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Oryza sativa
cluster # 8412 cluster # 8412       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8412#0 length = 1455 sequences # 5  
consensusID : consensus_8412#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1455
fasta sequence 
                              [TTGGAAGCACACTTGATCCAGATCGACCCAGGAATGATAAGGCAACTATCCTTAGTGATGCAATTCAAATGCTGAAAGATTTGACGTCCCAGGTGAACAAGCTTAAAGCTGAATATACTTCACTCTCAGAAGAAGCACGTGAGTTGACTCAGGAAAAGAATGAGCTCAGAGATGAGAAAGTTTCACTGAAGTTTGAGGTTGATAATCTGAATACCCAGTATCAGCAACGAATGCGTGTGCTGTACCCTTGGACTGGAATGGAGCCTTCTGTTGTCATTGGGCCACCCCTGCCATATCCTTTTTCAGTCCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCTATACCTTCAGGTGCTGTTCCTATGCACCCACAGCTCCAGGCATACCCTTACTTCCGAAATCAAACTTCTGGAACCGTCTCCAATCCATGCACACCTTACATGGCATACACTCAACCCATCCATCCTCCTACTGATCAACTATCTAACCAATTCAGTGCTCCAGTTCAGCATTCAAGTAGTAATCGATCTCACTCTATGGCCCAAGACTCTAGAAGCAAGTCCTCTGCACTGCAGCAAGTAAGTTGTAGAGGGAAACATGATGACTTTGATGACGTTGCAACTGATCTGGAACTAAAAACTCCTGGTTCCTCAGCCCCTCTACAATCAGAGATTGCCAACAAGGATTCCTCTTCTGACTTGAAAAAAAAGCAGCAGTTCATACAGGAAACTAAAGGTAGTTCTCTTACAGAAGGCAGTAGTAGTTCAAGCAGATGCTCGTCCAGTGGTCCTCCAGATGTCTCTAACAGTATTGAAGGTGGATCAGTTGCTGATGATCAACGATCGACAGTACAGACATAGACTAATATATGACGTATAGCTATCTTTTCCGACATTCCTAGGCCTGCATGTGTGGTGTAATCTGCTGGCACATCAACCTTTGCTGCTTAGCTGTGCCCACTTGATATCGGAATTGACAAATTAGGAGGCCTATAGGCAAAGTAGAACTGGTTAGTCGAAGCCAAAGCCATATTCCATGGCTATGATTATGAATGGTCGGTAGTTACCCACACTCTTCTATGGCAGTTTGAAATGCTTTCGGCGACTAGGTATGCTTGCGACTAACTTCTGCGGTTTGTCATCTAAGATATGCGTCAAGTGCCAACCAGATCTGTTGAGATAGTTCTATCCTGGAGTAGCATTTTCTACGAATATATGGTAAATTAACTAGTGATTAACCATAGAATTTATCATGGTTCAATAGTTACCTGGTAGATCAGCTACAAGTTGTACATCATACACTATATTACCATTAATTGGAATATGTTCTTAAGTATATTATTTGACATGATTGT-CAGTATCCACATTTTACTATATATAGGCGGCATGTTATTGAAGGTGGTTTGTTTCGTGGGGCATGTTATTGAAAGCAAACAAGTATTCTAGGTCGAGTGTAACATGCAAATAT]

[+] EMBL AK069790             [TTGGAAGCACACTTGATCCAGATCGACCCAGGAATGATAAGGCAACTATCCTTAGTGATGCAATTCAAATGCTGAAAGATTTGACGTCCCAGGTGAACAAGCTTAAAGCTGAATATACTTCACTCTCAGAAGAAGCACGTGAGTTGACTCAGGAAAAGAATGAGCTCAGAGATGAGAAAGTTTCACTGAAGTTTGAGGTTGATAATCTGAATACCCAGTATCAGCAACGAATGCGTGTGCTGTACCCTTGGACTGGAATGGAGCCTTCTGTTGTCATTGGGCCACCCCTGCCATATCCTTTTTCAGTCCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCTATACCTTCAGGTGCTGTTCCTATGCACCCACAGCTCCAGGCATACCCTTACTTCCGAAATCAAACTTCTGGAACCGTCTCCAATCCATGCACACCTTACATGGCATACACTCAACCCATCCATCCTCCTACTGATCAACTATCTAACCAATTCAGTGCTCCAGTTCAGCATTCAAGTAGTAATCGATCTCACTCTATGGCCCAAGACTCTAGAAGCAAGTCCTCTGCACTGCAGCAAGTAAGTTGTAGAGGGAAACATGATGACTTTGATGACGTTGCAACTGATCTGGAACTAAAAACTCCTGGTTCCTCAGCCCCTCTACAATCAGAGATTGCCAACAAGGATTCCTCTTCTGACTTGAAAAAAAAGCAGCAGTTCATACAGGAAACTAAAGGTAGTTCTCTTACAGAAGGCAGTAGTAGTTCAAGCAGATGCTCGTCCAGTGGTCCTCCAGATGTCTCTAACAGTATTGAAGGTGGATCAGTTGCTGATGATCAACGATCGACAGTACAGACATAGACTAATATATGACGTATAGCTATCTTTTCCGACATTCCTAGGCCTGCATGTGTGGTGTAATCTGCTGGCACATCAACCTTTGCTGCTTAGCTGTGCCCACTTGATATCGGAATTGACAAATTAGGAGGCCTATAGGCAAAGTAGAACTGGTTAGTCGAAGCCAAAGCCATATTCCATGGCTATGATTATGAATGGTCGGTAGTTACCCACACTCTTCTATGGCAGTTTGAAATGCTTTCGGCGACTAGGTATGCTTGCGACTAACTTCTGCGGTTTGTCATCTAAGATATGCGTCAAGTGCCAACCAGATCTGTTGAGATAGTTCTATCCTGGAGTAGCATTTTCTACGAATATATGGTAAATTAACTAGTGATTAACCATAGAATTTATCATGGTTCAATAGTTACCTGGTAGATCAGCTACAAGTTGTACATCATACACTATATTACCATTAATTGGAATATGTTCTTAAGTATATTATTTGACATGATTGT CAGTATCCACATTTTACTATATATAGGCGG                                                                                   ]
[+] EMBL AK103986             [TTGGAAGCACACTTGATCCAGATCGACCCAGGAATGATAAGGCAACTATCCTTAGTGATGCAATTCAAATGCTGAAAGATTTGACGTCCCAGGTGAACAAGCTTAAAGCTGAATATACTTCACTCTCAGAAGAAGCACGTGAGTTGACTCAGGAAAAGAATGAGCTCAGAGATGAGAAAGTTTCACTGAAGTTTGAGGTTGATAATCTGAATACCCAGTATCAGCAACGAATGCGTGTGCTGTACCCTTGGACTGGAATGGAGCCTTCTGTTGTCATTGGGCCACCCCTGCCATATCCTTTTTCAGTCCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCTATACCTTCAGGTGCTGTTCCTATGCACCCACAGCTCCAGGCATACCCTTACTTCCGAAATCAAACTTCTGGAACCGTCTCCAATCCATGCACACCTTACATGGCATACACTCAACCCATCCATCCTCCTACTGATCAACTATCTAACCAATTCAGTGCTCCAGTTCAGCATTCAAGTAGTAATCGATCTCACTCTATGGCCCAAGACTCTAGAAGCAAGTCCTCTGCACTGCAGCAAGTAAGTTGTAGAGGGAAACATGATGACTTTGATGACGTTGCAACTGATCTGGAACTAAAAACTCCTGGTTCCTCAGCCCCTCTACAATCAGAGATTGCCAACAAGGATTCCTCTTCTGACTTGAAAAAAAAGCAGCAGTTCATACAGGAAACTAAAGGTAGTTCTCTTACAGAAGGCAGTAGTAGTTCAAGCAGATGCTCGTCCAGTGGTCCTCCAGATGTCTCTAACAGTATTGAAGGTGGATCAGTTGCTGATGATCAACGATCGACAGTACAGACATAGACTAATATATGACGTATAGCTATCTTTTCCGACATTCCTAGGCCTGCATGTGTG  GTAATCTGCTGGCACATCAACCTTTGCTGCTTAGCTGTGCCCACTTGATATCGGAATTGACAAATTAGGAGGCCTATAGGCAAAGTAGAACTGGTTAGTCGAAGCCAAAGCCATATTCCATGGCTATGATTATGAATGGTCGGTAGTTACCCACACTCTTCTATGGCAGTTTGAAATGCTTTCGGCGACTAGGTATGCTTGCGACTAACTTCTGCGGTTTGTCATCTAAGATATGCGTCAAGTGCCAACCAGATCTGTTGAGATAGTTCTATCCTGGAGTAGCATTTTCTACGAATATATGGTAAATTAACTAGTGATTAACCATAGAATTTATCATGGTTCAATAGTTACCTGGTAGATCAGCTACAAGTTGTACATCATACACTATATTACCATTAATTGGAATAT                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CB620318             [TTGGAAGCACACTTGATCCAGATCGACCCAGGAATGATAAGGCAACTATCCTTAGTGATGCAATTCAAATGCTGAAAGATTTGACGTCCCAGGTGAACAAGCTTAAAGCTGAATATACTTCACTCTCAGAAGAAGCACGTGAGTTGACTCAGGAAAAGAATGAGCTCAGAGATGAGAAAGTTTCACTGAAGTTTGAGGTTGATAATCTGAATACCCAGTATCAGCAACGAATGCGTGTGCTGTACCCTTGGACTGGAATGGAGCCTTCTGTTGTCATTGGGCCACCCCTGCCATATCCTTTTTCAGTCCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCTATACCTTCAGGTGCTGTTCCTATGCACCCACAGCTCCAGGCATACCCTTACTTCCGAAATCAAACTTCTGGAACCGTCTCCAATCCATGCACACCTTACATGGCATACACTCAACCCATCCATCCTCCTACTGATCAACTATCTAACCAATTCAGTGCTCCAGTTCAGCATTCAAGTAGTAATCGATCTCACTCTATGGCCCAAGACTCTAGAAGCAAGTCCTCTGCCCTGCAGCAAGTAAGTTGTAGAGGGAAACATGATGACTTTGATGACGTTGCAACTGATCTGGAACTAAAAACTCCTGGTTCCTCAGCCCCTCTACAATCAGAGATTGCCAACAAGGATTCCTCTTCTGACTTGAAAAAAAAGCAGCAGTTCATACAGGAAACTAAAGGTAGTTCTCTTACAGAAAGCAGTAGTAGTTCAAGCAGATGCTCGTCCAGTGGTCCTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CB620319             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CAAGCAGATGCTCGTCCAGTGGTCCTCCAGATGTCTCTAACAGTATTGAAGGTGGATCAGTTGCTGATGATCAACGATCGACAGTACAGACATAGACTAATATATGACGTATAGCTATCTTTTCCGACATTCCTAGGCCTGCATGTGTGGTGTAATCTGCTGGCACATCAACCTTTGCTGCTTAGCTGTGCCCACTTGATATCGGAATAGACAAATTAGGAGGCCTATAGGCAAAGTAGAACTGGTTAGTCGAAGCCAAAGCCATATTCCATGGCTATGATTATGAATGGTCGGTAGTTACCCACACTCTTCTATGGCAGTTTGAAATGCTTTCGGCGACTAGGTATGCTTGCGACTAACTTCTGCGGTTTGTCATCTAAGATATGCGTCAAGTGCCAACCAGATCTGTTGAGATAGTTCTATCCTGGAGTAGCATTTTCTACGAATATATGGTAAATTAACTAGTGATTAACCATAGAATTTATCATGGTTCAATAGTTACCTGGTAGATCAGCTACAAGTTGTACATCATACACTATATTACCATTAATTGGAATATGTTCTTAAGTATATTATTTGACATGATTGT CAGTATCCACATTTTACTATATACAGGCGGCATGTTATTGAAGGTGGTTTGTTTCGTGGGGCATGTTATTGAAAGCAAACAAGTATTCTAGGTCGAGTGTAACATGCAAATAT]
[+] EMBL BI813143             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGACTAATATATGACGTATAGCTATCTTTTCCGACATTCCTAGGCCTGCATGTGTGGTGTAATCTGCTGGCACATCAACCTTTGCTGCTTAGCTGTGCCCACTTGATATCGGAATAGAC AATTAGGAGGCCTATAGGC AAGTAGAACTGGTTAGTCGAAGCCCAAGCCATATTCCATGGCTATGATTATGAATGGTCGGTAGTTACCCACACTCTTCTATGGCAGTTTGAAATGCTTTCGGCGACTAGGTATGCTTGCGACTAACTTCTGCGGTTTGTCATCTAAGATATGCGTCAAGTGCCCACCAGATCTGTTGAGATAGTTCTATCCTGGAGTAGCATTTTCTACGAATATATGGTAAATTAACTAGTGATTAACCATAGAATTTATCATGGTTCAATAGTTACCTGGTAGATCAGCTACCAGTTGTACATCATACACTATATTACC TTAATTGGAATATGTTCTTAAGTATATTATTTGACATGATTGTCCAGTAaaaaaaaaa                                                                                                   ]




>consensus_8412#0
TTGGAAGCACACTTGATCCAGATCGACCCAGGAATGATAAGGCAACTATCCTTAGTGATG
CAATTCAAATGCTGAAAGATTTGACGTCCCAGGTGAACAAGCTTAAAGCTGAATATACTT
CACTCTCAGAAGAAGCACGTGAGTTGACTCAGGAAAAGAATGAGCTCAGAGATGAGAAAG
TTTCACTGAAGTTTGAGGTTGATAATCTGAATACCCAGTATCAGCAACGAATGCGTGTGC
TGTACCCTTGGACTGGAATGGAGCCTTCTGTTGTCATTGGGCCACCCCTGCCATATCCTT
TTTCAGTCCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCTATACCTTCAGGTGCTGTTCCTATGCACCCAC
AGCTCCAGGCATACCCTTACTTCCGAAATCAAACTTCTGGAACCGTCTCCAATCCATGCA
CACCTTACATGGCATACACTCAACCCATCCATCCTCCTACTGATCAACTATCTAACCAAT
TCAGTGCTCCAGTTCAGCATTCAAGTAGTAATCGATCTCACTCTATGGCCCAAGACTCTA
GAAGCAAGTCCTCTGCACTGCAGCAAGTAAGTTGTAGAGGGAAACATGATGACTTTGATG
ACGTTGCAACTGATCTGGAACTAAAAACTCCTGGTTCCTCAGCCCCTCTACAATCAGAGA
TTGCCAACAAGGATTCCTCTTCTGACTTGAAAAAAAAGCAGCAGTTCATACAGGAAACTA
AAGGTAGTTCTCTTACAGAAGGCAGTAGTAGTTCAAGCAGATGCTCGTCCAGTGGTCCTC
CAGATGTCTCTAACAGTATTGAAGGTGGATCAGTTGCTGATGATCAACGATCGACAGTAC
AGACATAGACTAATATATGACGTATAGCTATCTTTTCCGACATTCCTAGGCCTGCATGTG
TGGTGTAATCTGCTGGCACATCAACCTTTGCTGCTTAGCTGTGCCCACTTGATATCGGAA
TTGACAAATTAGGAGGCCTATAGGCAAAGTAGAACTGGTTAGTCGAAGCCAAAGCCATAT
TCCATGGCTATGATTATGAATGGTCGGTAGTTACCCACACTCTTCTATGGCAGTTTGAAA
TGCTTTCGGCGACTAGGTATGCTTGCGACTAACTTCTGCGGTTTGTCATCTAAGATATGC
GTCAAGTGCCAACCAGATCTGTTGAGATAGTTCTATCCTGGAGTAGCATTTTCTACGAAT
ATATGGTAAATTAACTAGTGATTAACCATAGAATTTATCATGGTTCAATAGTTACCTGGT
AGATCAGCTACAAGTTGTACATCATACACTATATTACCATTAATTGGAATATGTTCTTAA
GTATATTATTTGACATGATTGTCAGTATCCACATTTTACTATATATAGGCGGCATGTTAT
TGAAGGTGGTTTGTTTCGTGGGGCATGTTATTGAAAGCAAACAAGTATTCTAGGTCGAGT
GTAACATGCAAATAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)