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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7686#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 2855 fasta sequence
[TCCCTCCTCCCCTGAAGAAGTCGAAACCCTCCCACCGCCGGTGGGCGGTGGCGGCAAGCCGGCAACGGCGGAATCCACCCTCCTCCGGCGGCGCTGGCTGAAGACGACAGCCATGCCTACCTACCTGCCTTCCTGCCTTTCCCCTCCCTTTCTCCCCTAGCTAGGGGAATGTGCGAGAGCAGTCTAGACTCTAGAGGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGCTTTTTCTCCTCGTCCAGGTTCTCACGGCGAAATTCCGCTCCTCCTTTTTGTGCCTGCGACGAGCACTCCCGTATCGCGAATGGATTGGCTGGTTTTCTGGGTTCCTTCAGTGAAAAATCTGGCCGTGTAGGTGTCGAAGGCCAGAGATTATCGAAGTTTTTGTGTTTTGGTCTTGTGAATTTTGCGAAGGTAAACCTCATATATCTCTGATGGGATTGATGTATGTCTGGGGAATGCTTCTTATATTTGGCATGATTCTCATTATCTAATTTTTTTTTGGCATGATTCTGATTTCTGAGACCTTGAATTGACGATAACTTTCCCAGATTAATGTTGGGATTTGCAGTAGTATTACAAGACATGTTAAACATATTAAGTACTAGCATGATACTGGTAGGAATTGAAGGCTCATGGCCCTAACATGAGCATGATATATATTCACCCATTTCACCCGTATCAGTTTCAGCTTTGGAATCAGGATACTGTGGTAGTTTTGATGGTGTTCTTACATAACTTGCCTGCGCATGGAGCATGTCTCGATCCTTACTATTGTCGATTTAATTTTTCCTGTTGCAACATGAACTCAAAGCCTAGGATCTAGAACAAAATTATCATCTATTTCTGTTTTGTTATGAATATAACTGTGCCATTGTTCTTCCTATGCTCGACTCCAGAATGAAAAAGATAAGTTGCATTGACTAAAATCTCACTGAATACGGTGCCCGAAAAAACTGTTCACATGACCTCCTGATTAAAGACGAAAAATATACACCTAAAGCCAACAGTTTGCAGAAATATTTATTAATGTTTCTCTTGAATGAAAATACAATAACTCCTTAAAGTCGTCCTGGATGGATCACTGATGAAGATAATACTACCGAGGTACCTTCTCAATTTTCAAATAGAAATGAACTTTTAAACCTATTTCCCCCCAATGAACAAGAGGTTTTACTGCCTGATATTATGTCAACACCTGCTTAATGGCTAATTCTGCTCCTGTTAAGTTGAAGGTGAACTACCAGTGTAAGTGAACTGTCTGCTTAAGAATCCCAAATGGGTTTTTCCAATGCAGTGGGGTCAAGAGATGACTGATGGTAAGAGTAGATATGTTCCTGAGGTTTCTCCTGCTCATCAGAATAGCTTAATGCTGTCACATCCGCGTTGGAAAATGCTAGGGTTATCCTTTTCTTCTCTCATGGAAAATGGATGGTTCATTAGTCCAATTAAAGGCACAGTACCTGGCCTCATGATGCCACTGGACCACGGTGCGTTGATCAGAATATTACCACGGCCAATCATCACAAGTTTCTTAGTTCATGGCTAAAACGGCACTGCACAAGAACATATTGAGTTTCCAGTTCTGAGGATCAGAGGTGCTAAAAAGCCAGGTGTAACCAAGAAACACAATTATTGTTTTGAGCATTGCTTTGATGCATTTATTATGTCACTTGCACAGTTGCACGTGTGCTCATGAAATCAGACAATTATCACTCGAAATAATGAGGAAAGATCGAAGGGACGTACCTGGGTTTCCTGGGTGACCTCGTCTCTTCTTCACCACAGGCATGACAGTGTCACCTTTGCTTGATCCAGCAGCGCACGCCTCTAGCTTCGGTTGCTGCTGGAGGTTGTTCAAGGATTCTTCCTCTGATGTGTGTGACATTGTTTGGAGGCTCAGTTAGTGGTTTTAGAGGGTGCCAGTAAAGTGAGGAGGGTTGATGATTTATGCACAACAGAGTGGAGGGACTACAACTGGACAATAGGGAAATGGTGAATTCCCTTTCAGTCACCATCAAGGACTGCAACCATTAGTTTTAAATCTGAGGAACACGACGCTGATTGTTTCGTCAGCATGGAATGTTCTGTTCATTGTTCCTGATTATTTTGTCAGGATCACTGGAGTTTCCTGAGTGAAGCTCCACATGAAGAGAGATATCGAGCCTTGAGTTGCATGCCTACTGTACGCCCATTTTGTTGCAAATTATAACAGTTTCATTTAGTGTGCGCTATGAGCGACAGGTCGATATGATGACCATTTGGGGATCTCAAAGAAAACACTTCACTGCAGACAGTAAATCTGTGCTACTGGACCTTTATTTTTCTCCTGCTGTGAGTATAAATCTGAACACCTTGTAACTATCGACACGAGGATGGAATTCATGTCATATTTCACCGCAGGTGGAACAATGGCTGTGAAGAGCAGGCAGGAGGCGGTTTTGTCGGTACAAGGAAGGTGATGGATATGACAAGGGGGAGATCCGGGAGGAGAGACAAACTCTGGCCATGTTCTTTTTCTAACCGGCATCCATGGTATCTCCCTCCTCTGCTGGCACAACTGTCAGACTTGCTCTTGTTTTAGTGCTTGGAGCATGGTGGTACCTGGGGGCTTTGAAGGTTTCCACGGCATGTCATCCAATGCAGATACTGAGACCGGAGAGAGGCTGGAAGGTATGTCAAATGAACCGTTCACCGATTTGGCTACTTCTAGTTATCTCCGGTCTCAGCATCTGCATTGGATTTGTCCAGAGATGGGTTTTTTTGGATTTGCTCACTGACCTCTCCATGAACTTCATATGT-TAGTTTAAGTACATTAACA-GCTTATATACTCTTCAAG-TCATCATTTTTCCCTAAAAAAAAA]
[+] EMBL AK069284 [TCCCTCCTCCCCTGAAGAAGTCGAAACCCTCCCACCGCCGGTGGGCGGTGGCGGCAAGCCGGCAACGGCGGAATCCACCCTCCTCCGGCGGCGCTGGCTGAAGACGACAGCCATGCCTACCTACCTGCCTTCCTGCCTTTCCCCTCCCTTTCTCCCCTAGCTAGGGGAATGTGCGAGAGCAGTCTAGACTCTAGAGGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGCTTTTTCTCCTCGTCCAGGTTCTCACGGCGAAATTCCGCTCCTCCTTTTTGTGCCTGCGACGAGCACTCCCGTATCGCGAATGGATTGGCTGGTTTTCTGGGTTCCTTCAGTGAAAAATCTGGCCGTGTAGGTGTCGAAGGCCAGAGATTATCGAAGTTTTTGTGTTTTGGTCTTGTGAATTTTGCGAAGGTAAACCTCATATATCTCTGATGGGATTGATGTATGTCTGGGGAATGCTTCTTATATTTGGCATGATTCTCATTATCTAATTTTTTTTTGGCATGATTCTGATTTCTGAGACCTTGAATTGACGATAACTTTCCCAGATTAATGTTGGGATTTGCAGTAGTATTACAAGACATGTTAAACATATTAAGTACTAGCATGATACTGGTAGGAATTGAAGGCTCATGGCCCTAACATGAGCATGATATATATTCACCCATTTCACCCGTATCAGTTTCAGCTTTGGAATCAGGATACTGTGGTAGTTTTGATGGTGTTCTTACATAACTTGCCTGCGCATGGAGCATGTCTCGATCCTTACTATTGTCGATTTAATTTTTCCTGTTGCAACATGAACTCAAAGCCTAGGATCTAGAACAAAATTATCATCTATTTCTGTTTTGTTATGAATATAACTGTGCCATTGTTCTTCCTATGCTCGACTCCAGAATGAAAAAGATAAGTTGCATTGACTAAAATCTCACTGAATACGGTGCCCGAAAAAACTGTTCACATGACCTCCTGATTAAAGACGAAAAATATACACCTAAAGCCAACAGTTTGCAGAAATATTTATTAATGTTTCTCTTGAATGAAAATACAATAACTCCTTAAAGTCGTCCTGGATGGATCACTGATGAAGATAATACTACCGAGGTACCTTCTCAATTTTCAAATAGAAATGAACTTTTAAACCTATTTCCCCCCAATGAACAAGAGGTTTTACTGCCTGATATTATGTCAACACCTGCTTAATGGCTAATTCTGCTCCTGTTAAGTTGAAGGTGAACTACCAGTGTAAGTGAACTGTCTGCTTAAGAATCCCAAATGGGTTTTTCCAATGCAGTGGGGTCAAGAGATGACTGATGGTAAGAGTAGATATGTTCCTGAGGTTTCTCCTGCTCATCAGAATAGCTTAATGCTGTCACATCCGCGTTGGAAAATGCTAGGGTTATCCTTTTCTTCTCTCATGGAAAATGGATGGTTCATTAGTCCAATTAAAGGCACAGTACCTGGCCTCATGATGCCACTGGACCACGGTGCGTTGATCAGAATATTACCACGGCCAATCATCACAAGTTTCTTAGTTCATGGCTAAAACGGCACTGCACAAGAACATATTGAGTTTCCAGTTCTGAGGATCAGAGGTGCTAAAAAGCCAGGTGTAACCAAGAAACACAATTATTGTTTTGAGCATTGCTTTGATGCATTTATTATGTCACTTGCACAGTTGCACGTGTGCTCATGAAATCAGACAATTATCACTCGAAATAATGAGGAAAGATCGAAGGGACGTACCTGGGTTTCCTGGGTGACCTCGTCTCTTCTTCACCACAGGCATGACAGTGTCACCTTTGCTTGATCCAGCAGCGCACGCCTCTAGCTTCGGTTGCTGCTGGAGGTTGTTCAAGGATTCTTCCTCTGATGTGTGTGACATTGTTTGGAGGCTCAGTTAGTGGTTTTAGAGGGTGCCAGTAAAGTGAGGAGGGTTGATGATTTATGCACAACAGAGTGGAGGGACTACAACTGGACAATAGGGAAATGGTGAATTCCCTTTCAGTCACCATCAAGGACTGCAACCATTAGTTTTAAATCTGAGGAACACGACGCTGATTGTTTCGTCAGCATGGAATGTTCTGTTCATTGTTCCTGATTATTTTGTCAGGATCACTGGAGTTTCCTGAGTGAAGCTCCACATGAAGAGAGATATCGAGCCTTGAGTTGCATGCCTACTGTACGCCCATTTTGTTGCAAATTATAACAGTTTCATTTAGTGTGCGCTATGAGCGACAGGTCGATATGATGACCATTTGGGGATCTCAAAGAAAACACTTCACTGCAGACAGTAAATCTGTGCTACTGGACCTTTATTTTTCTCCTGCTGTGAGTATAAATCTGAACACCTTGTAACTATCGACACGAGGATGGAATTCATGTCATATTTCACCGCAGGTGGAACAATGGCTGTGAAGAGCAGGCAGGAGGCGGTTTTGTCGGTACAAGGAAGGTGATGGATATGACAAGGGGGAGATCCGGGAGGAGAGACAAACTCTGGCCATGTTCTTTTTCTAACCGGCATCCATGGTATCTCCCTCCTCTGCTGGCACAACTGTCAGACTTGCTCTTGTTTTAGTGCTTGGAGCATGGTGGTACCTGGGGGCTTTGAAGGTTTCCACGGCATGTCATCCAATGCAGATACTGAGACCGGAGAGAGGCTGGAAGGTATGTCAAATGAACCGTTCACCGATTTGGCTACTTCTAGTTATCTCCGGTCTCAGCATCTGCATTGGATTTGTCCAGAGATGGGTTTTTTTGGATTTGCTCACTGACCTCTCCATGAACTTCATATGT TAGTTTAAGTACATTAACA GCTTATATACTCTTCAAG TCATC ]
[+] EMBL CB634316 [ ATATCTCTGATGGGATTGATGTATGTCTGGGGAATGCTTCTTATATTTGGCATGATTCTCATTATCTAATTTTTTTTTGGCATGATTCTGATTTCTGAGACCTTGAATTGACGATAACTTTCCCAGATTAATGTTGGGATTTGCAGTAGTATTACAAGACATGTTAAACATATTAAGTACTAGCATGATACTGGTAGGAATTGAAGGCTCATGGCCCTAACATGAGCATGATATATATTCACCCATTTCACCCGTATCAGTTTCAGCTTTGGAATCAGGATACTGTGGTAGTTTTGATGGTGTTCTTACATAACTTGCCTGCGCATGGAGCATGTCTCGATCCTTACTATTGTCGATTTAATTTTTCCTGTTGCAACATGAACTCAAAGCCTAGGATCTAGAACAAAATTATCATCTATTTCTGTTTTGTTATGAATATAACTGTGCCATTGTTCTTCCTATGCTCGACTCCAGAATGAAAAAGATAAGTTGCATTGACTAAAATCTCACTGAATACGGTGCCCGAAAAAACTGTTCACATGACCTCCTGATTAAAGACGAAAAATATACACCTAAAGCCAACAGTTTGCAGAAATATTTATTAATGTTTCTCTTGAATGAAAATACAATAACTCCTTAAAGTCGTCCTGGATGGATCACTGATGAAGATAATACTACCGAGGTACCTTCTCAATTTTCAAATAGAAATGAACTTTTAAACCTATTTCCCCCCAATGAACAAGAGGTTTTACTGCCTGATATTATGTCAACACCTGCTTAATGGCTAATT ]
[+] EMBL CF326969 [ GATCCAGCAGCGCAAGCCTCTAGCTTCGGTTGCTGCTGGAGGTTGTTCAAGGATTCTTCCTCTGATGTGTGTGACATTGTTTGGAGGCTCAGTTAGTGGTTTTAGAGGGTGCCAGTAAAGTTAGGAGGGTTGATGATTTATGCACAACAGATTGGAGGGACTACAACTGGACAATAGGGAAATGGTGAATTCCCTTTCAGTCACCATCAAGGACTGCAACCATTAGTTTTAAATCTGAGGAACACGACGCTGATTGTTTCGTCAGCATGGAATGTTCTGTTCATTGTTCCTGATTATTTTGTCAGGATCACTGGAGTTTCCTGAGTGAAGCTCCACATGAAGAGAGATATCGAGCCTTGAGTTGCATGCCTACTGTACGCCCATTTTGTTGCAAATTATAACAGTTTCATTTAGTGTGCGCTATGAGCGACAGGTCGATATGATGACCATTTG ]
[-] EMBL CB634317 [ GTTTCGTCAGCATGGAATGTTCTGTTCATTGTTCCTGATTATTTTGTCAGGATCACTGGAGTTTCCTGAGTGAAGCTCCACATGAAGAGAGATATCGAGCCTTGAGTTGCATGCCTACTGTACGCCCATTTTGTTGCAAATTATAACAGTTTCATTTAGTGTGCGCTATGAGCGACAGGTCGATATGATGACCATTTGGGGATCTCAAAGAAAACACTTCACTGCAGACAGTAAATCTGTGCTACTGGACCTTTATTTTTCTCCTGCTGTGAGTATAAATCTGAACACCTTGTAACTATCGACACGAGGATGGAATTCATGTCATATTTCACCGCAGGTGGAACAATGGCTGTGAAGAGCAGGCAGGAGGCGGTTTTGTCGGTACAAGGAAGGTGATGGATATGACAAGGGGGAGATCCGGGAGGAGAGACAAACTCTGGCCATGTTCTTTTTCTAACCGGCATCCATGGTATCTCCCTCCTCTGCTGGCACAACTGTCAGACTTGCTCTTGTTTTAGTGCTTGGAGCATGGTGGTACCTGGGGGCTTTGAAGGTTTCCACGGCATGTCATCCAATGCAGATACTGAGACCGGAGAGAGGCTGGAAGGTATGTCAAATGAACCGTTCACCGATTTGGCTACTTCTAGTTATCTCCGGTCTCAGCATCTGCATTGGATTTGTCCAGAGATGGGTTTTTTTGGATTTGCTCACTGACCTCTCCATGAACTTCATATGT TAGTTTAAGTACATTAACA GCTTATATACTCTTCAAG TCATCATTTTTCCCTA ]
[-] EMBL CF326970 [ GTCAGACTTGATATTGTTTTAGTGCTTGGAGCATGCTGGAACCTGGGGGCTTTCAAGGTTTCCACGGCATGTCATCCAATGCAGATACTGAGACCGGAGAGAGGATGCAAGGTATGTCAAATGAACCGTTCTCCGATTTGGGTACTTCCAGTTATCTCCGGTCTCAGCATCTGCATTGGATTTGTCCAAAGATGGGTTTTTTTGGATTTGCTCACTGACCTCTCCATGAACTTCATATGTATAGTTTAAGTACATTAACAGGCTTATATACTCTCCAAGTTCATCACTTTTCCCTAAAAAAAAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||