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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7599#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1766 fasta sequence
[TATATTTATCCCCGTCTCCGCGCTCGTCTCGGCTCCTTCTTTGCCCACTTCCTGCCGCCGATTTTGCATCTCGCGAGCAGAGCAGGGCGCGCGGCTGCTTCCGCCACATCCTGGGGGTGGAATGCTTGCCAAGATGCAGTCGTGCCGATGGATCTTGGCTTACTTGCTCGTCGTTCTCGTGAGCCTGCACGGTGGTGCCAATGGCTTCTACCTCCCGGGCACATTCATGCACACCTACACCCCAAATGAGGTGATCTCAGCCAAGGTCAACTCGCTCACCTCCATTGAGACTGAGTTGCCCTTCAGCTACTACAGCTTGCCCTACTGTAAGCCCCCGGAAGGCGTCAAGAAGAGCGCCGAGAACCTCGGCGAGATCCTCATGGGTGATCAGATCGACAATTCGCCATACCGGTTCCGAGTCAACGTGAACGAGTCCGTGTACCTATGCACCACGGACCCACTCACCAAGGAGCAGGCCGAGCTGTTGAAGAAGCGGGCGCGAGATCTGTACCAGGTCAACATGATCCTTGACAATCTGCCGGTCATGCGATTCACCGAGCAGAATGGGGTGACTATCCAGTGGACCGGATTCCCGGTCGGGTACAACCCGATGGGGAGTAACGAGGATTACATCATTAACCATCTCAGGTTCAAGGTCTTGGTCCATCAGTACCAGGCGCAGGGTGATGTTGTGATCACCAGTGAGGATGGCGTTGCCATGGTGGAGTCGGATCGCAAGAGCGGATTCCAGATTGTTGGCTTCGAGGTTGTGCCTTGCAGTGTGAGGCGTGATCCTGAGGCGATGTCCAAGCTGAAGATGTATGACAAGGTTGATTCTGTCAAGTGCCCATTGGAGCTTGAGAAATCTCAGGCTATCCGTGAGAACGAGAGGATTACATTCACCTATGACGTTGAGTATGTTAAGAGCAACATTAAGTGGCCATCAAGGTGGGATGCATACTTGAAAATGGATGGTGCCAAGGTTCACTGGTTCTCGATCATGAACTCGATGATGGTTGTCTTCTTCTTGGCTGGTATCGTGTTTGTCATATTCTTGAGGACTGTCCGTAGGGATCTGACACGGTATGAGGAGATGGACAAGGAGGCGCAAGCTCAGATGAATGAGGAGCTCTCAGGATGGAAACTTGTGGTTGGTGATGTCTTCAGAGAGCCTTGCTGCTCAAAGCTGCTATGTGTTATGGTCGCTGATGGTATCCAGATCACTGGTATGGCAGTGGTTACAATTGTCTTTGCTGCTCTGGGTTTCCTCTCACCTGCTTCAAGGGGAATGCTCTTGACCGGAATGATCATCCTGTACCTCTTCCTTGGAATTATCGCTGGATATGTCGGTGTCCGTGTTTGGAGGACAATCAAAGGAACCTCAGAAGGGTGGAAATCTGTTGCTTGGCTGACCTCCTGCTTCTTCCCTGGCATTGTTTTCGTTATCCTGACTGTGCTGAACTCCATCCTGTGGGGCAAGAAGAGCACTGGAGCTTTACCTATCTCACTGTTTTTCACACTCCTGGCCCTGTGGTTCTGCATCTCAGTTCCACTCACACTTATTGGAGGTTTGCTGGGTACACGTGCTGCAAGCATAGAGTACCCTGTCCGTACCAACCAAATTCCACGAGAGATCCCTGAGCGCAAGTTCCCGTCATGGCTGCTTGTTTTGGGTGCTGGAACATTGCCCTTTGGCACCCTCTTCATTGAGCTTTTCTTCATCCTGTCTAGCATTTGGTTGGGGAGGTTCTACTACGTCTTTGGCT]
[+] EMBL CB638313 [TATATTTATCCCCGTCTCCGCGCTCGTCTCGGCTCCTTCTTTGCCCACTTCCTGCCGCCGATTTTGCATCTCGCGAGCAGAGCAGGGCGCGCGGCTGCTTCCGCCACATCCTGGGGGTGGAATGCTTGCCAAGATGCAGTCGTGCCGATGGATCTTGGCTTACTTGCTCGTCGTTCTCGTGAGCCTGCACGGTGGTGCCAATGGCTTCTACCTCCCGGGCACATTCATGCACACCTACACCCCAAATGAGGTGATCTCATCCAAGGTCAACTCGCTCACCTCCATTGAGACTGAGTTGCCCTTCAGCTACTACAGCTTGCCCTACTGTAAGCCCCCGGAAGGCGTCAAGAATATCGCCTATAACCCTGGCGAGATCCT ]
[+] EMBL AK100711 [ CTCCGCGCTCGTCTCGGCTCCTTCTTTGCCCACTTCCTGCCGCCGATTTTGCATCTCGCGAGCAGAGCAGGGCGCGCGGCTGCTTCCGCCACATCCTGGGGGTGGAATGCTTGCCAAGATGCAGTCGTGCCGATGGATCTTGGCTTACTTGCTCGTCGTTCTCGTGAGCCTGCACGGTGGTGCCAATGGCTTCTACCTCCCGGGCACATTCATGCACACCTACACCCCAAATGAGGTGATCTCAGCCAAGGTCAACTCGCTCACCTCCATTGAGACTGAGTTGCCCTTCAGCTACTACAGCTTGCCCTACTGTAAGCCCCCGGAAGGCGTCAAGAAGAGCGCCGAGAACCTCGGCGAGATCCTCATGGGTGATCAGATCGACAATTCGCCATACCGGTTCCGAGTCAACGTGAACGAGTCCGTGTACCTATGCACCACGGACCCACTCACCAAGGAGCAGGCCGAGCTGTTGAAGAAGCGGGCGCGAGATCTGTACCAGGTCAACATGATCCTTGACAATCTGCCGGTCATGCGATTCACCGAGCAGAATGGGGTGACTATCCAGTGGACCGGATTCCCGGTCGGGTACAACCCGATGGGGAGTAACGAGGATTACATCATTAACCATCTCAGGTTCAAGGTCTTGGTCCATCAGTACCAGGCGCAGGGTGATGTTGTGATCACCAGTGAGGATGGCGTTGCCATGGTGGAGTCGGATCGCAAGAGCGGATTCCAGATTGTTGGCTTCGAGGTTGTGCCTTGCAGTGTGAGGCGTGATCCTGAGGCGATGTCCAAGCTGAAGATGTATGACAAGGTTGATTCTGTCAAGTGCCCATTGGAGCTTGAGAAATCTCAGGCTATCCGTGAGAACGAGAGGATTACATTCACCTATGACGTTGAGTATGTTAAGAGCAACATTAAGTGGCCATCAAGGTGGGATGCATACTTGAAAATGGATGGTGCCAAGGTTCACTGGTTCTCGATCATGAACTCGATGATGGTTGTCTTCTTCTTGGCTGGTATCGTGTTTGTCATATTCTTGAGGACTGTCCGTAGGGATCTGACACGGTATGAGGAGATGGACAAGGAGGCGCAAGCTCAGATGAATGAGGAGCTCTCAGGATGGAAACTTGTGGTTGGTGATGTCTTCAGAGAGCCTTGCTGCTCAAAGCTGCTATGTGTTATGGTCGCTGATGGTATCCAGATCACTGGTATGGCAGTGGTTACAATTGTCTTTGCTGCTCTGGGTTTCCTCTCACCTGCTTCAAGGGGAATGCTCTTGACCGGAATGATCATCCTGTACCTCTTCCTTGGAATTATCGCTGGATATGTCGGTGTCCGTGTTTGGAGGACAATCAAAGGAACCTCAGAAGGGTGGAAATCTGTTGCTTGGCTGACCTCCTGCTTCTTCCCTGGCATTGTTTTCGTTATCCTGACTGTGCTGAACTCCATCCTGTGGGGCAAGAAGAGCACTGGAGCTTTACCTATCTCACTGTTTTTCACACTCCTGGCCCTGTGGTTCTGCATCTCAGTTCCACTCACACTTATTGGAGGTTTGCTGGGTACACGTGCTGCAAGCATAGAGTACCCTGTCCGTACCAACCAAATTCCACGAGAGATCCCTGAGCGCAAGTTCCCGTCATGGCTGCTTGTTTTGGGTGCTGGAACATTGCCCTTTGGCACCCTCTTCATTGAGCTTTTCTTCATCCTGTCTAGCATTTGGTTGGGGAGGTTCTACTACGTCTTTGGCT]
[+] EMBL CB646453 [ TTTGCATCTCGCGAGCAGAGCAGGGCGCGCGGCTGCTTCCGCCACATCCTGGGGGTGGAATGCTTGCCAAGATGCAGTCGTGCCGATGGATCTTGGCTTACTTGCTCGTCGTTCTCGTGAGCCTGCACGGTGGTGCCAATGGCTTCTACCTCCCGGGCACATTCATGCACACCTACACCCCAAATGAGGTGATCTCAGCCAAGGTCAACTCGCTCACCTCCATTGAGACTGAGTTGCCCTTCAGCTACTACAGCTTGCCCTACTGTAAGCCCCCGGAAGGCGTCAAGAAGAGCGCCGAGAACCTCGGCGAGATCCTCATGGGTGATCAGATCGACAATTCGCCATACCGGTTCCGAGTCAACGTGAACGAGTCCGTGTACCTATGCACCACGGACCCACTCACCAAGGAGCAGGCCGAGCTGTTGAAGAAGCGGGCGCGAGATCTGTACCAGGTCAACATGATCCTTGACAATCTGCCGGTCATGCGATTCACCGAGCAGAATGGGGTGACTATCCAGTGGACCGGATTCCCGGTCGGGTACAACCCGATGGGGAGTAACGAGGATTACATCATTAACCATCTCAGGTTCAAGGTCTTGGTCCATCAGTACCAGGCGCAGGGTGATGTTGTGATCACCAGTGACGATGGCGTTGCCATGGTGGAGTCGGATCGCAAGAGCGGATTCCA ]
[+] EMBL CB638096 [ AGCAGGGCGCGCGGCTGCTTCCGCCACATCCTGGGGGTGGAATGCTTGCCAAGATGCAGTCGTGCCGATGGATCTTGGCTTACTTGCTCGTCGTTCTCGTGAGCCTGCACGGTGGTGCCAATGGCTTCTACCTCCCGGGCACATTCATGCACACCTACACCCCAAATGAGGTGATCTCAGCCAAGGTCAACTCGCTCACCTCCATTGAGACTGAGTTGCCCTTCAGCTACTACAGCTTGCCCTACTGTAAGCCCCCGGAAGGCGTCAAGAAGAGCGCCGAGAACCTCGGCGAGATCCTCATGGGTGATCAGATCGACAATTCGCCATACCGGTTCCGAGTCAACGTGAACGAGTCCGTGTACCTATGCACCACGGACCCACTCACCAAGGAGCAGGCCGAGCTGTTGAAGAAGCGGGCGCGAGATCTGTACCAGGTCAACATGATCCTTGACAATCTGCCGGTCATGCGATTCACCGAGCAGAATGGGGTGACTATCCAGTGGACCGGATTCCCGGTCGGGTACAACCCGATGGGGAGTCACGAGGATTACATC ]
[+] EMBL OSR22321B [ AGGCGATGTCCAAGCTGAAGATGTATGACAAGGTTGATTCTGTCAAGTGCCCATTGGAGCTTGAGAAATCTCAGGCTATCCGTGAGAACGAGAGGATTACATTCACCTATGACGTTGAGTATGTTAAGAGCAACATTAAGTGGCCATCAAGGTGGGATGCATACTTGAAAATGGATGGTGCCAAGGTTCACTGGTTCTCGATCATGAACTCGATGATNGTTGTCTTCTTCTTGGCTGGTATCGTGTTTGTCATATTCTTGAGGACTGTCCGTAGGGATCTGACACGGTATGAGGAGATGGACAAGGAGGCGCAAGCTCAGATGAATGAGGAGCTCTCAGGATGG AACTTGTGGTTGGTGATGTCTTCAGAGAGCCTTGCTGCTCAAAGC ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||