These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8793#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1809 fasta sequence [CCTTCGAGTGCGAGCCATGTCCACCTCCGCACCCACCTCGTCGCCTGAGCCGCCGGAGTTCATCCGCGGGAGCCTCATCCCGGCTCTCCCCGACGACCTGGCCATCCACTGCGTCGCCCTGCTGCCGCGCGCCGCGCACCCCTCCCTCGCGCTCGTCTCCCGCGCCTTCCACACCTTGCTGTGCCGCGACCCGGGTCCCCTCCTGGCCGCGCGCCGCCGCCTCCGCCTCTCCGACCCCCACGTCATCCTCTCCCTCCGCCCGCCGGCCTCCGCCTCGCCTCTCTTCTTCCTCCTCCTCCCGCATCCCGGATGGCCACCGCTGCCTCTCCCGTCCCCTCCCGTCCCCGTCTCCTCCTCCTCCTCGGTCGCCGTCGACGGCAACCGGGTGTTCCTCTTCGGCGGGTCCGTCTCCGGAGTGCCGTCCCCGTCGGTGCAGATCTTGGACCCCCGCACCAGATCCTGGTCAGTCGGCCCGCGCCTCTCCTCTCCGCGGGAGTTCGCCGCCGCCGTTGCCCACTCCGGCGTACTATTCGTCGCCGGCGGTTGTGTTCCTTCCTCCCCCTTCTGGGCTGAGTCCCTGAACCTCTCCTCCCCGGATGCAAAGTGGTCTCCGGTCCCCAGCCCGCCCCACTTCCGGGAGAAGTGGATGCACGGCTCCGCCTCGCTCGCCGGGAAGGTCCTCGCGGTGGCCGATCGCGGCGGCTTGGCCTACGACCCGGCTGCGCCGCCTACTGAGGCATGGGCGCCGGTTTCTCCGATCCTTGACATGGGGT-GGAAGGGCCGTGCAGCTGTGGTCGGTGGAATCCTCTACTCCTACGATTACTTGGGGCAGGTCAAGGGCTATGATCCGGACACCGATTGCTGGAGCAAGGTGGAAGGGTTGGAGCAGGAGCTGCCCAAGTTCTTGTGTGGTGCCACTCTCGCCAATGTCGGTGAACTGCTCTACTTGGTTTGGGAAGGGAAGTGGAAAGGGAAAGGGAAAGCGAAAGGAAAGGGCGAAGCAAGGAGCATGGTGGTGATTGATTGGGCTGCCATTGCGGTGACGAAAGCCGAAGAGGGCCGGCTAACGGGGAAGGTGTTGTCAAGGGACACCATTGTATTCAAGGACATGCCAAAGGGGTCAGCAATCACACATTGCATCGCATTGGAGCTGTGACGATGGTTGCTCCAGTAGCCCAGTCATAAATCAAATGGCATCCATGTTTTAAATGTTCTCTGCTGATTTGAGGATGGAAAAACTCAGTATTGTGGTAGGCTGGTAGCACCTCCTGCTGAGAAATGAGGATGCTTCACTACTGGGCAGCAGAGCACTGATAAATCTGGCTGGATGACAAGTTAAAGATAATTCAGAAAATTGTGTTTCAATTCCTTATCGTCTGGATGCTGGAAGAAGGCATTTGGAATTCTACCCAGCAAAAATCATGCATTTGGATCTCTCTTAGACATTGAACATATTTGATGAAGCAGAAGTTTTGCCTTAAACACTATTTATTCTTCATTGCCGGTCAGTTGTAATTGTAAGATAACCAATGTAGCTTGTAGCCCTCTTGTATAGTTGTATGGCCTATTGCTGAGCTTGCTGTGCCCGTGTGTGGCAGCATTAGTTGTGTTTAAACATATCGAATTACTTTGCTAGCTTGGGCCAGTAGTGCAAATTGTTAAAACCAGTTTGGCCCAAGAGAAACAGCACCTACAGTTGTCTCATTCTGTGCAGAGTTTCTATCCATGGATGTACCCCTAAATAAACTATGAAATTAATTCATGCATTCTCTTTTAGGACCAAGACAAGTAGAAATCATAGTAGTACTT] [+] EMBL AK071934 [CCTTCGAGTGCGAGCCATGTCCACCTCCGCACCCACCTCGTCGCCTGAGCCGCCGGAGTTCATCCGCGGGAGCCTCATCCCGGCTCTCCCCGACGACCTGGCCATCCACTGCGTCGCCCTGCTGCCGCGCGCCGCGCACCCCTCCCTCGCGCTCGTCTCCCGCGCCTTCCACACCTTGCTGTGCCGCGACCCGGGTCCCCTCCTGGCCGCGCGCCGCCGCCTCCGCCTCTCCGACCCCCACGTCATCCTCTCCCTCCGCCCGCCGGCCTCCGCCTCGCCTCTCTTCTTCCTCCTCCTCCCGCATCCCGGATGGCCACCGCTGCCTCTCCCGTCCCCTCCCGTCCCCGTCTCCTCCTCCTCCTCGGTCGCCGTCGACGGCAACCGGGTGTTCCTCTTCGGCGGGTCCGTCTCCGGAGTGCCGTCCCCGTCGGTGCAGATCTTGGACCCCCGCACCAGATCCTGGTCAGTCGGCCCGCGCCTCTCCTCTCCGCGGGAGTTCGCCGCCGCCGTTGCCCACTCCGGCGTACTATTCGTCGCCGGCGGTTGTGTTCCTTCCTCCCCCTTCTGGGCTGAGTCCCTGAACCTCTCCTCCCCGGATGCAAAGTGGTCTCCGGTCCCCAGCCCGCCCCACTTCCGGGAGAAGTGGATGCACGGCTCCGCCTCGCTCGCCGGGAAGGTCCTCGCGGTGGCCGATCGCGGCGGCTTGGCCTACGACCCGGCTGCGCCGCCTACTGAGGCATGGGCGCCGGTTTCTCCGATCCTTGACATGGGGT GGAAGGGCCGTGCAGCTGTGGTCGGTGGAATCCTCTACTCCTACGATTACTTGGGGCAGGTCAAGGGCTATGATCCGGACACCGATTGCTGGAGCAAGGTGGAAGGGTTGGAGCAGGAGCTGCCCAAGTTCTTGTGTGGTGCCACTCTCGCCAATGTCGGTGAACTGCTCTACTTGGTTTGGGAAGGGAAGTGGAAAGGGAAAGGGAAAGCGAAAGGAAAGGGCGAAGCAAGGAGCATGGTGGTGATTGATTGGGCTGCCATTGCGGTGACGAAAGCCGAAGAGGGCCGGCTAACGGGGAAGGTGTTGTCAAGGGACACCATTGTATTCAAGGACATGCCAAAGGGGTCAGCAATCACACATTGCATCGCATTGGAGCTGTGACGATGGTTGCTCCAGTAGCCCAGTCATAAATCAAATGGCATCCATGTTTTAAATGTTCTCTGCTGATTTGAGGATGGAAAAACTCAGTATTGTGGTAGGCTGGTAGCACCTCCTGCTGAGAAATGAGGATGCTTCACTACTGGGCAGCAGAGCACTGATAAATCTGGCTGGATGACAAGTTAAAGATAATTCAGAAAATTGTGTTTCAATTCCTTATCGTCTGGATGCTGGAAGAAGGCATTTGGAATTCTACCCAGCAAAAATCATGCATTTGGATCTCTCTTAGACATTGAACATATTTGATGAAGCAGAAGTTTTGCCTTAAACACTATTTATTCTTCATTGCCGGTCAGTTGTAATTGTAAGATAACCAATGTAGCTTGTAGCCCTCTTGTATAGTTGTATGGCCTATTGCTGAGCTTGCTGTGCCCGTGTGTGGCAGCATTAGTTGTGTTTAAACATATCGAATTACTTTGCTAGCTTGGGCCAGTAGTGCAAATTGTTAAAACCAGTTTGGCCCAAGAGAAACAGCACCTACAGTTGTCTCATTCTGTGCAGAGTTTCTATCCATGGATGTACCCCTAAATAAACTATGAAATTAATTCATGCATTCTC ] [+] EMBL AK107556 [ TCCACCTCCGCACCCACCTCGTCGCCTGAGCCGCCGGAGTTCATCCGCGGGAGCCTCATCCCGGCTCTCCCCGACGACCTGGCCATCCACTGCGTCGCCCTGCTGCCGCGCGCCGCGCACCCCTCCCTCGCGCTCGTCTCCCGCGCCTTCCACACCTTGCTGTGCCGCGACCCGGGTCCCCTCCTGGCCGCGCGCCGCCGCCTCCGCCTCTCCGACCCCCACGTCATCCTCTCCCTCCGCCCGCCGGCCTCCGCCTCGCCTCTCTTCTTCCTCCTCCTCCCGCATCCCGGATGGCCACCGCTGCCTCTCCCGTCCCCTCCCGTCCCCGTCTCCTCCTCCTCCTCGGTCGCCGTCGACGGCAACCGGGTGTTCCTCTTCGGCGGGTCCGTCTCCGGAGTGCCGTCCCCGTCGGTGCAGATCTTGGACCCCCGCACCAGATCCTGGTCAGTCGGCCCGCGCCTCTCCTCTCCGCGGGAGTTCGCCGCCGCCGTTGCCCACTCCGGCGTACTATTCGTCGCCGGCGGTTGTGTTCCTTCCTCCCCCTTCTGGGCTGAGTCCCTGAACCTCTCCTCCCCGGATGCAAAGTGGTCTCCGGTCCCCAGCCCGCCCCACTTCCGGGAGAAGTGGATGCACGGCTCCGCCTCGCTCGCCGGGAAGGTCCTCGCGGTGGCCGATCGCGGCGGCTTGGCCTACGACCCGGCTGCGCCGCCTACTGAGGCATGGGCGCCGGTTTCTCCGATCCTTGACATGGGGT GGAAGGGCCGTGCAGCTGTGGTCGGTGGAATCCTCTACTCCTACGATTACTTGGGGCAGGTCAAGGGCTATGATCCGGACACCGATTGCTGGAGCAAGGTGGAAGGGTTGGAGCAGGAGCTGCCCAAGTTCTTGTGTGGTGCCACTCTCGCCAATGTCGGTGAACTGCTCTACTTGGTTTGGGAAGGGAAGTGGAAAGGGAAAGGGAAAGCGAAAGGAAAGGGCGAAGCAAGGAGCATGGTGGTGATTGATTGGGCTGCCATTGCGGTGACGAAAGCCGAAGAGGGCCGGCTAACGGGGAAGGTGTTGTCAAGGGACACCATTGTATTCAAGGACATGCCAAAGGGGTCAGCAATCACACATTGCATCGCATTGGAGCTGTGACGATGGTTGCTCCAGTAGCCCAGTCATAAATCAAATGGCATCCATGTTTTAAATGTTCTCTGCTGATTTGAGGATGGAAAAACTCAGTATTGTGGTAGGCTGGTAGCACCTCCTGCTGAGAAATGAGGATGCTTCACTACTGGGCAGCAGAGCACTGATAAATCTGGCTGGATGACAAGTTAAAGATAATTCAGAAAATTGTGTTTCAATTCCTTATCGTCTGGATGCTGGAAGAAGGCATTTGGAATTCTACCCAGCAAAAATCATGCATTTGGATCTCTCTTAGACATTGAACATATTTGATGAAGCAGAAGTTTTGCCTTAAACACTATTTATTCTTCATTGCCGGTCAGTTGTAATTGTAAGATAACCAATGTAGCTTGTAGCCCTCTTGTATAGTTGTATGGCCTATTGCTGAGCTTGCTGTGCTCGTGTGTGGCAGCATTAGTTGTGTTTAAACATATCGAATTACTTTGCTAGCTTGGGCCAGTAGTGCAAATTGCTAAAACCAGTTTGGCCCAAGAGAAACAGCACCTACAGTTGTCTCATTCTGTGCAGAGTTTCTATCCATGGATGTACCCCTAAATAAACTATGAAATTAATTCATGCATTCTC ] [+] EMBL CB642230 [ ACCTCCGCACCCACCTCGTCGCCTGAGCCGCCGGAGTTCATCCGCGGGAGCCTCATCCCGGCTCTCCCCGACGACCTGGCCATCCACTGCGTCGCCCTGCTGCCGCGCGCCGCGCACCCCTCCCTCGCGCTCGTCTCCCGCGCCTTCCACACCTTGCTGTGCCGCGACCCGGGTCCCCTCCTGGCCGCGCGCCGCCGCCTCCGCCTCTCCGACCCCCACGTCATCCTCTCCCTCCGCCCGCCGGCCTCCGCCTCGCCTCTCTTCTTCCTCCTCCTCCCGCATCCCGGATGGCCACCGCTGCCTCTCCCGTCCCCTCCCGTCCCCGTCTCCTCCTCCTCCTCGGTCGCCGTCGACGGCAACCGGGTGTTCCTCTTCGGCGGGTCCGTCTCCGGAGTGCCGTCCCCGTCGGTGCAGATCTTGGACCCCCGCACCAGATCCTGGTCAGTCGGCCCGCGCCTCTCCTCTCCGCGGGAGTTCGCCGCCGCCGTTGCCCACTCCGGCGTACTATTCGTCGCCGGCGGTTGTGTTCCTTCCTCCCCCTTCTGGGCTGAGTCCCTGAACCTCTCCTCCCCGGATGCAAAGTGGTCTCCGGTCCCCAGCCCGCCCCACTTCCGGGAGAAGTGGATGCACGGCTCCGCCTCGCTCGCCGGGAAGGTCCTCGCGGTGGCCGATCGCGGCGGCTTGGCCTACGACCCGGCTGCGCCGCCTACTGAGGCATGGGCGCCGGTTTCTCCGATCCTTGACATGGGGTGGGAAGGGCCGGGCAGCTGTGGTCGGTGG ] [-] EMBL CB642231 [ 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TGGCTGGATGACAAGTTAAAGATAATTCAGAAAATTGTGTTTCAATTCCTTATCGTCTGGATGCTGGAAGAAGGCATTTGGAATTCTACCCAGCAAAAATCATGCATTTGGATCTCTCTTAGACATTGAACATATTTGATGAAGCAGAAGTTTTGCCTTAAACACTATTTATTCTTCATTGCCGGTCAGTTGTAATTGTAAGATAACCAATGTAGCTTGTAACCCTCTTGTATAGTTGTATGGCCTATTGCTGAGCTTGCTGTGCCCGTGTGTGGCAGCATTAGTTGTGTTTAAACATATCGAATTACTTTGCTAGCTTGGGCCAGTAGTGCAAATTGTTAAAACCAGTTTGGCCCAAGAGAAACAGCACCTACAGTTGTCTCATTCTGTGCAGAGTTTCTATCCATGGATGTACCCCTAAATAAACTATGAAATTAATTCATGCATTCTCTTCTAGGA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||