cluster # 7323

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Oryza sativa
cluster # 7323 cluster # 7323 Sequences # 4 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7323#0 length = 822 sequences # 4
consensusID : consensus_7323#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 822
fasta sequence
                              [AGAGAAGTGAGGAGAGAGATGATGAGCCACCCCTAAATCAAGAGGCAACCTCCACACAAATTTCAAGAAGGATGTAAGAGTATTAGATATATTAATATTTGTATACTAGATGTGATACATTATATGAGTTGCC-TCTTAGTTTATGATTGAATAAAATAGATAAATTTAGAGGTGATAGTCACATCTACCATAGCACTTGCCC-TTAGGTACTACTAGTAGTAGTCGGGGCAATCAGGCATGGTGGTCATGCCCTTTTGTTCTGTACTTGT-CAGTTTCATTTAATATGATATTTCGATTACCAGGTAATATAGTAGAAGTAGTAATATGTTGGTTTATAAT-AAATTACTGCAAGGGTTGTCAAAAAATATTAC-GGGTTAACATGTCAAGTTTC-TTTAAAAGA-GGAATACTATAGTAAGGTAT-CATGTTT-GAACCGTATCTCCGAGGTATCAACCGATATTCTANCATGTATCAAACGATACCTTTGAGTTATCATCCCGTATTTTCTTTGTACAAACTTATGATTGGTGTTCATATAGTATTTTTCTAAACATCGTTGTGAACATTTCCTTAATTAGAAACGTGAATGGTGATAATATTCAGTTTCTAGGCAAAAAAAACGGCGGAAATGGTTATCTCTTTTTTTTTCTTAGACTAGACTTTACAATTATCTGTTTTTTTTTCATAGCAAGGGGCTTTACAGTTCCAATTGTAATATTTCTTCGTTTTAAGCTTTTTCTTGTGTATATTTTTGCGTGTGCTAATGGTGTGCTTAACAGATATATATAGTACCTATAATGTCAATTCGATCGAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AU066009             [AGAGAAGTGAGGAGAGAGATGATGAGCCACCCCTAAATCAAGAGGCAACCTCCACACAAATTTCAAGAAGGATGTAAGAGTATTAGATATATTAATATTTGTATACTAGATGTGATACATTATATGAGTTGCC TCTTAGTTTATGATTGAATAAAATAGATAAATTTAGAGGTGATAGTCACATCTACCATAGCACTTGCCC TTAGGTACTACTAGTAGTAGTCGGGGCAATCAGGCATGGTGGTCATGCCCTTTTGTTCTGTACTTGT CAGTTTCATTTAATATGATATTTCGATTACCAGGTAATATAGTAGAAGTAGTAATATGTTGGTTTATAAT AAATTACTGCAAGGGTTGTCAAAAAATATTAC GGGTTAACATGTCAAGTTTC TTTAAAAGAGGGAATACTATAGTAAGGTAT CATGTTTGGAACCGTATCTCCGAGGTATCAACCGATATTCTANCATGTATCAAACGATACCTTTGAGTTATCATCCCGTATTTTCTTTGTACAAACTTATGATTGGTGTTCATATAGTATTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL OSS14896A            [   GAAGTGAGGAGAGAGATGATGAGCCACCCCTAAATCAAGAGGCAACCTCCACACAAATTTCAAGAAGGATGTAAGAGTATTAGATATATTAATATTTGTATACTAGATGTGATACATTATATGAGTTGCC TCTTAGTTTATGATTGAATAAAATAGATAAATTTAGAGGTGATAGTCACATCTACCATAGCACTTGCCC TTAGGTACTACTAGTAGTAGTCGGGGCAATCAGGCATGGTGGTCATGCCCTTTTGTTCTGTACTTGT CAGTTTCATTTAATATGATATTTCGATTACCAGGTAATATAGTAGAAGTAGTAATATGTTGGTTTATAATAAAATTACTGCAAGGGTTGTTAAAAAATATTACGGGGTTAACATGTCAAGTTTCTTTTAAAAGA GGAATACTATAGTAAGGTATCCTTGTTT GGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CB684821             [          GGAGACTGATGATGAGCCACCCCTAAATCAAGAGGCAACCTCCACACAAATTTCAAGAAGGATGTAAGAGTATTAGATATATTAATATTTGTATACTAGATGTGATACATTATATGAGTTGCC TCTTAGTTTATGATTGAATAAAATAGATAAATTTAGAGGTGATAGTCACATCTACCATAGCACTTGCCC TTAGGTACTACTAGTAGTAGTCGGGGCAATCAGGCATGGTGGTCATGCCCTTTTGTTCTGTACTTGT CAGTTTCATTTAATATGATATTTCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AU082100             [                                                                                                                                gTGCCNCCTTAGTTTAGGA TGGATTAAATGGNTAAATTTAGAGGTGATAGTCACATCTACCATAGCACTTGCCCNTTAGGTACTACTAGTAGTAGTCGGGNCAATCAGGCATGGTGGTCAGCCCCTTTGGTTCTGTACTTGTCCAGTTCCATTTAATATGATATTTCGATTACCAGGTAATATAGTAGAAGTAGTAATATGTTGGTTTATAAT AAATTACTGCAAGGGTTGTCAAAAAATATTAC GGGTTAACATGTCAAGTTTC TTTAAAAGA GGAATACTATAGTAAGGTAT CATGTTT GAACCGTATCTCCGAGGTATCAACCGATA TCTATCATGTATCAAACGATACCTTTGAGTTATCATCCCGTATTTTCTTTGTACAAACTTATGATTGGTGTTCATATAGTATTTTTCTAAACATCGTTGTGAACATTTCCTTAATTAGAAACGTGAATGGTGATAATATTCAGTTTCTAGGCAAAAAAAACGGCGGAAATGGTTATCTCTTTTTTTTTCTTAGACTAGACTTTACAATTATCTGTTTTTTTTTCATAGCAAGGGGCTTTACAGTTCCAATTGTAATATTTCTTCGTTTTAAGCTTTTTCTTGTGTATATTTTTGCGTGTGCTAATGGTGTGCTTAACAGATATATATAGTACCTATAATGTCAATTCGATCGAAAAAAAAAAAAA]




>consensus_7323#0
AGAGAAGTGAGGAGAGAGATGATGAGCCACCCCTAAATCAAGAGGCAACCTCCACACAAA
TTTCAAGAAGGATGTAAGAGTATTAGATATATTAATATTTGTATACTAGATGTGATACAT
TATATGAGTTGCCTCTTAGTTTATGATTGAATAAAATAGATAAATTTAGAGGTGATAGTC
ACATCTACCATAGCACTTGCCCTTAGGTACTACTAGTAGTAGTCGGGGCAATCAGGCATG
GTGGTCATGCCCTTTTGTTCTGTACTTGTCAGTTTCATTTAATATGATATTTCGATTACC
AGGTAATATAGTAGAAGTAGTAATATGTTGGTTTATAATAAATTACTGCAAGGGTTGTCA
AAAAATATTACGGGTTAACATGTCAAGTTTCTTTAAAAGAGGAATACTATAGTAAGGTAT
CATGTTTGAACCGTATCTCCGAGGTATCAACCGATATTCTANCATGTATCAAACGATACC
TTTGAGTTATCATCCCGTATTTTCTTTGTACAAACTTATGATTGGTGTTCATATAGTATT
TTTCTAAACATCGTTGTGAACATTTCCTTAATTAGAAACGTGAATGGTGATAATATTCAG
TTTCTAGGCAAAAAAAACGGCGGAAATGGTTATCTCTTTTTTTTTCTTAGACTAGACTTT
ACAATTATCTGTTTTTTTTTCATAGCAAGGGGCTTTACAGTTCCAATTGTAATATTTCTT
CGTTTTAAGCTTTTTCTTGTGTATATTTTTGCGTGTGCTAATGGTGTGCTTAACAGATAT
ATATAGTACCTATAATGTCAATTCGATCGAAAAAAAAAAAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case