These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9304#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 3127 fasta sequence [GAGATACGTGGCTATGAGGAAGGTTCAAGATTCTTGATTGTATTTCGTTTGGGGCCATCAGATGGACCAATCAGGATTGAGAACCGGACAAGTAGTACAACTATCAGTGCTCGACAGTCTGGTTTGGGAGAGGATTCTTGGATACAAGTGAAACCACTTTCAACCAAAAAATATTCTTGGGATGACCCATATGGACATACAACTTTTGATGTTAGCATCCAGCAAGGAGATGTTACTTTCTTTCAGTGTGTTGACCTGGAAAACCCTGATGAATGTTCCGCTGGTTTTAGAGAACATCACCTCAAGCTCAGTATAGTTGAGACTGCTGATGTTAAGATTTTGAAGTTTGCTGATTACCCAAGAAGACAAGAGGGAGGGTACAGATCTGATCTGGGTGATCACCAAGCCTCGCCAGTTATGCAAAATGATACAGATACAGGTGCTGGACTATTGGAACTTATTGTTGAACTTGGAGTTGTTGGAGTCTCTTTGATTGATCATAAACCGAGAGAGCTTTTGTACTTACATCTGCAGAAGCTTTTTATTTCATACATGACTGGTTACAATTCTGGTACCACTAGCAGGTTTAAGTTAATTATTGGCCATATGCAACTAGATAATCAGTTGCCATTGTCTATAATGCCTGTTGCTTTGGCAACTGAGAGCATGCCTGACTCAAACCATCCTGTATTTAAAGCAAACATCGCCGTAAGCAATGTAACTTCAAATGGTATTCAAGTCTATCCACATGTCTATATCCGGGTAACTGATCAAACATGGAGGTTGAATATTCATGAACCTATTATTTGGGCATTGGTTGATTTCTACAGCAATCTTCGTTTTGTCAGCACCAACAACATCTCAACTGTAACAGAAGTGGATCCTGAGATACGAATAGAGCTTGTTGATATATCGGAGATAAGGTTGAAAATATCTCTGGAAACTGCGCCTACTCAAAGACCACGTGGTGTCCTTGGCATATGGAGCCCTGTCCTATCAGCTGTAGGCAATGCACTTAAGATTCAGGTGCATCTGCGTAAGGTCATGCACAGAAGTCGTTACATGCGGAAGAGTTCCATCATTCCCGCAATCACGAACCGAATCAAGAGAGATCTGATCCACAATCCTCTGCACCTAATATTTTCAGTAGATTTTCTTGGAGTGACAAAATCAACTTTGTCATCACTTAGTAAAGGGTTTGCAGAGCTCTCTACTGATGGGCAATTTCTTCAGCTGAGATCAAAGCAGGTTTGGTCAAGGAGAATAACTGGTGTTGGTGATGGACTAGTTCAAGGGACTGAAGCATTTGCTCAGGGTTTGGCTTTTGGGGTTTCTGGTGTTCTAAGAAAGCCAGTCGAGAGTGCCCGACAGTATGGTGCAATTGGCATTGCACATGGTCTTGGCCGTGCTTTTGTGGGGTTTATTGTCCAACCCTTAAGTGGGGCCTTTGATTTCTTCTCATTGACAGTTGATGGAATTAGTGCCAGCTTTATGAGATGCGTGGATATTCTGAATAATAAACATGTCCCTCAGAGGATTAGAGATCCTCGTGCTATACACCGAGATGGTATAATAAGAGAGTACGACAAAGTACAAGCTGCGGGCCAGATGGCCCTTTACCTAGCAGAGGCTAGCAGATATTTTGCATGCACAGATTTATTTCGGGAACCTTCAAAGTATGCATGGTCAGATTACTATGAAGATCATTTTATCGTACAAAATCAGAAGGTTGCTTTGGTAACAAACAAACGAGTGATACTGCTTCAGTGCGTGGATCTAGATAAAATGGATAAGAAGCCTTCGAAAATACTTTGGGACGTTCCTTGGGAAGATGTGCTTGCATTGGAGCTGGCAAAAGCTGGGTATCAAAGGCCTTCTCACGTAATCATACATCTGAAGAATTTTAGGAGATCTGAAAACTTTGTAAGGCTTATAAAGTGCAACGTTGATGAGGAGCATGAACCTCAGGCTCTTCTACTTTGTTCTTCAATTCGAAAGATGTGGAGATCTCACCAGGCAGATATGAAAGTTGTACCCTTGAAGGTTCCTGGGGGCCAGCACGATGTATATTTCGCATTTGATGAAGATATGAGGGAGTTCCACAGTTTTGCTAGGCCTTTGCTAAGCCCAAGGGGAGCAGCAAGTAATGTTGAGGAGCGACTCATTAACGATACAGTTAACTTCCAGAACATGTGGAGCAGTGAACAAG-AAATTCGAAGCAGATGCAAACTACTTTCAAAGCAGGTTGCAGATGATGGAAGGGTGTTTAGTATCTGGAGGCCTCTCTGCCCTAGTGGGTATGTCTCAATCGGAGATATTGCTCATGTTGGCATTCATCCACCACATGTTGC-TGCTGTCTACAAAAATG-TGGGTGGAAATTTCGCTCTGCCACTTGGCTATGACCTGGTTTGG-AGAAACTGTGGTGAGGATTACAGGAATCCTGTATCAATATGGTTTCCACGGCCACCTGAAGGATACGTAGCTCTCGGATGCGTGGCTGTATCTGCTTTTGAGGAGCCCCCTCTCGACTCTGCCTTCTGTGTTAGTGAGAGATTTGCGGAAGATGCAGTATACGAGGAGCAAATTGTATGGGCTTCGTCAGATGCCTACCCATGGGGATGCTATGTTTACCAAGTTCAGAGCAAGTCACTGCAATTCATGGCGATGCGGCGGCCAAAAGAAGAGTGTGAGCTAAAACCTAAGAAGGTATCAGAGTCTTATGCCCAGCAAGCAT-TGGAGAGGTCCTGAGATGAGAGGCAAACATGCCATGCATTAGTGTAGACACTAGACACATGTAAAGTGATGTA-CATAACATAGGTGGGTATACATGCGTGTAAGAAAGGAGTCAGGAGCAGGACAGATCCAGCATTTTCGTGCAAGATGTGTCCGAAATGAGAGTTTCAGGTTTACATTTGCTCCCATTTGTAATCCATCATTCTGCTTCTACCTTTGTCAGACCCTTGGGGTCAAAGCTTGTACGTCGAGCACTTGTACCAAACAATCCGTCTGCTTGTCAACCAGCAGAAAAGGGGTTGTAAATTTTGTACATGTAAAATCGGTTGTACTTTTATTCAGCACTAAATAAAAAGCATGTAAGCGGTTGGGGGCAGAAAAAAAAAGAAAAAAA] 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AGAAACTGTGGTGAGGATTACAGGAATCCTGTATCAATATGGTTTCCACGGCCACCTGAAGGATACGTAGCTCTCGGATGCGTGGCTGTATCTGCTTTTGAGGAGCCCCCTCTCGACTCTGCCTTCTGTGTTAGTGAGAGATTTGCGGAAGATGCAGTATACGAGGAGCAAATTGTATGGGCTTCGTCAGATGCCTACCCATGGGGATGCTATGTTTACCAAGTTCAGAGCAAGTCACTGCAATTCATGGCGATGCGGCGGCCAAAAGAAGAGTGTGAGCTAAAACCTAAGAAGGTATCAGAGTCTTATGCCCAGCAAGCATNTGGAGAGGTCCTGAGATGAGAGGCAAACATGCCATGCATTAGTGTAGACACTAGACACATGTAAAGTGATGTACCATAACATAGGT ] [-] EMBL CB620560 [ CGTGGCTGTATCTGCTTTTGAGGAGCCCCCTCTCGACTCTGCCTTCTGTGTTAGTGAGAGATTTGCGGAAGATGCAGTATACGAGGAGCAAATTGTATGGGCTTCGTCAGATGCCTACCCATGGGGATGCTATGTTTACCAAGTTCAGAGCAAGTCACTGCAATTCATGGGGATGCGGCGGCCAAAAGAAGAGTGTGAGCTAAAACCTAAGAAGGTATCAGAGTCTTATGCCCAGCAAGCAT TGGAGAGGTCCTGAGATGAGAGGCAAACATGCCATGCATTAGTGTAGACACTAGACACATGTAAAGTGATGTA CATAACATAGGTGGGTATACATGCGTGTAAGAAAGGAGTCAGGAGCAGGACAGATCCAGCATTTTCGTGCAAGATGTGTCCGAAATGAGAGTTTCAGGTTTACATTTGCTCCCATTTGTAATCCATCATTCTGCTTCTACCTTTGTCAGACCCTTGGGGTCAAAGCTTGTACGTGGAGCACTTGTACCAAACAATCCGTCTGCTTGTCAACCAGCAGAAAAGGGGTGGTAAATTTTGTACATGTAAAATCGGTTGT CTTTTATTCAGCACTAAATAAAAAGCATGTAAGCGGTTGGGGGCAGAAAAAAAAAGA ] [-] EMBL CF308143 [ CCATGCATTAGTGTAGCCACTAGACACATGTAAAGTGATGTA CATAACATAGGTGGGTATACATGCGTGTAAAAAAGGAGTCAGGACCAGGACAGATCCAGCATTTTCGTGCAAAATGTGTCCGAAATGAGAGTTTCAGGTTTACATTTGCTCCCATTTGTAATCCATCATTCGGCTTCTCCCTTTGTCAGACCCTTGGGGTCAAAGTTTGTACGTCGAGCACTTGTACCAAACAATCCGTTTGTTTGTCAACCAGCAAAAAAGGGGTTGTAAATTTTGTACATGTAAAATCGGTTGTACTTTTATTCAGCATTAAATAAAAAGCATGTAAGCGGTTGGGCGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||