cluster # 8644

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Oryza sativa
cluster # 8644 cluster # 8644 Sequences # 5 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8644#0 length = 3104 sequences # 5
consensusID : consensus_8644#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
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fasta sequence
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[+] EMBL CF305091             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAGGGTTAAGAAGTGATCTTTTCTGGACACAACTAGGCCTTTCTTCTGAGTCCTTTGGGCCTAATGGCCAGATTGGTGGTGATTTGAACTCGACATGCCCTCCTCCACCACTGTTTCCCCGTTACCCACTTCAGTCTCTCCGAGCTGATAAAAGCAGTATCAAGGGTGGTTGCTCTTACCCTCCGTGCATCTGCAAAAGTAGCACATCTAAGCCTGAGAATCTCTCCCATTACCCAGTTCAGTCCCTCCAAGCTGACAGAAGCCTAAAGGGTGGTCACTATTTCCCTCCATGCACCTGCAAAAGTAACACATCCAAGCCAGATAATCTCTCACCAGTCGGTCTTTATGGACCTTATTCTGAAGGCAGCAGCTGTAATAGGTGCCCATACAGGGATCTAAGTGATAAGCACGAGAGCATGGCGCAGCACACACTGCATAGATGGATACAGTGCGATGGCTGTGGGGTCACTCCTATCGCTGGTTCTCGCTACAAGTCAAATATTAAAGATGATTATGATTTATGCAATACCTGTTTTTCTCGAATGGGCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CF304117             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAGGGTTAAGAAGTGATCTTTTCTGGACACAACTAGGCCTTTCTTCTGAGTCCTTTGGGCCTAATGGCCAGATTGGTGGTGATTTGAACTCGACATGCCCTCCTCCACCACTGTTTCCCCGTTACCCACTTCAGTCTCTCCGAGCTGATAAAAGCAGTATCAAGGGTGGTTGCTCTTACCCTCCGTGCATCTGCAAAAGTAGCACATCTAAGCCTGAGAATCTCTCCCATTACCCAGTTCAGTCCCTCCAAGCTGACAGAAGCCTAAAGGGTGGTCACTATTTCCCTCCATGCACCTGCAAAAGTAACACATCCAAGCCAGATAATCTCTCACCAGTCGGTCTTTATGGACCTTATTCTGAAGGCAGCAGCTGTAATAGGTGCCCATACAGGGATCTAAGTGATAAGCACGAGAGCATGGCGCAGCACACACTGCATAGATGGATACAGTGCGATGGCTGTGGGGTCACTCCTATCGCTGGTTCTCGCTACAAGTCAAATATTAAAGATGATTATGATTTATGCAATACCTGTTTTTCTCGAATGGGCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CF306212             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGCACCCGGTCAAAACCAGTAGCAACAAGCAGAGTGCTGCTATAAACTTGAACATGCCCCCAGAAGGAAGCAACACAGAATGGAAGCATTCTGTTGATGCAAATATTCAGTCTGCAGATATTGTGGGTAAATACTCTGGAAGCACCATAACTGATCCTCTTGCACATGCACTATACCATGAAGCCACCAAACCGATGGAACCTGAGCTTGTTTCAAGTGCCGTACCTTCTGTACCTAGAGCATTTGAATCAGTGCTAGTGCCAGCTACTGATCTCCTCACTTCATCTGCTGGAGCTGAAAAGGCTTCGAAGCCTGCTGCCACGCCTGGACCTGCACCTCAAGCCGTTCCCCTGCCAAAACCTGTTAGCATTCCTGCATCTGGACCTGCGCCTGCTCCTGTTAGTGCGACTACCGCTGCACCTGTCGGAGCTGCTGCTGCTCCTATCAGTGAGCCCACTGCACCTGCTGCTGCCATTGGAATGCCCTCTGCAACTGCTCGCGCTGCTTCTTGCCTGCCTACCGAGCCTTCATCTGATCACATCAGTGCCGTGGAGGACAACATGCTGAGAGAGCTGGGGCAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CF305870             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGGAGCTGAAAAGGCTTCGAAGCCTGCTGCCACGCCTGGACCTGCACCTCAAGCCGTTCCCCTGCCAAAACCTGTTAGCATTCCTGCATCTGGACCTGCGCCTGCTCCTGTTAGTGCGACTACCGCTGCACCTGTCGGAGCTGCTGCTGCTCCTATCAGTGAGCCCACTGCACCTGCTGCTGCCATTGGAATGCCCTCTGCAACTGCTCGCGCTGCTTCTTGCCTGCCTACCGAGCCTTCATCTGATCACATCAGTGCCGTGGAGGACAACATGCTGAGAGAGCTGGGGCAGATGGGCTTCGGGCAAGTCGACCTGAACAAGGAAATAATTAGGCGGAACGAGTACAACCTGGAGCAGTCCATTGATGAACTCTGTGGCATCCTCGAATGGGATGCACTCCATGATGAACTGCACGAACTGGGCATCTGATCAGAACGGAGATGAACAAGGCGCTCACCAAGGACGGCGAGGAAGCATGTGGCCGTGAATCTTTTTTGCCCCTCCTAGAAAGGCCAGTGATGACCTCGTCGTGTTCAGCTATTGAGCACCTTGCAGTATCCAAGATATAGACCGTAGTATATTTATAAATAGCTTACCTAGTTAAAAGCGG                                                                                                                                                          ]




>consensus_8644#0
CGGAATTTGCTTACGGATTAAAAGGGAGGTCTTGACTCAACCCGTCTCCTTCTCCTCCTC
CCCTCCGCCTCGTCGTCTTCGTCTCACGCCACCATCGCCATCGCGGGGCTTCGTTTGGTC
GGGATGTCTCGCCGCCGGGACGCTGCGCCGACGGCGCGCGAGGGCGAGAGGGATCTCGTC
GTGAAGGTAAAATTCGATGGCACTCTTAAGCGGTTCACTGCTTTTGTGAATGGTCCGCAC
TTTGATCTTAATCTGGCTGCTCTTCGGTCAAAGATTGCGAGTGCTTTTAAGTTCAATCCA
GATACTGAGTTTGTACTCACCTATACTGATGAGGATGGGGATGTTGTCATACTGGATGAT
GATAGTGATTTATGTGATGCTGCCATTAGTCAGAGACTGAACCCTCTTAGGATTAATGTT
GAGTTGAAGAGCAGCAGTGATGGGGTACATCAGACAAAACAGCAGGTGTTGGATTCCATA
TCTGTAATGTCCACTGCTCTGGAAGATCAATTGGCTCAGGTGAAATTAGCTATCGATGAA
GCTTTAAAATTTGTACCAGAACAAGTTCCCACTGTCCTTGCAAAAATATCACATGACTTG
CGTTCTAAAGCTGCATCATCAGCGCCATCATTGGCTGATTTGCTGGACCGGCTTGCTAAA
CTGATGGCACCAAAGAGCAAAATGCAGTCTTCCAGTGGTTCTGCTGATGGTTCATCTGGC
TCCTCTAGTGGTAGGGGACAAACTTTGGGAAGTTTGAATATTAAAAATGACACTGAGCTC
ATGGCTGTTTCAGCTTCGAACCCTCTGGATATGCATAACTCTGGATCAACTAAATCACTT
GGTCTTAAGGGTGTGCTTCTTGATGACATCAAAGCTCAAGCTGAACATGTATCGGGATAT
CCTTATTATGTGGATACCCTTTCAGGCTAGGTAAAAGTTGGTAACAAGGGAAGTACCAAT
GCCCAAAGTAAGGGCAAGTCTGTTACATCCTCTGCTGTGCCACAAGTTACTAGCATTGGT
CATGGTGCACCTACTGTTCATTCTGCTCCTGCTTCAGATTGCGGTGAAGGGTTAAGAAGT
GATCTTTTCTGGACACAACTAGGCCTTTCTTCTGAGTCCTTTGGGCCTAATGGCCAGATT
GGTGGTGATTTGAACTCGACATGCCCTCCTCCACCACTGTTTCCCCGTTACCCACTTCAG
TCTCTCCGAGCTGATAAAAGCAGTATCAAGGGTGGTTGCTCTTACCCTCCGTGCATCTGC
AAAAGTAGCACATCTAAGCCTGAGAATCTCTCCCATTACCCAGTTCAGTCCCTCCAAGCT
GACAGAAGCCTAAAGGGTGGTCACTATTTCCCTCCATGCACCTGCAAAAGTAACACATCC
AAGCCAGATAATCTCTCACCAGTCGGTCTTTATGGACCTTATTCTGAAGGCAGCAGCTGT
AATAGGTGCCCATACAGGGATCTAAGTGATAAGCACGAGAGCATGGCGCAGCACACACTG
CATAGATGGATACAGTGCGATGGCTGTGGGGTCACTCCTATCGCTGGTTCTCGCTACAAG
TCAAATATTAAAGATGATTATGATTTATGCAATACCTGTTTTTCTCGAATGGGCAATGTG
AATGAATATACCAGAATAGACAGACCATCTTTTGGGAGTAGACGATGTAGAGACCTCAAT
CAGAACCAGATGCTCTTTCCACATCTTCGACAGCTACATGATTGCCGCTTCATTAAGGAT
GTTACTGTCCCTGATGGAACAGTAATGGCACCATCAACCCCATTTACAAAGATTTGGCGC
ATACATAACAATGGATCTTCCATGTGGCCATATGGGACATGTCTTACCTGGGTTGGTGGA
CATCTATTTGCACGCAACAGCTCAGTTAAATTAGGGATCTCGGTGGATGGTTTCCCTATT
GATCAAGAGATCGATGTTGGTGTTGATTTTGTCACACCTGCAAAGCCTGGTGGGTACGTG
TCGTACTGGAGATTGGCATCACCCACTGGCCAGATGTTTGGTCAGCGAGTTTGGGTTTTT
ATTCAGGTGGAGCACCCGGTCAAAACCAGTAGCAACAAGCAGAGTGCTGCTATAAACTTG
AACATGCCCCCAGAAGGAAGCAACACAGAATGGAAGCATTCTGTTGATGCAAATATTCAG
TCTGCAGATATTGTGGGTAAATACTCTGGAAGCACCATAACTGATCCTCTTGCACATGCA
CTATACCATGAAGCCACCAAACGGATGGAACCTGAGCTTGTTTCAAGTGCCGTACCTTCT
GTACCTAGAGCATTTGAATCAGTGCTAGTGCCAGCTACTGATCTCCTCACTTCATCTGCT
GGAGCTGAAAAGGCTTCGAAGCCTGCTGCCACGCCTGGACCTGCACCTCAAGCCGTTCCC
CTGCCAAAACCTGTTAGCATTCCTGCATCTGGACCTGCGCCTGCTCCTGTTAGTGCGACT
ACCGCTGCACCTGTCGGAGCTGCTGCTGCTCCTATCAGTGAGCCCACTGCACCTGCTGCT
GCCATTGGAATGCCCTCTGCAACTGCTCGCGCTGCTTCTTGCCTGCCTACCGAGCCTTCA
TCTGATCACATCAGTGCCGTGGAGGACAACATGCTGAGAGAGCTGGGGCAGATGGGCTTC
GGGCAAGTCGACCTGAACAAGGAAATAATTAGGCGGAACGAGTACAACCTGGAGCAGTCC
ATTGATGAACTCTGTGGCATCCTCGAATGGGATGCACTCCATGATGAACTGCACGAACTG
GGCATCTGATCAGAACGGAGATGAACAAGGCGCTCACCAAGGACGGCGAGGAAGCATGTG
GCCGTGAATCTTTTTTGCCCCTCCTAGAAGGGCCAGTGATGACCTCGTCGTGTTCAGCTA
TTGAGCACCTTGCAGTATCCAAGATATAGACCGTAGTATATTTATAAATAGCTTACCTAG
TTAAAAGCGGCGTTCGTGCTGCTGTGCTACCCCTACTCGCCAGCAACCTTAGAGGGTCTG
GTGTAGTGCCAGTAGTGGTGTTTAAAGACTTCTAATCATCGGTGTGTAATCGAAATAAGT
ACCGTACCTACTAGTTGTTTATTATGCTATATGATGTATTAAAC
clustalw multiple alignements is not computed in this case