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Oryza sativa
cluster # 7741 cluster # 7741       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7741#0 length = 1510 sequences # 5  

consensusID : consensus_7741#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1510
fasta sequence
                              [AAGGTTGGGGAAAGTGTTTATGGAAGTGTGTATAAGGGACTTCTTCGGCAAACAAATGTGGCTGTAAAGAAGTTGAATCCTGAAAGCACAGAGTCACTGTCACAGTTCAGTCATGAGGTGGAAATCCTTAGCAGGGTGCGACATCCGAATCTTGTAACTCTTATAGGGGCATGCAAGGATGCCCGAGCTCTTGTCTATAAATACATGCCCAATGGAAGCTTAGATGACCGCTTGGCTTGCAAGGACAATTCAAAGCCTCTTAGTTGGCAGTTGCGTACCCGCATCGCTTCCAATATTTGTTCTGCACTGATTTTTCTCCATTCCAATAAACCCCACAGCATTGTTCACAGTGACTTGAAAGCATCTAACATTCTTCTTGATGGAAATAATGTGGCTAAGCTTAGTGGTTTTGGTGTGTGCCGAATGTTAACTGATGAATTCAAGGCCACAACCACTCTATACCGCCATACCCACCCAAAAGGAACTTTTGTGTACATTGATCCTGAATACGCTATTTCTGGTGATCTGACACCCCTATCTGATGTATATTCTTTTGGTATCATACTCCTGCGACTCTTGACTGGAAGATCAGGATTTGGTCTTTTGAAAGATGTGCAACGGGCAGTAGCAAAGGGTTGCTTGCAAGCAATATTGGATTCATCAGCTGGAGACTGGCCTCTTATGCATGCTGAGCAGTTGTCTCGGGTAGGCCTAAGATGCTGTGAAATCAGAAGAAAAAACCGTCCTGACCTGCAAACAGAGGTTTGGACAGTACTTGAACCAATGTTGAGGTCTGCTTCCTCTATGCTATGTTCATTATCATTTAAATCAGTATCTGAAGACTTTGGTAATGTGCCATCCTACTTCATCTGTCCAATACAACAGGATGTCATGAGGGACCCTTTAATTGCTGCAGATGGTTTCACCTACGAAGCAGAGGCTATAAGAGAGTGGTTTGATAGTGGTCACTATACATCACCCATGACAAACCT-CGATCTACCACACCGTGATCTTTTGCCGAACCATGCCCTCCGTTCTGCAATTCAAGAATGGCTTCAGTCAAATGCAGATTAATATGTTTGGATTCTCATCATGGAAAGTAACAATGAAAATTATGTCATATATCTTCTGAAGATACATCTCAGACCAGGGTTAATAAGCAGAAACCACAGGAAACCAAACGTCTTGTGTCTTTTTTTGTTCTGAAGGAATGACTAATTAAAGGTATACACACGGTTGTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTAGCAAAACCTGTATGTAAAAAATATAATAAATTCGGAGCTATCTCTGCTCCATCAGTAGCATGGTAGACATTGTACAGGTAGTCACTTGTCACTTTGTCAGTGTAGTAG-AGAGTTGTGATATCTGAGCAATAGCC--AAAAAAATGCTCAGCTAGAGTGTAT--GGAAGTGGAAATACATGTATGAATAGAACTATCAGATCAGAATTTCACCATTTATAAGGGTATCATGCTTACGTGTTGTAACCATTCTGA]

[+] EMBL AK058797             [AAGGTTGGGGAAAGTGTTTATGGAAGTGTGTATAAGGGACTTCTTCGGCAAACAAATGTGGCTGTAAAGAAGTTGAATCCTGAAAGCACAGAGTCACTGTCACAGTTCAGTCATGAGGTGGAAATCCTTAGCAGGGTGCGACATCCGAATCTTGTAACTCTTATAGGGGCATGCAAGGATGCCCGAGCTCTTGTCTATAAATACATGCCCAATGGAAGCTTAGATGACCGCTTGGCTTGCAAGGACAATTCAAAGCCTCTTAGTTGGCAGTTGCGTACCCGCATCGCTTCCAATATTTGTTCTGCACTGATTTTTCTCCATTCCAATAAACCCCACAGCATTGTTCACAGTGACTTGAAAGCATCTAACATTCTTCTTGATGGAAATAATGTGGCTAAGCTTAGTGGTTTTGGTGTGTGCCGAATGTTAACTGATGAATTCAAGGCCACAACCACTCTATACCGCCATACCCACCCAAAAGGAACTTTTGTGTACATTGATCCTGAATACGCTATTTCTGGTGATCTGACACCCCTATCTGATGTATATTCTTTTGGTATCATACTCCTGCGACTCTTGACTGGAAGATCAGGATTTGGTCTTTTGAAAGATGTGCAACGGGCAGTAGCAAAGGGTTGCTTGCAAGCAATATTGGATTCATCAGCTGGAGACTGGCCTCTTATGCATGCTGAGCAGTTGTCTCGGGTAGGCCTAAGATGCTGTGAAATCAGAAGAAAAAACCGTCCTGACCTGCAAACAGAGGTTTGGACAGTACTTGAACCAATGTTGAGGTCTGCTTCCTCTATGCTATGTTCATTATCATTTAAATCAGTATCTGAAGACTTTGGTAATGTGCCATCCTACTTCATCTGTCCAATACAACAGGATGTCATGAGGGACCCTTTAATTGCTGCAGATGGTTTCACCTACGAAGCAGAGGCTATAAGAGAGTGGTTTGATAGTGGTCACTATACATCACCCATGACAAACCC CGATCTACCACACCGTGATCTTTTGCCGAACCATGCCCTCCGTTCTGCAATTCAAGAATGGCTTCAGTCAAATGCAGATTAATATGTTTGGATTCTCATCATGGAAAGTAACAATGAAAATTATGTCATATATCTTCTGAAGATACATCTCAGACCAGGGTTAATAAGCAGAAACCACAGGAAACCAAACGTCTTGTGTCTTTTTTTGTTCTGAAGGAATGACTAATTAAAGGTATACACACGGTTGTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTAGCAAAACCTGTATGTAAAAAATATAATAAATTCGGAGCTATCTCTGCTCCATCAGTAGCATGGTAGACATTGTACAGGTAGTCACTTGTCACTTTGTCAGTGTAGTAG AGAGTTGTGATATCTGAGCAATAGCC  AAAAAAATGCTCAGCTAGAGTGTAT  GGAAGTGGAAATACATGTATGAATAGAACTATCAGATCAGAATTT                                             ]
[-] EMBL CB631963             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gGGATTCATCAGCTGGAGACTGGCCTCTTATGCATGCTGAGCAGTTGTCTCGGGTAGGCCTAAGATGCTGTGAAATCAGAAGAAAAAACCGTCCTGACCTGCAAACAGAGGTTTGGACAGTACTTGAACCAATGTTGAGGTCTGCTTCCTCTATGCTATGTTCATTATCATTTAAATCAGTATCTGAAGACTTTGGTAATGTGCCATCCTACTTCATCTGTCCAATACAACAGGATGTCATGAGGGACCCTTTAATTGCTGCAGATGGTTTCACCTACGAAGCAGAGGCTATAAGAGAGTGGTTTGATAGTGGTCACTATACATCACCCATGACAAACCT CGATCTACCACACCGTGATCTTTTGCCGAACCATGCCCTCCGTTCTGCAATTCAAGAATGGCTTCAGTCAAATGCAGATTAATATGTTTGGATTCTCATCATGGAAAGTAACAATGAAAATTATGTCATATATCTTCTGAAGATACATCTCAGACCAGGGTTAATAAGCAGAAACCACAGGAAACCAAACGTCTTGTGTCTTTTTTTGTTCTGAAGGAATGACTAATTAAAGGTATACACACGGTTGTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTAGCAAAACCTGTATGTAAAAAATATAATAAATTCGGAGCTATCTCTGCTCCATCAGTAGCATGGTAGACATTGTACAGGTAGTCACTTGTCACTTTGTCAGTGTAGTAG AGAGTAGTGATATCTGAGCAATAGCCAAAAAAAAAAGCTCAGCTAGAGTGTAT  GGAAGTGGAAATACATGTATGAATAGAACTATCAGATCAGAATTTCACCATTTATAAGGGTATCATGCTTACGTGTTGTAACCATTCTGA]
[+] EMBL CF316548             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCTGCTTCCTCTATGCTATGTTCATTATCATTTAAATCAGTATCTGAAGACTTTGGTAATGTGCCATCCTACTTCATCTGTCCAATACAACAGGATGTCATGAGGGACCCTTTAATTGCTGCAGATGGTTTCACCTACGAAGCAGAGGCTATAAGAGAGTGGTTTGATAGTGGTCACTATACATCACCCATGACAAACCT CGATCTACCACACCGTGATCTTTTGCCGAACCATGCCCTCCGTTCTGCAATTCAAGAATGGCTTCAGTCAAATGCAGATTAATATGTTTGGATTCTCATCATGGAAAGTAACAATGAAAATTATGTCATATATCTTCTGAAGATACATCTCAGACCAGGGTTAATAAGCAGAAACCACAGGAAACCAAACGTCTTGTGTCTTTTTTTGTTCTGAAGGAATGACTAATTAAAGGTATAC CACGGTTGTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTAGCAAAACCTGTATGTAAAAAATATAATAAATTCGGAGCTATCTCTGCTCCATCAGTAGCATGGTAGACATTGTACAGGTAGTCACTTGTCACTTTGTCAGTGTAGTAGAAGAGTTGTGATATCTGAGCAATAGCC  AAAAAAATGCTCAGCTAGAGTGTTTTGGGAAGTGGAAATACATGTATGAATAGAACTATCAGATCAGAAaa                                              ]
[-] EMBL CA882843             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTATCATTTAAATCAGTATCTGAAGACTTTGGTAATGTGCCATCCTACTTCATCTGTCCAATACAACAGGATGTCATGAGGGACCCTTTAATTGCTGCAGATGGTTTCACCTACGAAGCAGAGGCTATAAGAGAGTGGTTTGATAGTGGTCACTATACATCACCCATGACAAACCT CGATCTACCACACCGTGATCTTTTGCCGAACCATGCCCTCCGTTCTGCAATTCAAGAATGGCTTCAGTCAAATGCAGATTAATATGTTTGGATTCTCATCATGGAAAGTAACAATGAAAATTATGTCATATATCTTCTGAAGATACATCTCAGACCAGGGTTAATAAGCAGAAACCACAGGAAACCAAACGTCTTGTGTCTTTTTTTGTTCTGAAGGAATGACTAATTAAAGGTATACACACGGTTGTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTAGCAAAACCTGTATGTAAAAAATATAATAAATTCGGAGCTATCTCTGCTCCATCAGTAGCATGGT                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CF316549             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GATGTCATGAGGGACCCTTTAATTGCTGCAGATGGTTTCACCTACGAAGCAGAGGCTATAAGAGAGTGGTTTGATAGTGGTCACTATACATCACCCATGACAAACCTCCGATCTACCACACCGTGATCTTTTGCCGAACCATGCCCTCCGTTCTGCAATTCAAGAATGGCTTCAGTCAAATGCAGATTAATATGTTTGGATTCTCATCATGGAAAGTAACAATGAAAATTATGTCATATATCTTCTGAAGATACATCTCAGACCAGGGTTAATAAGCAGAAACCACAGGAAACCAAACGTCTTGTGTCTTTTTTTGTTCTGAAGGAATGACTAATTAAAGGTATACACACGGTTGTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTAGCAAAACCTGTATGTAAAAAATATAATAAATTCGGAGCTATCTCTGCTCCATCAGTAGCATGGTAGACATTGTACAGGTAGTCACTTGTCACTTTGTCAGTGTAGTAG AGAGTTGTGATATCTGAGCAATAGCC  AAAAAAATGCTCAGCTAGAGTGTAT  GGAAGTGGAAATACATGTATGAATAGAACTATCAGATCAGAAaaaa                                            ]


>consensus_7741#0 AAGGTTGGGGAAAGTGTTTATGGAAGTGTGTATAAGGGACTTCTTCGGCAAACAAATGTG GCTGTAAAGAAGTTGAATCCTGAAAGCACAGAGTCACTGTCACAGTTCAGTCATGAGGTG GAAATCCTTAGCAGGGTGCGACATCCGAATCTTGTAACTCTTATAGGGGCATGCAAGGAT GCCCGAGCTCTTGTCTATAAATACATGCCCAATGGAAGCTTAGATGACCGCTTGGCTTGC AAGGACAATTCAAAGCCTCTTAGTTGGCAGTTGCGTACCCGCATCGCTTCCAATATTTGT TCTGCACTGATTTTTCTCCATTCCAATAAACCCCACAGCATTGTTCACAGTGACTTGAAA GCATCTAACATTCTTCTTGATGGAAATAATGTGGCTAAGCTTAGTGGTTTTGGTGTGTGC CGAATGTTAACTGATGAATTCAAGGCCACAACCACTCTATACCGCCATACCCACCCAAAA GGAACTTTTGTGTACATTGATCCTGAATACGCTATTTCTGGTGATCTGACACCCCTATCT GATGTATATTCTTTTGGTATCATACTCCTGCGACTCTTGACTGGAAGATCAGGATTTGGT CTTTTGAAAGATGTGCAACGGGCAGTAGCAAAGGGTTGCTTGCAAGCAATATTGGATTCA TCAGCTGGAGACTGGCCTCTTATGCATGCTGAGCAGTTGTCTCGGGTAGGCCTAAGATGC TGTGAAATCAGAAGAAAAAACCGTCCTGACCTGCAAACAGAGGTTTGGACAGTACTTGAA CCAATGTTGAGGTCTGCTTCCTCTATGCTATGTTCATTATCATTTAAATCAGTATCTGAA GACTTTGGTAATGTGCCATCCTACTTCATCTGTCCAATACAACAGGATGTCATGAGGGAC CCTTTAATTGCTGCAGATGGTTTCACCTACGAAGCAGAGGCTATAAGAGAGTGGTTTGAT AGTGGTCACTATACATCACCCATGACAAACCTCGATCTACCACACCGTGATCTTTTGCCG AACCATGCCCTCCGTTCTGCAATTCAAGAATGGCTTCAGTCAAATGCAGATTAATATGTT TGGATTCTCATCATGGAAAGTAACAATGAAAATTATGTCATATATCTTCTGAAGATACAT CTCAGACCAGGGTTAATAAGCAGAAACCACAGGAAACCAAACGTCTTGTGTCTTTTTTTG TTCTGAAGGAATGACTAATTAAAGGTATACACACGGTTGTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTT AGCAAAACCTGTATGTAAAAAATATAATAAATTCGGAGCTATCTCTGCTCCATCAGTAGC ATGGTAGACATTGTACAGGTAGTCACTTGTCACTTTGTCAGTGTAGTAGAGAGTTGTGAT ATCTGAGCAATAGCCAAAAAAATGCTCAGCTAGAGTGTATGGAAGTGGAAATACATGTAT GAATAGAACTATCAGATCAGAATTTCACCATTTATAAGGGTATCATGCTTACGTGTTGTA ACCATTCTGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)