cluster # 9355

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 9355 cluster # 9355 Sequences # 6 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9355#0 length = 1693 sequences # 6
consensusID : consensus_9355#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1693
fasta sequence
                              [TCCCTCTCTCGGCTCTCGCGCTCGCTTTCTGTCTGTCTCTGCTCTCGCTCCGCCGCCCCGCCTCCTCCGTTCGCCGAGCGCCCGCCGCGTCGCCGGCCGCCACACGGCCAACCTCTTCCTTCCTCGCCGCCCCCTCGCGCTTCCAGTTCCTCCTCCTCCTCCGTTTCTAACTAGCGAGGATTAGGGTTAGCCCTACTACCTTCGCGCTCTTCCCCCAACCCCCGCTTCGCTTCTTCCTCGTCTCGGTCGCAGCACGACGTCCGCTTCAGTGAGGGAAGGGGAGGGAGAGGGATGGATGTGCTGAGGAAGCAGGCGAGCAAGTTCAAGGAGCAGGTCGCCAAGCAGCAGCAGGCTGTGATAAAGCAGTTCAGTACTACGGGCTATGAACATTCAGACGCTGTTGTAATTGATGAAGTTGAATTACAGAGACATCAACAGCTTGAGAAATTGTACACTTCTACTCGTTCTGGAAGGGATTTCCAAAAGGACATTGTTCGAGCGGCTGAAGGTTTGGTTTCTATTGGAATCAGGCATGTTGAAGTGGGAACAAAATTTTCAGAGGATTGTTATAGATATGGAGGTGAAAGTAGTGCTAGTGATGAAGCCCTTGCAAAAGCAGCATCTCTGTATGGAGGTGCTCTAAGAAATGTTGAGAAAGAGTACGAAGAATTTAATAGAATTTTATCTTCTCAGACTATAGATCCATTGAGGGCTATGGCTGCAGGCGCTCCCCTGGAAGATGCTCGTGGTCTTGCACAACGTTATAGCCGGATG-AGACAT-GAAGCTGAGATCCTTTCTGCTGAAATTGCT-AGAAGGAAGCAACGGGTACGAGAAGCTCCACTTGCTGAGCACACTACGAAGCTTCAACAGTCTGAATCTAAAATGATAGAGCACAAAGCAAGCATGGCTGTGTTAGGAAAGGAAGCTGCTGCTGCACTTGCCGCTGTTGAATCTCAGCAGCAAAGGATAACTCTTCAGCGCCTGGTTGGCATGGTAGAAGCAGAAAAGTTATTTCATTTGAGGTTAGCTGCTATACTTGATGATGTTGAAGCTGAGATGTCCTCTGAAAAGCAAAAGAGAGAATCTGCACCGCCTACTATTCATTCCCATAAGCGTGCTGAGAAGGCCCAGTACTTCCTTGCTGAGGCGGTGCATAACTTCAATGGTACCACAGAAAAGGAGTTGAGTTTAATTGTTGGTGATTATGTCGTTGTTCGTCAGATTGCTCCGAATGGTTGGGCCGAAGGAGAATGCAAGGGGGTGGCAGGATGGTTCCCGGCTGCCTACGTGGAGAGGCGTGAAAATATCCCGCCAAACAAAGTCTTCCCGCAAGCATAAACCGCCAAATGCTAGTTGAAAATCTAGATTTGCGCTGCTAAAATCTGTAATTTGGTTTGGGACTGCCATGATTTTTGGTCCTTTTGGAGTTGTTTAGGCCGTATGACTGGTATGTTCTTTGTTCTACCTTGTACATGTTTTAGTAACTTGTGATCAGTATACATGTTTTCCTGGCAGCAGATTAGACAGTAGACTAAAAGCTTTGGCCATTCATGATGATGCCTTTCGAAT-GTAAAGTTATTTATGTA-CCAAATTC-TTTCGCTAATGATGTGCTT-ATTGATTGATGATTCCCTTCNGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAANAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK073874             [TCCCTCTCTCGGCTCTCGCGCTCGCTTTCTGTCTGTCTCTGCTCTCGCTCCGCCGCCCCGCCTCCTCCGTTCGCCGAGCGCCCGCCGCGTCGCCGGCCGCCACACGGCCAACCTCTTCCTTCCTCGCCGCCCCCTCGCGCTTCCAGTTCCTCCTCCTCCTCCGTTTCTAACTAGCGAGGATTAGGGTTAGCCCTACTACCTTCGCGCTCTTCCCCCAACCCCCGCTTCGCTTCTTCCTCGTCTCGGTCGCAGCACGACGTCCGCTTCAGTGAGGGAAGGGGAGGGAGAGGGATGGATGTGCTGAGGAAGCAGGCGAGCAAGTTCAAGGAGCAGGTCGCCAAGCAGCAGCAGGCTGTGATAAAGCAGTTCAGTACTACGGGCTATGAACATTCAGACGCTGTTGTAATTGATGAAGTTGAATTACAGAGACATCAACAGCTTGAGAAATTGTACACTTCTACTCGTTCTGGAAGGGATTTCCAAAAGGACATTGTTCGAGCGGCTGAAGGTTTGGTTTCTATTGGAATCAGGCATGTTGAAGTGGGAACAAAATTTTCAGAGGATTGTTATAGATATGGAGGTGAAAGTAGTGCTAGTGATGAAGCCCTTGCAAAAGCAGCATCTCTGTATGGAGGTGCTCTAAGAAATGTTGAGAAAGAGTACGAAGAATTTAATAGAATTTTATCTTCTCAGACTATAGATCCATTGAGGGCTATGGCTGCAGGCGCTCCCCTGGAAGATGCTCGTGGTCTTGCACAACGTTATAGCCGGATG AGACAT GAAGCTGAGATCCTTTCTGCTGAAATTGCT AGAAGGAAGCAACGGGTACGAGAAGCTCCACTTGCTGAGCACACTACGAAGCTTCAACAGTCTGAATCTAAAATGATAGAGCACAAAGCAAGCATGGCTGTGTTAGGAAAGGAAGCTGCTGCTGCACTTGCCGCTGTTGAATCTCAGCAGCAAAGGATAACTCTTCAGCGCCTGGTTGGCATGGTAGAAGCAGAAAAGTTATTTCATTTGAGGTTAGCTGCTATACTTGATGATGTTGAAGCTGAGATGTCCTCTGAAAAGCAAAAGAGAGAATCTGCACCGCCTACTATTCATTCCCATAAGCGTGCTGAGAAGGCCCAGTACTTCCTTGCTGAGGCGGTGCATAACTTCAATGGTACCACAGAAAAGGAGTTGAGTTTAATTGTTGGTGATTATGTCGTTGTTCGTCAGATTGCTCCGAATGGTTGGGCCGAAGGAGAATGCAAGGGGGTGGCAGGATGGTTCCCGGCTGCCTACGTGGAGAGGCGTGAAAATATCCCGCCAAACAAAGTCTTCCCGCAAGCATAAACCGCCAAATGCTAGTTGAAAATCTAGATTTGCGCTGCTAAAATCTGTAATTTGGTTTGGGACTGCCATGATTTTTGGTCCTTTTGGAGTTGTTTAGGCCGTATGACTGGTATGTTCTTTGTTCTACCTTGTACATGTTTTAGTAACTTGTGATCAGTATACATGTTTTCCTGGCAGCAGATTAGACAGTAGACTAAAAGCTTTGGCCATTCATGATGATGCCTTTCGAAT GTAAAGTTATTTATGTA CCAAATTC TTTCGCTAATGATGTGCTT ATTGAT                                                                          ]
[+] EMBL AU065704             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAGTGGGAACAAAATTTTCAGAGGATTGTTATAGATATGGAGGTGAAAGTAGTGCTAGTGATGAAGCCCTTGCAAAAGCAGCATCTCTGTATGGAGGTGCTCTAAGAAATGTTGAGAAAGAGTACGAAGAATTTAATAGAATTTTATCTTCTCAGACTATAGATCCATTGAGGGCTATGGCTGCAGGCGCTCCCCNGGAAGATGCTCGTGGTCTTGCACAACGTTATAGCCGGATGAAGACATGGAANCTGAGATNCCTTCTGCTGGAATTGCTNAGAgg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AK063908             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTGAAAAGCAAAAGAGAGAATCTGCACCGCCTACTATTCATTCCCATAAGCGTGCTGAGAAGGCCCAGTACTTCCTTGCTGAGGCGGTGCATAACTTCAATGGTACCACAGAAAAGGAGTTGAGTTTAATTGTTGGTGATTATGTCGTTGTTCGTCAGATTGCTCCGAATGGTTGGGCCGAAGGAGAATGCAAGGGGGTGGCAGGATGGTTCCCGGCTGCCTACGTGGAGAGGCGTGAAAATATCCCGCCAAACAAAGTCTTCCCGCAAGCATAAACCGCCAAATGCTAGTTGAAAATCTAGATTTGCGCTGCTAAAATCTGTAATTTGGTTTGGGACTGCCATGATTTTTGGTCCTTTTGGAGTTGTTTAGGCCGTATGACTGGTATGTTCTTTGTTCTACCTTGTACATGTTTTAGTAACTTGTGATCAGTATACATGTTTTCCTGGCAGCAGATTAGACAGTAGACTAAAAGCTTTGGCCATTCATGATGATGCCTTTCGAAT GTAAAGTTATTTATGTA CCAAATTC TTTCGCTAATGATGTGCTT ATTGATTGAT                                                                      ]
[+] EMBL AU030445             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCCTTGCTGAGGCGNTGCATAACTTCAATGGTACCACAGAAAAGGAGTTGAGTTTAATTGTTGGTGATTATGTCGTTGTTCGTCAGATTGCTCCGAATGGTTGGGCCGAAGGNGAATGCAAGGGGGTGGCAGGATGGTTCCCGGCTGCCTACGTGGAGAGGCGTGAAAATATCCCGCCAAACAAAGTCTTCCCGCAAGCATAAACCGCCAAATGCTAGTTGAAAATCTAGATTTGCGCTGCTAAAATCTGTAATTTGGTTTGGGACTGCCATGATTTTTGGTCCTTTTGGAGTTGTTTAGGCCGTATGACTGGTATGTTCTTTGTTCTACCTTGTACATGTTTTAGTAACTTGTGATCAGTATACATGTTTTCCTGGCAGCAGATTAGACAGTAGACTAAAAGCTTTGGCCATTCATGATGATGCCTTTCGAAT GTAAAGTTATTTATGTA CCAAATTC TTTCGCTAATGATGTGCTT ATTGATTGATGATTCCCTTCNGTAAAAAAA                                                  ]
[+] EMBL C73709               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTCGTCAGATTGCTCCGAATGGTTGGGCCGAA GAGAATGCAAGGGGGTGGCAGGATGGTTCCCGGCTGCCTACGTGGAGAGGCGTGAAAATATCCCNCCAAACAAAGTCTTCCCGCAAGCATAAACCGCCAAATGCTAGTTGAAAATCTAGATTTGCGCTGCTAAAATCTGTAATTTGGTTTGGGACTGCCATGATTTTTGGTCCTTTTGGAGTTGTTTAGGCCGTATGACTGGTATGTTCTTTGTTCTACCTTGTACATGTTTTAGTAACTTGTGATCAGTATACATGTTTTCCTGGCAGCAGATTAGACAGTAGACTAAAAGCTTTGGCCATTCATGATGATGCCTTTCGAATGGTAAAGTTATTTATGTACCCAAATTCTTTTCGCTAATGATGTGCTTAATTGATTGATGATTCCCc                                                              ]
[+] EMBL C99488               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGCAGGNTGGTTCCCGGNTGCCTACGTGGAGAGGCGTGAAAATATCCCGCCAAACAAAGTCTTCCCGCAAGCNTAAACCGCCAAATGCTAGTTGAAAATCTAGATTTGCGCTGCTAAAATCTGTAATTTGGTTTGGGACTGCCATGATTTTTGGNCCTTTTGGNGTTGTTTAGGCCGTNTGACTGGTATGTTCTTTGTTCTNCCTTGTACATGTTTTAGTAACTTGTGATCAGTATACATGTTTTCCTGGCAGCAGATTAGACAGTAGACTAAAAGCTTTGGCCATTCATGNTGATGCCTTTCGAAT GTAAAGTTATTTATGTA CCAAATTN TTTCGCTAATGATGTGCTT ATTGATTGATGNTTCCCTTCCGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAANAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]




>consensus_9355#0
TCCCTCTCTCGGCTCTCGCGCTCGCTTTCTGTCTGTCTCTGCTCTCGCTCCGCCGCCCCG
CCTCCTCCGTTCGCCGAGCGCCCGCCGCGTCGCCGGCCGCCACACGGCCAACCTCTTCCT
TCCTCGCCGCCCCCTCGCGCTTCCAGTTCCTCCTCCTCCTCCGTTTCTAACTAGCGAGGA
TTAGGGTTAGCCCTACTACCTTCGCGCTCTTCCCCCAACCCCCGCTTCGCTTCTTCCTCG
TCTCGGTCGCAGCACGACGTCCGCTTCAGTGAGGGAAGGGGAGGGAGAGGGATGGATGTG
CTGAGGAAGCAGGCGAGCAAGTTCAAGGAGCAGGTCGCCAAGCAGCAGCAGGCTGTGATA
AAGCAGTTCAGTACTACGGGCTATGAACATTCAGACGCTGTTGTAATTGATGAAGTTGAA
TTACAGAGACATCAACAGCTTGAGAAATTGTACACTTCTACTCGTTCTGGAAGGGATTTC
CAAAAGGACATTGTTCGAGCGGCTGAAGGTTTGGTTTCTATTGGAATCAGGCATGTTGAA
GTGGGAACAAAATTTTCAGAGGATTGTTATAGATATGGAGGTGAAAGTAGTGCTAGTGAT
GAAGCCCTTGCAAAAGCAGCATCTCTGTATGGAGGTGCTCTAAGAAATGTTGAGAAAGAG
TACGAAGAATTTAATAGAATTTTATCTTCTCAGACTATAGATCCATTGAGGGCTATGGCT
GCAGGCGCTCCCCTGGAAGATGCTCGTGGTCTTGCACAACGTTATAGCCGGATGAGACAT
GAAGCTGAGATCCTTTCTGCTGAAATTGCTAGAAGGAAGCAACGGGTACGAGAAGCTCCA
CTTGCTGAGCACACTACGAAGCTTCAACAGTCTGAATCTAAAATGATAGAGCACAAAGCA
AGCATGGCTGTGTTAGGAAAGGAAGCTGCTGCTGCACTTGCCGCTGTTGAATCTCAGCAG
CAAAGGATAACTCTTCAGCGCCTGGTTGGCATGGTAGAAGCAGAAAAGTTATTTCATTTG
AGGTTAGCTGCTATACTTGATGATGTTGAAGCTGAGATGTCCTCTGAAAAGCAAAAGAGA
GAATCTGCACCGCCTACTATTCATTCCCATAAGCGTGCTGAGAAGGCCCAGTACTTCCTT
GCTGAGGCGGTGCATAACTTCAATGGTACCACAGAAAAGGAGTTGAGTTTAATTGTTGGT
GATTATGTCGTTGTTCGTCAGATTGCTCCGAATGGTTGGGCCGAAGGAGAATGCAAGGGG
GTGGCAGGATGGTTCCCGGCTGCCTACGTGGAGAGGCGTGAAAATATCCCGCCAAACAAA
GTCTTCCCGCAAGCATAAACCGCCAAATGCTAGTTGAAAATCTAGATTTGCGCTGCTAAA
ATCTGTAATTTGGTTTGGGACTGCCATGATTTTTGGTCCTTTTGGAGTTGTTTAGGCCGT
ATGACTGGTATGTTCTTTGTTCTACCTTGTACATGTTTTAGTAACTTGTGATCAGTATAC
ATGTTTTCCTGGCAGCAGATTAGACAGTAGACTAAAAGCTTTGGCCATTCATGATGATGC
CTTTCGAATGTAAAGTTATTTATGTACCAAATTCTTTCGCTAATGATGTGCTTATTGATT
GATGATTCCCTTCNGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAANAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case