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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8522#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 991 fasta sequence
[ACCAGCAAGGGTCACAAGAGCCATGGGGCATTGATACAGCAAGGCAAAGACTTGGTTACTTATGCAATTATAAATGCCGTGGCCATGAGGAAAATTTTAAAGAAATATGACAAGATACATTACTCGAAGCAAGGGCAGGAATTCAAAGCTCAAGCCCAGAGTCTGCATATTGAAATACTTCAATCCCCATGGCTCTGTGAGCTGATGGCTTTCTACATGAACTTGAGAAGAAGCAAGAAGAACAACGGTGCTATGGAGCTCTTTGGGGATTGTTCTCTCGTATTCGATGATGACAAACCAACAATTTCATGCAACCTCTTTGACTCTATGCGTGTCGACATTAGCTTGACATGTTCGATTTGCTTGGATACCGTGTTTGATCCAGTTGCTCTTTCCTGTGGTCACATATATTGCTACTTGTGCAGCTGTTCTGCTGCATCCGTTACGATCGTTGATGGGCTGAAGTCTGCCGAGCGCAAATCAAAGTGCCCACTGTGCCGACAGGCAGGAGTCTTTCCTAATGCTGTACACTTGGATGAGCTGAACATGCTACTAAGCTATAGTTGTCCAGAGTACTGGGAGAAGAGAATACAGATGGAGCGGGTTGAACGTGTTCGTCTGGCTAAGGAACACTGGGAGTCACAGTGCAGGGCATTCTTGGGCATGTGATTCTAAAGTTGGTGGATTTTTTTTTTCTTTAGAGGGGCTTCATATGTGATGTATAGTTTCTTGACAAAATGGAATTTGCCATTTGTTGTCACTTATATCCTGCTCTGTTGCTCCTCTTTGTGTAAGAAGTTGGATTTGTCATCCTAAATGCAAAAACAGCAGGGGTTGTTCACTACTGTGCACTTAGATGTAAATAGGGTAGATTTGTAGTCATTGTTCAAGTGCATAACTGTAAATTCATTTATATTTGATCAGTTCAATCTGGGGGTTTGACTTTGTGGTTAAAAHAAAAAAAAAAAAAWAAACTCGAGACTAGTTCTCG]
[+] EMBL AK065454 [ACCAGCAAGGGTCACAAGAGCCATGGGGCATTGATACAGCAAGGCAAAGACTTGGTTACTTATGCAATTATAAATGCCGTGGCCATGAGGAAAATTTTAAAGAAATATGACAAGATACATTACTCGAAGCAAGGGCAGGAATTCAAAGCTCAAGCCCAGAGTCTGCATATTGAAATACTTCAATCCCCATGGCTCTGTGAGCTGATGGCTTTCTACATGAACTTGAGAAGAAGCAAGAAGAACAACGGTGCTATGGAGCTCTTTGGGGATTGTTCTCTCGTATTCGATGATGACAAACCAACAATTTCATGCAACCTCTTTGACTCTATGCGTGTCGACATTAGCTTGACATGTTCGATTTGCTTGGATACCGTGTTTGATCCAGTTGCTCTTTCCTGTGGTCACATATATTGCTACTTGTGCAGCTGTTCTGCTGCATCCGTTACGATCGTTGATGGGCTGAAGTCTGCCGAGCGCAAATCAAAGTGCCCACTGTGCCGACAGGCAGGAGTCTTTCCTAATGCTGTACACTTGGATGAGCTGAACATGCTACTAAGCTATAGTTGTCCAGAGTACTGGGAGAAGAGAATACAGATGGAGCGGGTTGAACGTGTTCGTCTGGCTAAGGAACACTGGGAGTCACAGTGCAGGGCATTCTTGGGCATGTGATTCTAAAGTTGGTGGA TTTTTTTTTCTTTAGAGGGGCTTCATATGTGATGTATAGTTTCTTGACAAAATGGAATTTGCCATTTGTTGTCACTTATATCCTGCTCTGTTGCTCCTCTTTGTGTAAGAAGTTGGATTTGTCATCCTAAATGCAAAAACAGCAGGGGTTGTTCACTACTGTGCACTTAGATGTAAATAGGGTAGATTTGTAGTCATTGTTCAAGTGCATAACTGTAAATTCATTTATATT ]
[-] EMBL CB617770 [ TGACAAGATACATT NTCGAAGCAAGGGCAGGAATTCAAAGCTCAAGCCCAGAGTCTGCATATTGAAATACTTCAATCCCCATGGCTCTGTGAGCTGATGGCTTTCTACATGAACTTGAGAAGAAGCAAGAAGAACAACGGTGCTATGGAGCTCTTTGGGGATTGTTCTCTCGTATTCGATGATGACAAACCAACAATTTCATGCAACCTCTTTGACTCTATGCGCGTCGACATTAGCTTGACATGTTCTATTTGCTTGGATACCGTGTTTGATCCAGTTGCTCTTTCCTGTGGTCACATATATTGCTACTTGTGCAGCTGTTCTGCTGCATCCGTTACGATCGTTGATGGGCTGAAGTCTGCCGAGCGCAAATCAAAGTGCCCACTGTGCCGACAGGCAGGAGTCTTTCCTAATGCTGTACACTTGGATGAGCTGAACATGCTACTAAGCTATAGTTGTCCAGAGTACTGGGAGAAGAGAATACAGATGGAGCGGGTTGAACGTGTTCGTCTGGCTAAGGAACACTGGGAGTCACAGTGCAGGGCATTCTTGGGCATGTGATTCTAAAGTTGGTGGATTTTTTTTTTCTTTAGAGGGGCTTCATATGTGATGTATAGTTTCTTGACAAAATGGAATTTGCCATTTGTTGTCACTTATATCCTGCTCTGTTGCTCCTCTTTGTGTAAGAAGTTGGATTTGTCATCCTAAATGCAAAAACAGCAGGGGTTGTTCACTGCTGTGCACTTAGATGTAAATAGGGTAGATTTGTAGTCATTGTTCAAGTGCATAACTGTAAATTCATTTGTATTTGATCAGTTCAATCTGGGGGTTTGACT ]
[-] EMBL CB651785 [ ATTCAAAGCTCAAGCCCAGAGTCTGCATATTGAAATACTTCAATCCGCATGGCTCTGTGAGCTGATGGCTTTCTACATGAACTTGAGAAGAAGCAAGAAGAACAACGGTGCTATGGAGCTCTTTGGGGATTGTTCTCTCGTATTCGATGATGACAAACCAACAATTTCATGCAACCTCTTTGACTCTATGCGTGTCGACATTAGCTTGACATGTTCGATTTGCTTGGATACCGTGTTTGATCCAGTTGCTCTTTCCTGTGGTCACATATATTGCTACTTGTGCAGCTGTTCTGCTGCATCCGTTACGATCGTTGATGGGCTGAAGTCTGCCGAGCGCAAATCAAAGTGCCCACTGTGCCGACAGGCAGGAGTCTTTCCTAATGCTGTACACTTGGATGAGCTGAACATGCTACTAAGCTATAGTTGTCCAGAGTACTGGGAGAAGAGAATACAGATGGAGCGGGTTGAACGTGTTCGTCTGGCTAAGGAACACTGGGAGTCACAGTGCAGGGCATTCTTGGGCATGTGATTCTAAAGTTGGTGGATTTTTTTTTTCTTTAGAGGGGCTTCATATGTGATGTATAGTTTCTTGACAAAATGGAATTTGCCATTTGTTGTCACTTATATCCTGCTCTGTTGCTCCTCTTTGTGTAAGAAGTTGGATTTGTCATCCTAAATGCAAAAACAGCAGGGGTTGTTCACTACTGTGCACTTAGATGTAAATAGGGTAGATTTGTAGTCATTGTTCAAGTGCATAACTGTAAATTCATTTATATTTGATCAGTTCAATCTGGGGGTTTGACTTTGTGG ]
[-] EMBL CB627499 [ TGGCTCTGTGAGCTGATGGCTTTCTACATGAACTTGAGAAGAAGCAAGAAGAACAACGGTGCTATGGAGCTCTTTGGGGATTGTTCTCTCGTATTCGATGATGACAAACCAACAATTTCATGCAACCTCTTTGACTCTATGCGCGTCGACATTAGCTTGACATGTTTTATTTGCTTGGATACCGTGTTTGATCCAGTTGCTCTTTCCTGTGGTCACATATATTGCTACTTGTGCAGCTGTTTTGCTGCATCCGTTACGATCGTTGATGGGCTGAAGTCTGCCGAGCGCAAATCAAAGTGCCCACTGTGCCGACAGGCAGGAGTCTTTCCTAATGCTGTACACTTGGATGAGCTGAACATGCTACTAAGCTATAGTTGTCCAGAGTACTGGGAGAAGAGAATACAGATGGAGCGGGTTGAACGTGTTCGTTTGGCTAAGGAACACTGGGAGTCACAGTGCAGGGCATTTTTGGGCATGTGATTTTAAAGTTGGTGGATTTTTTTTTTCTTTAGAGGGGCTTCATATGTGATGTATAGTTTCTTGACAAAATGGAATTTGCCATTTGTTGTCACTTATATCCTGCTCTGTTGCTCCTCTTTGTGTAAGAAGTTGGATTTGTCATCCTAAATGCAAAAACAGCAGGGGTTGTTCACTGCTGTGCACTTAGATGTAAATAGGGTAGATTTGTAGTCATTGTTCAAGTGCATAACTGTAAATTCATTTGTATTTGATCAGTTCAATCTGGGGGTTTGAC ]
[-] EMBL AA754260 [ GTAAGAAGTTGGATTTGTCACCCTAAATGCAAAAACAGCAGGGGTTGTTCACTACTGTGCACTTAGATGTAAATAGGGTAGATTTGTAGTCATTGTTCAAGTGCATAACTGTAAATTCATTTATATTTGATCAGTTCAATCTGGGGGTTTGACTTTGTGGTTAAAAHAAAAAAAAAAAAAWAAACTCGAGACTAGTTCTCG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||