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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8793#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1809 fasta sequence
[CCTTCGAGTGCGAGCCATGTCCACCTCCGCACCCACCTCGTCGCCTGAGCCGCCGGAGTTCATCCGCGGGAGCCTCATCCCGGCTCTCCCCGACGACCTGGCCATCCACTGCGTCGCCCTGCTGCCGCGCGCCGCGCACCCCTCCCTCGCGCTCGTCTCCCGCGCCTTCCACACCTTGCTGTGCCGCGACCCGGGTCCCCTCCTGGCCGCGCGCCGCCGCCTCCGCCTCTCCGACCCCCACGTCATCCTCTCCCTCCGCCCGCCGGCCTCCGCCTCGCCTCTCTTCTTCCTCCTCCTCCCGCATCCCGGATGGCCACCGCTGCCTCTCCCGTCCCCTCCCGTCCCCGTCTCCTCCTCCTCCTCGGTCGCCGTCGACGGCAACCGGGTGTTCCTCTTCGGCGGGTCCGTCTCCGGAGTGCCGTCCCCGTCGGTGCAGATCTTGGACCCCCGCACCAGATCCTGGTCAGTCGGCCCGCGCCTCTCCTCTCCGCGGGAGTTCGCCGCCGCCGTTGCCCACTCCGGCGTACTATTCGTCGCCGGCGGTTGTGTTCCTTCCTCCCCCTTCTGGGCTGAGTCCCTGAACCTCTCCTCCCCGGATGCAAAGTGGTCTCCGGTCCCCAGCCCGCCCCACTTCCGGGAGAAGTGGATGCACGGCTCCGCCTCGCTCGCCGGGAAGGTCCTCGCGGTGGCCGATCGCGGCGGCTTGGCCTACGACCCGGCTGCGCCGCCTACTGAGGCATGGGCGCCGGTTTCTCCGATCCTTGACATGGGGT-GGAAGGGCCGTGCAGCTGTGGTCGGTGGAATCCTCTACTCCTACGATTACTTGGGGCAGGTCAAGGGCTATGATCCGGACACCGATTGCTGGAGCAAGGTGGAAGGGTTGGAGCAGGAGCTGCCCAAGTTCTTGTGTGGTGCCACTCTCGCCAATGTCGGTGAACTGCTCTACTTGGTTTGGGAAGGGAAGTGGAAAGGGAAAGGGAAAGCGAAAGGAAAGGGCGAAGCAAGGAGCATGGTGGTGATTGATTGGGCTGCCATTGCGGTGACGAAAGCCGAAGAGGGCCGGCTAACGGGGAAGGTGTTGTCAAGGGACACCATTGTATTCAAGGACATGCCAAAGGGGTCAGCAATCACACATTGCATCGCATTGGAGCTGTGACGATGGTTGCTCCAGTAGCCCAGTCATAAATCAAATGGCATCCATGTTTTAAATGTTCTCTGCTGATTTGAGGATGGAAAAACTCAGTATTGTGGTAGGCTGGTAGCACCTCCTGCTGAGAAATGAGGATGCTTCACTACTGGGCAGCAGAGCACTGATAAATCTGGCTGGATGACAAGTTAAAGATAATTCAGAAAATTGTGTTTCAATTCCTTATCGTCTGGATGCTGGAAGAAGGCATTTGGAATTCTACCCAGCAAAAATCATGCATTTGGATCTCTCTTAGACATTGAACATATTTGATGAAGCAGAAGTTTTGCCTTAAACACTATTTATTCTTCATTGCCGGTCAGTTGTAATTGTAAGATAACCAATGTAGCTTGTAGCCCTCTTGTATAGTTGTATGGCCTATTGCTGAGCTTGCTGTGCCCGTGTGTGGCAGCATTAGTTGTGTTTAAACATATCGAATTACTTTGCTAGCTTGGGCCAGTAGTGCAAATTGTTAAAACCAGTTTGGCCCAAGAGAAACAGCACCTACAGTTGTCTCATTCTGTGCAGAGTTTCTATCCATGGATGTACCCCTAAATAAACTATGAAATTAATTCATGCATTCTCTTTTAGGACCAAGACAAGTAGAAATCATAGTAGTACTT]
[+] EMBL AK071934 [CCTTCGAGTGCGAGCCATGTCCACCTCCGCACCCACCTCGTCGCCTGAGCCGCCGGAGTTCATCCGCGGGAGCCTCATCCCGGCTCTCCCCGACGACCTGGCCATCCACTGCGTCGCCCTGCTGCCGCGCGCCGCGCACCCCTCCCTCGCGCTCGTCTCCCGCGCCTTCCACACCTTGCTGTGCCGCGACCCGGGTCCCCTCCTGGCCGCGCGCCGCCGCCTCCGCCTCTCCGACCCCCACGTCATCCTCTCCCTCCGCCCGCCGGCCTCCGCCTCGCCTCTCTTCTTCCTCCTCCTCCCGCATCCCGGATGGCCACCGCTGCCTCTCCCGTCCCCTCCCGTCCCCGTCTCCTCCTCCTCCTCGGTCGCCGTCGACGGCAACCGGGTGTTCCTCTTCGGCGGGTCCGTCTCCGGAGTGCCGTCCCCGTCGGTGCAGATCTTGGACCCCCGCACCAGATCCTGGTCAGTCGGCCCGCGCCTCTCCTCTCCGCGGGAGTTCGCCGCCGCCGTTGCCCACTCCGGCGTACTATTCGTCGCCGGCGGTTGTGTTCCTTCCTCCCCCTTCTGGGCTGAGTCCCTGAACCTCTCCTCCCCGGATGCAAAGTGGTCTCCGGTCCCCAGCCCGCCCCACTTCCGGGAGAAGTGGATGCACGGCTCCGCCTCGCTCGCCGGGAAGGTCCTCGCGGTGGCCGATCGCGGCGGCTTGGCCTACGACCCGGCTGCGCCGCCTACTGAGGCATGGGCGCCGGTTTCTCCGATCCTTGACATGGGGT GGAAGGGCCGTGCAGCTGTGGTCGGTGGAATCCTCTACTCCTACGATTACTTGGGGCAGGTCAAGGGCTATGATCCGGACACCGATTGCTGGAGCAAGGTGGAAGGGTTGGAGCAGGAGCTGCCCAAGTTCTTGTGTGGTGCCACTCTCGCCAATGTCGGTGAACTGCTCTACTTGGTTTGGGAAGGGAAGTGGAAAGGGAAAGGGAAAGCGAAAGGAAAGGGCGAAGCAAGGAGCATGGTGGTGATTGATTGGGCTGCCATTGCGGTGACGAAAGCCGAAGAGGGCCGGCTAACGGGGAAGGTGTTGTCAAGGGACACCATTGTATTCAAGGACATGCCAAAGGGGTCAGCAATCACACATTGCATCGCATTGGAGCTGTGACGATGGTTGCTCCAGTAGCCCAGTCATAAATCAAATGGCATCCATGTTTTAAATGTTCTCTGCTGATTTGAGGATGGAAAAACTCAGTATTGTGGTAGGCTGGTAGCACCTCCTGCTGAGAAATGAGGATGCTTCACTACTGGGCAGCAGAGCACTGATAAATCTGGCTGGATGACAAGTTAAAGATAATTCAGAAAATTGTGTTTCAATTCCTTATCGTCTGGATGCTGGAAGAAGGCATTTGGAATTCTACCCAGCAAAAATCATGCATTTGGATCTCTCTTAGACATTGAACATATTTGATGAAGCAGAAGTTTTGCCTTAAACACTATTTATTCTTCATTGCCGGTCAGTTGTAATTGTAAGATAACCAATGTAGCTTGTAGCCCTCTTGTATAGTTGTATGGCCTATTGCTGAGCTTGCTGTGCCCGTGTGTGGCAGCATTAGTTGTGTTTAAACATATCGAATTACTTTGCTAGCTTGGGCCAGTAGTGCAAATTGTTAAAACCAGTTTGGCCCAAGAGAAACAGCACCTACAGTTGTCTCATTCTGTGCAGAGTTTCTATCCATGGATGTACCCCTAAATAAACTATGAAATTAATTCATGCATTCTC ]
[+] EMBL AK107556 [ TCCACCTCCGCACCCACCTCGTCGCCTGAGCCGCCGGAGTTCATCCGCGGGAGCCTCATCCCGGCTCTCCCCGACGACCTGGCCATCCACTGCGTCGCCCTGCTGCCGCGCGCCGCGCACCCCTCCCTCGCGCTCGTCTCCCGCGCCTTCCACACCTTGCTGTGCCGCGACCCGGGTCCCCTCCTGGCCGCGCGCCGCCGCCTCCGCCTCTCCGACCCCCACGTCATCCTCTCCCTCCGCCCGCCGGCCTCCGCCTCGCCTCTCTTCTTCCTCCTCCTCCCGCATCCCGGATGGCCACCGCTGCCTCTCCCGTCCCCTCCCGTCCCCGTCTCCTCCTCCTCCTCGGTCGCCGTCGACGGCAACCGGGTGTTCCTCTTCGGCGGGTCCGTCTCCGGAGTGCCGTCCCCGTCGGTGCAGATCTTGGACCCCCGCACCAGATCCTGGTCAGTCGGCCCGCGCCTCTCCTCTCCGCGGGAGTTCGCCGCCGCCGTTGCCCACTCCGGCGTACTATTCGTCGCCGGCGGTTGTGTTCCTTCCTCCCCCTTCTGGGCTGAGTCCCTGAACCTCTCCTCCCCGGATGCAAAGTGGTCTCCGGTCCCCAGCCCGCCCCACTTCCGGGAGAAGTGGATGCACGGCTCCGCCTCGCTCGCCGGGAAGGTCCTCGCGGTGGCCGATCGCGGCGGCTTGGCCTACGACCCGGCTGCGCCGCCTACTGAGGCATGGGCGCCGGTTTCTCCGATCCTTGACATGGGGT GGAAGGGCCGTGCAGCTGTGGTCGGTGGAATCCTCTACTCCTACGATTACTTGGGGCAGGTCAAGGGCTATGATCCGGACACCGATTGCTGGAGCAAGGTGGAAGGGTTGGAGCAGGAGCTGCCCAAGTTCTTGTGTGGTGCCACTCTCGCCAATGTCGGTGAACTGCTCTACTTGGTTTGGGAAGGGAAGTGGAAAGGGAAAGGGAAAGCGAAAGGAAAGGGCGAAGCAAGGAGCATGGTGGTGATTGATTGGGCTGCCATTGCGGTGACGAAAGCCGAAGAGGGCCGGCTAACGGGGAAGGTGTTGTCAAGGGACACCATTGTATTCAAGGACATGCCAAAGGGGTCAGCAATCACACATTGCATCGCATTGGAGCTGTGACGATGGTTGCTCCAGTAGCCCAGTCATAAATCAAATGGCATCCATGTTTTAAATGTTCTCTGCTGATTTGAGGATGGAAAAACTCAGTATTGTGGTAGGCTGGTAGCACCTCCTGCTGAGAAATGAGGATGCTTCACTACTGGGCAGCAGAGCACTGATAAATCTGGCTGGATGACAAGTTAAAGATAATTCAGAAAATTGTGTTTCAATTCCTTATCGTCTGGATGCTGGAAGAAGGCATTTGGAATTCTACCCAGCAAAAATCATGCATTTGGATCTCTCTTAGACATTGAACATATTTGATGAAGCAGAAGTTTTGCCTTAAACACTATTTATTCTTCATTGCCGGTCAGTTGTAATTGTAAGATAACCAATGTAGCTTGTAGCCCTCTTGTATAGTTGTATGGCCTATTGCTGAGCTTGCTGTGCTCGTGTGTGGCAGCATTAGTTGTGTTTAAACATATCGAATTACTTTGCTAGCTTGGGCCAGTAGTGCAAATTGCTAAAACCAGTTTGGCCCAAGAGAAACAGCACCTACAGTTGTCTCATTCTGTGCAGAGTTTCTATCCATGGATGTACCCCTAAATAAACTATGAAATTAATTCATGCATTCTC ]
[+] EMBL CB642230 [ ACCTCCGCACCCACCTCGTCGCCTGAGCCGCCGGAGTTCATCCGCGGGAGCCTCATCCCGGCTCTCCCCGACGACCTGGCCATCCACTGCGTCGCCCTGCTGCCGCGCGCCGCGCACCCCTCCCTCGCGCTCGTCTCCCGCGCCTTCCACACCTTGCTGTGCCGCGACCCGGGTCCCCTCCTGGCCGCGCGCCGCCGCCTCCGCCTCTCCGACCCCCACGTCATCCTCTCCCTCCGCCCGCCGGCCTCCGCCTCGCCTCTCTTCTTCCTCCTCCTCCCGCATCCCGGATGGCCACCGCTGCCTCTCCCGTCCCCTCCCGTCCCCGTCTCCTCCTCCTCCTCGGTCGCCGTCGACGGCAACCGGGTGTTCCTCTTCGGCGGGTCCGTCTCCGGAGTGCCGTCCCCGTCGGTGCAGATCTTGGACCCCCGCACCAGATCCTGGTCAGTCGGCCCGCGCCTCTCCTCTCCGCGGGAGTTCGCCGCCGCCGTTGCCCACTCCGGCGTACTATTCGTCGCCGGCGGTTGTGTTCCTTCCTCCCCCTTCTGGGCTGAGTCCCTGAACCTCTCCTCCCCGGATGCAAAGTGGTCTCCGGTCCCCAGCCCGCCCCACTTCCGGGAGAAGTGGATGCACGGCTCCGCCTCGCTCGCCGGGAAGGTCCTCGCGGTGGCCGATCGCGGCGGCTTGGCCTACGACCCGGCTGCGCCGCCTACTGAGGCATGGGCGCCGGTTTCTCCGATCCTTGACATGGGGTGGGAAGGGCCGGGCAGCTGTGGTCGGTGG ]
[-] EMBL CB642231 [ GGGCCGGCTAACGGGGAAGGTGTTGTCAAGGGACACCATTGTATTCAAGGACATGCCAAAGGGGTCAGCAATCACACATTGCATCGCATTGGAGCTGTGACGATGGTTGCTCCAGTAGCCCAGTCATAAATCAAATGGCATCCATGTTTTAAATGTTCTCTGCTGATTTGAGGATGGAAAAACTCAGTATTGTGGTAGGCTGGTAGCACCTCCTGCTGAGAAATGAGGATGCTTCACTACTGGGCAGCAGAGCACTGATAAATCTGGCTGGATGACAAGTTAAAGATAATTCAGAAAATTGTGTTTCAATTCCTTATCGTCTGGATGCTGGAAGAAGGCATTTGGAATTCTACCCAGCAAAAATCATGCATTTGGATCTCTCTTAGACATTGAACATATTTGATGAAGCAGAAGTTTTGCCTTAAACACTATTTATTCTTCATTGCCGGTCAGTTGTAATTGTAAGATAACCAATGTAGCTTGTAGCCCTCTTGTATAGTTGTATGGCCTATTGCTGAGCTTGCTGTGCCCGTGTGTGGCAGCATTAGTTGTGTTTAAACATATCGAATTACTTTGCTAGCTTGGGCCAGTAGTGCAAATTGTTAAAACCAGTTTGGCCCAAGAGAAACAGCACCTACAGTTGTCTCATTCTGTGCAGAGTTTCTATCCATGGATGTACCCCTAAATAAACTATGAAATTAATTCATGCATTCTCTTTTAGGACCAAGACAAGTAGAAATCATAGTAGTACTT]
[+] EMBL CF333195 [ TGGCTGGATGACAAGTTAAAGATAATTCAGAAAATTGTGTTTCAATTCCTTATCGTCTGGATGCTGGAAGAAGGCATTTGGAATTCTACCCAGCAAAAATCATGCATTTGGATCTCTCTTAGACATTGAACATATTTGATGAAGCAGAAGTTTTGCCTTAAACACTATTTATTCTTCATTGCCGGTCAGTTGTAATTGTAAGATAACCAATGTAGCTTGTAACCCTCTTGTATAGTTGTATGGCCTATTGCTGAGCTTGCTGTGCCCGTGTGTGGCAGCATTAGTTGTGTTTAAACATATCGAATTACTTTGCTAGCTTGGGCCAGTAGTGCAAATTGTTAAAACCAGTTTGGCCCAAGAGAAACAGCACCTACAGTTGTCTCATTCTGTGCAGAGTTTCTATCCATGGATGTACCCCTAAATAAACTATGAAATTAATTCATGCATTCTCTTCTAGGA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||