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Oryza sativa
cluster # 8220 cluster # 8220       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8220#0 length = 1094 sequences # 5  
consensusID : consensus_8220#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1094
fasta sequence 
                              [GAGAGCCCTTCAGGGGGCCTAATTCCCCCCTATTGATTGCACGCGGGGACGACGGGATGCGGCGGATTCGGCGGCGGCCGCGGCGCTAGGGCGCGGACGAGGCGGCGGGAGCGGCGGGAGGACAGGGATGACAGGTGGGCCCCACCCGTCAGCGAGGGTGGCGGGCGGGCCCGCCCGTCAGCGGCGCGCGCGCGGAGAGGAGGCCGAATGGGCCGCGGGGAGAGGAGAGGGAGAGGGAGGGAGCTGGGCCGGACCGGCCCAAGAGGGAGAGGGGGACGGAAAGGGAACTTTTTTAGGGCTTTTCTTTTTATAAAATCATTTTAACTTTGTTTATTTCTTAATAATTATTATTTGTGCTCTGAAAATTCCACTAAAATTTGAGGGCTCTTTTTAGACCAAGGAGAATTTAACAAAAATT-CTCCGGGCCACATTTGAATTTTTCTTGTACGTATTTTAGTGTTTGCCAAATTCTTTTCGAATTTTAATTAATTCTATTATTCCTTTTAGAAAATAATTTTTATTTCGGGATGAATTTATCAGGACGTGACACCGAACCCCCTGGTTTGGCTGAACCATGGGCTGGCCCAAACCAGCCCATCTTCGGTTGGCGACTTCCTCTATTGCTTCACTTTGTAGACTTGTGAATTTTGGCCCAATTCATCGTGTCAATTCTGAGTTCTTGGCCCATTCATACATAAGTCTGGTTCTCGACATCGTCCGATTGATTTATCGTCTATGTTGATGTCGATTCTCCTCCACTTTAGTGTCATTCTCTACAAAAAGGTTAGTATACCTAATACTAGTGGAATATTATTATTCTAACAAACATATGCATTGCAAGCATCACTAGTTCTCTCCTATTTTGATAATATTGACGGTCGAAACTGTTTGATAACGACCGTCAACACTGTCTCCCTTGTTTCCTTAGCATGTGATTCTGAGTACTTTGTTGTCGTTGTAGATATATTGATGTCGAGGATGTCCAGCAGCACGGGCAGCCCGATATGCCGGTGATCGTTCCGGCGCTCACACTCGAGCCGTTCGTGCTGTGGGAGGAAATTAGTCAAGGCCCGTCCGCGGAGGCAAACATGGCG]

[+] EMBL CB652618             [GAGAGCCCTTCAGGGGGCCTAATTCCCCCCTATTGATTGCACGCGGGGACGACGGGATGCGGCGGATTCGGCGGCGGCCGCGGCGCTAGGGCGCGGACGAGGCGGCGGGAGCGGCGGGAGGACAGGGATGACAGGTGGGCCCCACCCGTCAGCGAGGGTGGCGGGCGGGCCCGCCCGTCAGCGGCGCGCGCGCGGAGAGGAGGCCGAATGGGCCGCGGGGAGAGGAGAGGGAGAGGGAGGGAGCTGGGCCGGACCGGCCCAAGAGGGAGAGGGGGACGGAAAGGGAACTTTTTTAGGGCTTTTCTTTTTATAAAATCATTTTAACTTTGTTGATTTCTTAATAATTATTATTTGTGCTCTGACAATTCCCCTAAAATTTGAGGGCTCTTTTTAGACCAAGGAGAATTTAACAAAAATTCCTCCGGGCCACATTTGAATTTTTCTTGCACCTATTTTACTGTTTGCCCAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CB677264             [                                                                                                                                                                                                                   GCCGCGGGGAGAGGAGAGGGAGAGGGAGGGAGCTGGGCCGGACCGGCCCAAGAGGGAGAGGGGGAGGGAAAGGGAACTTTTTTAGGGCTTTTCTTTTTATAAAATCATTTTAACTTTGTTTATTTCTTAATAATTATTATTTGTGCTCTGAAAATTCCACTAAAATTTGAGGGCTCTTTTTAGACCAAGGAGAATTTAACAAAAATT CTCCGGGCCACATTTGAATTTTTCTTGTACGTATTTTAGTGTTTGCCAAATTCTTTTCGAATTTTAATTAATTCTATTATTCCTTTTAGAAAATAATTTTTATTTCGGGATGAATTTATCAGGACGTGACACCGAACCCCCTGGTTTGGCTGAACCATGGGCTGGCCCAAACCAGCCCATCTTCGGTTGGCGACTTCCTCTATTGCTTCACTTTGTAGACTTGTGAATTTTGGCCCAATTCATCGTGTCAATTCTGAGTTCTTGGCCCATTCATACATAAGTCTGGTTCTCGACATCGTCCGATTGATTTATCGTCTATGTTGATGTCGATTCTCCTCCACTTTAGTGTCATTCTCTACAAAAAGGTTAGTATACCTAATACTAGTGGAATATTATTATTCTAACAAACATATGCATTGCAAGCATCACTAGTTCTCTCCTATTTTGATAATATTGACGGTCGAAACTGTTTGATAACGACCGTCAACACTGTCTCCCTTGTTTCCTTAGCATGTGATTCTGAGTACTTTGTTGTCGTTGTAGATATATTGATGTCGAGGATGTCCAGCAGCACGGGCAGCCCGATATGCCGGTGATCG                                                                             ]
[-] EMBL CB677265             [                                                                                                                                                                                                                                                                                             AACTTTTTTAGGGCTTTTCTTTTTATAAAATCATTTTAACTTTGTTTATTTCTTAATAATTATTATTTGTGCTCTGAAAATTCCACTAAAATTTGAGGGCTCTTTTTAGACCAAGGAGAATTTAACAAAAATT CTCCGGGCCACATTTGAATTTTTCTTGTACGTATTTTAGTGTTTGCCAAATTCTTTTCGAATTTTAATTAATTCTATTATTCCTTTTAGAAAATAATTTTTATTTCGGGATGAATTTATCAGGACGTGACACCGAACCCCCTGGTTTGGCTGAACCATGGGCTGGCCCAAACCAGCCCATCTTCGGTTGGCGACTTCCTCTATTGCTTCACTTTGTAGACTTGTGAATTTTGGCCCAATTCATCGTGTCAATTCTGAGTTCTTGGCCCATTCATACATAAGTCTGGTTCTCGACATCGTCCGATTGATTTATCGTCTATGTTGATGTCGATTCTCCTCCACTTTAGTGTCATTCTCTACAAAAAGGTTAGTATACCTAATACTAGTGGAATATTATTATTCTAACAAACATATGCATTGCAAGCATCACTAGTTCTCTCCTATTTTGATAATATTGACGGTCGAAACTGTTTGATAACGACCGTCAACACTGTCTCCCTTGTTTCCTTAGCATGTGATTCTGAGTACTTTGTTGTCGTTGTAGATATATTGATGTCGAGGATGTCCAGCAGCACGGGCAGCCCGATATGCCGGTGATCGATCGGG                                                                       ]
[+] EMBL CB677586             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAAATCATTTTAACTTTGTTTATTTCTTAATAATTATTATTTGTGCTCTGAAAATTCCACTAAAATTTGAGGGCTCTTTTTAGACCAAGGAGAATTTAACAAAAATT CTCCGGGCCACATTTGAATTTTTCTTGTACGTATTTTAGTGTTTGCCAAATTCTTTTCGAATTTTAATTAATTCTATTATTCCTTTTAGAAAATAATTTTTATTTCGGGATGAATTTATCAGGACGTGACACCGAACCCCCTGGTTTGGCTGAACCATGGGCTGGCCCAAACCAGCCCATCTTCGGTTGGCGACTTCCTCTATTGCTTCACTTTGTAGACTTGTGAATTTTGGCCCAATTCATCGTGTCAATTCTGAGTTCTTGGCCCATTCATACATAAGTCTGGTTCTCGACATCGTCCGATTGATTTATCGTCTATGTTGATGTCGATTCTCCTCCACTTTAGTGTCATTCTCTACAAAAAGGTTAGTATACCTAATACTAGTGGAATATTATTATTCTAACAAACATATGCATTGCAAGCATCACTAGTTCTCTCCTATTTTGATAATATTGACGGTCGAAACTGTTTGATAACGACCGTCAACACTGTCTCCCTTGTTTCCTTAGCATGTGATTCTGAGTACTTTGTTGTCGTTGTAGATATATTGATGTCGAGGATGTCCAGCAGCACGGGCAGCCCGATATGCCGGTGATCGTTCCGGCGCTCACACTCGAGCCGTTCGTGCTGTGGGAGGAAATTAGTC                             ]
[+] EMBL CB677562             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATTTATCAGGACGTGACACCGAACCCCCTGGTTTGGCTGAACCATGGGCTGGCCCAAACCAGCCCATCTTCGGTTGGCGACTTCCTCTATTGCTTCACTTTGTAGACTTGTGAATTTTGGCCCAATTCATCGTGTCAATTCTGACTTCTTGGCCCATTCATACATAAGTCTGGTTCTCGACATCGTCCGATTGATTTATCGTCTATGTTGATGTCGATTCTCCTCCACTTTAGTGTCATTCTCTACAAAAAGGTTAGTATACCTAATACTACTGGAATATTATTATTCTAACAAACATATGCATTGCAAGCATCACTAGTTCTCTCCTATTTTGATAATATTGACGGTCGAAACTGTTTGATAACGACCGTCAACACTGTCTCCCTTGTTTCCTTAGCATGTGATTCTGAGTACTTTGTTGTCGTTGTAGATATATTGATGTCGAGGATGTCCAGCAGCACGGGCAGCCCGATATGCCGGTGATCGTTCCGGCGCTCACACTCGAGCCGTTCGTGCTGTGGGAGGAAATTAGTCAAGGCCCGTCCGCGGAGGCAAACATGGCG]




>consensus_8220#0
GAGAGCCCTTCAGGGGGCCTAATTCCCCCCTATTGATTGCACGCGGGGACGACGGGATGC
GGCGGATTCGGCGGCGGCCGCGGCGCTAGGGCGCGGACGAGGCGGCGGGAGCGGCGGGAG
GACAGGGATGACAGGTGGGCCCCACCCGTCAGCGAGGGTGGCGGGCGGGCCCGCCCGTCA
GCGGCGCGCGCGCGGAGAGGAGGCCGAATGGGCCGCGGGGAGAGGAGAGGGAGAGGGAGG
GAGCTGGGCCGGACCGGCCCAAGAGGGAGAGGGGGACGGAAAGGGAACTTTTTTAGGGCT
TTTCTTTTTATAAAATCATTTTAACTTTGTTTATTTCTTAATAATTATTATTTGTGCTCT
GAAAATTCCACTAAAATTTGAGGGCTCTTTTTAGACCAAGGAGAATTTAACAAAAATTCT
CCGGGCCACATTTGAATTTTTCTTGTACGTATTTTAGTGTTTGCCAAATTCTTTTCGAAT
TTTAATTAATTCTATTATTCCTTTTAGAAAATAATTTTTATTTCGGGATGAATTTATCAG
GACGTGACACCGAACCCCCTGGTTTGGCTGAACCATGGGCTGGCCCAAACCAGCCCATCT
TCGGTTGGCGACTTCCTCTATTGCTTCACTTTGTAGACTTGTGAATTTTGGCCCAATTCA
TCGTGTCAATTCTGAGTTCTTGGCCCATTCATACATAAGTCTGGTTCTCGACATCGTCCG
ATTGATTTATCGTCTATGTTGATGTCGATTCTCCTCCACTTTAGTGTCATTCTCTACAAA
AAGGTTAGTATACCTAATACTAGTGGAATATTATTATTCTAACAAACATATGCATTGCAA
GCATCACTAGTTCTCTCCTATTTTGATAATATTGACGGTCGAAACTGTTTGATAACGACC
GTCAACACTGTCTCCCTTGTTTCCTTAGCATGTGATTCTGAGTACTTTGTTGTCGTTGTA
GATATATTGATGTCGAGGATGTCCAGCAGCACGGGCAGCCCGATATGCCGGTGATCGTTC
CGGCGCTCACACTCGAGCCGTTCGTGCTGTGGGAGGAAATTAGTCAAGGCCCGTCCGCGG
AGGCAAACATGGCG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)