These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8733#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 623 fasta sequence [GAAAATAATGATTGCTGGGTTACTTGCTGACCGAGAATTCGTTGGCGATAATTGGTTTGCATGGTTACTGACAGAAAAAATACCGTTCTGTATCCGAATTAAAAACAATGTAATTACTACCAATGCTCGTGGATTTAATTTTGAGGATACACGGATGACTCAACCTGAGCGCATTGAAAAATTACTGGTATTATTGAGCATTGCCTTTTGTTTAGCTCATAAAACGGGAGAGTGGCGACATTTACAGAAGGCCATCAAAATCAAAAAGCATGGGCGAAAAGCTATCAGCTATTTTCGTTATGGCCTTGATTTATTACGCGATACGGCTCTGAATG-GAGGTCGGTGTATTCGCCATGGTTTAACCGATATACTTAGTTTCTTGAGTATTACTCCAACGACATACTCAGTGACATGAAATAGTCCAACAATAAGGAAGAAAGATGCCAGTTAAACAGCCCGCCATTTATATCATGGTGAATAGACGTAATGGAACAATT-TACACCGGTGTCACCAGCGATTTAATCAAACGAGTATATGAACATAAATATGCGGATGTCCCTGNGTTTACGCAAAAACATGGCTGTAAACATCTTGTCTATTATGAGCTTATAGAAGACATCATC] [+] EMBL CF339125 [GAAAATAATGATTGCTGGGTTACTTGCTGACCGAGAATTCGTTGGCGATAATTGGTTTGCATGGTTACTGACAGAAAAAATACCGTTCTGTATCCGAATTAAAAACAATGTAATTACTACCAATGCTCGTGGATTTAATTTTGAGGATACACGGATGACTCAACCTGAGCGCATTGAAAAATTACTGGTATTATTGAGCATTGCCTTTTGTTTAGCTCATAAAACGGGAGAGTGGCGACATTTACAGAAGGCCATCAAAATCAAAAAGCATGGGCGAAAAGCTATCAGCTATTTTCGTTATGGCCTTGATTTATTACGCGATACGGCTCTGAATG GAGGTCGGTGTATTCGCCATGGTTTAACCGATATACTTAGTTTCTTGAGTATTACTCCAACGACATACTCAGTGACATGAAATAGTCCAACAATAAGGAAGAAAGATGCCAGTTAAACAGCCCGCCATTTATATCATGGTGAATAGACGTAATGGAACAATT TACACCGGTGTCACCAGCGATTTAATCAAACGAGTA ] [+] EMBL CF339037 [ AAAATAATGATTGCTGGGTTACTTGCTGACCGAGAATTCGTTGGCGATAATTGGTTTGCATGGTTACTGACAGAAAAAATACCGTTCTGTATCCGAATTAAAAACAATGTAATTACTACCAATGCTCGTGGATTTAATTTTGAGGATACACGGATGACTCAACCTGAGCGCATTGAAAAATTACTGGTATTATTGAGCATTGCCTTTTGTTTAGCTCATAAAACGGGAGAGTGGCGACATTTACAGAAGGCCATCAAAATCAAAAAGCATGGGCGAAAAGCTATCAGCTATTTTCGTTATGGCCTTGATTTATTACGCGATACGGCTCTGAATG GAGGTCGGTGTATTCGCCATGGTTTAACCGATATACTTAGTTTCTTGAGTATTACTCCAACGACATACTCAGTGACATGAAATAGTCCAACAATAAGGAAGAAAGATGCCAGTTAAACAGCCCGCCATTTATATCATGGTGAATAGACGTAATGGAACAATT TACACCGGTGTCACCAGCGATTTAATCAAACGAGTATATGAACATAAATATGCGGATGTCCCTGNGTTTACGCAAAAACATGGCTGTAAACATCTTGTCTATTATGAGCTTATAGAAGACATCATC] [+] EMBL CF340259 [ TAATGATTGCTGGGTTACTTGCTGACCGAGAATTCGTTGGCGATAATTGGTTTGCATGGTTACTGACAGAAAAAATACCGTTCTGTATCCGAATTAAAAACAATGTAATTACTACCAATGCTCGTGGATTTAATTTTGAGGATACACGGATGACTCAACCTGAGCGCATTGAAAAATTACTGGTATTATTGAGCATTGCCTTTTGTTTAGCTCATAAAACGGGAGAGTGGCGACATTTACAGAAGGCCATCAAAATCAAAAAGCATGGGCGAAAAGCTATCAGCTATTTTCGTTATGGCCTTGATTTATTACGCGATACGGCTCTGAATGNGAGGTCGGTGTATTCGCCATGGTTTAACCGATATACTTAGTTTCTTGAGTATTACTCCAACGACATACTCAGTGACATGAAATAGTCCAACAATAAGGAAGAAAGATGCCAGTTAAACAGCCCGCCATTTATATCATGGTGAATAGACGTAATGGAACAATT TACACCGGTGTCACCAGCGATTTAATCAAACGAGTATATG ] [+] EMBL CF338819 [ TAATGATTGCTGGGTTACTTGCTGACCGAGAATTCGTTGGCGATAATTGGTTTGCATGGTTACTGACAGAAAAAATACCGTTCTGTATCCGAATTAAAAACAATGTAATTACTACCAATGCTCGTGGATTTAATTTTGAGGATACACGGATGACTCAACCTGAGCGCATTGAAAAATTACTGGTATTATTGAGCATTGCCTTTTGTTTAGCTCATAAAACGGGAGAGTGGCGACATTTACAGAAGGCCATCAAAATCAAAAAGCATGGGCGAAAAGCTATCAGCTATTTTCGTTATGGCCTTGATTTATTACGCGATACGGCTCTGAATG GAGGTCGGTGTATTCGCCATGGTTTAACCGATATACTTAGTTTCTTGAGTATTACTCCAACGACATACTCAGTGACATGAAATAGTCCAACAATAAGGAAGAAAGATGCCAGTTAAACAGCCCGCCATTTATATCATGGTGAATAGACGTAATGGAACAATTNTACACCGGTGTCACCAGCGATTTAATCAAACGAGTATATG ] [+] EMBL CF340455 [ TAATGATTGCTGGGTTACTTGCTGACCGAGAATTCGTTGGCGATAATTGGTTTGCATGGTTACTGACAGAAAAAATACCGTTCTGTATCCGAATTAAAAACAATGTAATTACTACCAATGCTCGTGGATTTAATTTTGAGGATACACGGATGACTCAACCTGAGCGCATTGAAAAATTACTGGTATTATTGAGCATTGCCTTTTGTTTAGCTCATAAAACGGGAGAGTGGCGACATTTACAGAAGGCCATCAAAATCAAAAAGCATGGGCGAAAAGCTATCAGCTATTTTCGTTATGGCCTTGATTTATTACGCGATACGGCTCTGAATG GAGGTCGGTGTATTCGCCATGGTTTAACCGATATACTTAGTTTCTTGAGTATTACTCCAACGACATACTCAGTGACATGAAATAGTCCAACAATAAGGAAGAAAGATGCCAGTTAAACAGCCCGCCATTTATATCATGGTGAATAGACGTAATGGAACAATT TACACCGGTGTCACCAGCGATTTAATCAAACGAGT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||