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Oryza sativa
cluster # 7358 cluster # 7358       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7358#0 length = 2829 sequences # 4  

consensusID : consensus_7358#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 2829
fasta sequence
                              [AGACTTACACGACGACGCGCCTTATCTCCCCCGGTCGCCGTGCCCGCCCGTCGCCGTCGCCGTCGCCGTCGCCGTCGACGCCGCAGCAGCCGGGAGGGAGGCCTCGTCGTAGCTCCTCTCCTCTCCCGCCTCAGGGTCGGGGAGCCCCCGCCCCCCCGCCGCGGGTTCCGTTGACGTGGAGCCCTAGCGCGCGCCACCGCCGGGCGTCGCCCTCCCGTAGCGACGCCGCCGCCGCCGTCGCCGCCGGTGGACCGCTGATCCATCGACATAAGCGCTCATGGGGAAGGGAGAAATTGTGGCTGTTCTTCAAGTAGGTGGAGAATTCAGCACAGATGCTGATGGACTAATGTCTTACTCTGGTGGAGAAGCACACGCAATGCTTGTCAAAAGTGACTGGACGTTCAGTGCATTCAAGCATGAAATATCTTCAACGCTGAATAATATCAGAGTCGATCAGTTTGTGTTCAAGTATTTCCTTCCAAAAAATAAGAAAACCTTGATTTCTATTTCCAATGACAAGGATCTACACCGCATGGTTGAGTTCCATGCAGAATCTGAGACTACATACATCTATGTCATGAAAAAGAAGGTTGACAACAGGGCATCGATTGTTGTTGCTGACTCTGGTACTCCTGTAGATACCACTGCAGTTGTGCCAACGACTCAGGATGGGTCTAAGAGGCAGAAGATCTGTGCAACATGGAAGAATGTGATTACTGGAGTTGGTCAAGTGTTTGATGGTCCTAAAGATTTCCGTGATGCCTTACATAAGTATGCCATTGCCCATAAATTCCATTACAGATTTATCAAGAATGATTCATCTCGTGTGACTGCGGAATGTACTGGTGAAGATTGCCCTTGGCGAATACATGCTTCCAAATCCCCTGCCAAGAAGCAATTCATGATCAAGAAAATATCTGAAAGCCACACCTGTGAATCAGAGACAGTCAAAAGTCATCGTCTGGCTTCTCAGCGATGGGTTGCTAGTGTTATAAAAGAAAAGTTACGCGATAGTCCAAACTACAGGCCAAGAGATATTGCAAGTGATCTTCAGCGTGAGTATGGACTATGCCTAAATTACTCTCAGGCTTGGCGTGGAAGATCAATTGCTCAAAAGGAACTTCATAGCACACACGATGAGGTAACCAGTCAGCTACCTTGGTTTTGTGGACGGATCATGCAGACAAACCCTCAAAGTGTGGCCACTGTAGTACCTATGGAAGATTCAAAATTTCGTTTGTTTGTTGCATTCCATGCATCGCTTCATGGTTTTGAGCATGGGTGCAGACCATTACTTTTTCTTGATGTAATATCTGCAAAACCAAATAAGCAGTGGAAGCTACTTACTGCCACTTCTGTTGATAGTGAAGGTGATGTGTTCCCAGTTGCATTTGCTGTAGTGGATGATGAGAGCAGTGAACACTGGCATTGGTTTCTTGAGCAACTTAAATCTTCTGTGTCAGCTTCCCGTGCCATAACATTCATATCGAATGGAGAAAATGGACTATGGGATGAAGTGCCTTTGGTTTTCCCTGACAGTCACCACGGATACTGTGTGGACTATCTTATTGAAGAATTTAAGACACAATTGGATGATGCATGGACCGAAGAAGCAAGAGATGTCATGGTTGAGCATCTTAAGAAGGCCATATATGCATGCACAGTTGACGAGTTCAATCAGTATATTGAACTAATCAAAGGTGAATCTGACAAGCTTGCTGAATGGCTTCTGGAGATTAAACCCGAGCGATGGTCAGATGCCTTTTTCAAAGGGTCAAGGCATGGGCAGTATTCATGCAATTTTCCTAGCACTATTGTTGAGTGGATCCCCACCAGATACGAGCTTTCAATTGTCCAGTTAGTTGACATGATAAGATGCAAGCTCATGGAGATGATGTACACACGCAGGGAGTCTTCTAATGCGTGGGCTGAGTTATTAACACCTGCAGCTAATCAGAAATTGCAGGAAGAAGTGAGCAAAGCCCACACCCTGAACGTCATCCCTTCTGAAAGTAATGAAAATGGCAATGTGTTCAAGGTGTGTGATGATTCTGTTAATGTTGTCAATATTGATGCATGGGAGTGTACCTGCCGAAAGTGGCATATTTCTGGGTTGCCATGCATGCATGCAATTGCAGTAATAGAGCGGATTGGACACTGCCCTTACGATTACTGTGTGAAGTATTTCAGAACAGAATGCTACCGCTTGACCTACTCCATGTCGATAAATCCAATACCCGATGTTATGCTGCCTCCTGCTATATTAAGTGATCAATCTCAAAGTCCAGTAACACATGCAACCCCAATAAGAACCCGACGACGGGTTGGCAGGCCAAAGGAGAAGCCGGCAGACCCACGCATCGCAATTAAAAGGGCAGTGCGGTGCAGCAGGTGCCAGGGTTATGGCCACAATAAAGCAACCTGCAAAGTTCCTCTGAGCACATAGTCTACCCATGGGTTCAGTTCTCCTATGTACATTTAGGTGGAGAGTTGCTCTTGTTTGCTGTAATACGAGTGATGCTATTTCTTTATAACTCGGTACATGCATCAGTCATTGATTCTAGCTCTAAATTGCTTTGTATTTGCTTGCTTTGTTAGGCTAACATATTTGGTCGTAAAATCGCACATTGTAATGGACGCAATAGAGAGACTTGGGAGGTTTGCTGTTATGTAATGCTGTCCAATTTGATCTGGTTTCCCGTTCTAGCTATTGTGTGCCAATCTGATCATCTCAACTCTCAGGCAAGGAAAGGAATATATATAGACTGTAGTTACTTGAAAAACCTTTGTCAGAGTATTTGAACTTTGCATTATTAGTTTGTTTGGTTT]

[+] EMBL AK101148             [AGACTTACACGACGACGCGCCTTATCTCCCCCGGTCGCCGTGCCCGCCCGTCGCCGTCGCCGTCGCCGTCGCCGTCGACGCCGCAGCAGCCGGGAGGGAGGCCTCGTCGTAGCTCCTCTCCTCTCCCGCCTCAGGGTCGGGGAGCCCCCGCCCCCCCGCCGCGGGTTCCGTTGACGTGGAGCCCTAGCGCGCGCCACCGCCGGGCGTCGCCCTCCCGTAGCGACGCCGCCGCCGCCGTCGCCGCCGGTGGACCGCTGATCCATCGACATAAGCGCTCATGGGGAAGGGAGAAATTGTGGCTGTTCTTCAAGTAGGTGGAGAATTCAGCACAGATGCTGATGGACTAATGTCTTACTCTGGTGGAGAAGCACACGCAATGCTTGTCAAAAGTGACTGGACGTTCAGTGCATTCAAGCATGAAATATCTTCAACGCTGAATAATATCAGAGTCGATCAGTTTGTGTTCAAGTATTTCCTTCCAAAAAATAAGAAAACCTTGATTTCTATTTCCAATGACAAGGATCTACACCGCATGGTTGAGTTCCATGCAGAATCTGAGACTACATACATCTATGTCATGAAAAAGAAGGTTGACAACAGGGCATCGATTGTTGTTGCTGACTCTGGTACTCCTGTAGATACCACTGCAGTTGTGCCAACGACTCAGGATGGGTCTAAGAGGCAGAAGATCTGTGCAACATGGAAGAATGTGATTACTGGAGTTGGTCAAGTGTTTGATGGTCCTAAAGATTTCCGTGATGCCTTACATAAGTATGCCATTGCCCATAAATTCCATTACAGATTTATCAAGAATGATTCATCTCGTGTGACTGCGGAATGTACTGGTGAAGATTGCCCTTGGCGAATACATGCTTCCAAATCCCCTGCCAAGAAGCAATTCATGATCAAGAAAATATCTGAAAGCCACACCTGTGAATCAGAGACAGTCAAAAGTCATCGTCTGGCTTCTCAGCGATGGGTTGCTAGTGTTATAAAAGAAAAGTTACGCGATAGTCCAAACTACAGGCCAAGAGATATTGCAAGTGATCTTCAGCGTGAGTATGGACTATGCCTAAATTACTCTCAGGCTTGGCGTGGAAGATCAATTGCTCAAAAGGAACTTCATAGCACACACGATGAGGTAACCAGTCAGCTACCTTGGTTTTGTGGACGGATCATGCAGACAAACCCTCAAAGTGTGGCCACTGTAGTACCTATGGAAGATTCAAAATTTCGTTTGTTTGTTGCATTCCATGCATCGCTTCATGGTTTTGAGCATGGGTGCAGACCATTACTTTTTCTTGATGTAATATCTGCAAAACCAAATAAGCAGTGGAAGCTACTTACTGCCACTTCTGTTGATAGTGAAGGTGATGTGTTCCCAGTTGCATTTGCTGTAGTGGATGATGAGAGCAGTGAACACTGGCATTGGTTTCTTGAGCAACTTAAATCTTCTGTGTCAGCTTCCCGTGCCATAACATTCATATCGAATGGAGAAAATGGACTATGGGATGAAGTGCCTTTGGTTTTCCCTGACAGTCACCACGGATACTGTGTGGACTATCTTATTGAAGAATTTAAGACACAATTGGATGATGCATGGACCGAAGAAGCAAGAGATGTCATGGTTGAGCATCTTAAGAAGGCCATATATGCATGCACAGTTGACGAGTTCAATCAGTATATTGAACTAATCAAAGGTGAATCTGACAAGCTTGCTGAATGGCTTCTGGAGATTAAACCCGAGCGATGGTCAGATGCCTTTTTCAAAGGGTCAAGGCATGGGCAGTATTCATGCAATTTTCCTAGCACTATTGTTGAGTGGATCCCCACCAGATACGAGCTTTCAATTGTCCAGTTAGTTGACATGATAAGATGCAAGCTCATGGAGATGATGTACACACGCAGGGAGTCTTCTAATGCGTGGGCTGAGTTATTAACACCTGCAGCTAATCAGAAATTGCAGGAAGAAGTGAGCAAAGCCCACACCCTGAACGTCATCCCTTCTGAAAGTAATGAAAATGGCAATGTGTTCAAGGTGTGTGATGATTCTGTTAATGTTGTCAATATTGATGCATGGGAGTGTACCTGCCGAAAGTGGCATATTTCTGGGTTGCCATGCATGCATGCAATTGCAGTAATAGAGCGGATTGGACACTGCCCTTACGATTACTGTGTGAAGTATTTCAGAACAGAATGCTACCGCTTGACCTACTCCATGTCGATAAATCCAATACCCGATGTTATGCTGCCTCCTGCTATATTAAGTGATCAATCTCAAAGTCCAGTAACACATGCAACCCCAATAAGAACCCGACGACGGGTTGGCAGGCCAAAGGAGAAGCCGGCAGACCCACGCATCGCAATTAAAAGGGCAGTGCGGTGCAGCAGGTGCCAGGGTTATGGCCACAATAAAGCAACCTGCAAAGTTCCTCTGAGCACATAGTCTACCCATGGGTTCAGTTCTCCTATGTACATTTAGGTGGAGAGTTGCTCTTGTTTGCTGTAATACGAGTGATGCTATTTCTTTATAACTCGGTACATGCATCAGTCATTGATTCTAGCTCTAAATTGCTTTGTATTTGCTTGCTTTGTTAGGCTAACATATTTGGTCGTAAAATCGCACATTGTAATGGACGCAATAGAGAGACTTGGGAGGTTTGCTGTTATGTAATGCTGTCCAATTTGATCTGGTTTCCCGTTCTAGCTATTGTGTGCCAATCTGATCATCTCAACTCTCAGGCAAGGAAAGGAATATATATAGACTGTAGTTACTTGAAAAACCTTTGTCAGAGTATTTGAACTTTGCATTATTAGTTTGTTTGGTTT]
[+] EMBL CB658786             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTGACTCAGAGACAGTCAAAAGTCATCGTCTGGCTTCTCAGCGATGGGTTGCTAGTGTTATAAAAGAAAAGTTACGCGATAGTCCAAACTACAGGCCAAGAGATATTGCAAGTGATCTTCAGCGTGAGTATGGACTATGCCTAAATTACTCTCAGGCTTGGCGTGGAAGATCAATTGCTCAAAAGGAACTTCATAGCACACACGATGAGGTAACCAGTCAGCTACCTTGGTTTTGTGGACGGATCATGCAGACAAACCCTCAAAGTGTGGCCACTGTAGTACCTATGGAAGATTCAAAATTTCGTTTGTTTGTTGCATTCCATGCATCGCTTCATGGTTTTGAGCATGGGTGCAGACCATTACTTTTTCTTGATGTAATATCTGCAAAACCAAATAAGCAGTGGAAGCTACTTACTGCCACTTCTGTTGATAGTGAAGGTGATGTGTTCCCAGTTGCATTTGCTGTAGTGGATGATGAGAGCAGTGAACACTGGCATTGGTTTCTTGAGCAACTTAAATCTTCTGTGTCAGCTTCCCGTGCCATAACATTCATATCGAATGGAGAAAATGGACTATGGGATGAAGTGCCTTTGGTTTTCCCTGACAGTCACCACGGATACTGTGTGGACTATCTTATTGAAGAATTTAAGACACAATTGGATGATGCATGGACCGAAGAAGCAAGAGATGTCATGGTTGAGCATCTTAAGAAAGCCATATATGCATGCACAGTTGACGAGTTCTATCAGTATATTGAACTAATCAAAAGTGAATCTGACAAGCTTGCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
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[+] EMBL D43061               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cctGCAGGTTAAGANGGCCATATATGCATGCNCAGTTGACGAGTTCAATCAGTATATNGACCTAATCAAAGGTGAATCTGACAAGCTTGCTGAATGGCTTCTGGNGATTAANCCCGAGCGATGGTCAGATGCCTTTTNCAAAGGGTCAAGGCATGGNCAGTATTCANGCAATTTCCCTAGCACTATTGTNGAGTGGTTCCCCACCAGATACGAGCTTTCANTTGTCCAGTTAGTTGACATGATAAGATGCAAGCNCATGGNGATGATGTACACACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]


>consensus_7358#0 AGACTTACACGACGACGCGCCTTATCTCCCCCGGTCGCCGTGCCCGCCCGTCGCCGTCGC CGTCGCCGTCGCCGTCGACGCCGCAGCAGCCGGGAGGGAGGCCTCGTCGTAGCTCCTCTC CTCTCCCGCCTCAGGGTCGGGGAGCCCCCGCCCCCCCGCCGCGGGTTCCGTTGACGTGGA GCCCTAGCGCGCGCCACCGCCGGGCGTCGCCCTCCCGTAGCGACGCCGCCGCCGCCGTCG CCGCCGGTGGACCGCTGATCCATCGACATAAGCGCTCATGGGGAAGGGAGAAATTGTGGC TGTTCTTCAAGTAGGTGGAGAATTCAGCACAGATGCTGATGGACTAATGTCTTACTCTGG TGGAGAAGCACACGCAATGCTTGTCAAAAGTGACTGGACGTTCAGTGCATTCAAGCATGA AATATCTTCAACGCTGAATAATATCAGAGTCGATCAGTTTGTGTTCAAGTATTTCCTTCC AAAAAATAAGAAAACCTTGATTTCTATTTCCAATGACAAGGATCTACACCGCATGGTTGA GTTCCATGCAGAATCTGAGACTACATACATCTATGTCATGAAAAAGAAGGTTGACAACAG GGCATCGATTGTTGTTGCTGACTCTGGTACTCCTGTAGATACCACTGCAGTTGTGCCAAC GACTCAGGATGGGTCTAAGAGGCAGAAGATCTGTGCAACATGGAAGAATGTGATTACTGG AGTTGGTCAAGTGTTTGATGGTCCTAAAGATTTCCGTGATGCCTTACATAAGTATGCCAT TGCCCATAAATTCCATTACAGATTTATCAAGAATGATTCATCTCGTGTGACTGCGGAATG TACTGGTGAAGATTGCCCTTGGCGAATACATGCTTCCAAATCCCCTGCCAAGAAGCAATT CATGATCAAGAAAATATCTGAAAGCCACACCTGTGAATCAGAGACAGTCAAAAGTCATCG TCTGGCTTCTCAGCGATGGGTTGCTAGTGTTATAAAAGAAAAGTTACGCGATAGTCCAAA CTACAGGCCAAGAGATATTGCAAGTGATCTTCAGCGTGAGTATGGACTATGCCTAAATTA CTCTCAGGCTTGGCGTGGAAGATCAATTGCTCAAAAGGAACTTCATAGCACACACGATGA GGTAACCAGTCAGCTACCTTGGTTTTGTGGACGGATCATGCAGACAAACCCTCAAAGTGT GGCCACTGTAGTACCTATGGAAGATTCAAAATTTCGTTTGTTTGTTGCATTCCATGCATC GCTTCATGGTTTTGAGCATGGGTGCAGACCATTACTTTTTCTTGATGTAATATCTGCAAA ACCAAATAAGCAGTGGAAGCTACTTACTGCCACTTCTGTTGATAGTGAAGGTGATGTGTT CCCAGTTGCATTTGCTGTAGTGGATGATGAGAGCAGTGAACACTGGCATTGGTTTCTTGA GCAACTTAAATCTTCTGTGTCAGCTTCCCGTGCCATAACATTCATATCGAATGGAGAAAA TGGACTATGGGATGAAGTGCCTTTGGTTTTCCCTGACAGTCACCACGGATACTGTGTGGA CTATCTTATTGAAGAATTTAAGACACAATTGGATGATGCATGGACCGAAGAAGCAAGAGA TGTCATGGTTGAGCATCTTAAGAAGGCCATATATGCATGCACAGTTGACGAGTTCAATCA GTATATTGAACTAATCAAAGGTGAATCTGACAAGCTTGCTGAATGGCTTCTGGAGATTAA ACCCGAGCGATGGTCAGATGCCTTTTTCAAAGGGTCAAGGCATGGGCAGTATTCATGCAA TTTTCCTAGCACTATTGTTGAGTGGATCCCCACCAGATACGAGCTTTCAATTGTCCAGTT AGTTGACATGATAAGATGCAAGCTCATGGAGATGATGTACACACGCAGGGAGTCTTCTAA TGCGTGGGCTGAGTTATTAACACCTGCAGCTAATCAGAAATTGCAGGAAGAAGTGAGCAA AGCCCACACCCTGAACGTCATCCCTTCTGAAAGTAATGAAAATGGCAATGTGTTCAAGGT GTGTGATGATTCTGTTAATGTTGTCAATATTGATGCATGGGAGTGTACCTGCCGAAAGTG GCATATTTCTGGGTTGCCATGCATGCATGCAATTGCAGTAATAGAGCGGATTGGACACTG CCCTTACGATTACTGTGTGAAGTATTTCAGAACAGAATGCTACCGCTTGACCTACTCCAT GTCGATAAATCCAATACCCGATGTTATGCTGCCTCCTGCTATATTAAGTGATCAATCTCA AAGTCCAGTAACACATGCAACCCCAATAAGAACCCGACGACGGGTTGGCAGGCCAAAGGA GAAGCCGGCAGACCCACGCATCGCAATTAAAAGGGCAGTGCGGTGCAGCAGGTGCCAGGG TTATGGCCACAATAAAGCAACCTGCAAAGTTCCTCTGAGCACATAGTCTACCCATGGGTT CAGTTCTCCTATGTACATTTAGGTGGAGAGTTGCTCTTGTTTGCTGTAATACGAGTGATG CTATTTCTTTATAACTCGGTACATGCATCAGTCATTGATTCTAGCTCTAAATTGCTTTGT ATTTGCTTGCTTTGTTAGGCTAACATATTTGGTCGTAAAATCGCACATTGTAATGGACGC AATAGAGAGACTTGGGAGGTTTGCTGTTATGTAATGCTGTCCAATTTGATCTGGTTTCCC GTTCTAGCTATTGTGTGCCAATCTGATCATCTCAACTCTCAGGCAAGGAAAGGAATATAT ATAGACTGTAGTTACTTGAAAAACCTTTGTCAGAGTATTTGAACTTTGCATTATTAGTTT GTTTGGTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)