cluster # 823

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Oryza sativa
cluster # 823 cluster # 823 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_823#0 length = 2033 sequences # 2
consensusID : consensus_823#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2033
fasta sequence
                              [TAGGGGCCGTGGCCGGATCGCAATGTCGGCGTCGGGGGGATTGAGCTTGGTGCGCCGCGCCGTCGAGGCCGCGCGCCGCACGCCGCGGTGGCAGAAGAGGCTCCTCGTCCTCACCGCCGGTGTTGGTTCTTTGACTTATGCTTGCCAGGATAATCAAGTACTTCAAATAAATGATGGAACTGGCAAGAAGAGGGTGGTTATCGTTGGAACTGGTTGGGCAGGCGCAAGTTTCTTGAGAAATATTGACACTTCCTTGTACGATGTTCATGTCGTATCACCTCGCAACTATTTTACCTTCACACCTTTGTTGCCTAGTGTGACATGTGGCACAGTTGAAGCACGTAGTATTGTAGAGCCTATCCGTAATATTGTGAGAAAGAGAGGCGGCGCATTTAGATTTTGGGAAGCAGAGTGCTACAAGATTGATCCAACTAACAAAAAGATCCACTGCAGATCAGACTCAGATGGAAATAGTGAATTTGTTGTAGATTATGATTACCTGGTCGTCAGTGTTGGAGCTAGACCTAATACATTCAATACCCCTGGTGTTGTTGAAAACTGCCATTTTCTAAAGGAAGTAGAAGATGCTCAAAAAATTAGGAAGAGTGTCCTGAAATGTTTCGAAAGAGCGTCCCTTCCAAACCTAACTGAGGAAGAGAGGAAGAAGAATCTTCATTTTGTTGTTATTGGTGGTGGCCCAACAGGTGTAGAATTTGCTGCAGAGCTTCATGACTTTGTCAATGAGGACTTGGCAAAGTTGTATCCTGATGTGAAGAAGTATGCGAATATTTCAGTAATTGAAGCTGGAGATCATATCCTTACAATGTTTGACAAGAGAATTACCCAATTTGCTGAAGATAAATTCAAGAGGACAGGCATAGATTTGAAGACGAATTTTAAGGTTGTGAAGGTGTCTGATAAGGCTATCACTATGACTAATTCTGCAACTGGAGAGATTGCTGTGCCTTATGGCATGGCTGTTTGGTCCACTGGTATTGGAACCCGTCCCCTCATAATGGATTTCATGAAGCAAGTTGGTCAGGCAAACCGACGAGTGCTAGCTACTGATGAATGGCTCAGGGTTCATGGATGTGATGATGTATATGCTCTCGGTGATTGCGCGACAATAACTCAAAGAAAAGTTATGGAAGATATTGCTTCAATTTTCCGGGTAGCAGACAAGGACAATTCTGGCTCTTTGACTGTCAAGAAAATTAAAAATGTTCTTGGCGACATCTATGAAAGGTACCCACAGGTTGAGTTGTACCTTAAAACTAACCAAATGAAGGACTTCCATGACCTACTCAAAGATTCAGACGGGAATGCTATTAAGGAGTCAAAAGAGCTGAACATAGAGGAATTCAAGAAAGCCCTTGCTCGAGTGGACTCGCAAGTTAAGATGCTCCCAGCAACAGCTCAGGTTGCTTCACAAGAGGGAGCCTATCTGGCAAACTGCTTCAACAAGATGAAATACTGTGAAGAGAACCCTGAAGGTCCGTTGAGGATCAGAGGCACAGGGCGTCATCGGTTCAAACCTTTCAGGTACAGGCACCTTGGCCAGTTTGCTCCACTGGGTGGAGAGCAAACAGCCGCTCAATTGCCGGGTGATTGGATACATGTTGGTCACAGCACCCAATGGCTATGGTATTCTGTCTATGCCAGTAAGCAATTCAGCTGGCGCACCAGGATGCTGGTAGTATCTGATTGGGGCAGGCGGTTCATCTATGGAAGGGACTCAAGCAGCCTATAAATTGAACTAGG-ATGGTGTTGTTCACCGCCCTGCATTTTGCCAACTGAAGCTCTATTAGACTTGGATAATACAATTTTTGCATACCTTCGGAAACAACTATTTTTGCATACAGCATCATTTTTTTTAGAGAGAGAGAGCATCGTTATATTTGTTCGGCTATTTTCACAAGCTCAGGTTTCTGTAGCGTAGCAAGGTTTTGTCACCAATTTTTGATCTTGCCGATATTTCTATGACACAATGGAGGTTAAATGATTTATACATCAGTACTTTATAATACAGTTCA]

[+] EMBL AK100884             [TAGGGGCCGTGGCCGGATCGCAATGTCGGCGTCGGGGGGATTGAGCTTGGTGCGCCGCGCCGTCGAGGCCGCGCGCCGCACGCCGCGGTGGCAGAAGAGGCTCCTCGTCCTCACCGCCGGTGTTGGTTCTTTGACTTATGCTTGCCAGGATAATCAAGTACTTCAAATAAATGATGGAACTGGCAAGAAGAGGGTGGTTATCGTTGGAACTGGTTGGGCAGGCGCAAGTTTCTTGAGAAATATTGACACTTCCTTGTACGATGTTCATGTCGTATCACCTCGCAACTATTTTACCTTCACACCTTTGTTGCCTAGTGTGACATGTGGCACAGTTGAAGCACGTAGTATTGTAGAGCCTATCCGTAATATTGTGAGAAAGAGAGGCGGCGCATTTAGATTTTGGGAAGCAGAGTGCTACAAGATTGATCCAACTAACAAAAAGATCCACTGCAGATCAGACTCAGATGGAAATAGTGAATTTGTTGTAGATTATGATTACCTGGTCGTCAGTGTTGGAGCTAGACCTAATACATTCAATACCCCTGGTGTTGTTGAAAACTGCCATTTTCTAAAGGAAGTAGAAGATGCTCAAAAAATTAGGAAGAGTGTCCTGAAATGTTTCGAAAGAGCGTCCCTTCCAAACCTAACTGAGGAAGAGAGGAAGAAGAATCTTCATTTTGTTGTTATTGGTGGTGGCCCAACAGGTGTAGAATTTGCTGCAGAGCTTCATGACTTTGTCAATGAGGACTTGGCAAAGTTGTATCCTGATGTGAAGAAGTATGCGAATATTTCAGTAATTGAAGCTGGAGATCATATCCTTACAATGTTTGACAAGAGAATTACCCAATTTGCTGAAGATAAATTCAAGAGGACAGGCATAGATTTGAAGACGAATTTTAAGGTTGTGAAGGTGTCTGATAAGGCTATCACTATGACTAATTCTGCAACTGGAGAGATTGCTGTGCCTTATGGCATGGCTGTTTGGTCCACTGGTATTGGAACCCGTCCCCTCATAATGGATTTCATGAAGCAAGTTGGTCAGGCAAACCGACGAGTGCTAGCTACTGATGAATGGCTCAGGGTTCATGGATGTGATGATGTATATGCTCTCGGTGATTGCGCGACAATAACTCAAAGAAAAGTTATGGAAGATATTGCTTCAATTTTCCGGGTAGCAGACAAGGACAATTCTGGCTCTTTGACTGTCAAGAAAATTAAAAATGTTCTTGGCGACATCTATGAAAGGTACCCACAGGTTGAGTTGTACCTTAAAACTAACCAAATGAAGGACTTCCATGACCTACTCAAAGATTCAGACGGGAATGCTATTAAGGAGTCAAAAGAGCTGAACATAGAGGAATTCAAGAAAGCCCTTGCTCGAGTGGACTCGCAAGTTAAGATGCTCCCAGCAACAGCTCAGGTTGCTTCACAAGAGGGAGCCTATCTGGCAAACTGCTTCAACAAGATGAAATACTGTGAAGAGAACCCTGAAGGTCCGTTGAGGATCAGAGGCACAGGGCGTCATCGGTTCAAACCTTTCAGGTACAGGCACCTTGGCCAGTTTGCTCCACTGGGTGGAGAGCAAACAGCCGCTCAATTGCCGGGTGATTGGATACATGTTGGTCACAGCACCCAATGGCTATGGTATTCTGTCTATGCCAGTAAGCAATTCAGCTGGCGCACCAGGATGCTGGTAGTATCTGATTGGGGCAGGCGGTTCATCTATGGAAGGGACTCAAGCAGCCTATAAATTGAACTAGG ATGGTGTTGTTCACCGCCCTGCATTTTGCCAACTGAAGCTCTATTAGACTTGGATAATACAATTTTTGCATACCTTCGGAAACAACTATTTTTGCATACAGCATCATTTTTTTTAGAGAGAGAGAGCATCGTTATATTTGTTCGGCTATTTTCACAAGCTCAGGTTTCTGTAGCGTAGCAAGGTTTTGTCACCAATTTTTGATCTTGCCGATATTTCTATGACACAATGGAGGTTAAATGATTTATACATCAGTACTTTATAATACAGTTCA]
[+] EMBL AA751652             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GAACTAGGCATGGTGTTGTTCACCGCCCTGCATTTTGCCAACTGAAGCTCTATTANACTTGGATAATACAATTTTTGCATACCTTCGGAAACAACTATTTTTGCATACAGCATCATTTTTTTTANAAANANANANCATCGTTATATTTGTTCGGCTATTTTCACAAGCTCAGGTTTCTGTAGCGTANCAAGGTTTTGTCACCAATTTTTGATCTTGCCGATATTTCTATGACACAATGGAGGTTAAATG                                ]




>consensus_823#0
TAGGGGCCGTGGCCGGATCGCAATGTCGGCGTCGGGGGGATTGAGCTTGGTGCGCCGCGC
CGTCGAGGCCGCGCGCCGCACGCCGCGGTGGCAGAAGAGGCTCCTCGTCCTCACCGCCGG
TGTTGGTTCTTTGACTTATGCTTGCCAGGATAATCAAGTACTTCAAATAAATGATGGAAC
TGGCAAGAAGAGGGTGGTTATCGTTGGAACTGGTTGGGCAGGCGCAAGTTTCTTGAGAAA
TATTGACACTTCCTTGTACGATGTTCATGTCGTATCACCTCGCAACTATTTTACCTTCAC
ACCTTTGTTGCCTAGTGTGACATGTGGCACAGTTGAAGCACGTAGTATTGTAGAGCCTAT
CCGTAATATTGTGAGAAAGAGAGGCGGCGCATTTAGATTTTGGGAAGCAGAGTGCTACAA
GATTGATCCAACTAACAAAAAGATCCACTGCAGATCAGACTCAGATGGAAATAGTGAATT
TGTTGTAGATTATGATTACCTGGTCGTCAGTGTTGGAGCTAGACCTAATACATTCAATAC
CCCTGGTGTTGTTGAAAACTGCCATTTTCTAAAGGAAGTAGAAGATGCTCAAAAAATTAG
GAAGAGTGTCCTGAAATGTTTCGAAAGAGCGTCCCTTCCAAACCTAACTGAGGAAGAGAG
GAAGAAGAATCTTCATTTTGTTGTTATTGGTGGTGGCCCAACAGGTGTAGAATTTGCTGC
AGAGCTTCATGACTTTGTCAATGAGGACTTGGCAAAGTTGTATCCTGATGTGAAGAAGTA
TGCGAATATTTCAGTAATTGAAGCTGGAGATCATATCCTTACAATGTTTGACAAGAGAAT
TACCCAATTTGCTGAAGATAAATTCAAGAGGACAGGCATAGATTTGAAGACGAATTTTAA
GGTTGTGAAGGTGTCTGATAAGGCTATCACTATGACTAATTCTGCAACTGGAGAGATTGC
TGTGCCTTATGGCATGGCTGTTTGGTCCACTGGTATTGGAACCCGTCCCCTCATAATGGA
TTTCATGAAGCAAGTTGGTCAGGCAAACCGACGAGTGCTAGCTACTGATGAATGGCTCAG
GGTTCATGGATGTGATGATGTATATGCTCTCGGTGATTGCGCGACAATAACTCAAAGAAA
AGTTATGGAAGATATTGCTTCAATTTTCCGGGTAGCAGACAAGGACAATTCTGGCTCTTT
GACTGTCAAGAAAATTAAAAATGTTCTTGGCGACATCTATGAAAGGTACCCACAGGTTGA
GTTGTACCTTAAAACTAACCAAATGAAGGACTTCCATGACCTACTCAAAGATTCAGACGG
GAATGCTATTAAGGAGTCAAAAGAGCTGAACATAGAGGAATTCAAGAAAGCCCTTGCTCG
AGTGGACTCGCAAGTTAAGATGCTCCCAGCAACAGCTCAGGTTGCTTCACAAGAGGGAGC
CTATCTGGCAAACTGCTTCAACAAGATGAAATACTGTGAAGAGAACCCTGAAGGTCCGTT
GAGGATCAGAGGCACAGGGCGTCATCGGTTCAAACCTTTCAGGTACAGGCACCTTGGCCA
GTTTGCTCCACTGGGTGGAGAGCAAACAGCCGCTCAATTGCCGGGTGATTGGATACATGT
TGGTCACAGCACCCAATGGCTATGGTATTCTGTCTATGCCAGTAAGCAATTCAGCTGGCG
CACCAGGATGCTGGTAGTATCTGATTGGGGCAGGCGGTTCATCTATGGAAGGGACTCAAG
CAGCCTATAAATTGAACTAGGATGGTGTTGTTCACCGCCCTGCATTTTGCCAACTGAAGC
TCTATTAGACTTGGATAATACAATTTTTGCATACCTTCGGAAACAACTATTTTTGCATAC
AGCATCATTTTTTTTAGAGAGAGAGAGCATCGTTATATTTGTTCGGCTATTTTCACAAGC
TCAGGTTTCTGTAGCGTAGCAAGGTTTTGTCACCAATTTTTGATCTTGCCGATATTTCTA
TGACACAATGGAGGTTAAATGATTTATACATCAGTACTTTATAATACAGTTCA
clustalw multiple alignements is not computed in this case