These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9375#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1442 fasta sequence [GTTGATAATGAGATTGACCCTGAAAATTCATGGAGATGGGATATTGGGATCGCATTTCAATATTGACTCAGTACTTACCTTTTGATCTGATGGTCCTTTGAACTACATGGTCCTTTGAACTACCAAGCTGGGGTAAATGCTACACTCTGCTCTGAAACTTTAGATGTACCAATCAAACATACAGCAATCATGTGTTTTTGCATAAGACCTTATTCTTATGTGTTCCTTCCCTTCAAGTCCTGCTATATGATAATTTAGTGTATAATGCTGAGTCCAGCATGGTTTTGCTTATATATGGCAATTGTTGTTTCTACCCAACTAACGAAGCTCTAATTAAGATTGATATCATCTCTTTTCTTCGATGTTGGTATTTAGCACTATCTATATTCTGTAGTAGTCATCATGATAAGTCTCTCGATTGAAAATCTGAAATATTGTAGGATCGTGTGCTTATCTTGTTGGCCAAGCTTGCTGCATGTGTTAGACCTTCGTATATTACAGATAGCATTTCAGCGGCAGATGTCAGCCTAACTCGAAACATGTCATATTTCCGGCGTGTTAATTCCAATGGCATTCCTAAAATCACTTACTTACACCTTTATGAGTGTGAGGCTTTCTCGATCGGCATCTTTTGTTTGCCTCCAAGGGGTGTCATTCCTCTCCATAAATCACCC--ACATGACTGTGTTCAGTAAGCTTCTTTTTGGTGAGCTGCGTGTGAAGTCCTATGATTGGGCTGATGCCTCACAAGATTCAACTGATGCTCAGTTGCAAGGAGCCCGCTTAGCAAAGGTGAAGGTTGATGGCACCTTGAATGCACCTTGTGCAACATCGGTACTATATCCGGAAGATGGTGGCAACCTGCACTGCTTCACCGCACATACTGCTTGTGCTGTTCTTGATGTCCTTGGCCCACCATATGACGATGGCAGTGGGAGGCACTGCCAGCACTACAACGTCTCTTCCTCT-GCACCTTCTGCTGGAGATTCAAAGCCCCTTCCTGGAGACGAT-GGATACGCAT-GGCTGGAGGAGTGTGAACCACCAGACAA-TTTTCATCTTG-TC-GGGTC-AACTTATAT-GGG-TCCAAGAATTGTGGACAATTGAACTTACGA-GGATTCCTTGG-TTTCTTGC-AGCGCATGA-TGTAACTTTCA-TTTGGTGTAAATACATCGCTGGAGAAAATAGGTCCTCCTTTGGGTCATAACTAGACCACGTTCATCATCACTTAAACTGGAGGACCTAAATTGCTTAGTAATAAAAACATGCTCGGTAATTGAGGTTGTGTAGGCCTTTGCTGTATTTTTTTTTCTTGTTCATTTCTGTGTTTTCTTGTGTCTCTAGTCTGTACCAGTTAGCAGTGTAGCATTGGATTGCCTGATTCATCATGTTCCCAAGTAATGTTTGGACTTGCTAAAAAAATCAGAAATCTTTTCCTTTTCCTGAAAAAATT] [+] EMBL CB000918 [GTTGATAATGAGATTGACCCTGAAAATTCATGGAGATGGGATATTGGGATCGCATTTCAATATTGACTCAGTACTTACCTTTTGATCTGATGGTCCTTTGAACTACATGGTCCTTTGAACTACCAAGCTGGGGTAAATGCTACACTCTGCTCTGAAACTTTAGATGTACCAATCAAACATACAGCAATCATGTGTTTTTGCATAAGACCTTATTCTTATGTGTTCCTTCCCTTCAAGTCCTGCTATATGATAATTTAGTGTATAATGCTGAGTCCAGCATGGTTTTGCTTATATATGGCAATTGTTGTTTCTACCCAACTAACGAAGCTCTAATTAAGATTGATATCATCTCTTTTCTTCGATGTTGGTATTTAGCACTATCTATATTCTGTAGTAGTCATCATGATAAGTCTCTCGATTGAAAATCTGAAATATTGTAGGATCGTGTGCTTATCTTGTTGGCCAAGCTTGCTGCATGTGTTAGACCTTCGTATATTACAGATAGCATTTCAGCGGCAGATGTCAGCCTAACTCGAAACATGTCATATTTCCGGCGTGTTAATTCCAATGGCATTCCTAAAATCACTTACTTACACCTTTATGAGTGTGAGGCTTTCTCGATCGGCATCTTTTGTTTGCCTCCAAGGGGTGTCATTCCTCTCCATAAATCACCC ACATGACTGTGTTCA ] [+] EMBL OSR19441A [ TTCTCGATCGGCATCTTTTGTTTGCCTCCAAGGGGTGTCATTCCTCTCCAT AATCACCCCAACATGACTGTGTTCAGTAAGCTTCTTTTTGGTGAGCTGCGTGTGAAGTCCTATGATTGGGCTGATGCCTCACAAGATTCAACTGATGCTCAGTTGCAAGGAGCCCGCTTAGCAAAGGTGAAGGTTGATGGCACCTTGAATGCACCTTGTGCAACATCGGTACTATATCCGGAAGATGGTGGCAACCTGCACTGCTTCACCGCACATACTGCTTGTGCTGTTCTTGATGTCCTTGGCCCACCATATGACGATGGCAGTGGGAGGCACTGCCAGCACTACAACGTCTCTTCCTCTGGCACCTTCTGCTGGAGATTCAAAGCCCCTTCCTGGAGACGATGGGATACGCATGGGCTGGAGGAGTGTGAACCACCAGACAA TTTTCATCTTG TC GGGTC AACTTATAT GGG TCCAAGAATTGTGGACAATTGAACTTACGA GGATTCCTTGG TTTCTTGC AGCGCATGA TGTAACTTTCA TTTGGTGTAAATACATCGCTGGAGAAAATAGGTCCTCCTTTGGGTCATAACTAGACCACGTTCATCATCACTTAAACTGGAGGACCTAAATTGCTTAGTAATAAAAACATGCTCGGTAATTGAGGTTGTGTAGGCCTT ] [+] EMBL D43270 [ AGTTGCAAGGAGCCCGCTTAGCAAAGGTGAAGGTTGATGGCACCTTGAATGCACCTTGT CAACATCGGTACTATATTNGGAAGATGGTGGCAACCTGCACTGCTTCACCGNACATACTGCTTGTGCTGTTCTTGATGTTCTTGGNCCACCATATGACGATGGCAGTGGGNGGCACTGNCAGCACTACAACGTCTCTTCCTCT GCACCTTCTTCTGGAGATTCAAAGCCCCTTCCTGGAGACGAT GGATACGCAT GGCTGGTGGAGTGTGAACCACCAGCCAA TTTTCATCTTGTTCGGGGTCAAACTTATAT GGGNTCCAAG ] [+] EMBL OSC356 [ ACCTTGTG AACATCGGTACTATATCCGGAAGATGGTGGCAACCTGCACTGCTTCACCGCACATACTGCTTGTGCTGTTCTTGATGTCCTTGGCCCACCATATGACGATGGCAGTGGGAGGCACTGCCAGCACTACAACGTCTCTTCCTCT GCACCTTCTGCTGGAGATTCAAAGCCCCTTCCTGGAGACGAT GGATACGCAT GGCTGGAGGAGTGTGAACCACCAGACAA TTTTCATCTTG TC GGGTC AACTTATAT GGG TCCAAGAATTGTGGACAATTGAACTTACGAGGGATTCCTTGG TTTCTTGCAAGCGAATGATTGTAACTTTCATTTTGGNGTAAAT ] [+] EMBL AU031820 [ TCCTGGAGACGAT GGATACGCATGGGCTGGAGGAGTGTGANCCACCAGACAATTTTTCATCTTG TC GGGTC AACTTATATGGGG TCCAAGAATTGTGGACAATTGAACTTACGA GGATTCCTTGGTTTTCTTGC AGCGCATGA TGTAACTTTCA TTTGGTGTAAATACATCGCTGGAGAAAATAGGTCCTCCTTT GGTCATAACTAGACCACGTTCATCATCACTTAAACTGGAGGACCTAAATTGCTTAGTAATAAAAACATGCTCGGTAATTGAGGTTGTGTAGGCCTTTGCTGTATTTTTTTTTCTTGTTCATTTCTGTGTTTTCTTGTGTCTCTAGTCTGTACCAGTTAGCAGTGTAGCATTGGATTGCCTGATTCATCATGTTCCCAAGTAATGTTTGGACTTGCTAAAAAAATCAGAAATCTTTTCCTTTTCCTGAAAAAA ] [+] EMBL C99149 [ GAGGACCTAAATTGCTTAGTAATAAAAACATGCTCGGTAATTGAGGTTGTGTAGGCCTTTGCTGTATTTTTTTTTCTTGTTCATTTCTGTGTTTTCTTGTGTCTCTAGTCTGTACCAGTTAGCAGTGTAGCATTGGATTGCCTGATTCATCATGTTCCCNAGTAATGTTTGGACTTGCTAANAAAATNAGAAATCTTTTCCTTTTCCTGACTAATTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||