|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8990#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1267 fasta sequence
[TGAAGAACCTGGTGTCGAGGGAGTATTTCGGCCACAAGAAGAAGGTGCACTCTGTAGCATGGAACTGCCTAGGCATGAAGCTTGCTTCAGGCTCTATTGATCATACTGCACGTGTATGGAGTATCGATCCCCATGGCCATTCCAAGGTTAAAGACATTGAATTGAAAGGCCACACAGATTGTGTAGATCAGCTCTGCTGGGATCCGAAGCATCCTGATACAGTTGCTACAGCAGCTGCTGACAAGTCAATTCGCCTCTGGGATGCACGGAGTGGAAAATGTCAAGTCGTCGAACTTAGTGGAGAAAACATCAATATCACTTATAAACATGGTGGTACTCAAATAGCTGTTGGAAACAAGGAGGATGAGTTGACAATAGTGGATGTTCGGAAGCTAAAAGCCCTTCACAAATTTAAGTTTAATTATGAGATAAATGAGATTGCATGGAACAAAACTGGAGATTTATTCTTCATCACTACTGGACTTGGAAATGTTGAGGTATTTGGTGATCCTTCCCTTGATGACACCCTTCATGTGGTTGGCAAATTGAATGCTCATACAGCGGGTTGTTATTGCATTGGAATGGATCCCCTTGATAGGTATTTTGCTGTTGGAAGTGCAGATTCACTTGTCAGTCTTTGGGATGTCAAAGAGCTCCTTTGCATTAAAACCTTTACCAAACTCGAGTGGCCTGTAAGAACAGTTAGCTTCAATCATACTGGAGAGTTTCTTGCATATGCTAGCGAAGATCCCTTCATTGACATTGCCAATGTTCAAACTGGACGATCGATTCATCAGATTCCATGCAAGGCAGCTATGAATAGTGTTGAATGGAACCCCAAGTACAACCTCCTGGCTTACG-CAGG-AGACG-ACAAG-A-ACA-AGTACC-AGGCTGATG-AAGGTGTTTTCCGAATATTTGGCTTTGAAAGCACATAACTGATGGTTAGCAGATTACCGTCACCAACTATTCATTGTAGATTGATTTCCGAGTTCTGATCTGCATTTCTGACAGCAGTTTGGGTCCTGATTGTAACTTCAATTTTATTAATGTCCTGGCCGCTTGAACTGAATTGTATTGTACTTTGTGACTCGAGAGTCGAGACCCATATTTTTGTTAGAGTAAAGTTCAGAAATCCTATATGTTTTGTTGTCTACGTAGGGAAAAAACAACTGCATGTTTGCATCATGTGGCACTGAGCCTCAGGTGCTATGGGCGCAAAGTTTTATGACCATACGTTCTTTTAAATCCAAAATAATATAACGTGGCACCT]
[+] EMBL AK111666 [TGAAGAACCTGGTGTCGAGGGAGTATTTCGGCCACAAGAAGAAGGTGCACTCTGTAGCATGGAACTGCCTAGGCATGAAGCTTGCTTCAGGCTCTATTGATCATACTGCACGTGTATGGAGTATCGATCCCCATGGCCATTCCAAGGTTAAAGACATTGAATTGAAAGGCCACACAGATTGTGTAGATCAGCTCTGCTGGGATCCGAAGCATCCTGATACAGTTGCTACAGCAGCTGCTGACAAGTCAATTCGCCTCTGGGATGCACGGAGTGGAAAATGTCAAGTCGTCGAACTTAGTGGAGAAAACATCAATATCACTTATAAACATGGTGGTACTCAAATAGCTGTTGGAAACAAGGAGGATGAGTTGACAATAGTGGATGTTCGGAAGCTAAAAGCCCTTCACAAATTTAAGTTTAATTATGAGATAAATGAGATTGCATGGAACAAAACTGGAGATTTATTCTTCATCACTACTGGACTTGGAAATGTTGAGGTATTTGGTGATCCTTCCCTTGATGACACCCTTCATGTGGTTGGCAAATTGAATGCTCATACAGCGGGTTGTTATTGCATTGGAATGGATCCCCTTGATAGGTATTTTGCTGTTGGAAGTGCAGATTAACTTGTCAGTCTTTGGGATGTCAAAGAGCTCCTTTGCATTAAAACCTTTACCAAACTCGAGTGGCCTGTAAGAACAGTTAGCTTCAATCATACTGGAGAGTTTCTTGCATATGCTAGCGAAGATCCCTTCATTGACATTGCCAATGTTCAAACTGGACGATCGATTCATCAGATTCCATGCAAGGCAGCTATGAATAGTGTTGAATGGAACCCCAAGTACAACCTCCTGGCTTACG CAGG AGACG ACAAG A ACA AGTACC AGGCTGATG AAGGTGTTTTCCGAATATTTGGCTTTGAAAGCACATAACTGATGGTTAGCAGATTACCGTCACCAACTATTCATTGTAGATTGATTTCCGAGTTCTGATCTGCATTTCTGACAGCAGTTTGGGTCCTGATTGTAACTTCAATTTTATTAATGTCCTGGCCGCTTGAACTGAATTGTATTGTACTTTGTGACTCGAGAGTCGAGACCCATATTTTTGTTAG ]
[+] EMBL CB651318 [TGAAGAACCTGGTGTCGAGGGAGTATTTCGGCCACAAGAAGAAGGTGCACTCTGTAGCATGGAACTGCCTAGGCATGAAGCTTGCTTCAGGCTCTATTGATCATACTGCACGTGTATGGAGTATCGATCCCCATGGCCATTCCAAGGTTAAAGACATTGAATTGAAAGGCCACACAGATTGTGTAGATCAGCTCTGCTGGGATCCGAAGCATCCTGATACAGTTGCTACAGCAGCTGCTGACAAGTCAATTCGCCTCTGGGATGCACGGAGTGGAAAATGTCAAGTCGTCGAACTTAGTGGAGAAAACATCAATATCACTTATAAACATGGTGGTACTCAAATAGCTGTTGGAAACAAGGAGGATGAGTTGACAATAGTGGATGTTCGGAAGCTAAAAGCCCTTCACAAATTTAAGTTTAATTATGAGATAAATGAGATTGCATGGAACAAAACTGGAGATTTATTCTTCATCACTACTGGACTTGGAAATGTTGAGGTATTTGGTGATCCTTCCCTTGATGACACCCTTCATGTGGTTGGCAAATTGAATGCTCATACAGCGGGTTGTTATTGCATTGGAATGGATCCCCTTGATANGTAT ]
[+] EMBL CF304271 [ GAAAGGCCACACAGATTGTGTAGATCAGCTCTGCTGGGATCCGAAGCATCCTGATACAGTTGCTACAGCAGCTGCTGACAAGTCAATTCGCCTCTGGGATGCACGGAGTGGAAAATGTCAAGTCGTCGAACTTAGTGGAGAAAACATCAATATCACTTATAAACATGGTGGTACTCAAATAGCTGTTGGAAACAAGGAGGATGAGTTGACAATAGTGGATGTTCGGAAGCTAAAAGCCCTTCACAAATTTAAGTTTAATTATGAGATAAATGAGATTGCATGGAACAAAACTGGAGATTTATTCTTCATCACTACTGGACTTGGAAATGTTGAGGTATTTGGTGATCCTTCCCTTGATGACACCCTTCATGTGGTTGGCAAATTGAATGCTCATACAGCGGGTTGTTATTGCATTGGAATGGATCCCCTTGATAGGTATTTTGCTGTTGGAAGTGCAGATTCACTTGTCAGTCTTTGGGATGTCAAAGAGCTCCTTTGCATTAAAACCTTTACCAAACTCGAGTGGCCTGTAAGAACAGTTAGCTTCAATCATACTGGAGAGTTTCTTGCATATGCTAGCGAAGATCCCTTCATTGACATTGCCAATGTTCAAACTGGACGA ]
[-] EMBL CB651319 [ AATTATGAGATAAATGAGATTGCATGGACCAAAACTGGAGATTTATTCTTCATCACTACTGGACTTGGAAATGTTGAGGTATTTGGTGATCCTTCCCTTGATGACACCCTTCATGTGGTTGGCAAATTGAATGCTCATACAGCGGGTTGTTATTGCATTGGAATGGATCCCCTTGATAGGTATTTTGCTGTTGGAAGTGCAGATTCACTTGTCAGTCTTTGGGATGTCAAAGAGCTCCTTTGCATTAAAACCTTTACCAAACTCGAGTGGCCTGTAAGAACAGTTAGCTTCAATCATACTGGAGAGTTTCTTGCATATGCTAGCGAAGATCCCTTCATTGACATTGCCAATGTTCAAACTGGACGATCGATTCATCAGATTCCATGCAAGGCAGCTATGAATAGTGTTGAATGGAACCCCAAGTACAACCTCCTGGCTTACG CAGG AGACG ACAAG A ACA AGTACC AGGCTGATG AAGGTGTTTTCCGAATATTTGGCTTTGAAAGCACATAACTGATGGTTAGCAGATTACCGTCACCAACTATTCATTGTAGATTGATTTCCGAGTTCTGATCTGCATTTCTGACAGCAGTTTGGGTCCTGATTGTAACTTCAATTTTATTAATGTCCTGGCCGCTTGAACTGAATTGTATTGTACTTTGTGACTCGAGAGTCGAGACCCATATTTTTGTTAGAGTAAATTTCAGAAATCCTATATGTTTTGTTGTCTACGTAGGGAAAAAACAACTGCATGTTTGCATCATGTGGCACTGAGCCTCAGGTGCTATGGGCGCAAAGTTTTATGACCATACGTTCTTTTAAATCCAAAATAATATAACGTGGCACCT]
[+] EMBL BQ907497 [ ATTCCATGCAAGNCAGCTATGAATAGTGTTGAATGGAACCCCAAGTACAACCTCCTGGCTTACGCCAGG AGACG ACAAG A ACA AGTACC AGGCTGATG AAGGTGTTTTCCGAATATTTGGCTTTGAAAGCACATAACTGATGGTTA CAGATTACCGTCACCAACTATTCATTGTAGATTGATTTCCGAGTTCTGATCTGCATTTCTGACACCA TTTGGGT CTGATTGTAACTTCAATTTTATTAATGTCCT GCCGCTTGAACTGAATTGTATTGTACTTTGTGACTCGAGAGTCGAGACCCATATTTTTGTTAGAGTAAAGTTCAGAAATCCTATAaaaa ]
[+] EMBL BQ907762 [ cCCCAAAGTACAACCTCCTGGCTTACG CAGGTAGACGTACAAGTANACATAGTACCTAGGCTGATGTAAGGTGTTTTCCGAATATTTGGCTTTGAAAGCACATAACTGATGGTTAGCAGATTACCGTCACCAACTATTCATTGTAGATTGATTTCCGAGTTCTGATCTGCATTTCTGACAGCAGTTTGGGTGCTGATTGTAACTTCAATTTTATNAATGTCCTGGCCGCTTGAACTGAATTGTATTGTACTTTGTGACTCGAGAGTCGAGACCCATATTTTTGTTAGAGTAAAGTTCAGAAATCCT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||