cluster # 9245

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Oryza sativa
cluster # 9245 cluster # 9245 Sequences # 6 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9245#0 length = 667 sequences # 6
consensusID : consensus_9245#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 667
fasta sequence
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[+] EMBL CF339335             [CAGCACTTAAGTCTTAATACTGGCCTGGCAATTCTTTCGCCTGGTGCATTTGAAGTTCACTCTGACGGAATAGATGTGGATAACGAATTGTTTCACTATCCTATTAAAAAAGCATATACCCCATATAATATACACACTTACAAGACAGAGGAAGTTGTAAACCAGATGAATATAAAAGTTAAAAACATGACCTTAGATGAAATAAACAATACTTACTGTAATAACGATTATTACAATCAGGCAATAAGAGAGGAACCGATAGACCTTCTGGACAGATCGTTTTCCTCCAGTTCATGGCCTTTTTAGTGAATAAATCATCACTAATTCTATAAGTGTCTGGTCTTGTTGATAATATAGTTAATATGTAACCCTTTAGATTCACGATCTGAAGGGTTGAAACATGACATACGTTCAAAGATTAACCCCGTTTGAAGGTTAGCTTGTTAGTTACATTTAGTAACACATATCTGGCTACTTAATCCCCATTCTGCCCCCGCGGTTACGCTTTCTTATCTATTCTTTCAATCAGCACTTCACCCAATTCATCCTTAATTCTAATAACTGGCTATTGCGCCTTACCTCGTGTTTTGTCTTTTTTTCATTACCAATGTGTGCATGTGAGGAACAATATGGCACTGCAAAATGAGAAAAATAGTCGTTATCTTTT]
[+] EMBL CF339100             [CAGCACTTAA GCTT TTACTGGCCTGGCAATTCTTTCGCCTGGTGCATTTGAAGTTCACTCTGACGGAATAGATGTGGATAACGAATTGTTTCACTATCCTATTAAAAAAGCATATACCCCATATAATATACACACTTACAAGACAGAGGAAGTTGTAAACCAGATGAATATAAAAGTTAAAAACATGACCTTAGATGAAATAAACAATACTTACTGTAATAACGATTATTACAATCAGGCAATAAGAGAGGAACCGATAGACCTTCTGGACAGATCGTTTTCCTCCAGTTCATGGCCTTTTTAGTGAATAAATCATCACTAATTCTATAAGTGTCTGGTCTTGTTGATAATATAGTTAATATGTAACCCTTTAGATTCACGATCTGAAGGGTTGAAACATGACATACGTTCAAAGATTAACCCCGTTTGAAGGTTAGCTTGTTAGTTACATTTAGTAACACATATCTGGCTACTTAATCCCCATTCTGCCCCCGCGGTTACGCTTTCTTATCTATTCTTTCAATCAGCACTTCACCCAATTCATCCTTAATTCTAATAACTGGCTATTGCGCCTTACCTCGTGTTTTGTCTTTTTTTCATTACCAATGTGTGCATGTGAGGAACAA                                       ]
[+] EMBL CF340005             [           GCTTAATACTGGCCTGGCAATTCTTTCGCCTGGTGCATTTGAAGTTCACTCTGACGGAATAGATGTGGATAACGAATTGTTTCACTATCCTATTAAAAAAGCATATACCCCATATAATATACACACTTACAAGACAGAGGAAGTTGTAAACCAGATGAATATAAAAGTTAAAAACATGACCTTAGATGAAATAAACAATACTTACTGTAATAACGATTATTACAATCAGGCAATAAGAGAGGAACCGATAGACCTTCTGGACAGATCGTTTTCCTCCAGTTCATGGCCTTTTTAGTGAATAAATCATCACTAATTCTATAAGTGTCTGGTCTTGTTGATAATATAGTTAATATGTAACCCTTTAGATTCACGATCTGAAGGGTTGAAACATGACATACGTTCAAAGATTAACCCCGTTTGAAGGTTAGCTTGTTAGTTACATTTAGTAACACATATCTGGCTACTTAATCCCCATTCTGCCCCCGCGGTTACGCTTTCTTATCTATTCTTTCAATCAGCACTTCACCCAATTCATCCTTAATTCTAATAACTGGCTATTGCGCCTTACCTCGTGTTTTGTCTTTTTTTCATTACCAATGTGTGCATGTGAGGAACAATATGGCACT                              ]
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[+] EMBL CF338251             [           GCTTAATACTGGCCTGGCAATTCTTTCGCCTGGTGCATTTGAAGTTCACTCTGACGGAATAGATGTGGATAACGAATTGTTTCACTATCCTATTAAAAAAGCATATACCCCATATAATATACACACTTACAAGACAGAGGAAGTTGTAAACCAGATGAATATAAAAGTTAAAAACATGACCTTAGATGAAATAAACAATACTTACTGTAATAACGATTATTACAATCAGGCAATAAGAGAGGAACCGATAGACCTTCTGGACAGATCGTTTTCCTCCAGTTCATGGCCTTTTTAGTGAATAAATCATCACTAATTCTATAAGTGTCTGGTCTTGTTGATAATATAGTTAATATGTAACCCTTTAGATTCACGATCTGAAGGGTTGAAACATGACATACGTTCAAAGATTAACCCCGTTTGAAGGTTAGCTTGTTAGTTACATTTAGTAACACATATCTGGCTACTTAA                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CF339662             [           GCTTAATACTGGCCTGGCAATTCTTTCGCCTGGTGCATTTGAAGTTCACTCTGACGGAATAGATGTGGATAACGAATTGTTTCACTATCCTATTAAAAAAGCATATACCCCATATAATATACACACTTACAAGACAGAGGAAGTTGTAAACCAGATGAATATAAAAGTTAAAAACATGACCTTAGATGAAATAAACAATACTTACTGTAATAACGATTATTACAATCAGGCAATAAGAGAGGAACCGATAGACCTTCTGGACAGATCGTTTTCCTCCAGTTCATGGCCTTTTTAGTGAATAAATCATCACTAATTCTATAAGTGTCTGGTCTTGTTGATAATATAGTTAATATGTAACCCTTTAGATTCACGATCTGAAGGGTTGAA                                                                                                                                                                                                                                                                             ]




>consensus_9245#0
CAGCACTTAAGGCTTAATACTGGCCTGGCAATTCTTTCGCCTGGTGCATTTGAAGTTCAC
TCTGACGGAATAGATGTGGATAACGAATTGTTTCACTATCCTATTAAAAAAGCATATACC
CCATATAATATACACACTTACAAGACAGAGGAAGTTGTAAACCAGATGAATATAAAAGTT
AAAAACATGACCTTAGATGAAATAAACAATACTTACTGTAATAACGATTATTACAATCAG
GCAATAAGAGAGGAACCGATAGACCTTCTGGACAGATCGTTTTCCTCCAGTTCATGGCCT
TTTTAGTGAATAAATCATCACTAATTCTATAAGTGTCTGGTCTTGTTGATAATATAGTTA
ATATGTAACCCTTTAGATTCACGATCTGAAGGGTTGAAACATGACATACGTTCAAAGATT
AACCCCGTTTGAAGGTTAGCTTGTTAGTTACATTTAGTAACACATATCTGGCTACTTAAT
CCCCATTCTGCCCCCGCGGTTACGCTTTCTTATCTATTCTTTCAATCAGCACTTCACCCA
ATTCATCCTTAATTCTAATAACTGGCTATTGCGCCTTACCTCGTGTTTTGTCTTTTTTTC
ATTACCAATGTGTGCATGTGAGGAACAATATGGCACTGCAAAATGAGAAAAATAGTCGTT
ATCTTTT
clustalw multiple alignements is not computed in this case