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Oryza sativa
cluster # 7648 cluster # 7648       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7648#0 length = 1443 sequences # 5  
consensusID : consensus_7648#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1443
fasta sequence 
                              [GCATCCCTGCTTCCTCTAGCTCCGCCCTCGACGCCAACCCCACCAATCCGCCGCCTCCATGCCCTCCCCTTCCTCCCCGGCCTGAGATTAGCTTCGCCGCCGCGCCCAATCGCCCCGCCCTGCTGCTCCCCGCCGCCGATTCCGTCCCCCGTCCACCGCCATGGATCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAACCCGCATCTCGGGGTCAACAAGCTCGGCCGCAACATCCGCAAGGCCACGCCACCGCCGCCGCAGCCGCAGCCGCCGTCACGCCCGCCGCAGCCGCAGCCGCAGGTCTACAACATCAGCAAGAACCAGTTCCGCGACATAGTCCAGCAGCTCACCGCGGGGACCCCCTCCCCGCCTCCGCCGCCGCAGCCACAGCACCAGCACCACCCGCACCGCCCGCTGCCGCCGCAGCACCAGCAGCCCAAGCCCCCATCCATGCGCCTTCAGAAGATCCGCCCGCCTCCCATCTCCACCCCCGTCGCGCGGCCCCCTCCCGTCCACAACCACCAGATCCCCAACCCTAACCACAACCCCGCCTTCCACCGCCCACCGCCGCCGCAGCCCATGCCCATGCCTATGCCTGGTCCCCCCGTCTGGGCTGACTCACCGGTCACCGCCTACATGCGCATCCTCGAGAACTCCCTCTTCAGCGCCACCCCGCCAGGCGCCGCCGCCGCCGCTGCCGCTGCCGCCGCTGCTGCTACGGGACAACAGGCCCCTCCGCACCACCCTCATCCCCCACCCCCGCCGCCGGTGCCGTCGCCAGGGATACTCCCCTCGCCGAGCGGCTTTCTCAACCTGCTCTCGCCCACGCCCAGGTCGCCCTACCCGCTGCTATCGCCGGGCTTCCAGCACCCGGGGCCACTCACGCCCAACTTCCCCGCGCTGTCGCCGCTGCCGGGCACTGGGATCCTGGGTCCAGGGCCCATGGCTCCGCCGTCGCCTGGCCTCTGGTTCCCGCAGTCGCCGTCAGGGCTGCTCTCGCCCTCCGGGTTCTTGCCAATTCTGAGCCCAAGGTGGAGAGAGATGTAGTGCACATCGCTCGCCGCAGCGCAG-CACAAAGCTCCCGTGAAGGCCACAGCC-GGGTAACATTTGACGCTAGGGTTGTAGCTACTGTGAGGTGAATTGGTCGCTGCCCCGGAGATGGGCGCAGGTGGGTTGCAGCTTCGGACACCACTATTTGTTGCTCTCACTTACTGCTTGTGTGATTAGTCAGTCATTATATCAGTCAGTCTATAAGGTGGTTGCTCATATATTTGTAATTGTATAACTGGGAAAGTTTTTAATTCATTCACTTCTCTTAGCTGCANAAACCTGGACAGCAAAAACTGGGGCANGTTGTAGTTAGACTCTTTGAGTTATTAGGGTTGAAACANGTAAGTTGTAAAACTTTAGGTCAGTAAAGGTTAGCCCTTTNTCACTGTAAAAAA]

[+] EMBL CB672164             [GCATCCCTGCTTCCTCTAGCTCCGCCCTCGACGCCAACCCCACCAATCCGCCGCCTCCATGCCCTCCCCTTCCTCCCCGGCCTGAGATTAGCTTCGCCGCCGCGCCCAATCGCCCCGCCCTGCTGCTCCCCGCCGCCGATTCCGTCCCCCGTCCACCGCCATGGATCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAACCCGCATCTCGGGGTCAACAAGCTCGGCCGCAACATCCGCAAGGCCACGCCACCGCCGCCGCAGCCGCAGCCGCCGTCACGCCCGCCGCAGCCGCAGCCGCAGGTCTACAACATCAGCAAGAACCAGTTCCGCGACATAGTCCAGCAGCTCACCGCGGGGACCCCCTCCCCGCCTCCGCCGCCGCAGCCACAGCACCAGCACCACCCGCACCGCCCGCTGCCGCCGCAGCACCAGCAGCCCAAGCCCCCATCCATGCGCCTTCAGAAGATCCGCCCGCCTCCCATCTCCACCCCCGTCGCGCGGCCCCCTCCCGTCCACAACCACCAGATCCCCAACCCTAACCACAACCCCGCCTTCCACCGCCCACCGCCGCCGCAGCCCATGCCCATGCCTATGCCTGGTCCCCCCGTCTGGGCTGACTCACCGGTCACCGCCTACATGCGCATCCTCGAGAACTCCCTCTTCAGCGCCACCCCGCCAGGCGCCGCCGCCGCCGCTGCCGCTGCCGCCGCTGCTGCTACGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AK106138             [     CCGGCTTCCTCTAGCTCCGCCCTCGACGCCAACCCCACCAATCCGCCGCCTCCATGCCCTCCCCTTCCTCCCCGGCCTGAGATTAGCTTCGCCGCCGCGCCCAATCGCCCCGCCCTGCTGCTCCCCGCCGCCGATTCCGTCCCCCGTCCACCGCCATGGATCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAACCCGCATCTCGGGGTCAACAAGCTCGGCCGCAACATCCGCAAGGCCACGCCACCGCCGCCGCAGCCGCAGCCGCCGTCACGCCCGCCGCAGCCGCAGCCGCAGGTCTACAACATCAGCAAGAACCAGTTCCGCGACATAGTCCAGCAGCTCACCGCGGGGACCCCCTCCCCGCCTCCGCCGCCGCAGCCACAGCACCAGCACCACCCGCACCGCCCGCTGCCGCCGCAGCACCAGCAGCCCAAGCCCCCATCCATGCGCCTTCAGAAGATCCGCCCGCCTCCCATCTCCACCCCCGTCGCGCGGCCCCCTCCCGTCCACAACCACCAGATCCCCAACCCTAACCACAACCCCGCCTTCCACCGCCCACCGCCGCCGCAGCCCATGCCCATGCCTATGCCTGGTCCCCCCGTCTGGGCTGACTCACCGGTCACCGCCTACATGCGCATCCTCGAGAACTCCCTCTTCAGCGCCACCCCGCCAGGCGCCGCCGCCGCCGCTGCCGCTGCCGCCGCTGCTGCTACGGGACAACAGGCCCCTCCGCACCACCCTCATCCCCCACCCCCGCCGCCGGTGCCGTCGCCAGGGATACTCCCCTCGCCGAGCGGCTTTCTCAACCTGCTCTCGCCCACGCCCAGGTCGCCCTACCCGCTGCTATCGCCGGGCTTCCAGCACCCGGGGCCACTCACGCCCAACTTCCCCGCGCTGTCGCCGCTGCCGGGCACTGGGATCCTGGGTCCAGGGCCCATGGCTCCGCCGTCGCCTGGCCTCTGGTTCCCGCAGTCGCCGTCAGGGCTGCTCTCGCCCTCCGGGTTCTTGCCAATTCTGAGCCCAAGGTGGAGAGAGATGTAGTGCACATCGCTCGCCGCAGCGCAG CACAAAGCTCCCGTGAAGGCCACAGCC GGGTAACATTTGACGCTAGGGTTGTAGCTACTGTGAGGTGAATTGGTCGCTGCCCCGGAGATGGGCGCAGGTGGGTTGCAGCTTCGGACACCACTATTTGTTGCTCTCACTTACTGCTTGTGTGATTAGTCAGTCATTATATCAGTCAGTCTATAAGGTGGTTGCTCATATATTTGTAATTGTATAACTGGGAAAGTTTTTAATTCATTCACTTC                                                                                                                                    ]
[+] EMBL OS0223A              [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CCAGGTCGCCCTACCCGCTGCTATCGCCGGGCTTCCAGCACCCGGGGCCACTCACGCCCAACTTCCCCGCGCTGTCGCCGCTGCCGGGCACTGGGATCCTGGGTCCAGGGCCCATGGCTCCGNCGTCGCCTGGCCTCTGGTTCCCGCAGTCGCCGTCAGGGCTGCTCTCGCCCTCCGGGTTCTTGCCAATTCTGAGCCCAAGGTGGAGAGAGATGTAGTGCACATNGCTNGCCGCAGCGCAGACA AAAGCTCCCGTGAAGGCCACAGCCGGGGTAACATTTGACGNTAGGGTTGTAGCTACTGTGAGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AU062915             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CCAAGGTGGAGAGAGATGTAGTGCACATCGCTCGCCGCAGCGCA  NACAAAGCTCCCGTGAAGGCCACAGCC GGGTAACATTTGACGCTAGGGTTGTAGCTACTGTGAGGTGAATTGGTCGCTGCCCCGGAGATGGGCGCAGGTGGGTTGCAGCTTCGGACACCACTATTTGTTGCTCTCACTTACTGCTTGTNTGATTAGTCAGTCATTATATCAGTCAGTCTATANGGTGGTTGCTCANATATTTGTANTTGTATAACTGGGAAAGTTTTTANTTCATTCACTTCTCTTAGCTGCANAAACCTGGACAGCAAAAACTGGGGCANGTTGTAGTTAGACTCTTTGAGTTATTAGGGTTGAAACANGTAAGTTGTAAAACTTTAGGTCAGTAAAGGTTAGCCCTTTNTCACTGTAAAAAA]
[+] EMBL C97961               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GCCGNAGCGCAG CACAANGCTCCCGTGAAGGCAACAGCC GGGTAACATTTGACGCTAGGGTTGTAGCTACTNTGAGGTGAATTGGTCGNTGCCCCGGAGATGGGCGCAGGTGGGTTGCAGCTTCGGACACCACTATTTGTTGCTCTCACTTACTGCTTGTGTGATTAGTCAGTCATTATATCAGTCAGTCTATAAGGTGGTTGCTNATATATTTNTNATTGTATNNCTGGGAAAGTTTTTAATTCATTCACTTNTCTTNGCTGCAAAAAaa                                                                                                                   ]




>consensus_7648#0
GCATCCCTGCTTCCTCTAGCTCCGCCCTCGACGCCAACCCCACCAATCCGCCGCCTCCAT
GCCCTCCCCTTCCTCCCCGGCCTGAGATTAGCTTCGCCGCCGCGCCCAATCGCCCCGCCC
TGCTGCTCCCCGCCGCCGATTCCGTCCCCCGTCCACCGCCATGGATCGCAGCAGCAGCAG
CAGCAGCAACAGCAACCCGCATCTCGGGGTCAACAAGCTCGGCCGCAACATCCGCAAGGC
CACGCCACCGCCGCCGCAGCCGCAGCCGCCGTCACGCCCGCCGCAGCCGCAGCCGCAGGT
CTACAACATCAGCAAGAACCAGTTCCGCGACATAGTCCAGCAGCTCACCGCGGGGACCCC
CTCCCCGCCTCCGCCGCCGCAGCCACAGCACCAGCACCACCCGCACCGCCCGCTGCCGCC
GCAGCACCAGCAGCCCAAGCCCCCATCCATGCGCCTTCAGAAGATCCGCCCGCCTCCCAT
CTCCACCCCCGTCGCGCGGCCCCCTCCCGTCCACAACCACCAGATCCCCAACCCTAACCA
CAACCCCGCCTTCCACCGCCCACCGCCGCCGCAGCCCATGCCCATGCCTATGCCTGGTCC
CCCCGTCTGGGCTGACTCACCGGTCACCGCCTACATGCGCATCCTCGAGAACTCCCTCTT
CAGCGCCACCCCGCCAGGCGCCGCCGCCGCCGCTGCCGCTGCCGCCGCTGCTGCTACGGG
ACAACAGGCCCCTCCGCACCACCCTCATCCCCCACCCCCGCCGCCGGTGCCGTCGCCAGG
GATACTCCCCTCGCCGAGCGGCTTTCTCAACCTGCTCTCGCCCACGCCCAGGTCGCCCTA
CCCGCTGCTATCGCCGGGCTTCCAGCACCCGGGGCCACTCACGCCCAACTTCCCCGCGCT
GTCGCCGCTGCCGGGCACTGGGATCCTGGGTCCAGGGCCCATGGCTCCGCCGTCGCCTGG
CCTCTGGTTCCCGCAGTCGCCGTCAGGGCTGCTCTCGCCCTCCGGGTTCTTGCCAATTCT
GAGCCCAAGGTGGAGAGAGATGTAGTGCACATCGCTCGCCGCAGCGCAGCACAAAGCTCC
CGTGAAGGCCACAGCCGGGTAACATTTGACGCTAGGGTTGTAGCTACTGTGAGGTGAATT
GGTCGCTGCCCCGGAGATGGGCGCAGGTGGGTTGCAGCTTCGGACACCACTATTTGTTGC
TCTCACTTACTGCTTGTGTGATTAGTCAGTCATTATATCAGTCAGTCTATAAGGTGGTTG
CTCATATATTTGTAATTGTATAACTGGGAAAGTTTTTAATTCATTCACTTCTCTTAGCTG
CANAAACCTGGACAGCAAAAACTGGGGCANGTTGTAGTTAGACTCTTTGAGTTATTAGGG
TTGAAACANGTAAGTTGTAAAACTTTAGGTCAGTAAAGGTTAGCCCTTTNTCACTGTAAA
AAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)