|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7801#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1943 fasta sequence
[TGCTACTTTGGTCATGACAGGTTAAATGTGTTATAGGAGTACTTCAGCTTTTACTGTTTCATGAGTTCAAAATATAAATTGATCTTTGAGGAATGAAAAGCAAATGTTCTCTTCAGCTATCTTTTCTGAAGTTCAAATGTGTCCTTTGATTGAATTAATCTTCTGTAACATTTTGAAACCTCCAGACTAGCATCATCATCTCTCAATACTATCGACATTAATTCAGTATCCATTTTATTAATCCAGTTTCACATTTTACTTTGATGTTCTTAATAATCTTCAGCGGAAAGAGATGTTCTACAGCTCTGCACTTTATCTCTGCCTGTTAGTAGCACTCTGAAGAACAGCCTAAGCTTATCACCCATCATTTCCTCTCTCTCCTTTTCTACTGTCTTCATTGATGCTGCTATATTGAAATTGCATTTTGATATTGGTTCTTTGACAACTGTGGAGCAGCTTGCCAAGACAAAGGCAGCTCATCTGCTGAATTATCCTGATGCGAAGATACTGTGGATCGGTTGCCCTACATATCTTTGCATTGTTGCTCTTAATATAACAAACGCCAGTCGTGTAGCTTCAGATTATTTATATTGCAGTATATCAAGAACATAGCTATACGATGTTTGGTTAGAGATATCAACTAGCTTTATGATAAGCAGCTTTCAATCCATTTGTCATAGATGGGCTAGCAGGCAGCCAGTCACTGTGTCTGTGCACATACACAAAGTGAGAACATTGAGATTCTTAGCTCAAATGCAAAGAATCTGATATTGTCCTCCTCTTATCCACATGATAAAAGCTAGAGCTAAAGTGTACTAATTCAAGTCAAAGGTCACATTGACTGTGAAGTGAAATAATATACATGTTTGTAACCAGGAAAAATAGTATGGACAAGACCAAGTAAAGACGAGAAATTATTTCCCTCTGTTTGGAACTCGTCTTGCTTTGATCCAAGCTCCATATACTTTATCTTGACACACCAAATATAACCTCAATTTGTCACCTTTCCTCCTCCTCTCTTAGTCTTAAAAAGAGCGAAAACTTAGCTTTACACTGCACTGCAACCATGTTACACATATATATGCATGTATA-TAACTTTAGGTTCACAGATAGCGTTACCACATCAACCGAAAAAAAAATATTTCTTTCAATA-TTTGGTTAACAACTTCTTATAAAAGAAAACACTAGTATCAGCAAAGAACATGGATCATGTGATCTGATCATCTGAGTAACTGATACAATTATCTTGATGTAGTATTTGCTAAAAAAACATTAGGTATGCATAATCAAGAAGCATCGTCTGACTTTTGCCCCCCCTTTTTTTTCATAGATTTGCTCTTTCATTGTGAGACTAATGGTATATCAAGTCCTACCGTTTTACTTTATTTTTCTCTCATTTTGCTTTGTCTGTGAACATAACAATATATCAATTTATAACTGCTTTACTCAATTTGTTTTCTAGAAAAAGTTCGTTTATTTACTGTGAGCATCGAGACATAAAGATTATGCATCTACATGGCAGGCTGTATCAGGGGTGCTGCAAGAAAATATTTTGAGGGAACGTTACTACGAACATATCATGTACACTAAAGTCCGTATCAATGCATACAATTGCTATGCCGTTATGATGTGCACTCTATATCAGGAATGGATTTATTTTGATCCCAAAATGGACGCTAAGATTGCTGAGATGAATCCGATGAATGAGAATGAGGTTGATTGGGCTATGGTTTATTGGTTTTATCAAAGTTGGTACGACAAGATATGGTGCAATTCTTCTATGTGCCTCAACGATGACTTGTATAGTTATACTTATTGTCTTTTGTTATAAGCTTTTTTTTTTTTAAAATGGAAGCATCATACACATGTGAGCTGTGTAATTTAATATTTTCAAACATTTTAATGAACATCAGATATTGGAGTATTTTCGGAAACGAAATGCA]
[+] EMBL CB674642 [TGCTACTTTGGTCATGACAGGTTAAATGTGTTATAGGAGTACTTCAGCTTTTACTGTTTCATGAGTTCAAAATATAAATTGATCTTTGAGGAATGAAAAGCAAATGTTCTCTTCAGCTATCTTTTCTGAAGTTCAAATGTGTCCTTTGATTGAATTAATCTTCTGTAACATTTTGAAACCTCCAGACTAGCATCATCATCTCTCAATACTATCGACATTAATTCAGTATCCATTTTATTAATCCAGTTTCACATTTTACTTTGATGTTCTTAATAATCTTCAGCGGAAAGAGATGTTCTACAGCTCTGCACTTTATCTCTGCCTGTTAGTAGCACTCTGAAGAACAGCCTAAGCTTATCACCCATCATTTCCTCTCTCTCCTTTTCTACTGTCTTCATTGATGCTGCTATATTGAAATTGCATTTTGATATTGGTTCTTTGACAACTGTGGAGCAGCTTGCCAAGACAAAGGCAGCTCATCTGCTGAATTATCCTGATGCGAAGATACTGTGGATCGGTTGCCCTACATATCTTTGCATTGTTGCTCTTAATATAACAAACGCCAGTCGTGTAGCTTCAGATTATTTATATTGCAGTATATCAAGAACATAGCTATACGATGTTTGGTTAGAGATATCAACTAGCTTTATGATAAGCAGCTTTCAATCCATTTGTCATAGATGGGCTAGCAGGCAGCCAGTCACTGTGTC ]
[+] EMBL CB660982 [ AGCTATACGATGTTTGGTTAGAGATATCAACTAGCTTTATGATAAGCAGCTTTCAATCCATTTGTCATAGATGGGCTAGCAGGCAGCCAGTCACTGTGTCTGTGCACATACACAAAGTGAGAACATTGAGATTCTTAGCTCAAATGCAAAGAATCTGATATTGTCCTCCTCTTATCCACATGATAAAAGCTAGAGCTAAAGTGTACTAATTCAAGTCAAAGGTCACATTGACTGTGAAGTGAAATAATATACATGTTTGTAACCAGGAAAAATAGTATGGACAAGACCAAGTAAAGACGAGAAATTATTTCCCTCTGTTTGGAACTCGTCTTGCTTTGATCCAAGCTCCATATACTTTATCTTGACACACCAAATATAACCTCAATTTGTCACCTTTCCTCCTCCTCTCTTAGTCTTAAAAAGAGCGAAAACTTAGCTTTACACTGCACTGCAACCATGTTACACATATATATGCATGTATA TAACTTTAGGTTCACAGATAGCGTTACCACATCAACCGAAAAAAAAATATTTCTTTCAATA TTTGGTTAACAACTTCTTATAAAAGAAAACACTAGTATCAGCAAAGAACATGGATCATGTGATCTGATCATCTGAGTAACTGATACAATTATCTTGATGTAGTATTTGCTAAAAAAACATTAGGTATGCATAATCAAGAAGCATCGTCTGACTTTTGCCCCCCCTTTTTTTTCATAGATTTGCTCTTTCATTGTGAGACTAATGGTATATCAAGTCCTACCGTTTTACTTTATTTTTCTCTCATTTTGCTTTGTCTGTGAACATAACAATATATCAATTTATAA ]
[+] EMBL CF323992 [ TTCAATCCATTTGTCATAGATGGGCTAGCAGGCAGCCAGTCACTGTGTCTGTGCACATACACAAAGTGAGGACATTGAGATTCTTAGCTCAAATGCAAAGAATCTGATATTGTCCTCCTCTTATCCACATGATAAAAGCTAGAGCTAAAGTGTACTAATTCAAGTCAAAGGTCACATTGACTGTGAAGTGAAATAATATACATGTTTGTAACCAGGAAAAATAGTATGGACAAGACCAAGTAAAGACGAGAAATTATTTCCCTCTGTTTGGAACTCGTCTTGCTTTGATCCAAGCTCCATATACTTTATCTTGACACACCAAATATAACCTCAATTTGTCACCTTTCCTCCTCCTCTCTTAGTCTTAAAAAGAGCGAAAACTTAGCTTTACACTGCACTGCAACCATGTTACACATATATATGCATGTATANTAACTTTAGGTTCACAGATAGCGTTACCACATCAACCGAAAAAAAAATATTTCTTTCAATANTTTGGTTAACAACTTCTTATAAAAGAAAACACTAGTATCA ]
[-] EMBL CB660983 [ CATGGATCATGTGATCTGATCATCTGAGTAACTGATACAATTATCTTGATGTAGTATTTGCTAAAAAAACATTAGGTATGCATAATCAAGAAGCATCGTCTGACTTTTGCCCCCCCTTTTTTTTCATAGATTTGCTCTTTCATTGTGAGACTAATGGTATATCAAGTCCTACCGTTTTACTTTATTTTTCTCTCATTTTGCTTTGTCTGTGAACATAACAATATATCAATTTATAACTGCTTTACTCAATTTGTTTTCTAGAAAAAGTTCGTTTATTTACTGTGAGCATCGAGACATAAAGATTATGCATCTACATGGCAGGCTGTATCAGGGGTGCTGCAAGAAAATATTTTGAGGGAACGTTACTACGAACATATCATGTACACTAAAGTCCGTATCAATGCATACAATTGCTATGCCGTTATGATGTGCACTCTATATCAGGAATGGATTTATTTTGATCCCAAAATGGACGCTAAGATTGCTGAGATGAATCCGATGAATGAGAATGAGGTTGATTGGGCTATGGTTTATTGGTTTTATCAAAGTTGGTACGACAAGATATGGTGCAATTCTTCTATGTGCCTCAACGATGACTTGTATAGTTATACTTATTGTCTTTTGTTATAAGCTTTTTTTTTTTTAAAATGGAAGCATCATACACATGTGAGCTGTGTAATTTAATATTTTCAAACATTTTAATGAACATCAGA ]
[-] EMBL CB674643 [ TGGATCATGTGATCTGATCATCTGAGTAACTGATACAATTATCTTGATGTAGTATTTGCTAAAAAAACATTAGGTATGCATAATCAAGAAGCATCGTCTGACTTTTGCCCCCCCTTTTTTTTCATAGATTTGCTCTTTCATTGTGAGACTAATGGTATATCAAGTCCTACCGTTTTACTTTATTTTTCTCTCATTTTGCTTTGTCTGTGAACATAACAATATATCAAGTTATAACTGCTTTACTCAATTTGTTTTTTAGAAAAAGTTCGTTTATTTACTGTGAGCATCGAGACATAAAGATTATGCATTTACATGGCAGGCTGTATCAGGGGTGCTGCAAGAAAATATTTTGAGGGAACGTTACTACGAACATATCATGTACACTAAAGTCCGTATCAATGCATACAATTGCTATGCCGTTATGATGTGCACTCTATATCAGGAATGGATTTATTTTGATCCCAAAATGGACGCTAAGATTGCTGAGATGAATCCGATGAATGAGAATGAGGTTGATTGGGCTATGGTTTATTGGTTTTATCAAAGTTGGTACGACAAGATATGGTGCAATTTTTTTATGTGCCTCAACGATGACTTGTATAGTTATACTTATTGTCTTTTGTTATAAGCTTTTTTTTTTTTAAAATGGAAGCATCATACACATGTGAGCTGTGTAATTTAATATTTTCAAACATTTTAATGAACATCAGATATTGGAGTATTTTCGGAAACGAAATGCA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||