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Oryza sativa
cluster # 8522 cluster # 8522       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8522#0 length = 991 sequences # 5  

consensusID : consensus_8522#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 991
fasta sequence
                              [ACCAGCAAGGGTCACAAGAGCCATGGGGCATTGATACAGCAAGGCAAAGACTTGGTTACTTATGCAATTATAAATGCCGTGGCCATGAGGAAAATTTTAAAGAAATATGACAAGATACATTACTCGAAGCAAGGGCAGGAATTCAAAGCTCAAGCCCAGAGTCTGCATATTGAAATACTTCAATCCCCATGGCTCTGTGAGCTGATGGCTTTCTACATGAACTTGAGAAGAAGCAAGAAGAACAACGGTGCTATGGAGCTCTTTGGGGATTGTTCTCTCGTATTCGATGATGACAAACCAACAATTTCATGCAACCTCTTTGACTCTATGCGTGTCGACATTAGCTTGACATGTTCGATTTGCTTGGATACCGTGTTTGATCCAGTTGCTCTTTCCTGTGGTCACATATATTGCTACTTGTGCAGCTGTTCTGCTGCATCCGTTACGATCGTTGATGGGCTGAAGTCTGCCGAGCGCAAATCAAAGTGCCCACTGTGCCGACAGGCAGGAGTCTTTCCTAATGCTGTACACTTGGATGAGCTGAACATGCTACTAAGCTATAGTTGTCCAGAGTACTGGGAGAAGAGAATACAGATGGAGCGGGTTGAACGTGTTCGTCTGGCTAAGGAACACTGGGAGTCACAGTGCAGGGCATTCTTGGGCATGTGATTCTAAAGTTGGTGGATTTTTTTTTTCTTTAGAGGGGCTTCATATGTGATGTATAGTTTCTTGACAAAATGGAATTTGCCATTTGTTGTCACTTATATCCTGCTCTGTTGCTCCTCTTTGTGTAAGAAGTTGGATTTGTCATCCTAAATGCAAAAACAGCAGGGGTTGTTCACTACTGTGCACTTAGATGTAAATAGGGTAGATTTGTAGTCATTGTTCAAGTGCATAACTGTAAATTCATTTATATTTGATCAGTTCAATCTGGGGGTTTGACTTTGTGGTTAAAAHAAAAAAAAAAAAAWAAACTCGAGACTAGTTCTCG]

[+] EMBL AK065454             [ACCAGCAAGGGTCACAAGAGCCATGGGGCATTGATACAGCAAGGCAAAGACTTGGTTACTTATGCAATTATAAATGCCGTGGCCATGAGGAAAATTTTAAAGAAATATGACAAGATACATTACTCGAAGCAAGGGCAGGAATTCAAAGCTCAAGCCCAGAGTCTGCATATTGAAATACTTCAATCCCCATGGCTCTGTGAGCTGATGGCTTTCTACATGAACTTGAGAAGAAGCAAGAAGAACAACGGTGCTATGGAGCTCTTTGGGGATTGTTCTCTCGTATTCGATGATGACAAACCAACAATTTCATGCAACCTCTTTGACTCTATGCGTGTCGACATTAGCTTGACATGTTCGATTTGCTTGGATACCGTGTTTGATCCAGTTGCTCTTTCCTGTGGTCACATATATTGCTACTTGTGCAGCTGTTCTGCTGCATCCGTTACGATCGTTGATGGGCTGAAGTCTGCCGAGCGCAAATCAAAGTGCCCACTGTGCCGACAGGCAGGAGTCTTTCCTAATGCTGTACACTTGGATGAGCTGAACATGCTACTAAGCTATAGTTGTCCAGAGTACTGGGAGAAGAGAATACAGATGGAGCGGGTTGAACGTGTTCGTCTGGCTAAGGAACACTGGGAGTCACAGTGCAGGGCATTCTTGGGCATGTGATTCTAAAGTTGGTGGA TTTTTTTTTCTTTAGAGGGGCTTCATATGTGATGTATAGTTTCTTGACAAAATGGAATTTGCCATTTGTTGTCACTTATATCCTGCTCTGTTGCTCCTCTTTGTGTAAGAAGTTGGATTTGTCATCCTAAATGCAAAAACAGCAGGGGTTGTTCACTACTGTGCACTTAGATGTAAATAGGGTAGATTTGTAGTCATTGTTCAAGTGCATAACTGTAAATTCATTTATATT                                                                          ]
[-] EMBL CB617770             [                                                                                                           TGACAAGATACATT NTCGAAGCAAGGGCAGGAATTCAAAGCTCAAGCCCAGAGTCTGCATATTGAAATACTTCAATCCCCATGGCTCTGTGAGCTGATGGCTTTCTACATGAACTTGAGAAGAAGCAAGAAGAACAACGGTGCTATGGAGCTCTTTGGGGATTGTTCTCTCGTATTCGATGATGACAAACCAACAATTTCATGCAACCTCTTTGACTCTATGCGCGTCGACATTAGCTTGACATGTTCTATTTGCTTGGATACCGTGTTTGATCCAGTTGCTCTTTCCTGTGGTCACATATATTGCTACTTGTGCAGCTGTTCTGCTGCATCCGTTACGATCGTTGATGGGCTGAAGTCTGCCGAGCGCAAATCAAAGTGCCCACTGTGCCGACAGGCAGGAGTCTTTCCTAATGCTGTACACTTGGATGAGCTGAACATGCTACTAAGCTATAGTTGTCCAGAGTACTGGGAGAAGAGAATACAGATGGAGCGGGTTGAACGTGTTCGTCTGGCTAAGGAACACTGGGAGTCACAGTGCAGGGCATTCTTGGGCATGTGATTCTAAAGTTGGTGGATTTTTTTTTTCTTTAGAGGGGCTTCATATGTGATGTATAGTTTCTTGACAAAATGGAATTTGCCATTTGTTGTCACTTATATCCTGCTCTGTTGCTCCTCTTTGTGTAAGAAGTTGGATTTGTCATCCTAAATGCAAAAACAGCAGGGGTTGTTCACTGCTGTGCACTTAGATGTAAATAGGGTAGATTTGTAGTCATTGTTCAAGTGCATAACTGTAAATTCATTTGTATTTGATCAGTTCAATCTGGGGGTTTGACT                                               ]
[-] EMBL CB651785             [                                                                                                                                            ATTCAAAGCTCAAGCCCAGAGTCTGCATATTGAAATACTTCAATCCGCATGGCTCTGTGAGCTGATGGCTTTCTACATGAACTTGAGAAGAAGCAAGAAGAACAACGGTGCTATGGAGCTCTTTGGGGATTGTTCTCTCGTATTCGATGATGACAAACCAACAATTTCATGCAACCTCTTTGACTCTATGCGTGTCGACATTAGCTTGACATGTTCGATTTGCTTGGATACCGTGTTTGATCCAGTTGCTCTTTCCTGTGGTCACATATATTGCTACTTGTGCAGCTGTTCTGCTGCATCCGTTACGATCGTTGATGGGCTGAAGTCTGCCGAGCGCAAATCAAAGTGCCCACTGTGCCGACAGGCAGGAGTCTTTCCTAATGCTGTACACTTGGATGAGCTGAACATGCTACTAAGCTATAGTTGTCCAGAGTACTGGGAGAAGAGAATACAGATGGAGCGGGTTGAACGTGTTCGTCTGGCTAAGGAACACTGGGAGTCACAGTGCAGGGCATTCTTGGGCATGTGATTCTAAAGTTGGTGGATTTTTTTTTTCTTTAGAGGGGCTTCATATGTGATGTATAGTTTCTTGACAAAATGGAATTTGCCATTTGTTGTCACTTATATCCTGCTCTGTTGCTCCTCTTTGTGTAAGAAGTTGGATTTGTCATCCTAAATGCAAAAACAGCAGGGGTTGTTCACTACTGTGCACTTAGATGTAAATAGGGTAGATTTGTAGTCATTGTTCAAGTGCATAACTGTAAATTCATTTATATTTGATCAGTTCAATCTGGGGGTTTGACTTTGTGG                                         ]
[-] EMBL CB627499             [                                                                                                                                                                                             TGGCTCTGTGAGCTGATGGCTTTCTACATGAACTTGAGAAGAAGCAAGAAGAACAACGGTGCTATGGAGCTCTTTGGGGATTGTTCTCTCGTATTCGATGATGACAAACCAACAATTTCATGCAACCTCTTTGACTCTATGCGCGTCGACATTAGCTTGACATGTTTTATTTGCTTGGATACCGTGTTTGATCCAGTTGCTCTTTCCTGTGGTCACATATATTGCTACTTGTGCAGCTGTTTTGCTGCATCCGTTACGATCGTTGATGGGCTGAAGTCTGCCGAGCGCAAATCAAAGTGCCCACTGTGCCGACAGGCAGGAGTCTTTCCTAATGCTGTACACTTGGATGAGCTGAACATGCTACTAAGCTATAGTTGTCCAGAGTACTGGGAGAAGAGAATACAGATGGAGCGGGTTGAACGTGTTCGTTTGGCTAAGGAACACTGGGAGTCACAGTGCAGGGCATTTTTGGGCATGTGATTTTAAAGTTGGTGGATTTTTTTTTTCTTTAGAGGGGCTTCATATGTGATGTATAGTTTCTTGACAAAATGGAATTTGCCATTTGTTGTCACTTATATCCTGCTCTGTTGCTCCTCTTTGTGTAAGAAGTTGGATTTGTCATCCTAAATGCAAAAACAGCAGGGGTTGTTCACTGCTGTGCACTTAGATGTAAATAGGGTAGATTTGTAGTCATTGTTCAAGTGCATAACTGTAAATTCATTTGTATTTGATCAGTTCAATCTGGGGGTTTGAC                                                ]
[-] EMBL AA754260             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTAAGAAGTTGGATTTGTCACCCTAAATGCAAAAACAGCAGGGGTTGTTCACTACTGTGCACTTAGATGTAAATAGGGTAGATTTGTAGTCATTGTTCAAGTGCATAACTGTAAATTCATTTATATTTGATCAGTTCAATCTGGGGGTTTGACTTTGTGGTTAAAAHAAAAAAAAAAAAAWAAACTCGAGACTAGTTCTCG]


>consensus_8522#0 ACCAGCAAGGGTCACAAGAGCCATGGGGCATTGATACAGCAAGGCAAAGACTTGGTTACT TATGCAATTATAAATGCCGTGGCCATGAGGAAAATTTTAAAGAAATATGACAAGATACAT TACTCGAAGCAAGGGCAGGAATTCAAAGCTCAAGCCCAGAGTCTGCATATTGAAATACTT CAATCCCCATGGCTCTGTGAGCTGATGGCTTTCTACATGAACTTGAGAAGAAGCAAGAAG AACAACGGTGCTATGGAGCTCTTTGGGGATTGTTCTCTCGTATTCGATGATGACAAACCA ACAATTTCATGCAACCTCTTTGACTCTATGCGTGTCGACATTAGCTTGACATGTTCGATT TGCTTGGATACCGTGTTTGATCCAGTTGCTCTTTCCTGTGGTCACATATATTGCTACTTG TGCAGCTGTTCTGCTGCATCCGTTACGATCGTTGATGGGCTGAAGTCTGCCGAGCGCAAA TCAAAGTGCCCACTGTGCCGACAGGCAGGAGTCTTTCCTAATGCTGTACACTTGGATGAG CTGAACATGCTACTAAGCTATAGTTGTCCAGAGTACTGGGAGAAGAGAATACAGATGGAG CGGGTTGAACGTGTTCGTCTGGCTAAGGAACACTGGGAGTCACAGTGCAGGGCATTCTTG GGCATGTGATTCTAAAGTTGGTGGATTTTTTTTTTCTTTAGAGGGGCTTCATATGTGATG TATAGTTTCTTGACAAAATGGAATTTGCCATTTGTTGTCACTTATATCCTGCTCTGTTGC TCCTCTTTGTGTAAGAAGTTGGATTTGTCATCCTAAATGCAAAAACAGCAGGGGTTGTTC ACTACTGTGCACTTAGATGTAAATAGGGTAGATTTGTAGTCATTGTTCAAGTGCATAACT GTAAATTCATTTATATTTGATCAGTTCAATCTGGGGGTTTGACTTTGTGGTTAAAAHAAA AAAAAAAAAAWAAACTCGAGACTAGTTCTCG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)