These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7323#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 822 fasta sequence [AGAGAAGTGAGGAGAGAGATGATGAGCCACCCCTAAATCAAGAGGCAACCTCCACACAAATTTCAAGAAGGATGTAAGAGTATTAGATATATTAATATTTGTATACTAGATGTGATACATTATATGAGTTGCC-TCTTAGTTTATGATTGAATAAAATAGATAAATTTAGAGGTGATAGTCACATCTACCATAGCACTTGCCC-TTAGGTACTACTAGTAGTAGTCGGGGCAATCAGGCATGGTGGTCATGCCCTTTTGTTCTGTACTTGT-CAGTTTCATTTAATATGATATTTCGATTACCAGGTAATATAGTAGAAGTAGTAATATGTTGGTTTATAAT-AAATTACTGCAAGGGTTGTCAAAAAATATTAC-GGGTTAACATGTCAAGTTTC-TTTAAAAGA-GGAATACTATAGTAAGGTAT-CATGTTT-GAACCGTATCTCCGAGGTATCAACCGATATTCTANCATGTATCAAACGATACCTTTGAGTTATCATCCCGTATTTTCTTTGTACAAACTTATGATTGGTGTTCATATAGTATTTTTCTAAACATCGTTGTGAACATTTCCTTAATTAGAAACGTGAATGGTGATAATATTCAGTTTCTAGGCAAAAAAAACGGCGGAAATGGTTATCTCTTTTTTTTTCTTAGACTAGACTTTACAATTATCTGTTTTTTTTTCATAGCAAGGGGCTTTACAGTTCCAATTGTAATATTTCTTCGTTTTAAGCTTTTTCTTGTGTATATTTTTGCGTGTGCTAATGGTGTGCTTAACAGATATATATAGTACCTATAATGTCAATTCGATCGAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL AU066009 [AGAGAAGTGAGGAGAGAGATGATGAGCCACCCCTAAATCAAGAGGCAACCTCCACACAAATTTCAAGAAGGATGTAAGAGTATTAGATATATTAATATTTGTATACTAGATGTGATACATTATATGAGTTGCC TCTTAGTTTATGATTGAATAAAATAGATAAATTTAGAGGTGATAGTCACATCTACCATAGCACTTGCCC TTAGGTACTACTAGTAGTAGTCGGGGCAATCAGGCATGGTGGTCATGCCCTTTTGTTCTGTACTTGT CAGTTTCATTTAATATGATATTTCGATTACCAGGTAATATAGTAGAAGTAGTAATATGTTGGTTTATAAT AAATTACTGCAAGGGTTGTCAAAAAATATTAC GGGTTAACATGTCAAGTTTC TTTAAAAGAGGGAATACTATAGTAAGGTAT CATGTTTGGAACCGTATCTCCGAGGTATCAACCGATATTCTANCATGTATCAAACGATACCTTTGAGTTATCATCCCGTATTTTCTTTGTACAAACTTATGATTGGTGTTCATATAGTATTTTT ] [+] EMBL OSS14896A [ GAAGTGAGGAGAGAGATGATGAGCCACCCCTAAATCAAGAGGCAACCTCCACACAAATTTCAAGAAGGATGTAAGAGTATTAGATATATTAATATTTGTATACTAGATGTGATACATTATATGAGTTGCC TCTTAGTTTATGATTGAATAAAATAGATAAATTTAGAGGTGATAGTCACATCTACCATAGCACTTGCCC TTAGGTACTACTAGTAGTAGTCGGGGCAATCAGGCATGGTGGTCATGCCCTTTTGTTCTGTACTTGT CAGTTTCATTTAATATGATATTTCGATTACCAGGTAATATAGTAGAAGTAGTAATATGTTGGTTTATAATAAAATTACTGCAAGGGTTGTTAAAAAATATTACGGGGTTAACATGTCAAGTTTCTTTTAAAAGA GGAATACTATAGTAAGGTATCCTTGTTT GGAC ] [+] EMBL CB684821 [ GGAGACTGATGATGAGCCACCCCTAAATCAAGAGGCAACCTCCACACAAATTTCAAGAAGGATGTAAGAGTATTAGATATATTAATATTTGTATACTAGATGTGATACATTATATGAGTTGCC TCTTAGTTTATGATTGAATAAAATAGATAAATTTAGAGGTGATAGTCACATCTACCATAGCACTTGCCC TTAGGTACTACTAGTAGTAGTCGGGGCAATCAGGCATGGTGGTCATGCCCTTTTGTTCTGTACTTGT CAGTTTCATTTAATATGATATTTCG ] [+] EMBL AU082100 [ gTGCCNCCTTAGTTTAGGA TGGATTAAATGGNTAAATTTAGAGGTGATAGTCACATCTACCATAGCACTTGCCCNTTAGGTACTACTAGTAGTAGTCGGGNCAATCAGGCATGGTGGTCAGCCCCTTTGGTTCTGTACTTGTCCAGTTCCATTTAATATGATATTTCGATTACCAGGTAATATAGTAGAAGTAGTAATATGTTGGTTTATAAT AAATTACTGCAAGGGTTGTCAAAAAATATTAC GGGTTAACATGTCAAGTTTC TTTAAAAGA GGAATACTATAGTAAGGTAT CATGTTT GAACCGTATCTCCGAGGTATCAACCGATA TCTATCATGTATCAAACGATACCTTTGAGTTATCATCCCGTATTTTCTTTGTACAAACTTATGATTGGTGTTCATATAGTATTTTTCTAAACATCGTTGTGAACATTTCCTTAATTAGAAACGTGAATGGTGATAATATTCAGTTTCTAGGCAAAAAAAACGGCGGAAATGGTTATCTCTTTTTTTTTCTTAGACTAGACTTTACAATTATCTGTTTTTTTTTCATAGCAAGGGGCTTTACAGTTCCAATTGTAATATTTCTTCGTTTTAAGCTTTTTCTTGTGTATATTTTTGCGTGTGCTAATGGTGTGCTTAACAGATATATATAGTACCTATAATGTCAATTCGATCGAAAAAAAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||