cluster # 7558

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 7558 cluster # 7558 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7558#0 length = 733 sequences # 4

consensusID : consensus_7558#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 733
fasta sequence

                              [CCGCTAAAGGTGTCATCACTCTGCATATCCTCACATGCATCCTTAATAGAAGATGGTAGAATGCGATTATATATCATGGCTTATAAGCTTATTAGAAATACAAAGTGTCGTAAACAAACATGAGAGATGGCCGGCACACTGGTTTGGATATCATGATATCCAACTTATTTATGACTACTCTAGGGCAGCATATATAGCCTTGCAGGGGATTCAAAGTGCGAATTCAAGTCCCTTATGCTTGCATGATGCAGTTGTTTAGGAAACGATAGTGACAATATCAGCTTCCTTGTTGCAGAAGTGGTAGCATGCTTCGTTGCAACGTTCCACAGCACCGTTCCCTTCTTCGTTGCCAGCAAAAGTGTTTATGTTGCTGCACACGGATGAAGTACATCCCAGCATACAGAAGTCAAGTACATCCAATTCCTCAGACTCAGGGTGAAGGGTGTGGTGAATGTAAGGTGGCTTGCATTTCCCATCAACAATTTTGCAGCCAGAGAGTTTAGAACATCTTTCCCTTGTGCCATGCGCAAAACGGCATGCATTATAGATGTTTCTTGCC-GTGGTGGTTGGGCAGCAGCTTTTTGCTCCCACCTTGATGGTCTCTTGCTGCCGGACTAACCCTAGCACCGGCTCCCACATGATGGGGACTCTTCGGGCCTTTCAGGCTGTCTAACTTGTTTTGCACGAACAGTTAGGCGCGACCAAATCCGGCGACGCACGACGCTCGAGCGAC]

[-] EMBL AU225883             [CCGCTAAAGGTGTCATCACTCTGCATATCCTCACATGCATCCTTAATAGAAGATGGTAGAATGCGATTATATATCATGGCTTATAAGCTTATTAGAAATACAAAGTGTCGTAAACAAACATGAGAGATGGCCGGCACACTGGTTTGGATATCATGATATCCAACTTATTTATGACTACTCCAGGGCAGCATATATAGCCTTGCAGGGGATTCAAAGTGCGAATTCAAGTCCCTTATGCTTGCATGATGCAGTTGTTTAGGAAACGATAGTGACAATATCAGCTTCCTTGTTGCAGAAGTGGTAGCATGCTTCGTTGCAACGTTCCACAGCACCGTTCCagcggc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CA763250             [                                            tttttttttTGGTAGAATGCGATTATATATCATGGCTCATAAGCTTATTAGAAATACAAAGTGTCGTAAACAAACATGAGAGATGGCCGGCACACTGGTTTGGATATCATGATATCCAACTTATTTATGACTACTCTAGGGCAGCATATATAGCCTTGCAGGGGATTCAAAGTGCGAATTCAAGTCCCTTATGCTTGCATGATGCAGTTGTTTAGGAAACGATAGTGACAATATCAGCTTCCTTGTTGCAGAAGTGGTAGCATGCTTCGTTGCAACGTTCCACAGCACCGTTCCCTTCTTCGTTGCCAGCAAAAGTGTTTATGTTGCTGCACACGGATGAAGTACATCCCAGCATACAGAAGTCAAGTACATCCGATTCCTCAGACTCAGGGTGAAGGGTGTGGTGAATGTAAGGTGGCTTGCATTTCCCATCAACAATTTTGCAGGCAGAGAGTTTAGAACATCTTGTCCTTGTGCCATGCGCGAAACGCCATGCATTATAAATGGTTCTTGCCGGAGGTGGTTGGGCAACACGTTTTTGCTCCCACCTTGATGGTCTCTTGCTGCCGGACTAACCCTAGCACCGGCTCCCACATGATGGGGACTCTTCGGGCCTTTCAGGCTGTCTAACTTGTTTTGCACGAACAGTTAGGCGCGACCAAATCCGGCGACGCACGACGCTCGAGCGAC]
[-] EMBL CB096395             [                                                              GCGATTATATATCATGGCTTATAAGCTTATTAGAAATACAAAGTGTCGTAAACAAACATGAGAGATGGCCGGCACACTGGTTTGGATATCATGATATCCAACTTATTTATGACTACTCTAGGGCAGCATATATAGCCCTGCAGGGGATTCAAAGTGCGAATTCAAGTCCCTTATGCTTGCATGATGCAGTTGTTTAGGAAACGATAGTGACAATATCAGCTTCCTTGTTGCAGAAGTGGTAGCATGCTTCGTTGCAACGTTCCACAGCACCGTTCCCTTCTTCGTTGCCAGCAAAAGTGTTTATGTTGCTGCACACGGATGAAGTACATCCCAGCATACAGAAGTCAAGTACATCCAATTCCTCAGACTCAGGGTGAAGGGTGTGGTGAATGTAAGGTGGCTTGCATTTCCCATCAACAATTTTGCAGCCAGAGAGTTTAGAACATCCTTCCCTTGTGCCATGCGCAAAACGGCATGCATTATAGATGTTTCTTGCC GTGGTGGTTGGGCAGCAGC                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CB096440             [                                                                           ATGGCTTATAAGCTTATTAGAAATACAAAGTGTCGTAAACAAACATGAGAGATGGCCGGCACACTGGTTTGGATATCATGATATCCAACTTATTTATGACTACTCTAGGGCAGCATATATAGCCTTGCAGGGGATTCAAAGTGCGAATTCAAGTCCCTTATGCTTGCATGATGCAGTTGTTTAGGAAACGATAGTGACAATATCAGCTTCCTTGTTGCGGAAGTGGTAGCATGCTTCGTTGCAACGTTCCACAGCACCGTTCCCTTCTTCGTTGCCAGCAAAAGTGTTTATGTTGCTGCACACGGATGAAGTGCATCCCAGCATACAGAAGTCAAGTACATCCAATTCCTCAGACTCAGGGTGAAGGGTGTGGTGAATGTAAGGTGGCTTGCATTTCCCATCAACAATTTTGCAGCCAGAGAGTTTAGAACATCTTTCCCTTGTGCCATGCGCAAAACGGCATGCATTATAGATGTTTCTTGCC GTGGTGGTTGGGCAGCAGCTc                                                                                                                                                         ]




>consensus_7558#0
CCGCTAAAGGTGTCATCACTCTGCATATCCTCACATGCATCCTTAATAGAAGATGGTAGA
ATGCGATTATATATCATGGCTTATAAGCTTATTAGAAATACAAAGTGTCGTAAACAAACA
TGAGAGATGGCCGGCACACTGGTTTGGATATCATGATATCCAACTTATTTATGACTACTC
TAGGGCAGCATATATAGCCTTGCAGGGGATTCAAAGTGCGAATTCAAGTCCCTTATGCTT
GCATGATGCAGTTGTTTAGGAAACGATAGTGACAATATCAGCTTCCTTGTTGCAGAAGTG
GTAGCATGCTTCGTTGCAACGTTCCACAGCACCGTTCCCTTCTTCGTTGCCAGCAAAAGT
GTTTATGTTGCTGCACACGGATGAAGTACATCCCAGCATACAGAAGTCAAGTACATCCAA
TTCCTCAGACTCAGGGTGAAGGGTGTGGTGAATGTAAGGTGGCTTGCATTTCCCATCAAC
AATTTTGCAGCCAGAGAGTTTAGAACATCTTTCCCTTGTGCCATGCGCAAAACGGCATGC
ATTATAGATGTTTCTTGCCGTGGTGGTTGGGCAGCAGCTTTTTGCTCCCACCTTGATGGT
CTCTTGCTGCCGGACTAACCCTAGCACCGGCTCCCACATGATGGGGACTCTTCGGGCCTT
TCAGGCTGTCTAACTTGTTTTGCACGAACAGTTAGGCGCGACCAAATCCGGCGACGCACG
ACGCTCGAGCGAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case