cluster # 8872

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Oryza sativa
cluster # 8872 cluster # 8872 Sequences # 6 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8872#0 length = 3223 sequences # 6
consensusID : consensus_8872#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 3223
fasta sequence
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[+] EMBL CB646999             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACCACAGATTTGGTTTATATCAGTAAATGGCCATGTTTTTTTCCCAAGTTATGTTTCTAAATATGTAGACTGTGGTACGATATTTATAAAGTTCAAGTTGTCTTTGTTTCCCAGAAAATCTTAGGTCTAGCAGACTTACTTAGTTTCTGTTTACAAATGAATAATCGGGTAGTGAATACTATACCTGTATATTTGTACTACTCTCTTATTTAGTAATGTATCTAAAATAATGTAGACTGTACTACAATATTTATTTAGATGCATATGCTCAATTTTTATATAAGTATATGCTGCTTTTACATTACTTTTGTTTGAATGTACATGCTGATATGAAATTTGGAGAGCTTTCTTGGAATGTACGCTGTTAAGAAAATTTAGATAAATTAAATCCTTATGCCTTATATTGTTTCTTAAACACACCTATAAGTTTGATTGGAGAAGGGGACATTAACCAATTGCTTGAAAAAGGTGTTTTGTTAGCTCAAGATATGGTGGAATATTTACAACTGTTTTAGTAACTCCCAGATAATCTTTCTCTACATACATGCATAACTAATTTCTCTAGGATAATGACACATTTCTGATTCGTTAAGGGCAAACTTTGAAGTACATCTGTTATGCGCGAGATATTCAGTTTATATTTCTAAACTTGGGTGCACTTTGAATCAGGACGAATAGGCTCAGTTGGATCAGTTGAATATAAAGAAGTGGTGTGCGATTAGTTTTTTTTGTAAATAGCTCAAGTTAGTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BF430774             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTGGTTTATATCAGTAAATGGCCATGTTTTTTTCCCAAGTTATGTTTCTAAATATGTAGACTGTGGTACGATATTTATAAAGTTCAAGTTGTCTTTGTTTCCCAGAAAATCTTAGGTCTAGCAGACTTACTTAGTTTCTGTTTACAAATGAATAATCGGGTAGTGAATACTGTACCTGTATATTTGTACTACTCTCTTATTTAGTAATGTATCTAAAATAATGTAGACTGTACTACAATATTTATTTAGATGCATATGCTCAATTTTTATATAAGTATATGCTGCTTTTACATTACTTTTGTTTGAATGTACATGCTGATATGAAATTTGGAGAGCTTTCTTGGAATGTACGCTGTTAAGAAAATTTAGATAAATTAAATCCTTATGCCTTATATGGTTTCTTAAACACACCTATAAGTTTGATTGGAGAAGGGGACATTAACCAATTGCTTGAAAAAGGTGTTTTGTTAGCTCAAGATATGGTGGAATATTTACAACTGTTTTAGTAACTCCCAGATAATCTTTCTCTACATACATGCATAACTAATTTCTCTAGGATAATGACACATTTCTGATTCGTTAAGGGCAAACTCTGAAGTACATCTGTTATGCGCGAGATATTCAGTTTATATTTCTAAACTTGGGTGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CB635201             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TGTAGACTGTACTACAATATTTATTTAGATGCATATGCTCAATTTTTATATAAGTATATGCTGCTTTTACATTACTTTTGTTTGAATGTACATGCTGATATGAAATTTGGAGAGCTTTCTTGGAATGTACGCTGTTAAGAAAATTTAGATAAATTAAATCCTTATGCCTTATATGGTTTCTTAAACACACCTATAAGTTTGATTGGAGAAGGGGACATTAACCAATTGCTTGAAAAAGGTGTTTTGTTAGCTCAAGATATGGTGGAATATTTACAACTGTTTTAGTAACTCCCAGATAATCTTTCTCTACATACATGCATAACTAATTTCTCTAGGATAATGACACATTTCTGATTCGTTAAGGGCAAACTTTGAAGTACATCTGTTATGCGCGAGATATTCAGTTTATATTTCTAAACTTGGGTGCACTTTGAATCAGGACGAATAGGCTCAGTTGGATCAGTTGAATATAAAGAAGTG   TGCGATTAGTTTTTTTTGTAAATAGCTCAAGTTAGTTTTCTTCCTTGTAGGATAGTTACAAAAAAATAAGGTAAACTTGCATTTCTTGCATGAGCAAAGTTCATTACAACCTATCTAAGTATAATTTCCTGAAGAGTGTTTATAGCTGAAGTTGTTTCTTCTAATTTTGCTGAGGTTAACCCTCCTATGGCATGCATCCTTCTAAATTTTGCTGAGGTAAACCCTCCTGAAATTAGTAGGGTGCACGAAATACTACTGTTTTTTTAATTTTTGTACAGTGGCATTGAACATGGTTTTGCTCTTTGAGATATGATGCTTCCCTCATGATCAATGAAGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CF305791             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTCAGTTATACAGTTCCGCATAATTGTGTGACGTCCTGACTAATCCTGACTAATCTGTATGACCTTTTCTTCCATTTACAAATGCTTGTGTCTCTCCAGTTCACCTGTGAGGGAGATATGAAATCAGGTATGAGTAATTCTTGTGGTTTTGCTTCTTTTTCTGGACACACTTATTTTCATCCATTTTGCAGCAAGCAATAGTTAGGTATGAGAAAGAATGTGCCTTACAATTAACTGTCAGTGGTACACATAAAACTATTCATTTACTCTTCTTTCCTGGTCATATTGATACAGGTTAGTTTATGCTCTTACTCGAAAAAAAAAACAAAGTACATGGTCTTACTATTTGACCGTTTGATTAATTATATAAGTTTCTGAGAAAGCCCTGAATTCGATGTACTAGACTCGATTGTTATAGGCAACTAAGTAAAAAAAACAAGGTGATCCAATAAAGTATTAAAACACCCATGGATCATGTTGCTACCCTGTGGTGATGAAAAGAGACATAAGTGCTAGCTACTATTTTTTGTTTAATCATGAAACAGAGGCTTCATGAAACCAGATCAAGCAAGTCAAATGGGATTGCATCATAGGTAAGATCAAAGTTTTCCCCTTTTTGACATCAACAGCGTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CB635202             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTATTAAAACACCCATGGATCATGTTGCTACCCTGTGGTGATGAAAAGAGACATAAGTGCTAGCTACTATTTTTTGTTTAATCATGAAACAGAGGCTTCATGAAACCAGATCAAGCAAGTCAAATGGGATTGCATCATAGGTAAGATCAAAGTTTTCCCCTTTTTGACATCAACAGCGTATTCTTTTGTCTGTAGAGATTGTATATTTGTTTTCATTCATAGAGGTTACATCATATCCAAGAGAGTGCCAAATCTGTCATGTAGCATTTGTC TTTTTTTTTTACCCGGCCTCTACATCCAACTGGATATATGCAACCTTTTTAAATTAAGAACTTAGCCCTCAAATAACCCAATCTGAAATTCGCTCCTATAGCGATTTAAATTCAGGACCTTGGGGTGCTACTCAGGTTACTGCAACCATTAGGCTACATACCCTTTTACATGTTGCATTTGTCTAGATTATTGCATTTATAAGCAGTAAATCTTTTTCAGAGCAAATAGCATTTGTGCAGTGACCAAGGGTACTATCTTCTTGATTTGCTTGCAGTCTCCCATTGTTTGCTGAGACCATCAATACTCTTGCATGGATGATGGTTCAATTGAATAATTAGGAACTGCAATACTGGACGAGGCTTGTTTGAGTTTTCTTTAGTTCTCTTCAATAAGTTACCTCTTTAATTATATGGCTTCAAACTTTTCCATATTCCCGAGAGCATGTCTGTATGGCACCAAACTGTTCACCTGAGCAAATGGTCCAATAATGAATTGTGCTT       ]




>consensus_8872#0
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GCAGATCTGAGTGTAGTCAAAATCCTTCAATTTTTCAAATCCGTTTGGTAAAAGTTACCA
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CCTCCTATGGCATGCATCCTTCTAAATTTTGCTGAGGTAAACCCTCCTGAAATTAGTAGG
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GTTATAGGCAACTAAGTAAAAAAAACAAGGTGATCCAATAAAGTATTAAAACACCCATGG
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ATTATATGGCTTCAAACTTTTTCATATTCCCGAGAGCATGTCTGTATGGCACCAAACTGT
TCACCTGAGCAAATGGTCCAATAATGAATTGTGCTTTGTCATG
clustalw multiple alignements is not computed in this case