACTAGGCTTCAACATCCAGATACCTGAAGCTTCATTTACCGGGGGGCTTGTTGGTAATTCGTCTCCTTTTGCTGTTCTTCCCAAGGTCACTCCAATAACTACATTTTTATTGGTCATACTTGCTATGTCTCCTTGCCTCATGAAAGCATTCTCTAAACCCCAGCCAAGGCACATTATTAGATGGGTGTCATATGCAACTACATGTGGGTTTATGTTTGGATGGCATGTACATGAGAAGGCATCACTCCATTTCACTATTCCGCTTGCCCTAATTGCCATGGATAGCTTGGAGGACGCGAAGCATTATTTTGTGTTGTCAATAGTTTCATGTTATTCATTGTTCCCATTGTTGTTTGAGAACCAAGAATATCCTATAAAGGTTATGCTTCTGTTGACCTATGCTACCCTCATGTGGGTAGGATTTTCTTCCCATTTTGCTGCAAAATCTCCTCAAGAAGGGAAGAAAGTAAATGAATCAGGCAGCGTGGTCAGGAAAAATAGCTTCATTGGGTGGATCAGTTTTAGCTATCTTTTAGGAATTGTTGCTATAGAATTATGGTCTCAAGTATTCCACCACTATGTATTTGGCAGCAGATTTCCTTTCCTACCTCTCATAATGGTGTCACTCTACTGTGGTGTCGGAATGATGTACTCATGGATGTGGCAACTCGCAT-GGATTGTCAGGCACTAATATGGTCTCTGGTTAGCAACACGAGCATGCTGC-TTTGCCTTGCTGGGAACCCA]

[+] EMBL AK102212             [CACCTCCCCGGCGCGGGCGGCGGCCTGGACCTTCGCCGCCGCCACATGCGTCAAGCTCCTGCTCGTCCCCACCTACCGCTCCACCGACTTCGACGTGCACCGCTACTGGCTCGCCCTCACCCACGCCCTCCCCGCGCGGCGGTGGTACACCGACGCCTCGTCGCAGTGGACGCTCGACTACCCGCCCTTCTTCGCCTACTTCTCCCGCCTCCTCGCCCTCCCGGCGCCCCTCGTCGACGCCTCCCTCGTCTCCCTCCCCGTCCCCGACGCGCCGCCCTCCTTCGCCTACCTCCTCTACCTCCGCCTCACCGTCGCCTTCTCCGACCTCCTCCTCCTCCTCTCCTCCGTCCTCCTGCTGGCCACGGACGCGCTCACGCGGCGGCGGCGGCGGCCGTTCCTCTCCCTCGCGCTCGTCCTCTGGTCGCCGGCGCTGCTCGCCGTGGACCACGTACACTTCCAGTACAACGGGTTCCTGATGGGGCTGCTGCTGCTGTCGCTGCACTTCCTTGAGCAGGGGAGGGATCTCGCCGGCGGAGTCGTTTTTGCTGCTCTGCTGTGCTCGAAGCACCTGTTCCTAGTGGCGGCGCCGGTCTACTTCGTGTATCTTTTCCGGCATTATTGCTGTGGCCGGGGTGTGGTGAGGGGATTGGGAAGGTTGGTGCTGATGGGGGCTGGTGTGGCTGCTGTGTTTGCTGCTGCATTTGTGCCCTTCCTGTACTATGGGCAGATGCAACAGCTCTTTAACCGGTTGTTTCCCTTTGGTCGAGGCCTGTGCCATGCTTATTGGGCGCCAAATTTTTGGGTATTCTACATTTTACTTGACAAGATCTTCGCGTTTCTTCTTAGAAGACTAGGCTTCAACATCCAGATACCTGAAGCTTCATTTACCGGGGGGCTTGTTGGTAATTCGTCTCCTTTTGCTGTTCTTCCCAAGGTCACTCCAATAACTACATTTTTATTGGTCATACTTGCTATGTCTCCTTGCCTCATGAAAGCATTCTCTAAACCCCAGCCAAGGCACATTATTAGATGGGTGTCATATGCAACTACATGTGGGTTTATGTTTGGATGGCATGTACATGAGAAGGCATCACTCCATTTCACTATTCCGCTTGCCCTAATTGCCATGGATAGCTTGGAGGACGCGAAGCATTATTTTGTGTTGTCAATAGTTTCATGTTATTCATTGTTCCCATTGTTGTTTGAGAACCAAGAATATCCTATAAAGGTTATGCTTCTGTTGACCTATGCTACCCTCATGTGGGTAGGATTTTCTTCCCATTTTGCTGCAAAATCTCCTCAAGAAGGGAAGAAAGTAAATGAATCAGGCAGCGTGGTCAGGAAAAATAGCTTCATTGGGTGGATCAGTTTTAGCTATCTTTTAGGAATTGTTGCTATAGAATTATGGTCTCAAGTATTCCACCACTATGTATTTGGCAGCAGATTTCCTTTCCTACCTCTCATAATGGTGTCACTCTACTGTGGTGTCGGAATGATGTACTCATGGATGTGGCAACTCGCAT GGATTGTCAGGCACTAATATGGTC                                               ]
[-] EMBL AU070634             [                                                                                                                                                 TACACCGACGCNTCGTCGCAGTGGACGCTCGACTACNCGCCCTTCTTCGCCTACTTCTCNCGCCTNCTCGCCCTCCCGNCGCCCCTCGTCGACGCCTCCCTCGTCTCCCTCCACGTCCCCGACGCGCCGCCCTCCTTCGCCTACCTCCTCTACCTCCGCCTCACCGTCGCCTTCTCCGACCcgg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CA767543             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGGTAATTCGTCTCCTTTTGCTGTTCTTCCCAAGGTCACTCCAATAACTACATTTTTATTGGTCATACTTGCTATGTCTCCTTGCCTCATGAAAGCATTCTCTAAACCCCAGCCAAGGCACATTATTAGATGGGTGTCATATGCAACTACATGTGGGTTTATGTTTGGATGGCATGTACATGAGAAGGCATCACTCCATTTCACTATTCCGCTTGCCCTAATTGCCATGGATAGCTTGGAGGACGCGAAGCATTATTTTGTGTTGTCAATAGTTTCATGTTATTCATTGTTCCCATTGTTGTTTGAGAACCAAGAATATCCTATAAAGGTTATGCTTCTGTTGACCTATGCTACCCTCATGTGGGTAGGATTTTCTTCCCATTTTGCTGCAAAATCTCCTCAAGAAGGGAAGAAAGTAAATGAATCAGGCAGCGAGGTCAGGAAAAATAGCTTCATTGGGTGGATCAGTTTTAGCTATCTTTTAGGAATTGTTGCTATAGAATTATGGTCTCAAGTATTCCACCGCTATGTATTTGGCAGCAGATTTCCTTTCCTACCTCTCATAATGGTGTCACTCTACTGTGGTGTCGGAATGATGTACTCATGGATGTGGCAACTCACATGGGATTGTCAGGCACTAATATGGTCTCTGGTTAGCAACACGAGCATGCTGCTTTTGCC              ]
[+] EMBL AK059118             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACCAAGAATATCCTATAAAGGTTATGCTTCTGTTGACCTATGCTACCCTCATGTGGGTAGGATTTTCTTCCCATTTTGCTGCAAAATCTCCTCAAGAAGGGAAGAAAGTAAATGAATCAGGCAGCGTGGTCAGGAAAAATAGCTTCATTGGGTGGATCAGTTTTAGCTATCTTTTAGGAATTGTTGCTATAGAATTATGGTCTCAAGTATTCCACCACTATGTATTTGGCAGCAGATTTCCTTTCCTACCTCTCATAATGGTGTCACTCTACTGTGGTGTCGGAATGATGTACTCATGGATGTGGCAACTCGCAT GGATTGTCAGGCACTAATATGGTCTCTGGTTAGCAACACGAGCATGCTGC TTTGCCTTGCTGGGAACCCA]




>consensus_7135#0
CACCTCCCCGGCGCGGGCGGCGGCCTGGACCTTCGCCGCCGCCACATGCGTCAAGCTCCT
GCTCGTCCCCACCTACCGCTCCACCGACTTCGACGTGCACCGCTACTGGCTCGCCCTCAC
CCACGCCCTCCCCGCGCGGCGGTGGTACACCGACGCCTCGTCGCAGTGGACGCTCGACTA
CCCGCCCTTCTTCGCCTACTTCTCCCGCCTCCTCGCCCTCCCGGCGCCCCTCGTCGACGC
CTCCCTCGTCTCCCTCCCCGTCCCCGACGCGCCGCCCTCCTTCGCCTACCTCCTCTACCT
CCGCCTCACCGTCGCCTTCTCCGACCTCCTCCTCCTCCTCTCCTCCGTCCTCCTGCTGGC
CACGGACGCGCTCACGCGGCGGCGGCGGCGGCCGTTCCTCTCCCTCGCGCTCGTCCTCTG
GTCGCCGGCGCTGCTCGCCGTGGACCACGTACACTTCCAGTACAACGGGTTCCTGATGGG
GCTGCTGCTGCTGTCGCTGCACTTCCTTGAGCAGGGGAGGGATCTCGCCGGCGGAGTCGT
TTTTGCTGCTCTGCTGTGCTCGAAGCACCTGTTCCTAGTGGCGGCGCCGGTCTACTTCGT
GTATCTTTTCCGGCATTATTGCTGTGGCCGGGGTGTGGTGAGGGGATTGGGAAGGTTGGT
GCTGATGGGGGCTGGTGTGGCTGCTGTGTTTGCTGCTGCATTTGTGCCCTTCCTGTACTA
TGGGCAGATGCAACAGCTCTTTAACCGGTTGTTTCCCTTTGGTCGAGGCCTGTGCCATGC
TTATTGGGCGCCAAATTTTTGGGTATTCTACATTTTACTTGACAAGATCTTCGCGTTTCT
TCTTAGAAGACTAGGCTTCAACATCCAGATACCTGAAGCTTCATTTACCGGGGGGCTTGT
TGGTAATTCGTCTCCTTTTGCTGTTCTTCCCAAGGTCACTCCAATAACTACATTTTTATT
GGTCATACTTGCTATGTCTCCTTGCCTCATGAAAGCATTCTCTAAACCCCAGCCAAGGCA
CATTATTAGATGGGTGTCATATGCAACTACATGTGGGTTTATGTTTGGATGGCATGTACA
TGAGAAGGCATCACTCCATTTCACTATTCCGCTTGCCCTAATTGCCATGGATAGCTTGGA
GGACGCGAAGCATTATTTTGTGTTGTCAATAGTTTCATGTTATTCATTGTTCCCATTGTT
GTTTGAGAACCAAGAATATCCTATAAAGGTTATGCTTCTGTTGACCTATGCTACCCTCAT
GTGGGTAGGATTTTCTTCCCATTTTGCTGCAAAATCTCCTCAAGAAGGGAAGAAAGTAAA
TGAATCAGGCAGCGTGGTCAGGAAAAATAGCTTCATTGGGTGGATCAGTTTTAGCTATCT
TTTAGGAATTGTTGCTATAGAATTATGGTCTCAAGTATTCCACCACTATGTATTTGGCAG
CAGATTTCCTTTCCTACCTCTCATAATGGTGTCACTCTACTGTGGTGTCGGAATGATGTA
CTCATGGATGTGGCAACTCGCATGGATTGTCAGGCACTAATATGGTCTCTGGTTAGCAAC
ACGAGCATGCTGCTTTGCCTTGCTGGGAACCCA
clustalw multiple alignements is not computed in this case