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Oryza sativa
cluster # 8733 cluster # 8733       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8733#0 length = 623 sequences # 5  

consensusID : consensus_8733#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 623
fasta sequence
                              [GAAAATAATGATTGCTGGGTTACTTGCTGACCGAGAATTCGTTGGCGATAATTGGTTTGCATGGTTACTGACAGAAAAAATACCGTTCTGTATCCGAATTAAAAACAATGTAATTACTACCAATGCTCGTGGATTTAATTTTGAGGATACACGGATGACTCAACCTGAGCGCATTGAAAAATTACTGGTATTATTGAGCATTGCCTTTTGTTTAGCTCATAAAACGGGAGAGTGGCGACATTTACAGAAGGCCATCAAAATCAAAAAGCATGGGCGAAAAGCTATCAGCTATTTTCGTTATGGCCTTGATTTATTACGCGATACGGCTCTGAATG-GAGGTCGGTGTATTCGCCATGGTTTAACCGATATACTTAGTTTCTTGAGTATTACTCCAACGACATACTCAGTGACATGAAATAGTCCAACAATAAGGAAGAAAGATGCCAGTTAAACAGCCCGCCATTTATATCATGGTGAATAGACGTAATGGAACAATT-TACACCGGTGTCACCAGCGATTTAATCAAACGAGTATATGAACATAAATATGCGGATGTCCCTGNGTTTACGCAAAAACATGGCTGTAAACATCTTGTCTATTATGAGCTTATAGAAGACATCATC]

[+] EMBL CF339125             [GAAAATAATGATTGCTGGGTTACTTGCTGACCGAGAATTCGTTGGCGATAATTGGTTTGCATGGTTACTGACAGAAAAAATACCGTTCTGTATCCGAATTAAAAACAATGTAATTACTACCAATGCTCGTGGATTTAATTTTGAGGATACACGGATGACTCAACCTGAGCGCATTGAAAAATTACTGGTATTATTGAGCATTGCCTTTTGTTTAGCTCATAAAACGGGAGAGTGGCGACATTTACAGAAGGCCATCAAAATCAAAAAGCATGGGCGAAAAGCTATCAGCTATTTTCGTTATGGCCTTGATTTATTACGCGATACGGCTCTGAATG GAGGTCGGTGTATTCGCCATGGTTTAACCGATATACTTAGTTTCTTGAGTATTACTCCAACGACATACTCAGTGACATGAAATAGTCCAACAATAAGGAAGAAAGATGCCAGTTAAACAGCCCGCCATTTATATCATGGTGAATAGACGTAATGGAACAATT TACACCGGTGTCACCAGCGATTTAATCAAACGAGTA                                                                                          ]
[+] EMBL CF339037             [ AAAATAATGATTGCTGGGTTACTTGCTGACCGAGAATTCGTTGGCGATAATTGGTTTGCATGGTTACTGACAGAAAAAATACCGTTCTGTATCCGAATTAAAAACAATGTAATTACTACCAATGCTCGTGGATTTAATTTTGAGGATACACGGATGACTCAACCTGAGCGCATTGAAAAATTACTGGTATTATTGAGCATTGCCTTTTGTTTAGCTCATAAAACGGGAGAGTGGCGACATTTACAGAAGGCCATCAAAATCAAAAAGCATGGGCGAAAAGCTATCAGCTATTTTCGTTATGGCCTTGATTTATTACGCGATACGGCTCTGAATG GAGGTCGGTGTATTCGCCATGGTTTAACCGATATACTTAGTTTCTTGAGTATTACTCCAACGACATACTCAGTGACATGAAATAGTCCAACAATAAGGAAGAAAGATGCCAGTTAAACAGCCCGCCATTTATATCATGGTGAATAGACGTAATGGAACAATT TACACCGGTGTCACCAGCGATTTAATCAAACGAGTATATGAACATAAATATGCGGATGTCCCTGNGTTTACGCAAAAACATGGCTGTAAACATCTTGTCTATTATGAGCTTATAGAAGACATCATC]
[+] EMBL CF340259             [     TAATGATTGCTGGGTTACTTGCTGACCGAGAATTCGTTGGCGATAATTGGTTTGCATGGTTACTGACAGAAAAAATACCGTTCTGTATCCGAATTAAAAACAATGTAATTACTACCAATGCTCGTGGATTTAATTTTGAGGATACACGGATGACTCAACCTGAGCGCATTGAAAAATTACTGGTATTATTGAGCATTGCCTTTTGTTTAGCTCATAAAACGGGAGAGTGGCGACATTTACAGAAGGCCATCAAAATCAAAAAGCATGGGCGAAAAGCTATCAGCTATTTTCGTTATGGCCTTGATTTATTACGCGATACGGCTCTGAATGNGAGGTCGGTGTATTCGCCATGGTTTAACCGATATACTTAGTTTCTTGAGTATTACTCCAACGACATACTCAGTGACATGAAATAGTCCAACAATAAGGAAGAAAGATGCCAGTTAAACAGCCCGCCATTTATATCATGGTGAATAGACGTAATGGAACAATT TACACCGGTGTCACCAGCGATTTAATCAAACGAGTATATG                                                                                      ]
[+] EMBL CF338819             [     TAATGATTGCTGGGTTACTTGCTGACCGAGAATTCGTTGGCGATAATTGGTTTGCATGGTTACTGACAGAAAAAATACCGTTCTGTATCCGAATTAAAAACAATGTAATTACTACCAATGCTCGTGGATTTAATTTTGAGGATACACGGATGACTCAACCTGAGCGCATTGAAAAATTACTGGTATTATTGAGCATTGCCTTTTGTTTAGCTCATAAAACGGGAGAGTGGCGACATTTACAGAAGGCCATCAAAATCAAAAAGCATGGGCGAAAAGCTATCAGCTATTTTCGTTATGGCCTTGATTTATTACGCGATACGGCTCTGAATG GAGGTCGGTGTATTCGCCATGGTTTAACCGATATACTTAGTTTCTTGAGTATTACTCCAACGACATACTCAGTGACATGAAATAGTCCAACAATAAGGAAGAAAGATGCCAGTTAAACAGCCCGCCATTTATATCATGGTGAATAGACGTAATGGAACAATTNTACACCGGTGTCACCAGCGATTTAATCAAACGAGTATATG                                                                                      ]
[+] EMBL CF340455             [     TAATGATTGCTGGGTTACTTGCTGACCGAGAATTCGTTGGCGATAATTGGTTTGCATGGTTACTGACAGAAAAAATACCGTTCTGTATCCGAATTAAAAACAATGTAATTACTACCAATGCTCGTGGATTTAATTTTGAGGATACACGGATGACTCAACCTGAGCGCATTGAAAAATTACTGGTATTATTGAGCATTGCCTTTTGTTTAGCTCATAAAACGGGAGAGTGGCGACATTTACAGAAGGCCATCAAAATCAAAAAGCATGGGCGAAAAGCTATCAGCTATTTTCGTTATGGCCTTGATTTATTACGCGATACGGCTCTGAATG GAGGTCGGTGTATTCGCCATGGTTTAACCGATATACTTAGTTTCTTGAGTATTACTCCAACGACATACTCAGTGACATGAAATAGTCCAACAATAAGGAAGAAAGATGCCAGTTAAACAGCCCGCCATTTATATCATGGTGAATAGACGTAATGGAACAATT TACACCGGTGTCACCAGCGATTTAATCAAACGAGT                                                                                           ]


>consensus_8733#0 GAAAATAATGATTGCTGGGTTACTTGCTGACCGAGAATTCGTTGGCGATAATTGGTTTGC ATGGTTACTGACAGAAAAAATACCGTTCTGTATCCGAATTAAAAACAATGTAATTACTAC CAATGCTCGTGGATTTAATTTTGAGGATACACGGATGACTCAACCTGAGCGCATTGAAAA ATTACTGGTATTATTGAGCATTGCCTTTTGTTTAGCTCATAAAACGGGAGAGTGGCGACA TTTACAGAAGGCCATCAAAATCAAAAAGCATGGGCGAAAAGCTATCAGCTATTTTCGTTA TGGCCTTGATTTATTACGCGATACGGCTCTGAATGGAGGTCGGTGTATTCGCCATGGTTT AACCGATATACTTAGTTTCTTGAGTATTACTCCAACGACATACTCAGTGACATGAAATAG TCCAACAATAAGGAAGAAAGATGCCAGTTAAACAGCCCGCCATTTATATCATGGTGAATA GACGTAATGGAACAATTTACACCGGTGTCACCAGCGATTTAATCAAACGAGTATATGAAC ATAAATATGCGGATGTCCCTGNGTTTACGCAAAAACATGGCTGTAAACATCTTGTCTATT ATGAGCTTATAGAAGACATCATC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)