These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8200#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1097 fasta sequence [AAACCTAAAGAATCACCAGCCTTGCAAACCAATCAACCTGTCTAGATTAATTTTTGCATGCTCTCTGGAATGGAGAAACAACCTGCAATGCTTCTCGTTCTTGTGACACTCTGCGCCTTCGCATGCAAGCGATCCGTCGCACAGTCTGCCTTTGCCACGTTCTACGGTGGCAAGGACGGGTCGGGCACCATGGGTGGCGCGTGTGGGTACGGTAACCTGTACAACGCCGGGTACGGGCTGTACAACGCGGCGCTGAGCTCGGCGCTGTTCAACGACGGCGCCATGTGCGGCGCGTGCTACACCATCACCTGCGACACCAGCC-AGACCAAGTGGTGCAAGCCCGGCGGCAACTCCATCACCATC-AC-GGCCACCAACTTATGCCCGCCTAACTGGGCGCTGCCCAGCAACAGCGGCGGGTGGTGCAACCCACCGCGGCAGCACTTCGACATGTCACAGCCGGCCTGGGAGAACATCGCCGTCTATCAAGCCGGCATTGTCCCCGTCAACTACAAGAGGGTTCCGTGCCAGAGGAGCGGGGGGATCCGGTTCGCGATCAGCGGTCACGACTACTTTGAGCTTGTGACCGTGACGAACGTGGGCGGCAGCGGCGTGGTGGCGCAGATGTCGATCAAGGGGTCCAACACGGGCTGGATGGCGATGAGCAGGAATTGGGGCGCCAATTGGCAGAGCAACGCGTACCTCGCCGGGCAGAGCCTGTCCTTCATTGTGCAGCTCGACGACGGCCGAAAGGTCACGGCCTGGAACGTCGCCCCGTCCAACTGGTTCTTCGGTGCCACCTACTCTACCTCTTGGGTGCAGTTCTGAAGTACTGCAACGTACGTACAGGTTTAGTTGATAAATTATACACATGCTGTTCATGGACATAATTAATTAATTACTAGCCATCCCGGCCGTTTGTGCATGTTCTGCTAGGTTGTGTGTTGCGTGGCATTAACTTGTTTTTCTCTGTTACCAGTCG-TTTTGTCAAACGCGTTGGTTGTGGCAAGCGCGATTGAATGTTTTGCCCACCAATTAATGTAACTGATCGTATGGGTGTTGAGTTAATAAATTATGTTTAATTATGCGGATGCCAAAAA] [+] EMBL AK060313 [AAACCTAAAGAATCACCAGCCTTGCAAACCAATCAACCTGTCTAGATTAATTTTTGCATGCTCTCTGGAATGGAGAAACAACCTGCAATGCTTCTCGTTCTTGTGACACTCTGCGCCTTCGCATGCAAGCGATCCGTCGCACAGTCTGCCTTTGCCACGTTCTACGGTGGCAAGGACGGGTCGGGCACCATGGGTGGCGCGTGTGGGTACGGTAACCTGTACAACGCCGGGTACGGGCTGTACAACGCGGCGCTGAGCTCGGCGCTGTTCAACGACGGCGCCATGTGCGGCGCGTGCTACACCATCACCTGCGACACCAGCC AGACCAAGTGGTGCAAGCCCGGCGGCAACTCCATCACCATC AC GGCCACCAACTTATGCCCGCCTAACTGGGCGCTGCCCAGCAACAGCGGCGGGTGGTGCAACCCACCGCGGCAGCACTTCGACATGTCACAGCCGGCCTGGGAGAACATCGCCGTCTATCAAGCCGGCATTGTCCCCGTCAACTACAAGAGGGTTCCGTGCCAGAGGAGCGGGGGGATCCGGTTCGCGATCAGCGGTCACGACTACTTTGAGCTTGTGACCGTGACGAACGTGGGCGGCAGCGGCGTGGTGGCGCAGATGTCGATCAAGGGGTCCAACACGGGCTGGATGGCGATGAGCAGGAATTGGGGCGCCAATTGGCAGAGCAACGCGTACCTCGCCGGGCAGAGCCTGTCCTTCATTGTGCAGCTCGACGACGGCCGAAAGGTCACGGCCTGGAACGTCGCCCCGTCCAACTGGTTCTTCGGTGCCACCTACTCTACCTCTTGGGTGCAGTTCTGAAGTACTGCAACGTACGTACAGGTTTAGTTGATAAATTATACACATGCTGTTCATGGACATAATTAATTAATTACTAGCCATCCCGGCCGTTTGTGCATGTTCTGCTAGGTTGTGTGTTGCGTGGCATTAACTTGTTTTTCTCTGTTACCAGTCG TTTTGTCAAACGCGTTGGTTGTGGCAAGCGCGATTGAATGTTTTGCCCACCAATTAATGTAACTGATCGTATGGGTGTTGAGTTAATAAATTATGTTTAATTA ] [+] EMBL OS30479 [ CAGCCTTGCAAACCAATCAACCTGTCTAGATTAATTTTTGCATGCTCTCTGGAATGGAGAAACAACCTGCAATGCTTCTCGTTCTTGTGACACTCTGCGCCTTCGCATGCAAGCNATCCGTCGCACAGTCTGCCTTTGCCACGTTCTACGGTGGCAAGGACGGGTCGTGCACCATGGGTGGCGCGTGTGGGTACGGTAACCTGTACAACGCCGGGTACGGGCTGTACAACGCGGCGCTGAGCTCGGCGCTGTTCAACGACGGCGCCATGTGCGGCGCGTGCTACACCATCACCTGCGACACCAGCC AGACCAAGTGGTGCAAGCCCGGCGGCAACTCCATCACCATC AC GGCCACCAACTTATGCCCGCCTAACTGGGCGCTGCCCAGCAACAGCGGCGGGTGGTGCAACCCACCGCTGCAGCACTTCGACATGTCACAGCCGGCCTGGGAGAACATCGCCGTCTATCAAGCCGGCATTGTCCCCGTCAACTACAAGAGGGTTCCGTGCCAGAGGAGCGGGGGGATCCGGTTCGCGATCAGCGGTCACGACTACTTTGAGCTTGTGACCGTGACGAACGTGGGCGGCAGCGGCGTGGTGGCGCAGATGTCGATCAAGGGGTCCAACACGGGCTGGATGGCGATGAGCAGGAATTGGGGCGCCAATTGGCAGAGCAACGCGTACCTCGCCGGGCAGAGCCTGTCCTTCATTGTGCAGCTCGACGACGGCCGCAAGGTCACGGCCTGGAACGTCGCCCCGTCCAACTGGTTCTTCGGTGCCACCTACTCTACCTCTTGGGTGCAGTTCTGAAGTACTGCAACGTACGTACAGGTTTAGTTGATAAATTATACACATGCTGTTCATGGACATAATTAATTAATTACTAGCCATCCCGGCCGTTTGTGCATGTTCTGCTAGGTTGTGTGTTGCGTGGCATTAACTTGTTTTTCTCTGTTACCAGTCGTTTTTGTCAAACGCGTTGGTTGTGGCAAGCGCGATTGAATGTTTTGCCCACCAATTAATGTAACTGATCGTATGGGTGTTGAGTTAATAAATTATGTTTAATTA ] [+] EMBL OSR04481A [ CAGCCTTGCAAACCAATCAACCTGTCTAGATTAATTTTTGCATGCTCTCTGGAATGGAGAAACAACCTGCAATGCTTCTCGTTCTTGTGACACTCTGCGCCTTCGCATGCAAGCGATCCGTCGCACAGTCTGNCTTTGCCACGTTCTACGGTGGCAAGGACGGGTCGGGCACCATGGGTGGCGCGTGTGGGTACGGTAACCTGTACAACGCCGGGTACGGGCTGTACAACGCGGCGCTGAGCTCGGCGCTGTTCAACGACGGCGCCATGTGCGGCGCGTGCTACACCATCACCTGCGACACCAGCCAAGACCAAGTGGTGCAAGCCCGGCGGCAACTCCATCACCATCAACGGGCCACCAAC ] [+] EMBL CA753464 [ CAGCCTTGCAAACCAATCAACCTGTCTAGATTAATTTTTGCATGCTCTCTGGAATGGAGAAACAACCTGCAATGCTTCTCGTTCTTGTGACACTCTGCGCCTTCGCATGCAAGCGATCCGTCGCACAGTCTGCCTTTGCCACGTTCTACGGTGGCAAGGACGGGTCGGGCACCATGGGTGGCGCGTGTGGGTACGGTAACCTGTACAACGCCGGGTACGGGCTGTACAACGCGGCGCTGAGCTCGGCGCTGTTCAACGACGGCGCCATGTGCGGCGCGTGCTACACCATCACCTGCGACACCAGC ] [+] EMBL AU031673 [ tnCAGTTCTGAAGTACTGCAACGTACGTACAGGTTTAGTTGATAAATTATACACATGCTGTTCATGGACATAATTAATTAATTACTAGCCATCCCGGCCGTTTGTGCATGTTCTGCTAGGTTGTGTGTTGCGTGGCATTAACTTGTTTTTCTCTGTTACCAGTCG TTTTGTCAAACGCGTTGGTTGTGGCAAGCGCGATTGAATGTTTTGCCCACCAATTAATGTAACTGATCGTATGGGTGTTGAGTTAATAAATTATGTTTAATTATGCGGATGCCAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||