These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8192#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1042 fasta sequence [TTGNGCTTCTCTCTCTTTCTCTAGACTCTACTACTGGCAGACAAAAATGGGATGTTTTTAGCTTTGTTTTACTGAAAAATATTATACTGATTAAGTTGGTGTCAAGTGCACGCACACTGACGAGGAATAATATATATTTGCTTCTTGCTTAGGTGCTTGAATGCTGCAGGTTTCCTGCTTCTCTAGCTTGACCTAGTTGTCACTCGTGACTAAAGACGTGTCT-AAAGTGTGT-AATAACTTTAACAAGTATGCTAAT-AAGCTAGCTCGTGA-CCAAGGATAACCTTAAACAAC-GGGATAAGCTTTTGA-CCCT-AAGTGGATTAATCTCTTACTAGCTAGCAATCTCACTCTACTA-CCTAACCCTGAAAATTAGGTCT-AATAGTTGAAAACTCTCCCCTGATCACGGCATCTAGCTATAGCTCTTGATGCAATTTTTTTTTGACTTTGGAAAGCTATCAAGTGTTTATCCTACAACAAATAGCATGTACTTGCACGCCACTTGTCAGCTAATTTCGGAGATGGACAAGGAATATACTACCCAAGAAACATAGAGAAATTGAGAGAGAAAAAATGAGATAGAGAAATTGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGAGATGTAATGGTTTGGTCCAACGTCAGCAGCATGACCGTTGGATAGTCCACGTAAGGTCGATGTGGCCAAAGGGGAAGCTAGCTAGCTAACTAACAAAGCAGCATCTAATAAGCTTTAGCTGAAGCTTAGTTTAGACCACCCGTGTGCTAATAGTCAGTGAGTGCAGTGGAGTAATATGCAACTACTCAAGAAACGTACATGTCCAAT-TAAATGAAG-CACACCC-CTACAACTTACTAATTGCTCCAATTTGTCAGGTCACAACATGCTTTAGGACAACATAAGCAACACCTGTCCTAACTAATTAATTTCTGACTACTGGTGATCATGGATGTGCCATGTGTTTACTACTACTCTCTTTACAGTTTAGTTGCACTATATGTGTCAATATTTGTGTTAGAACAAGACTAATAGCTATAATATGTAGTACAC] [-] EMBL AU175006 [TTGNGCTTCTCTCTCTTTCTCTAGACTCTACTACTGGCAGACAAAAATGGGATGTTTTTAGCTTTGTTTTACTGAAAAATATTATACTGATTAAGTTGGTGTCAAGTGCACGCACACTGACGAGGAATAATATATATTTGCTTCTTGCTTAGGTGCTTGAATGCTGCAGGTTTCCTGCTTCTCTAGCTTGACCTAGGTGTCACTCGTGACTAAAGACGTGTCTAAAAGTGTGTAAATAACTTTAACAAGTATGCTAATAAAGCTAGCTCGTGACCCAAGGATAACCTTAAACAACGGGGATAAGCTTTTGACCCCTAAAGTGGATTAATCTCTTACTAGCTAGCAATCTCACTCTACTACCCTAACCCTGAAAATTAGGTCTAAATAGTTGAAAACTCTCC ] [+] EMBL CB628871 [ tGCTTCTCTCTCTTTCTCTAGACTCTACTACTGGCAGACAAAAATGGGATGTTTTTAGCTTTGTTTTACTGAAAAATATTATACTGATTAAGTTGGTGTCAAGTGCACGCACACTGACGAGGAATAATATATATTTGCTTCTTGCTTAGTTGCTTGAATGCTGCAGGTTTCCTGCTTCTCTAGCTTGACCTAGTTGTCACTCGTGACTAAAGACGTGTCT AAAGTGTGT AATAACTTTAACAAGTATGCTAAT AAGCTAGCTCGTGA CCAAGGATAACCTTAAACAAC GGGATAAGCTTTTGA CCCT AAGTGGATTAATCTCTTACTAGCTAGCAATCTCACTCTACTA CCTAACCCTGAAAATTAGGTCT AATAGTTGAAAACTCTCCCCTGATCACGGCATCTAGCTATAGCTCTTGATGCAATTTTTTTTTGACTTTGGAAAGCTATCAAGTGTTTATCCTACAACAAATAGCATGTACTTGCACGCCACTTGTCAGCTAATTTCGGAGATGGACAAGGAATATACTACCCAAGAAACATAGAGAAATTGAGAGAGAAAAAATGAGATAGAGAAATTGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGAGATGTAATGGTTTGGTCCAACGTCAGCAGCATGACCGTTGGATAGTCCACGTAAGGTCGATGTGGCCAAAGGGGAAGCTAGCTAGCTAACTAACAAAGCAGCATCTAATAAGCTTTAGCTGAAGCTTAGTTTAGACCACCCGTGTGCTAATAGTCAGTGAGTGCAGTGGAGTAATATGCAACTACTCAAGAAACGTACATGTC ] [-] EMBL CB634859 [ TGCTGCAGGTTTCCTGCTTCTCTAGCTTGACNTAGTTGTCACTCGTGACTAAAGACGTGTCT AAAGTGTGT AATAACTTTAACAAGTATGCTAAT AAGCTAGCTCGTGA CCAAGGATAACCTTAAACAAC GGGATAAGCTTTTGA CCCT AAGTGGATTAATCTCTTACTAGCTAGCAATCTCACTCTACTA CCTAACCCTGAAAATTAGGTCT AATAGTTGAAAACTCTCCCCTGATCACGGCATCTAGCTATAGCTCTTGATGCAATTTTTTTTTGACTTTGGAAAGCTATCAAGTGTTTATCCTACAACAAATAGCATGTACTTGCACGCCACTTGTCAGCTAATTTCGGAGATGGACAAGGAATATACTACCCAAGAAACATAGAGAAATTGAGAGAGAAAAAATGAGATAGAGAAATTGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGAGATGTAATGGTTTGGTCCAACGTCAGCAGCATGACCGTTGGATAGTCCACGTAAGGTCGATGTGGCCAAAGGGGAAGCTAGCTAGCTAACTAACAAAGCAGCATCTAATAAGCTTTAGCTGAAGCTTAGTTTAGACCACCCGTGTGCTAATAGTCAGTGAGTGCAGTGGAGTAATATGCAACTACTCAAGAAACGTACATGTCCAAT TAAATGAAG CACACCC CTACAACTTACTAATTGCTCCAATTTGTCAGGTCACAACATGCTTTAGGACAACATAAGCAACACCTGTCCTAACTAATTAATTTCTGACTACTGGTGATCATGGATGTGCC ] [-] EMBL CB668672 [ AGCTATCAAGTGTTTATCTTACAACAAATAGCACGTACTTGCACGCCACTTGTCAGATAATTTGGGAGATGGACAAGGAATATACTACCCAAGAAACATAGAGAAATTGAGAGAGAAAAAATGAGATAGAGAAATTGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGAGATGTAATGGTTTGGTCCAACGTCAGCAGCATGACCGTTGGATAGTCCCCGTAAGGTCGATGTGCCCAAAGGGGAAGCTAGCTAGCTAACTAACAAAGCAGCATCTAATAAGCTTTAGCTGAAGCTTAGTTTAGACCACCCGTGTGTTAATAGTCAGTGAGTGCAGTGGAGTAATATGCAATTACTCAAGAAACGTACATGTCCAATCTAAATGAAGTCACACCCAATACAACTTACTAATTGCTCCAATTTGT ] [+] EMBL CB636343 [ ATAGCATGTACTTGCACGCCACTTGTCAGCTAATTTCGGAGATGGACAAGGAATATACTACCCAAGAAACATAGAGAAATTGAGAGAGAAAAAATGAGATAGAGAAATTGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGAGATGTAATGGTTTGGTCCAACGTCAGCAGCATGACCGTTGGATAGTCCACGTAAGGTCGATGTGGCCAAAGGGGAAGCTAGCTAGCTAACTAACAAAGCAGCATCTAATAAGCTTTAGCTGAAGCTTAGTTTAGACCACCCGTGTGCTAATAGTCAGTGAGTGCAGTGGAGTAATATGCAACTACTCAAGAAACGTACATGTCCAAT TAAATGAAG CACACCC CTACAACTTACTAATTGCTCCAATTTGTCAGGTCATAACATGCTTTAGGACAACATAAGCAACACCTGTCCTAACTAATTAATTTCTGACTACTGGTGATCATGGATGTGCCATGTGTTTACTACTACTCTCTTTACAGTTTAGTTGCACTATATGTGTCAATATTTGTGTTAGAACAAGACTAATAGCTATAATATGTAGTACAC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||