cluster # 9063

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Oryza sativa
cluster # 9063 cluster # 9063 Sequences # 6 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9063#0 length = 4622 sequences # 6
consensusID : consensus_9063#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 4622
fasta sequence
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[+] EMBL CF306675             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gGTGCTTTCATTTGCTGTAAATCTTATAGGAGGGTTTGAAGTATATGATAAACAAAGTGGAACAACTTATGAATGTGATGCCTAATTGTTGTTGTTTTAACTAGGCAACAAACTCAGCAAATTCAGAGGCACACTTCAAATGATCTGGTAGAAATCCCCACCTTAAATCCTTAATACTGTGCAAACCACAACTATATTTAATCATCTGTTGCCCTTGTTTTTCTTATATCTACACATGGCAATGATGCTTCATGTTTATTTTCTGAAAATGCCAGCACCTAAGATTTTGAAGCACACAGCTAACAAAGTGGACATGCTAGGAGTGCAATAGAACAAAATGCAGTACACATGTATGCTGATTGCAGTGCTAGGAGTGCAATAGATTTTTTTACATGGGTG TTTTTTTTTTGAATGATGGATGTTAATTATTGAGGGATATGAATGAATTAGATGATATATACAAGGCGCGATGAATGAATTGAGGCCATCCTGATGTTGGGTTGCACAAGTAATATATTTCATTGGATTTATCTTTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI812877             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GGC ATGATGCTTCATGTTTATTTTCTGAAAATGCCAGCACCTAAGATTTTGAAGCACACAGCTAAC AAGTGGACATGCTAGGAGTGCCATAGAACCAAATGCAGTACACATGTATGCTGATTGCAGTGCTAGGAGTGCCATAGATTTTTTTACATGGGTGTTTTTTTTTTTGAATGATGGATGTTAATTATTGAGGGATATGAATGAGTTAGCTGATATATACAAGGCGCGATGAATGAATTGAGGCCATCCTGATGTTGGGTTGCAAAAaaaaaa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CB657090             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgGCTCAGAATTGTAGATTTTCATTAGTGAAAATTGCAAGTGACAAGTTTGGTTCTATTGGTCAATATAATATTTTTTTGTGATATTGTGCAAGATGTTAAGTCAAATCCGTGACTGTTATCTTGACTAGAAGCAAATTTATGCCACAAAATATAGTATTTATTGCTGAGATTGTAGGATTTATTTGTTATAAAATGTTCTTTTTTATCTTGTAATAAAATGTTACCAGCGTAACAGAAGAAAACTATCAGATTATGTTTTATAGGCTAAATGTTAAACTATTTTCGTTAGTATGGCATTTCATTAATAATATTCTTAAGCGTAAACAAAAACTGGATTATATGTAAGCTATCTAATTATGAATGGCTGTGGTAAGTAATGTAGCATTCCTTCACTATTTATAATACCATCATTGAAGAGAAGATCTTCTTTACGTTTTTTTTCTTTCATGTGCCCGTTACTACTAAAAAAGAATTGAAAGTACAA CCTGAATAATTGGAGGGGATCTTACTCGACCAGTTGGCATGTCTCTACTTCACATTAGTGGGGATCTCACTTGGCTAATTGGCCAGTTGTCATGTATCTGCTTCACATTGGAGGGGATCTCACTTGGCCAATTGGCATGTCTATGCTTCACTTCATGTCAGCTCCTCAGAAACGAGCAACCAAGTTCTTATTGCCCAGGGATGGCCAAGCTCTCCAAAAACAGCTGATATAATGAAATATTCTTTCGTTCCTCCCACAAAG TTAAGGAGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CA765974             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCAAATTTATGCCACAAAATATAGTATTTATTGCTGAGATTGTAGGATTTATTTGTTATAAAATGTTCTTTTTTATCTTGTAATAAAATGTTACCAGCTTAACAGAAGAAAACTATCAGATTATGTTTTATAGGCTAAATGTTAAACTATTTTCGTTAGTATGGCATTTTTTTAATAATATTCTTAAGCCTAAACAAAAACTGGATTATATGTAAGCTATCTAATTATGAATGGCTTTGGTAAGTAATGTAGCATTCCTTCACTATTTATAATACCATCATTGAAGAGATGATCTTCTTTACGTTTTTTTTCTTTCATGTGCCCTTCACTACTAAAAAAGAATTGAAAGTACAACCCTGAATAATTGGAGGGGATCTTACTTGACCAGTTGGCATGTCTCTACTTCACATTAGTGGGGATCTCACTTGGCTAATTGGCCAGTTGTCATGTATCTGCTTCACATTGGAGGGGATCTCACTTGGCCAATTGGCATGTCTCTGCTTCACTTCATTTCAGCTCCTCAGAAACAAGCAACCAAGTTCTTATTGCCCAGGGATGGCCAAGCTCTCCAAAAACAACTGATATAATGAAATATTCTTTCGNTCCTCCCACAAAGCTTCA GAGCTGGACTATCGC  AAAAAAAAAAAAAAACTTCAAAGCTGGAGGGTGANGTTGCTGCCATGCCAAGCTGGAAATTTTCATTTTTGGAANATTCCTACTGGACCGGGTCCTGGTTTATNANACGGCCGGCCTTTTGTTTGGAANAGGATTGCCTTAATTAGGCCTTAGNAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CA761905             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTTTTTTTTTGCATTATTCATCCTGTCGAAATTCCTGCTGTACTATCCCTGTTGTCCAATTAGTCATAGATGTTTACAGAAGTTTGGACTGGACATACTATATTTTAAATTGAGATTTTATTTTCTATTAACATTGGATTGAATATTATAGAATTGGTACTCTTATGTCATAATGCATCTTCCTTCACTCTATTTACCAAAATAATCTTACTCTCCTTTTCGGAGGCCATTGGTGTAGTGCGCAAAGCGCGTGTTTGACTCTAGTATATAGTCAATAGCAACTCATACATATAGAGCTGTATTGATCGTGGAGATTCGATCTTCTTATGGAAGTAAAACAAATGTGCCCTTGATTGAAAGGACTCATGACTCATCAGTGTAAGAATGAACTGAAATACTAACAAAGTAGTAATCACAAGCCGCTCTTACCGAAGCTACACAAACTTGTTAGAGAAGGCCTACATAATCAGAAAAAAACATGCGACACAAAATATTAGGTTTTTGCAATAATAAGCAAGTATTACCGAACCATATGCAAAAGTATCTAGGCATCCAATAACTTCACCGTATTTCTTTGACCTCANATGCCCCTTGTCTCGTCC]




>consensus_9063#0
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GTATCTAGGCATCCAATAACTTCACCGTATTTCTTTGACCTCANATGCCCCTTGTCTCGT
CC
clustalw multiple alignements is not computed in this case