cluster # 9213

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Oryza sativa
cluster # 9213 cluster # 9213 Sequences # 6 consensus # 1
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consensus_9213#0 length = 2032 sequences # 6
consensusID : consensus_9213#0
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Sequences nbr = 6
consensus length = 2032
fasta sequence
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[+] EMBL AK065545             [TCCACCTCCAGATCCAGGCCGTTGTTCCCCAAGCCTTCCCCTTCCCACCTCGTCCCCCACGACCTCGCCTCCTCCTGGTGCTGCGCTCCGCACGGCCACACCCCCACCCCCGCCGCCGCCGCTGCCTCTTCCTCCCCGTCATCCCAATCCAGCTCCCCCGCCGCCGAAACGATGGATCCCCCGCCGCAGCCGCCCACCTCCTACCCGTCCAGCTACACCAAGTTCAACTCCGCGCTCAACGCCGGCCTCCTCAACCCAATGTCCCCGCCGCCGCTGCCGCTCGACAAGACGCGCTCCAGCCCAACCCTCTTCGACATGATGGCCAACGAGCAGGACTACCACCCGCGCACCGCCGCCGCCATCCACTCCATCCCGGCCCCGCCGCAGCAGGCGCACCCGCTGCAGCCCGCCCGCTCCATGGACAGGCAGGTGCTGCTCCAGGATCGCGTCGCCGAGCTCATCGGCAGCTGCAGCCCCGGGAACCAGTTCAACGACGCCGACTCCTCCGACGTCCGCCTCACCCTCACCTCCAAGGATGGCCTCTCCGTCACGCTCTGCGTGCACCGCCACATACTCGTCGCCCACAGCAGGTTCTTCGCCGCCAAGCTCTCCGACCGCTGGTCCAAGCAGCAGAGGACGTTGCCGCACATCGTTGAGATCTCCGACTGCGACGATGTCGAGGTCTACGTCGAGACGCTGCGGCTCATGTACTGCAAGGATCTCCGCCGGAGGCTCATGAGGGAGGATGTGAGCAAGGTCCTCGGCATTCTAAAGGTGTCCGCGGCCATTGTGTTCGACGCTGGGGTCCTGTCTTGCTTGGAGTATTTAGAGGCAGCTCCGTGGGCGGAGGATGACGATGAGAAGGTGGCGGCATTGTTGACACAGCTGCACCTCGAGAACTCGGGCGCTGGGGGGGTGCTTAAGAGGGTCTCACTGGAGTTGGCTCCCTCGGCAGTGGCTGAAGAGGTGGAGGTCGGCAGTGGTTGCAATGGTGGTGGCAATTCAGGTGGTGGGGAGGAGGTGTTAGTGAGGCTCCTGCAGGTCGTCCTGGAAGGGAAGGACGAGAAGGCAAGGAGGGAGATGAAGGGGCTGGTTTCCAAAATGCTCAGGGAGAACAGCACATCGCGTGGAGGAGCCATTGGAGGTGACCTCCGGAAGGAGTCACTGTATTCGGCGTGCAATGGCTGC TTGCGCCTGCTGCATGAACAATTTGAGATGGCTGCAGGGGGTGACCAATCTGAGGTAGCGCAGATTGCCAGGCAGGCTGACAACCTTCACTGGATGCTTGACATCCTTGTCGAACGCCAGATTGCCGAGGATTTCTTGAGGACGTGGGCAATGCAGATTGAGTTGGCAGAGTTGCATGGCAAGGTGCCAGCAATACACCGCTATGAAGTTAGCCGAGTGACGGCAAGACTCTTTGTTGGGGTTGGCAAGGGACAGATCTTGGTGTCCAAGGAGGTCCGTTGTCAACTCTTGAGTACTTGGTTAGAACCA TTCTATGAAGACTTTGGATGGATGAGGCGAGCCTGCAAGGGGCTTGACCGGCATTTGATTGAGGATGGACTGGCAAACA CCATCCTGACACTGCCGCTAGCAACTCAGCAGGAGATCTTGCTGGCATGGTTCAATCGGTTCCTGAACTCTGGGGAGGACTGCCCAAATATTCAGAGAGGATTC GAGGTATGGTGGCGGCGTGCCTTCTGGAAAAGAAACGGTGAACCCGAGCAACCACCTCGTTTGAGGATCACAGCAATCTGTGAGAATTCTTGATTACGTTGGTTCAGTTCTCGGATACAATGTGTGGCTGATGTTGTGATGTAAAGGTTAATGCTGTGTGATCTGTAGTTGTGATCTAACTGTCTTGTTGAGCTCTCTATTATTTCTGTTTGATTTAGGTGATTATACACGAGTATGTTCATCTTGTTCAATTATACCAGATCTGATGTACCTCTATGCTGGATCCATTTTGAATTGGAAATGAAGTAGGATGTTTTTTTTTCCCACCTAGTATAATCAGTGTTACCTGGAC]
[+] EMBL CB645739             [              CAGGCCGTTGTTCCCCAAGCCTTCCCCTTCCCACCTCGTCCCCCACGACCTCGCCTCCTCCTGGTGCTGCGCTCCGCACGGCCACACCCCCACCCCCGCCGCCGCCGCTGCCTCTTCCTCCCCGTCATCCCAATCCAGCTCCCCCGCCGCCGAAACGATGGATCCCCCGCCGCAGCCGCCCACCTCCTACCCGTCCAGCTACACCAAGTTCAACTCCGCGCTCAACGCCGGCCTCCTCAACCCAATGTCCCCGCCGCCGCTGCCGCTCGACAAGACGCGCTCCAGCCCAACCCTCTTCGACATGATGGCCAACGAGCAGGACTACCACCCGCGCACCGCCGCCGCCATCCACTCCATCCCGGCCCCGCCGCAGCAGGCGCACCCGCTGCAGCCCGCCCGCTCCATGGACAGGCAGGTGCTGCTCCAGGATCGCGTCGCCGAGCTCATCGGCAGCTGCAGCCCCGGGAACCAGTTCAACGACGCCGACTCCTCCGACGTCCGCCTCACCCTCACCTCCAAGGATGGCCTCTCCGTCACGCTCTGCGTGCACCGCCACATACTCGTCGCCCACAGCAGGTTCTTCGCCGCCAAGCTCTCCGACCGCTGGTCCAAGCAGCAGAGGACGTTGCCGCACATCGTTGAGATCTCCGACTGCGACGATGTCGAGGTCTACGTCGAGACGCTGCGGCTCATGTACTGCAAGGATCTCCGCCGGAGGCTCATGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CB637486             [               AGGCCGTTGTTCCCCAAGCCTTCCCCTTCCCACCTCGTCCCCCA GACCTCGCCTCCTCCTGGTGCTGCGCTCCGCACGGCCACACCCCCACCCCCGCCGCCGCCGCTGCCTCTTCCTCCCCGTCATCCCAATCCAGCTCCCCCGCCGCCGAAACGATGGATCCCCCGCCGCAGCCGCCCACCTCCTACCCGTCCAGCTACACCAAGTTCAACTCCGCGCTCAACGCCGGCCTCCTCAACCCAATGTCCCCGCCGCCGCTGCCGCTCGACAAGACGCGCTCCAGCCCAACCCTCTTCGACATGATGGCCAACGAGCAGGACTACCACCCGCGCACCGCCGCCGCCATCCACTCCATCCCGGCCCCGCCGCAGCAGGCGCACCCGCTGCAGCCCGCCCGCTCCATGGACAGGCAGGTGCTGCTCCAAGATCGCGTCGCCGAGCTCATCGGCAGCTGCAGCCCCGGGAACCAGTTCAACGACGCCGACTCCTCCGACGTCCGCCTCACCCTCACCTCCAAGGATGGCCTCTCCGTCACGCTCTGCGTGCACCGCCAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL OSS14706A            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGACACAGCTGCACCTCGAGAACTCGGGCGCTGGGGAGGTGCTTAAGAGGGTCTCACTGGAGTTGGCTCCCTCGGCAGTGGCTGAAGAGGTGGAGGTNGGCAGTGGTTGCAATGGTGGTGGCAATTCAGGTGGTGGGGAGGAGGTGTTAGTGAGGCTCCTGCAGGTCGTCCTGGAAGGGAAGGACGAGAAGGCAAGGAGGGAGATGAAGGGGCTGGTTTCCAAAATGCTCAGGGAGAACAGCACATCGCGTGGAGGAGCCATTGGAGGTTACCTCCGGAAGGAGTCACTGTATTCGGCGTGCAATGGCTGCTTTGCGCCTNCTGCATGAACAATTTGAGATGGCTGCAGGGGGTGACCAATCTGAGGTAGCGCAGATTGCCAGGCAGGCTGACAACCTTCACTGGATGCTTGACAT CTTGTNG ACGCCAGTTTNCCGA GATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CF330941             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAGAACCATTTCTATGAAGACTTTGGATGGATGAGGCGAGCCTGCAAGGGGCTTGACCGGCATTTGATTGAGGATGGACTGGCAAACACCCATCCTGACACTGCCGCTAGCAACTCAGCAGGAGATCTTGCTGGCATGGTTCAATCGGTTCCTGAACTCTGGGGAGGACTGCCCAAATATTCAGAGAGGATTC GAGGTATGGTGGCGGCGTGCCTTCTGGAAAAGAAACGGTGAACCCGAGCAACCACCTCGTTTGAGGATCACAGCAATCTGTGAGAATTCTTGATTACGTTGGTTCAGTTCTCGGATACAATGTGTGGCTGATGTTGTGATGTAAAGGTTAATGCTGTGTGATCTGTAGTTGTGATCTAACTGTCTTGTTGTGCTCTCTATTATTTCTGTTTGATTTAGGTGATTATACACGAGTATGTTCATCTTGTTCAATTATACCAGATCTGATGTACCTCTAAAAAAAA                                                                     ]
[+] EMBL CF330942             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACCTTGGATGGATGAGGCGAGCCTGCAAGGGGCTTGACCGGCATTTGATTGAGGATGGACTGGCAAACA CCATCCTGACACTGCCGCTAGCAACTCAGCAGGAGATCTTGCTGGCATGGTTCAATCGGTTTCTGAACTCTGGGGAGGACTGCCCAAATATTCAGAGAGGATTCTTAGGTATGGTGGCGGCGTGCCTTCTGGAAAAGAAACGGTGAACCCGAGCAACCACCTCGTTTGAGGATCACAGCAATCTGTGAGAATTCTTGATTACGTTGGTTCAGTTCTCGGATACAATGTGTGGCTGATGTTGTGATGTAAAGGTTAATGCTGTGTGATCTGTAGTTGTGATCTAACTGTCTTGTTGTGCTCTCTATTATTTCTGTTTGATTTAGGTGATTATACACGAGTATGTTCATCTTGTTCAATTATACCAGATCTGATGTACCTCTAAAAAAA                                                                      ]




>consensus_9213#0
TCCACCTCCAGATCCAGGCCGTTGTTCCCCAAGCCTTCCCCTTCCCACCTCGTCCCCCAC
GACCTCGCCTCCTCCTGGTGCTGCGCTCCGCACGGCCACACCCCCACCCCCGCCGCCGCC
GCTGCCTCTTCCTCCCCGTCATCCCAATCCAGCTCCCCCGCCGCCGAAACGATGGATCCC
CCGCCGCAGCCGCCCACCTCCTACCCGTCCAGCTACACCAAGTTCAACTCCGCGCTCAAC
GCCGGCCTCCTCAACCCAATGTCCCCGCCGCCGCTGCCGCTCGACAAGACGCGCTCCAGC
CCAACCCTCTTCGACATGATGGCCAACGAGCAGGACTACCACCCGCGCACCGCCGCCGCC
ATCCACTCCATCCCGGCCCCGCCGCAGCAGGCGCACCCGCTGCAGCCCGCCCGCTCCATG
GACAGGCAGGTGCTGCTCCAGGATCGCGTCGCCGAGCTCATCGGCAGCTGCAGCCCCGGG
AACCAGTTCAACGACGCCGACTCCTCCGACGTCCGCCTCACCCTCACCTCCAAGGATGGC
CTCTCCGTCACGCTCTGCGTGCACCGCCACATACTCGTCGCCCACAGCAGGTTCTTCGCC
GCCAAGCTCTCCGACCGCTGGTCCAAGCAGCAGAGGACGTTGCCGCACATCGTTGAGATC
TCCGACTGCGACGATGTCGAGGTCTACGTCGAGACGCTGCGGCTCATGTACTGCAAGGAT
CTCCGCCGGAGGCTCATGAGGGAGGATGTGAGCAAGGTCCTCGGCATTCTAAAGGTGTCC
GCGGCCATTGTGTTCGACGCTGGGGTCCTGTCTTGCTTGGAGTATTTAGAGGCAGCTCCG
TGGGCGGAGGATGACGATGAGAAGGTGGCGGCATTGTTGACACAGCTGCACCTCGAGAAC
TCGGGCGCTGGGGGGGTGCTTAAGAGGGTCTCACTGGAGTTGGCTCCCTCGGCAGTGGCT
GAAGAGGTGGAGGTCGGCAGTGGTTGCAATGGTGGTGGCAATTCAGGTGGTGGGGAGGAG
GTGTTAGTGAGGCTCCTGCAGGTCGTCCTGGAAGGGAAGGACGAGAAGGCAAGGAGGGAG
ATGAAGGGGCTGGTTTCCAAAATGCTCAGGGAGAACAGCACATCGCGTGGAGGAGCCATT
GGAGGTGACCTCCGGAAGGAGTCACTGTATTCGGCGTGCAATGGCTGCTTGCGCCTGCTG
CATGAACAATTTGAGATGGCTGCAGGGGGTGACCAATCTGAGGTAGCGCAGATTGCCAGG
CAGGCTGACAACCTTCACTGGATGCTTGACATCCTTGTCGAACGCCAGATTGCCGAGGAT
TTCTTGAGGACGTGGGCAATGCAGATTGAGTTGGCAGAGTTGCATGGCAAGGTGCCAGCA
ATACACCGCTATGAAGTTAGCCGAGTGACGGCAAGACTCTTTGTTGGGGTTGGCAAGGGA
CAGATCTTGGTGTCCAAGGAGGTCCGTTGTCAACTCTTGAGTACTTGGTTAGAACCATTC
TATGAAGACTTTGGATGGATGAGGCGAGCCTGCAAGGGGCTTGACCGGCATTTGATTGAG
GATGGACTGGCAAACACCATCCTGACACTGCCGCTAGCAACTCAGCAGGAGATCTTGCTG
GCATGGTTCAATCGGTTCCTGAACTCTGGGGAGGACTGCCCAAATATTCAGAGAGGATTC
GAGGTATGGTGGCGGCGTGCCTTCTGGAAAAGAAACGGTGAACCCGAGCAACCACCTCGT
TTGAGGATCACAGCAATCTGTGAGAATTCTTGATTACGTTGGTTCAGTTCTCGGATACAA
TGTGTGGCTGATGTTGTGATGTAAAGGTTAATGCTGTGTGATCTGTAGTTGTGATCTAAC
TGTCTTGTTGTGCTCTCTATTATTTCTGTTTGATTTAGGTGATTATACACGAGTATGTTC
ATCTTGTTCAATTATACCAGATCTGATGTACCTCTAAAAAAAATCCATTTTGAATTGGAA
ATGAAGTAGGATGTTTTTTTTTCCCACCTAGTATAATCAGTGTTACCTGGAC
clustalw multiple alignements is not computed in this case