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Oryza sativa
cluster # 917 cluster # 917       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_917#0 length = 3584 sequences # 2  

consensusID : consensus_917#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 3584
fasta sequence
                              [AGCCCACCACACCACACCACTTCTCCCACCATCGATCCAACACCCCAACTGCTGCTACCACCTCCCCCATCTCCGGCGGCCTCGCTCGCTCGCGCCGTCGAGCGCCAGCTACCTCACCGCCGGCGGCAGCGGCTGTATAACTAGCTGCGGTGTGGTGCGCGCGGCGAGGTAGTGGTTGGTAGGTGGGTGGGCATATATATATACTTGCGAAGTGTACAATGAGGTGGCGGCGGGTCGGCGATGTCGTGGCCGTGGCGTTGTTGTTGGGCGCGGCGGCGCCGCCGCCGCCGGCCACCGTCCTCGTGACCAACGGCACCGTCTCCCCGCAGGCACCACCCTCCGCGGCCTCCTTCCTCGACTCCACCCCGGGCGCCTACACCACCGCCCGCGCCACCGCCGCCGGTGGCCTCCTCTGGTGGCCGCGCCACCTCCTCCGCCTCGCCGACTCCACCCGCCTCCTCGCCCGCTTCCACCCTCATCTCCTCGGCCTCGCCGCGCCGCCGTCCCGCAAGCCGTTCGAGGACTCGCTGAGAGGGATCGAGCCTCTCGTCAACCGCTCCGTGCGGGTCGCCCTCGACGAGATGCCCGGCGAGGACATGGCGCTCACGGCGTTGCTCAGGGCCTCTCCGGCCGAGGAGGAGTCGGAGCTGGAGGTGTGCGTGCACCTGGGGGCCTACGTGCCTCCGGTCTTCGGAGAGGCCGGGGCGAGGCTTGCCGTCGCTGGGAGGGGAAGGGACGCCGCTGCCGCCAAGTACGCGCCATGGGCCAGGATGAGGAAGAGCATGGAGAAGATGAGGCCTCCTGGGGTGACGGAGCTCTTGTTGACAAACGATGGAGACCATATTCTTGAAGGCAGCATCACTAACTTCTTCGTTGTCTGCCGCAGGGTTAGCCTCATGCTAGGATTCGGTTTTCTTGGAATTCAAACAAAGTTATTAGTCCCATGCTATTGGATATCGCCTACCGAAACAACCGAGAAATAAAATAGAGTAGAAGGTCAAACTAAAATAACAGTAGCAATTCGATCGGCAATCGGTATGATTATAATGCACAAGTGAAAGGAGGAGGAGCATCCATTGAATAAGCCTTTATCTGTTGAAATGACAGCTAATGAGTTTGAAGTGCAAACAGCTCCACTGGGTGATGGAATTCTCCCTGGTATTATGCGTCAGATAGTGATAGAGGTATGCCATGATATTGGAATCCCATTCCGGGAGGTTTCACCATCGTGGTCCAAACACAAACTTTGGGAAGAGGCCTTTGTTACAAGTAGCTTAAGGCTTATCCAGCATGTGGAGACTGTTCAAGCTCCTATATTGTGGGAGAACATAGAATCAAAAACCTGGGCCGATGTATCTTGGGAAGTAAAACAATTTCAGGGTGCTGGAAGTATTACCACACAGATAAAGAGGGAAATATCGAAGAGAGCAATACAAGAGGAATATGACATAAAAGATCTCTTGTGAGTTATGAATCCTGTGATTAGTTTAGGGTGATAGATGTGGCTTTACTATTAGTTCAGAGAAGACAATAATGTCTTTGCTGTTATTTTCTTTTCTTTGGCTATGGTGAACTTTGTACTCCATCCGATTGGAGTCTAATAGGCTAATAATCTATCAATTCAGCTGCTTAGTATTTTTTAGACAATGGTGATTATGGTTTTGTGTTTGTTGTGTTCTATATATTTTCTTGGCTATTTTGGGTGCTGGATCAGGTGTTGCATAACATGATGTATTCATCTATCTCCCATTTCATCCGCCTTTGCTCAAGAACTTTGTTTTTCCAGTTAATACATATTTTTATGATAATCCAAATTTTCATAATTGCACCGAAACCGGGAGTACATCAGTGCGTAGTAGTGTATTTCAGCTGATGTGCCATTTATGTTGCTGCTGCTTTGATTAAAAGGAATTAGGAATCTAGTGTATTGCCTGAAATTTTGCAGAGTTAGTTTTGTGGTCTCTTTTGTCAAGATTGTTTAGATTTGTTTTGTTCAGCTTGAGTTGCAAATAAACATGGAACCTCAGTTTGCAGTACTGCAGTGATAAGCCACAGGTGTGTGCGGTGATTTATTTTATGCTGCTGAGGCTTCTTGCCACGTGATGCTTTATCTTCTTTGCTGGCTGAAATAGTAGTGAGTTCCCTACTGGATAATATTTTCATGTTGTTTATTTTCCAAATGATTGTGTGGCATCTCAAATATATTTTTGTAGTTTAATTGCAGATATTTTTGCATCACATCATGGGCTGAAACTCTGCTGTTTATATTACCTCACTACTGGTGGGTCTGGTTGATAGTTGTTTGGTGGATAGGAGAGGAGAGTCCATACTTGCGTGTTGATGTCATTGGGAGCACTGCTGAGTCTTCTCTTCTCTGTTGTGTAAAATAGTATATTTTGCAGCTTCTTGAATTTTCAGGGAAGACAGTGAGATGAGATTCCTTGACTCTTGAGGCCTCTTGGACTGGTGACATGTGTATGCAGATTGCCAGTATGGGCCTGTTTAGTGCACGAAAAGAAAATTTTTGGGTGTCACATCGGACGTTTGACCGGATGTCGGAAGGGATTTTCGGACACGAATGAAAAAACTAATTTCATAACTCGCCTGGAAACCGCGAGATGAATCTTTTGAGCCTAATTAATCCGCTATTAGCACATGTGGGTTACTGGAGCACTTATGGCTAATCATGGACTAATTAGGCTCAAAAGATTCGTCTCGATATTTTCCCCCTAACTGTGCAATTAGTTTTTTAATTTATTATTATTTAATACTCCATGCATGTGTCCAAAGATTCAATGTGATGTTTTTGGGAAAAAGCTTTTGGGAATTAAACAGGGCCTAAATGTGTTTGGCAAGCAGGCAACTAATTCTGTTGTTGCCTCCTGGATTCAGAAAAAGGAAGATGAAATTCTATTGTTCCCTCCGCTACGAATCAATAACTTCTAGTATTTCTAACTGTAGTGGTTGCCACCCCTTCTTCCACAAGCTTTCAAATTCAAAACCTCCAAATGTGCTTTAGTCAGTGGGTCATGTAATTAGAAATCAATTTTGAATTTGAGGTGTTACAGCTTCCAAGTAAGACTTTAACACTATTTTCAAGGGAAATTTTGTTTTCAACTCATGGAATCTCACCTTTCACTTTTGATGATATGTAAGGTGAGGAGGTGGATAATGCCTAGTAGCAATATCA-T-G-CAAGGGGAAAGGAAAGGGGAAATATCATCTAGGTGATG-TTATGGTGAAAACTCTGGTTTATGG-ATGTGCCATGGAGAGCGTTCACTATTTTGTACGCCATCAGATGTATTCAACCTGTACATAACTGAGGTTTGGAAGG-CAAGGTGTTAAGGCAGTCAGAAAGATAGTTTCACTAAAGATGAGATAATCTCAGTATACACAAAGGTAAGCAGAAGGAAGCTCCACGGTTGCCCATTTTGCTGTTGCAATCCTACTATTACTGGTACTATATACGGCTATTTGGTTTCGGGAATCCATACTTTTATCTACTTTTTTCCAGACTATGCATGATCTATTTATGTACACGTCTAATCAGTACAGTTTGGTGAACTGTTATTTATGGAGGTAAAAAA]

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>consensus_917#0 AGCCCACCACACCACACCACTTCTCCCACCATCGATCCAACACCCCAACTGCTGCTACCA CCTCCCCCATCTCCGGCGGCCTCGCTCGCTCGCGCCGTCGAGCGCCAGCTACCTCACCGC CGGCGGCAGCGGCTGTATAACTAGCTGCGGTGTGGTGCGCGCGGCGAGGTAGTGGTTGGT AGGTGGGTGGGCATATATATATACTTGCGAAGTGTACAATGAGGTGGCGGCGGGTCGGCG ATGTCGTGGCCGTGGCGTTGTTGTTGGGCGCGGCGGCGCCGCCGCCGCCGGCCACCGTCC TCGTGACCAACGGCACCGTCTCCCCGCAGGCACCACCCTCCGCGGCCTCCTTCCTCGACT CCACCCCGGGCGCCTACACCACCGCCCGCGCCACCGCCGCCGGTGGCCTCCTCTGGTGGC CGCGCCACCTCCTCCGCCTCGCCGACTCCACCCGCCTCCTCGCCCGCTTCCACCCTCATC TCCTCGGCCTCGCCGCGCCGCCGTCCCGCAAGCCGTTCGAGGACTCGCTGAGAGGGATCG AGCCTCTCGTCAACCGCTCCGTGCGGGTCGCCCTCGACGAGATGCCCGGCGAGGACATGG CGCTCACGGCGTTGCTCAGGGCCTCTCCGGCCGAGGAGGAGTCGGAGCTGGAGGTGTGCG TGCACCTGGGGGCCTACGTGCCTCCGGTCTTCGGAGAGGCCGGGGCGAGGCTTGCCGTCG CTGGGAGGGGAAGGGACGCCGCTGCCGCCAAGTACGCGCCATGGGCCAGGATGAGGAAGA GCATGGAGAAGATGAGGCCTCCTGGGGTGACGGAGCTCTTGTTGACAAACGATGGAGACC ATATTCTTGAAGGCAGCATCACTAACTTCTTCGTTGTCTGCCGCAGGGTTAGCCTCATGC TAGGATTCGGTTTTCTTGGAATTCAAACAAAGTTATTAGTCCCATGCTATTGGATATCGC CTACCGAAACAACCGAGAAATAAAATAGAGTAGAAGGTCAAACTAAAATAACAGTAGCAA TTCGATCGGCAATCGGTATGATTATAATGCACAAGTGAAAGGAGGAGGAGCATCCATTGA ATAAGCCTTTATCTGTTGAAATGACAGCTAATGAGTTTGAAGTGCAAACAGCTCCACTGG GTGATGGAATTCTCCCTGGTATTATGCGTCAGATAGTGATAGAGGTATGCCATGATATTG GAATCCCATTCCGGGAGGTTTCACCATCGTGGTCCAAACACAAACTTTGGGAAGAGGCCT TTGTTACAAGTAGCTTAAGGCTTATCCAGCATGTGGAGACTGTTCAAGCTCCTATATTGT GGGAGAACATAGAATCAAAAACCTGGGCCGATGTATCTTGGGAAGTAAAACAATTTCAGG GTGCTGGAAGTATTACCACACAGATAAAGAGGGAAATATCGAAGAGAGCAATACAAGAGG AATATGACATAAAAGATCTCTTGTGAGTTATGAATCCTGTGATTAGTTTAGGGTGATAGA TGTGGCTTTACTATTAGTTCAGAGAAGACAATAATGTCTTTGCTGTTATTTTCTTTTCTT TGGCTATGGTGAACTTTGTACTCCATCCGATTGGAGTCTAATAGGCTAATAATCTATCAA TTCAGCTGCTTAGTATTTTTTAGACAATGGTGATTATGGTTTTGTGTTTGTTGTGTTCTA TATATTTTCTTGGCTATTTTGGGTGCTGGATCAGGTGTTGCATAACATGATGTATTCATC TATCTCCCATTTCATCCGCCTTTGCTCAAGAACTTTGTTTTTCCAGTTAATACATATTTT TATGATAATCCAAATTTTCATAATTGCACCGAAACCGGGAGTACATCAGTGCGTAGTAGT GTATTTCAGCTGATGTGCCATTTATGTTGCTGCTGCTTTGATTAAAAGGAATTAGGAATC TAGTGTATTGCCTGAAATTTTGCAGAGTTAGTTTTGTGGTCTCTTTTGTCAAGATTGTTT AGATTTGTTTTGTTCAGCTTGAGTTGCAAATAAACATGGAACCTCAGTTTGCAGTACTGC AGTGATAAGCCACAGGTGTGTGCGGTGATTTATTTTATGCTGCTGAGGCTTCTTGCCACG TGATGCTTTATCTTCTTTGCTGGCTGAAATAGTAGTGAGTTCCCTACTGGATAATATTTT CATGTTGTTTATTTTCCAAATGATTGTGTGGCATCTCAAATATATTTTTGTAGTTTAATT GCAGATATTTTTGCATCACATCATGGGCTGAAACTCTGCTGTTTATATTACCTCACTACT GGTGGGTCTGGTTGATAGTTGTTTGGTGGATAGGAGAGGAGAGTCCATACTTGCGTGTTG ATGTCATTGGGAGCACTGCTGAGTCTTCTCTTCTCTGTTGTGTAAAATAGTATATTTTGC AGCTTCTTGAATTTTCAGGGAAGACAGTGAGATGAGATTCCTTGACTCTTGAGGCCTCTT GGACTGGTGACATGTGTATGCAGATTGCCAGTATGGGCCTGTTTAGTGCACGAAAAGAAA ATTTTTGGGTGTCACATCGGACGTTTGACCGGATGTCGGAAGGGATTTTCGGACACGAAT GAAAAAACTAATTTCATAACTCGCCTGGAAACCGCGAGATGAATCTTTTGAGCCTAATTA ATCCGCTATTAGCACATGTGGGTTACTGGAGCACTTATGGCTAATCATGGACTAATTAGG CTCAAAAGATTCGTCTCGATATTTTCCCCCTAACTGTGCAATTAGTTTTTTAATTTATTA TTATTTAATACTCCATGCATGTGTCCAAAGATTCAATGTGATGTTTTTGGGAAAAAGCTT TTGGGAATTAAACAGGGCCTAAATGTGTTTGGCAAGCAGGCAACTAATTCTGTTGTTGCC TCCTGGATTCAGAAAAAGGAAGATGAAATTCTATTGTTCCCTCCGCTACGAATCAATAAC TTCTAGTATTTCTAACTGTAGTGGTTGCCACCCCTTCTTCCACAAGCTTTCAAATTCAAA ACCTCCAAATGTGCTTTAGTCAGTGGGTCATGTAATTAGAAATCAATTTTGAATTTGAGG TGTTACAGCTTCCAAGTAAGACTTTAACACTATTTTCAAGGGAAATTTTGTTTTCAACTC ATGGAATCTCACCTTTCACTTTTGATGATATGTAAGGTGAGGAGGTGGATAATGCCTAGT AGCAATATCATGCAAGGGGAAAGGAAAGGGGAAATATCATCTAGGTGATGTTATGGTGAA AACTCTGGTTTATGGATGTGCCATGGAGAGCGTTCACTATTTTGTACGCCATCAGATGTA TTCAACCTGTACATAACTGAGGTTTGGAAGGCAAGGTGTTAAGGCAGTCAGAAAGATAGT TTCACTAAAGATGAGATAATCTCAGTATACACAAAGGTAAGCAGAAGGAAGCTCCACGGT TGCCCATTTTGCTGTTGCAATCCTACTATTACTGGTACTATATACGGCTATTTGGTTTCG GGAATCCATACTTTTATCTACTTTTTTCCAGACTATGCATGATCTATTTATGTACACGTC TAATCAGTACAGTTTGGTGAACTGTTATTTATGGAGGTAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)