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Oryza sativa
cluster # 8620 cluster # 8620       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8620#0 length = 3139 sequences # 5  
consensusID : consensus_8620#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 3139
fasta sequence 
                              [CGCCCCCCTGGCTGGCTCTGCCTCTGGCTCCGGTTCTTGCCGCTCGCGATCCCCAAAGCGCGGCAATCCGCCGCACGCGCGCGCGCGCGCTCGCACTCCCTCCGCCCCGCCGCGCCGTCCCTCCTGACGCGGCGTCTCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCAGGTTGGTGGTCGTCGCTTCAGGTTCGCGGAAGCCAGCGCGTGGGCAAGCGTCCTGGCCTCCAGGGACGAGCCAGGGTTCGCCGGGAAGGAGGACGGTGAGTTCATTCCCCATCGGATTTTCCAGCCATGGCGCTCGACCCCGCCGACGATCCGCTGCTCGCCGATTGCAAGTACAAGTTGAATCACTTTAGAATAAAAGAGCTAAAGGATGTCCTGCATCAGCTTGGACTTCCAAAGCAAGGAAGGAAACAGGAACTTGTGGACAAAATTATAGCAGTATTGTCTGATCAACAAGAACAAGACTCCAGATTGAATGGCTTGCCAAACAAAAAGATGGTTGGGAAAGAAACTGTGGCTAAAATAGTTGATGACACTTTTGCAAAAATGAATGGCTCCACAAATGCTGTTCCAGCCTCTAGAAATCAGACTGACTCGGGGCACATTGTAAAGCCTAAAAGGAAGTCAGATGATTCTGCTCAGTTGGATGTCAAAGTCCGTTGTCCCTGTGGTTATTCCATGGCCAATGATTCCATGATTAAGTGTGAAGGTCCACAATGCAATACACAGCAACATGTAGGCTGCGTTATCATATCTGAGAAGCCTGCAGACAGTGTTCCTCCAGAATTACCACCACACTTTTATTGTGATATGTGCCGAATCACTCGAGCTGACCCTTTCTGGGTTACTGTTAATCATCCTGTACTTCCAGTCTCAATAACTCCCTGTAAAGTAGCATCTGATGGGTCATATGCTGTACAGTATTTCGAGAAGACCTTTCCGCTATCAAGAGCTAATTGGGAGATGCTTCAGAAAGATGAATATGACCTCCAGGTTTGGTGTATCCTATTCAATGATAGCGTACCTTTCAGGATGCAGTGGCCTTTACATTCTGATATTCAAATTAATGGTATTCCTATTAGGGTTGTCAACAGGCAACCCACACAACAGTTAGGGGTGAATGGTAGAGACGATGGTCCAGTTTTAACAGCATATGTGAGAGAAGGGTCTAATAAGATTGTCCTATCTAGAAGTGACTCTCGCACATTCTGTTTGGGAGTCAGGATTGCCAAGAGGAGATCTGTAGAACAGGTCCTATCTTTGGTGCCAAAGGAACAAGATGGTGAGAACTTTGATAATGCCCTTGCTCGTGTGCGTCGCTGTGTTGGTGGTGGAACCGAGGCAGATAATGCTGACAGTGACAGTGATATTGAAGTTGTAGCTGATTCTGTCTCTGTGAATCTCCGATGCCCTATGACTGGTTCAAGGATCAAGATAGCTGGCCGGTTCAAACCCTGCGTTCACATGGGTTGTTTTGATTTAGAAGCTTTTGTGGAACTTAATCAACGTTCAAGAAAGTGGCAGTGCCCAATTTGCCTGAAAAACTACTCTTTGGACAACATAATCATTGATCCTTACTTCAACCGCATAACTGCTTTGGTCCAAAGTTGTGGAGATGATGTATCTGAAATTGATGTCAAGCCTGACGGTTCCTGGAGAGTCAAGGGTGGAGCAGAACTGAAGGGTCTTGCACAGTGGCATTTACCTGATGGCACTCTCTGTATGCCTACAGATACAAGGTCCAAGCCCAACATAAGAATTGTAAAGCAAGAGATTAAAGAAGAACCGTTGTCTGAAGAAACAGGTGGCCGTCTTAAGTTGGGAATCAGAAGAAACAACAATGGCCAGTGGGAAATTAACAAGAGATTGGATTCTAACAATGGTCAGAATGGATATATTGAAGATGAAAACTGTGTTGTTTCAGCAAGCAACACTGATGATGAGAACAGCAAAAATGGAATCTATAATCCAGAACCAGGGCAATTCGATCAACTAACCAGCAATATCTATGATCTTGATTCTTCTCCTATGGATGCACATTTTCCTCCAGCACCAACAGAGCAGGATGTAATAGTTCTGAGTGACTCAGATGATGATAATGTTATGGTGTTATCACCTGGTGATGTTAATTTCAGTTCAGCACATGACAATGGGAATGCATTCCCACCCAACCCACCTGAAGCTTCAGGAATTTGTGGGGAACAACCTAGAGGAGCCGGCCCAGATGTGACTTCATTTCTTGACGGTTTCGATGATCTGGAACTGCCATTTTGGGAATCTTCGAGCTCTCAAGATGCTGCAGGCACACAGGTGACAGACAATCAATGCGAAATGCAAAATTTCATTGTCAACCATCAATTTTTGCACGAGCCAATTTTAGGGGTTAACTTGGGTGGAACAGCAGCATCAAACACACTGGAATGTGAGCATGATGGTGCGTTACAAGCTTGTCAGTCGAGTGATCAAGATGGTGATCAGAATCAAACATGCCATGATGGGCACTCCGGGGATTTGACAAATCTTAGTATCATTAGCACTCAAGATAGTTTAACTAATGGCAAAAAT-GCTTCTCAGAAAAGGACA-AACTGTGAAGATGGCACGGCAGGTTTAGACGGCTCAGTTGTCAGGAGCGCGAATGGCTTGAGAGGAGAGATGCCACCACTTGGGCAGGAGCAGGATCGTACAGTTAGACAAAAGTTGATATTAACAATCGAGTCAGACTCTGATTAGCAGCTGATGCTATTTGATGTATGGTCCCTGCTATAGTGCTATGCCCCCCAGATGCATGCACCATCACCATCACTTATTTTTTGGCTGTGC----ACTAAGAAGGGCATCACTTCTTTTTTGGTTGTGCCCTAGTTGAGAAGGGATAGATGTTGGAGCTATGGTGGATGGATTGATGTTTGGCGGCAAGAAGCTGGGTCGGTTATCCTTGCTTCTACTAAGGTGGTATTGATTGATACAGTTAGGTAGGGTAGGTCCATTGTGTAGGCAGCAATTTTGTAGCTAGCTTGCATATACATCACAATGGAATTGCAGTGACAGAAGTTAGCTGATGTAAATATCATATGATGCTTTTCTGTTGCCTGGTGTACATATTATATGATGTTTTTTTTTTCTGTTGGTTGGTTACATATAGAG]

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[+] EMBL D43148               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGCTAAAATAGTTGATGACACTTTTGCAAAAATGAATGGCTCCACAAATGCTGTTCCAGCCTCTAGAAATCAGACTGACTCGGGGCACATTGTAAAGCCTAAAAGGAAGTCAGATGATTCTGCTCAGTTGGATGTCAAAGTCCGTTGTCCCTGTGGTTATTCCATGGCCAATGATTCCATGATTAAGTGTGAAGGTCCACAATGCAATACACAGCAACATGTAGGCTGCGTTATCATATCTGAGAAGCCTGCAGACAGTGTTCCTCCAGAATTACCACCACACTTTTATTGTGATATGTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CB680879             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGTCAACCCTTTATATTTGCACGAGCCAATTTTAGGGGTTAACTTGGGTGGAACAGCAGCATCAAACACACTGGAATGTGACCATGATGGTGCGTTACAAGCTTGTCAGTCGAGTGATCAAGATGGTGATCAGAATCAAACATGCCATGATGGGCACTCCGGGGATTTGACAAATCTTAGTATCATTAGCACTCAAGATAGTTTAACTAATGGCAAAAAT GCTTCTCAGAAAAGGACA AACTGTGAAGATGGCACGGCAGGTTTACACGGCTCAATTGTCAGGAGCGCCAATGGCTTGATAGGAGAGATGCCACCACTTGGGCAGGAGCAGGATCGTACAGTTATACAAAAGTTGATATTAACAATCCAGTCAGACTCTGATTACCATCTGATGCTATTTGATGTATGGTCCCTGCTATAGTGCTATGCCCCCCAGATGCATGCACCATCACCATCACTTATTTTTTGGCTGTGC    ACTAAGAAGGGCATCACTTCTTTTTTGGTTGTGCCCTATTTGAGAAGGGATAGATGTTGGAGCTATGGTGGATGGATTGATGTTTGGCGGCAAGAAGCTGGGTCCGTTATCCTTGCTTCTACTAAGGTGGTATTGATTGATACAGCTAGGTAGGGTAGGTCCATTGTGTAGGCAGCAATTTTGTAGCTAGCTTGCCTATACATCACAATGGAATTGCAGTGACAGAAGTTAGCTGATGCACATATCATA                                                                        ]
[+] EMBL CB680769             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                nnAATTTTAGGGGTTAACTTGGGTGGAACAGCAGCATCAAACACACTGGAATGCCCGCATGATGGTGCGTTACAAGCTTGTCAGTCGAGTGATCAAGATGGTGATCAGAATCAAACATGCCATGATGGGCACTCCGGGGATTTGACAAATCTTAGTATCATTAGCACTCAAGATAGTTTAACTAATGGCAAAAAT GCTTCTCAGAAAAGGACA AACTGTGAAGATGGCACGGCAGGTTTAGACGGCTCAGTTGTCAGGAGCGCGAATGGCTTGAGAGGAGAGATGCCACCACTTGGGCAGGAGCAGGATCGTACAGTTAGACAAAAGTTGATATTAACAATCGAGTCAGACTCTGATTAGCAGCTGATGCTATTTGATGTATGGTCCCTGCTATAGTGCTATGCCCCCCAGATGCATGCACCATCACCATCACTTATTTTTTGGCTGTGC    ACTAAGAAGGGCATCACTTCTTTTTTGGTTGTGCCCTAGTTGAGAAGGGATAGATGTTGGAGCTATGGTGGATGGATTGATGTTTGGCGGCAAGAAGCTGGGTCGGTTATCCTTGCTTCTACTAAGGTGGTATTGATTGATACAGCTACGTAGGGTAGGTCCATTGTGTAGGCAGCAATTTTGTAGCTAGCTTGCATATACATCACAATGGAATTGCAGTGACAGAAGTCAGCTGATGCAAATATCATATG                                                                      ]
[+] EMBL BM421001             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTTTAACTAATGGCCAAAATGGCTTCTCAGAAAAGGACACAACTGTGAAGATGGCACGGCAGGTTTAGACGGCTCAGTTGTCAGGAGCGCGAATGGCTTGAGAGGAGAGATGCCACCACTTGGGCAGGAGCAGGATCGTACAGTTAGACAAAAGTTGATACTAACAATCGAGTCAGACTCTGATTAGCAGCTGATGCTATTTGATGTATGGTCCCTGCTATAGTGCTATGCCCCCCAGATGCATG      CACCATCACTTATTTTTTGGCTGTGCACTAACTAAGAAGGGCATCACTTCTTTTTTGGTTGTGCCCTAGTTGAGAAGGGATAGATGTTGGAGCTATGGTGGATGGATTGATGTTTGGCGGCAAGAAGCTGGGTCGGTTATCCTTGCTTCTACTAAGGTGGTATTGATTGATACAGTTAGGTAGGGTAGGTCCATTGTGTAGGCAGCAATTTTGTAGCTAGCTTGCATATACATCACAATGGAATTGCAGTGACAGAAGTTAGCTGATGTAAATATCATATGATGCTTTTCTGTTaaaaaaaa                                                 ]




>consensus_8620#0
CGCCCCCCTGGCTGGCTCTGCCTCTGGCTCCGGTTCTTGCCGCTCGCGATCCCCAAAGCG
CGGCAATCCGCCGCACGCGCGCGCGCGCGCTCGCACTCCCTCCGCCCCGCCGCGCCGTCC
CTCCTGACGCGGCGTCTCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCAGGTTGGTGGTCGTCGCTTCA
GGTTCGCGGAAGCCAGCGCGTGGGCAAGCGTCCTGGCCTCCAGGGACGAGCCAGGGTTCG
CCGGGAAGGAGGACGGTGAGTTCATTCCCCATCGGATTTTCCAGCCATGGCGCTCGACCC
CGCCGACGATCCGCTGCTCGCCGATTGCAAGTACAAGTTGAATCACTTTAGAATAAAAGA
GCTAAAGGATGTCCTGCATCAGCTTGGACTTCCAAAGCAAGGAAGGAAACAGGAACTTGT
GGACAAAATTATAGCAGTATTGTCTGATCAACAAGAACAAGACTCCAGATTGAATGGCTT
GCCAAACAAAAAGATGGTTGGGAAAGAAACTGTGGCTAAAATAGTTGATGACACTTTTGC
AAAAATGAATGGCTCCACAAATGCTGTTCCAGCCTCTAGAAATCAGACTGACTCGGGGCA
CATTGTAAAGCCTAAAAGGAAGTCAGATGATTCTGCTCAGTTGGATGTCAAAGTCCGTTG
TCCCTGTGGTTATTCCATGGCCAATGATTCCATGATTAAGTGTGAAGGTCCACAATGCAA
TACACAGCAACATGTAGGCTGCGTTATCATATCTGAGAAGCCTGCAGACAGTGTTCCTCC
AGAATTACCACCACACTTTTATTGTGATATGTGCCGAATCACTCGAGCTGACCCTTTCTG
GGTTACTGTTAATCATCCTGTACTTCCAGTCTCAATAACTCCCTGTAAAGTAGCATCTGA
TGGGTCATATGCTGTACAGTATTTCGAGAAGACCTTTCCGCTATCAAGAGCTAATTGGGA
GATGCTTCAGAAAGATGAATATGACCTCCAGGTTTGGTGTATCCTATTCAATGATAGCGT
ACCTTTCAGGATGCAGTGGCCTTTACATTCTGATATTCAAATTAATGGTATTCCTATTAG
GGTTGTCAACAGGCAACCCACACAACAGTTAGGGGTGAATGGTAGAGACGATGGTCCAGT
TTTAACAGCATATGTGAGAGAAGGGTCTAATAAGATTGTCCTATCTAGAAGTGACTCTCG
CACATTCTGTTTGGGAGTCAGGATTGCCAAGAGGAGATCTGTAGAACAGGTCCTATCTTT
GGTGCCAAAGGAACAAGATGGTGAGAACTTTGATAATGCCCTTGCTCGTGTGCGTCGCTG
TGTTGGTGGTGGAACCGAGGCAGATAATGCTGACAGTGACAGTGATATTGAAGTTGTAGC
TGATTCTGTCTCTGTGAATCTCCGATGCCCTATGACTGGTTCAAGGATCAAGATAGCTGG
CCGGTTCAAACCCTGCGTTCACATGGGTTGTTTTGATTTAGAAGCTTTTGTGGAACTTAA
TCAACGTTCAAGAAAGTGGCAGTGCCCAATTTGCCTGAAAAACTACTCTTTGGACAACAT
AATCATTGATCCTTACTTCAACCGCATAACTGCTTTGGTCCAAAGTTGTGGAGATGATGT
ATCTGAAATTGATGTCAAGCCTGACGGTTCCTGGAGAGTCAAGGGTGGAGCAGAACTGAA
GGGTCTTGCACAGTGGCATTTACCTGATGGCACTCTCTGTATGCCTACAGATACAAGGTC
CAAGCCCAACATAAGAATTGTAAAGCAAGAGATTAAAGAAGAACCGTTGTCTGAAGAAAC
AGGTGGCCGTCTTAAGTTGGGAATCAGAAGAAACAACAATGGCCAGTGGGAAATTAACAA
GAGATTGGATTCTAACAATGGTCAGAATGGATATATTGAAGATGAAAACTGTGTTGTTTC
AGCAAGCAACACTGATGATGAGAACAGCAAAAATGGAATCTATAATCCAGAACCAGGGCA
ATTCGATCAACTAACCAGCAATATCTATGATCTTGATTCTTCTCCTATGGATGCACATTT
TCCTCCAGCACCAACAGAGCAGGATGTAATAGTTCTGAGTGACTCAGATGATGATAATGT
TATGGTGTTATCACCTGGTGATGTTAATTTCAGTTCAGCACATGACAATGGGAATGCATT
CCCACCCAACCCACCTGAAGCTTCAGGAATTTGTGGGGAACAACCTAGAGGAGCCGGCCC
AGATGTGACTTCATTTCTTGACGGTTTCGATGATCTGGAACTGCCATTTTGGGAATCTTC
GAGCTCTCAAGATGCTGCAGGCACACAGGTGACAGACAATCAATGCGAAATGCAAAATTT
CATTGTCAACCATCAATTTTTGCACGAGCCAATTTTAGGGGTTAACTTGGGTGGAACAGC
AGCATCAAACACACTGGAATGTGAGCATGATGGTGCGTTACAAGCTTGTCAGTCGAGTGA
TCAAGATGGTGATCAGAATCAAACATGCCATGATGGGCACTCCGGGGATTTGACAAATCT
TAGTATCATTAGCACTCAAGATAGTTTAACTAATGGCAAAAATGCTTCTCAGAAAAGGAC
AAACTGTGAAGATGGCACGGCAGGTTTAGACGGCTCAGTTGTCAGGAGCGCGAATGGCTT
GAGAGGAGAGATGCCACCACTTGGGCAGGAGCAGGATCGTACAGTTAGACAAAAGTTGAT
ATTAACAATCGAGTCAGACTCTGATTAGCAGCTGATGCTATTTGATGTATGGTCCCTGCT
ATAGTGCTATGCCCCCCAGATGCATGCACCATCACCATCACTTATTTTTTGGCTGTGCAC
TAAGAAGGGCATCACTTCTTTTTTGGTTGTGCCCTAGTTGAGAAGGGATAGATGTTGGAG
CTATGGTGGATGGATTGATGTTTGGCGGCAAGAAGCTGGGTCGGTTATCCTTGCTTCTAC
TAAGGTGGTATTGATTGATACAGTTAGGTAGGGTAGGTCCATTGTGTAGGCAGCAATTTT
GTAGCTAGCTTGCATATACATCACAATGGAATTGCAGTGACAGAAGTTAGCTGATGTAAA
TATCATATGATGCTTTTCTGTTGCCTGGTGTACATATTATATGATGTTTTTTTTTTCTGT
TGGTTGGTTACATATAGAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)