These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8522#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 991 fasta sequence [ACCAGCAAGGGTCACAAGAGCCATGGGGCATTGATACAGCAAGGCAAAGACTTGGTTACTTATGCAATTATAAATGCCGTGGCCATGAGGAAAATTTTAAAGAAATATGACAAGATACATTACTCGAAGCAAGGGCAGGAATTCAAAGCTCAAGCCCAGAGTCTGCATATTGAAATACTTCAATCCCCATGGCTCTGTGAGCTGATGGCTTTCTACATGAACTTGAGAAGAAGCAAGAAGAACAACGGTGCTATGGAGCTCTTTGGGGATTGTTCTCTCGTATTCGATGATGACAAACCAACAATTTCATGCAACCTCTTTGACTCTATGCGTGTCGACATTAGCTTGACATGTTCGATTTGCTTGGATACCGTGTTTGATCCAGTTGCTCTTTCCTGTGGTCACATATATTGCTACTTGTGCAGCTGTTCTGCTGCATCCGTTACGATCGTTGATGGGCTGAAGTCTGCCGAGCGCAAATCAAAGTGCCCACTGTGCCGACAGGCAGGAGTCTTTCCTAATGCTGTACACTTGGATGAGCTGAACATGCTACTAAGCTATAGTTGTCCAGAGTACTGGGAGAAGAGAATACAGATGGAGCGGGTTGAACGTGTTCGTCTGGCTAAGGAACACTGGGAGTCACAGTGCAGGGCATTCTTGGGCATGTGATTCTAAAGTTGGTGGATTTTTTTTTTCTTTAGAGGGGCTTCATATGTGATGTATAGTTTCTTGACAAAATGGAATTTGCCATTTGTTGTCACTTATATCCTGCTCTGTTGCTCCTCTTTGTGTAAGAAGTTGGATTTGTCATCCTAAATGCAAAAACAGCAGGGGTTGTTCACTACTGTGCACTTAGATGTAAATAGGGTAGATTTGTAGTCATTGTTCAAGTGCATAACTGTAAATTCATTTATATTTGATCAGTTCAATCTGGGGGTTTGACTTTGTGGTTAAAAHAAAAAAAAAAAAAWAAACTCGAGACTAGTTCTCG] [+] EMBL AK065454 [ACCAGCAAGGGTCACAAGAGCCATGGGGCATTGATACAGCAAGGCAAAGACTTGGTTACTTATGCAATTATAAATGCCGTGGCCATGAGGAAAATTTTAAAGAAATATGACAAGATACATTACTCGAAGCAAGGGCAGGAATTCAAAGCTCAAGCCCAGAGTCTGCATATTGAAATACTTCAATCCCCATGGCTCTGTGAGCTGATGGCTTTCTACATGAACTTGAGAAGAAGCAAGAAGAACAACGGTGCTATGGAGCTCTTTGGGGATTGTTCTCTCGTATTCGATGATGACAAACCAACAATTTCATGCAACCTCTTTGACTCTATGCGTGTCGACATTAGCTTGACATGTTCGATTTGCTTGGATACCGTGTTTGATCCAGTTGCTCTTTCCTGTGGTCACATATATTGCTACTTGTGCAGCTGTTCTGCTGCATCCGTTACGATCGTTGATGGGCTGAAGTCTGCCGAGCGCAAATCAAAGTGCCCACTGTGCCGACAGGCAGGAGTCTTTCCTAATGCTGTACACTTGGATGAGCTGAACATGCTACTAAGCTATAGTTGTCCAGAGTACTGGGAGAAGAGAATACAGATGGAGCGGGTTGAACGTGTTCGTCTGGCTAAGGAACACTGGGAGTCACAGTGCAGGGCATTCTTGGGCATGTGATTCTAAAGTTGGTGGA TTTTTTTTTCTTTAGAGGGGCTTCATATGTGATGTATAGTTTCTTGACAAAATGGAATTTGCCATTTGTTGTCACTTATATCCTGCTCTGTTGCTCCTCTTTGTGTAAGAAGTTGGATTTGTCATCCTAAATGCAAAAACAGCAGGGGTTGTTCACTACTGTGCACTTAGATGTAAATAGGGTAGATTTGTAGTCATTGTTCAAGTGCATAACTGTAAATTCATTTATATT ] [-] EMBL CB617770 [ TGACAAGATACATT NTCGAAGCAAGGGCAGGAATTCAAAGCTCAAGCCCAGAGTCTGCATATTGAAATACTTCAATCCCCATGGCTCTGTGAGCTGATGGCTTTCTACATGAACTTGAGAAGAAGCAAGAAGAACAACGGTGCTATGGAGCTCTTTGGGGATTGTTCTCTCGTATTCGATGATGACAAACCAACAATTTCATGCAACCTCTTTGACTCTATGCGCGTCGACATTAGCTTGACATGTTCTATTTGCTTGGATACCGTGTTTGATCCAGTTGCTCTTTCCTGTGGTCACATATATTGCTACTTGTGCAGCTGTTCTGCTGCATCCGTTACGATCGTTGATGGGCTGAAGTCTGCCGAGCGCAAATCAAAGTGCCCACTGTGCCGACAGGCAGGAGTCTTTCCTAATGCTGTACACTTGGATGAGCTGAACATGCTACTAAGCTATAGTTGTCCAGAGTACTGGGAGAAGAGAATACAGATGGAGCGGGTTGAACGTGTTCGTCTGGCTAAGGAACACTGGGAGTCACAGTGCAGGGCATTCTTGGGCATGTGATTCTAAAGTTGGTGGATTTTTTTTTTCTTTAGAGGGGCTTCATATGTGATGTATAGTTTCTTGACAAAATGGAATTTGCCATTTGTTGTCACTTATATCCTGCTCTGTTGCTCCTCTTTGTGTAAGAAGTTGGATTTGTCATCCTAAATGCAAAAACAGCAGGGGTTGTTCACTGCTGTGCACTTAGATGTAAATAGGGTAGATTTGTAGTCATTGTTCAAGTGCATAACTGTAAATTCATTTGTATTTGATCAGTTCAATCTGGGGGTTTGACT ] [-] EMBL CB651785 [ ATTCAAAGCTCAAGCCCAGAGTCTGCATATTGAAATACTTCAATCCGCATGGCTCTGTGAGCTGATGGCTTTCTACATGAACTTGAGAAGAAGCAAGAAGAACAACGGTGCTATGGAGCTCTTTGGGGATTGTTCTCTCGTATTCGATGATGACAAACCAACAATTTCATGCAACCTCTTTGACTCTATGCGTGTCGACATTAGCTTGACATGTTCGATTTGCTTGGATACCGTGTTTGATCCAGTTGCTCTTTCCTGTGGTCACATATATTGCTACTTGTGCAGCTGTTCTGCTGCATCCGTTACGATCGTTGATGGGCTGAAGTCTGCCGAGCGCAAATCAAAGTGCCCACTGTGCCGACAGGCAGGAGTCTTTCCTAATGCTGTACACTTGGATGAGCTGAACATGCTACTAAGCTATAGTTGTCCAGAGTACTGGGAGAAGAGAATACAGATGGAGCGGGTTGAACGTGTTCGTCTGGCTAAGGAACACTGGGAGTCACAGTGCAGGGCATTCTTGGGCATGTGATTCTAAAGTTGGTGGATTTTTTTTTTCTTTAGAGGGGCTTCATATGTGATGTATAGTTTCTTGACAAAATGGAATTTGCCATTTGTTGTCACTTATATCCTGCTCTGTTGCTCCTCTTTGTGTAAGAAGTTGGATTTGTCATCCTAAATGCAAAAACAGCAGGGGTTGTTCACTACTGTGCACTTAGATGTAAATAGGGTAGATTTGTAGTCATTGTTCAAGTGCATAACTGTAAATTCATTTATATTTGATCAGTTCAATCTGGGGGTTTGACTTTGTGG ] [-] EMBL CB627499 [ TGGCTCTGTGAGCTGATGGCTTTCTACATGAACTTGAGAAGAAGCAAGAAGAACAACGGTGCTATGGAGCTCTTTGGGGATTGTTCTCTCGTATTCGATGATGACAAACCAACAATTTCATGCAACCTCTTTGACTCTATGCGCGTCGACATTAGCTTGACATGTTTTATTTGCTTGGATACCGTGTTTGATCCAGTTGCTCTTTCCTGTGGTCACATATATTGCTACTTGTGCAGCTGTTTTGCTGCATCCGTTACGATCGTTGATGGGCTGAAGTCTGCCGAGCGCAAATCAAAGTGCCCACTGTGCCGACAGGCAGGAGTCTTTCCTAATGCTGTACACTTGGATGAGCTGAACATGCTACTAAGCTATAGTTGTCCAGAGTACTGGGAGAAGAGAATACAGATGGAGCGGGTTGAACGTGTTCGTTTGGCTAAGGAACACTGGGAGTCACAGTGCAGGGCATTTTTGGGCATGTGATTTTAAAGTTGGTGGATTTTTTTTTTCTTTAGAGGGGCTTCATATGTGATGTATAGTTTCTTGACAAAATGGAATTTGCCATTTGTTGTCACTTATATCCTGCTCTGTTGCTCCTCTTTGTGTAAGAAGTTGGATTTGTCATCCTAAATGCAAAAACAGCAGGGGTTGTTCACTGCTGTGCACTTAGATGTAAATAGGGTAGATTTGTAGTCATTGTTCAAGTGCATAACTGTAAATTCATTTGTATTTGATCAGTTCAATCTGGGGGTTTGAC ] [-] EMBL AA754260 [ GTAAGAAGTTGGATTTGTCACCCTAAATGCAAAAACAGCAGGGGTTGTTCACTACTGTGCACTTAGATGTAAATAGGGTAGATTTGTAGTCATTGTTCAAGTGCATAACTGTAAATTCATTTATATTTGATCAGTTCAATCTGGGGGTTTGACTTTGTGGTTAAAAHAAAAAAAAAAAAAWAAACTCGAGACTAGTTCTCG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||