cluster # 9467

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Oryza sativa
cluster # 9467 cluster # 9467 Sequences # 6 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_9467#0 length = 263 sequences # 6

consensusID : consensus_9467#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 263
fasta sequence

                              [TCACTCCGCTAGGGTTTTACCCCGCGATGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCGCGGAGGCTCCTCTCCCGCCGCGCCACCTCCTTCTCGGCCTCCGCTCTCCTCCGCCGCGGC-G-CCCCGGTGCGCCGGAGTCGCTGCTGCGCCCCACCGTCGCCGCGGTCTCGCGCGTCGGCTTCCTTCGCGGGTTCGCGCGGCGGCCGGGCGGCGATGGGTACTCCCCGATGCGGTCCGGTGGCGGCGGAGGAGGANGCGGAGACNGCGCNN]

[+] EMBL OSS3772A             [TCACTCCGCTAGGGTTTTACCCCGCGATGGCCGCCGNCGCCGCCGNCGCCGCGCGNAGGCTCCTCTCCCGCCGCGTCACCTCCTTCTCGGCCTCCGCTCTCCTCCGCCGCGGC GTCCCCGGTGCGCCGGAGTCGCTGCTGCGCCCCACCGTCGACGCGGTCTCGCGCGTCGGCTTCCTTCGCGGGTTCGCGCGGCGGCCGNGCGGCGATGGGTACTCCCCGAT                                         ]
[+] EMBL OSS3849A             [TCACTCCGCTAGGGTTTTACCCCGCNATGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCGCGGAGGCTCCTCTCCCGCCGCGCCACCTCCTTCTNGGCCTCCGCTCTCCTCCGCCGCGGCGG CCCCGGTGCGCCGNAGTCGCTGCTGCGCCCCACCGTNGCCGCGGTCTCGCGCGTNGGCTTCCTTCGCGGGTTCGCGCGGCGGCCGGGCGGCGATGGGT                                                   ]
[+] EMBL AU069972             [                  ACCCCGCGATGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCGCGTAGGCTCCTCTCCCGCCGCGCCACCTCCTTCTCGGCCTCCGCTCTCCTCCGCCGCGGC G CCCCGGTGCGCCGGAGTCGCTGCTGCGCCCCACCGTCGCCGCGGTCTCGCGCGTCGGCTTCCTTCGCGGGTTCGCGCGGCGGCCGGGCGGCGATNGGTACTCCCCGAT                                         ]
[+] EMBL AU163534             [                       GCGATGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCGCGGAGGCTCCTCTCCCGCCGCGCCACCTCCTTCTCGGCCTCCGCTCTCCTCCGCCGCGGCGG CCCCGGTGCGCCGGAGTCGCTGCTGCGCCCCACCGTCGCCGCGGTCTCGCGCGTCGGCTTCCTTCGCGGGTTCGCGCGGCGGCCGGGCGGCGATGGGTACTCCCCGAT                                         ]
[+] EMBL OS0416A              [                        ngancnctGCCGCCGCCACCGCCGCCGCGC GAGGCTCCTCTCCCGCCGCGCCACCTCCTTCTCGGCCTCCGCTCTCCTCCGCCGCGGCGG CCCCGGTGCGCCGGAGTCGCTGCTGCGCCCCACCGTCGCCGCGGTCTCGCGCGTCGGCTTCCTTCGCGGGTTCGCGCGGCGGCCGGGCGGCGATGGGTACTCCCCGAT                                         ]
[+] EMBL AU095103             [                                    CCGCCGCCGCCGCCGCGCGAAGGCTCCTCTCCCGCCGCGCCACCTCCTTCTCGGCCTCCGCTCTCCTCCGCCGCGGC G CCCCGGTGCGCCGGAGTCGCTGCTGCGCCCCACCNTCGNCGCGGTCTCGCGCGTCGGCTTCCTTCGCGGGTTCGCGCGGCGGCCGGGCGGCGATNGGTACTCCCCGATGCGGTCCGGTGGCGGCGGAGGAGGANGCGGAGACNGCGCNN]




>consensus_9467#0
TCACTCCGCTAGGGTTTTACCCCGCGATGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCGCGGAGGC
TCCTCTCCCGCCGCGCCACCTCCTTCTCGGCCTCCGCTCTCCTCCGCCGCGGCGCCCCGG
TGCGCCGGAGTCGCTGCTGCGCCCCACCGTCGCCGCGGTCTCGCGCGTCGGCTTCCTTCG
CGGGTTCGCGCGGCGGCCGGGCGGCGATGGGTACTCCCCGATGCGGTCCGGTGGCGGCGG
AGGAGGANGCGGAGACNGCGCNN

clustalw multiple alignements is not computed in this case