These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9527#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1064 fasta sequence [GTACAACTTCCCGCTCGCCGGCGGCGGCCGCGGCGCGGACCCGTCGATCCCGGAGGCGTTCCTCTTGGAGCTCCAGTCCCGGTGCGCCCCCGGCGACTTCAACACGCGGCTGCCGCTCGTCCGCGGCAGCGAGGCCGAGTTGGACACCTCCATCCTCCGCAACATCCGCAACGGCTTCGCCGTCATCGCCTCCGACGCCGCGCTTTACAACGCCACGGCCACCGTCGGCGTCGTCGACACCTACTCCAGCATGCTCAGCGCCTTCTTCGGCCCCTACTTCCGCCAGGACTTCGCCGACGCCATGGTCAAGATGGGGAGCGTCGGCGTGCTCACCGGCGCCGCC-GCGAGGTCAGGAAAGTCTGCTCCAAGTTCAACTGAG-TTTG-AAAAAAAATTAAGCTAGAGCTATTAGCTGGTAGAATGAGATGAAAATTAATCAT-CCATGGTTGGCATAATTTTAATTTCTTCTTGAAATCAACAAAATTGTGTAGATCATAATTAAATTACTGGAAATTAAAAGGAATTGATCAAGTTCATGTGCATCTTGCTGGGACAGAAGAAGAGAGAAATTTTGCATAAA-GGTCCAAAAATATTAAATTAATTGAGGATCTGTGCAGTTTTCTTCTTTTCTGGGGTCTCAGAAGATGGAATATATACAGAGAGAGGGGTTATAAGATAAATTTGGTCTACATGTTTATATATATACATATATGTACAAGTGAGATATAGTCATTTTTGTTCTTGGGTTTGGGGTATTTTGTTGATTTGTTGCCGAGTGAAACTGTAAAGAAGTGTTGAATTCATTGATTCTAAGTGGTGCCAAACCTCTGTAACGATCTGTCCCCTAGCTTAATTTTTTTTCTTTGGTTGGATTGTAAATTAAAAGCTACCATTTGCTTCTTGTTACGAGCTTTAAAGTGCAGTTATATTGTTAGGGCCGGCCTAGTACATGGATTGTTCTATCATCTTTGATATATGCAATGCAATTACCAGGTAGTGTAAATTTTTCACTGAATTACAAGTCAACTGATTTGTTAGGTTTGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [-] EMBL CB652786 [GTACAACTTCCCGCTCGCCGGCGGCGGCCGCGGCGCGGACCCGTCGATCCCGGAGGCGTTCCTCTTGGAGCTCCAGTCCCGGTGCGCCCCCGGCGACTTCAACACGCGGCTGCCGCTCGTCCGCGGCAGCGAGGCCGAGTTGGACACCTCCATCCTCCGCAACATCCGCAACGGCTTCGCCGTCATCGCCTCCGACGCCGCGCTTTACAACGCCACGGCCACCGTCGGCGTCGTCGACACCTACTCCAGCATGCTCAGCGCCTTCTTCGGCCCCTACTTCCGCCAGGACTTCGCCGACGCCATGGTCAAGATGGGGAGCGTCGGCGTGCTCACCGGCGCCGCCGGCGAGGTCAGGAAAGTCTGCTCCAAGTTCAACTGAG TTTG AAAAAAAATTAAGCTAGAGCTATTAGCTGGTAGAATGAGATGAAAATTAATCAT CCATGGTTGGCATAATTTTAATTTCTTCTTGAAATCAACAAAATTGTGTAGATCATAATTAAATTACTGGAAATTAAAAGGAATTGATCAAGTTCATGTGCATCTTGCTGGGACAGAAGAAGAGAGAAATTTTGCATAAA GGTCCAAAAATATTAAATTAATTGAGGATCTGTGCAGTTTTCTTCTTTTCTGGGGTCTCAGAAGAT GAAGATATACAGAGAGAGGGGTTATAAGATAAAaac ] [+] EMBL OSS14433A [ AGCGCCTTCTTCGGCCCCTACTTCCGCCA GACTTCNCCGACGCCATGGTCAAGATGGGGAGCGTCGGCGTGCTCACCGGCGNCGCC GCGAGGTCAGGAAAGTCTGCTCCAAGTTCAACTGAG TTTG AAAAAAAATTAAGCTAGAGCTATTAGCTGGTAGAATGAGATGAAAATTAATCAT CCATGGTTGGCATAATTTTAATTTCTTCTTGAAATCAACAAAATTGTGTAGATCATAATTAAATTACTGGAAATTAAAAGGAATTGATCAAGTTCATGTGCATCTTGCTGGGACAGAAGAAGAGAGAAATTTTGCATAAA GGTCCAAAAATATTAAATTAATTGAGGATCTGTGCAGTTTTCTTCTTTTCTGGGGTCTCAGAAGGTGGNATATATACAGAGAGAGGGG TATAAGNTAAATTTGGNCT CATG TTATATATATACATATATGTNCAAGTG GGTAT GGCATTTTTGT ] [+] EMBL OSS14544A [ AGCGCCTTCTTCGGCCCCTACTTCCGCCAGGACTTCGCCGACGCCATGGTCAAGATGGGGAGCGTCGGCGTGCTCACCGGCGCCGCC GCGAGGTCAGGAAAGTCTGCTCCAAGTTCAACTGAG TTTG AAAAAAAATTAAGCTAGAGCTATTAGCTGGTAGAATGAGATGAAAATTAATCAT CCATGGTTGGCATAATTTTAATTTCTTCTTGAAATCAACAAAATTGTGTAGATCATAATTAAATTACTGGAAATTAAAAGGAATTGATCAAGTTCATGTGCATCTTGCTGGGACAGAAGAAGAGAGAAATTTTGCATAAAGGGTCCAAAAATATTAAATTAATTGNGGGTCTGTGCAGTTTTCTTCNTTT ] [+] EMBL AU088699 [ CAACTGAGTTTTG AAAAAAAATTAAGCTAGAGCTATTAGCTGGTAGAATGAGATGAAAATTAATCATCCCATGGTTGGCATAATTTTAATTTCTTCTTGAAATCAACAAAATTGTGTAGATCATAATTAAATTACTGGAAATTAAAAGGAATTGATCAAGTTCATGTGCATCTTGCTGGGACAGAAGAAGAGAGAAATTTTGCATAAA GGTCCAAAAATATTAAATTAATTGAGGATCTGTGCAGTTTTCTTCTTTTCTGGGGTCTCAGAAGATGGAATATATACAGAGAGAGGGGTTATAAGATAAATTTGGTCTACATGTTTATATATATACATATATGTACAAGTGAGATATAGTCAaaaaaaaaa ] [+] EMBL AU096608 [ AACTGAG TTTGAAAAAAAAATTAAGCTAGAGCTATTAGCTGGTAGAATGAGATGAAAATTAATCAT CCATGGTTGGCATAATTTTAATTTCTTCTTGAAATCAACAAAATTGTGTAGATCATAATTAAATTACTGGAAATTAAAAGGAATTGATCAAGTTCATGTGCATCTTGCTGGGACAGAAGAAGAGAGAAATTTTGCATAAA GGTCCAAAAATATTAAATTAATTGAGGATCTGTGCAGTTTTCTTCTTTTCTGGGGTCTCAGAAGATGGAATATATACAGAGAGAGGGGTTATAAGATAAATTTGGTCTACATGTTTATATATATACATATATGTACAAGTGAGATATAGTCATTTTTGTTCTTGGGTTTGGGGTATTTTGTTGATTTGTTGCCGAGTGAAACTGTAAAGAAGTGTTGAATTCATTGATTCTAAGTGGTGCCAAACCTCTGTAACGATCTGTCCCCTAGCTTAATTTTTTTTCTTTGGTTGGATTGTAAATTAAAAGCTACCATTTGCTTCTTGTTACGAGCTTTAAAGTGCAGTTATATTGTTAGGGCCGGCCTAGTACATGGATTGTTCTATCATCTTTGATATATGCAATGCAATTACCAGGTAGTGTAAATTTTTCACTGAATTACAAGTCAACTGATTTGTTAGGTTTGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL AU096632 [ TACTGGAAATTAAANGGAATTGATCAAGTTCATGTGCATCTTGCTGGGACAGAAGANGAGAGAAATTTTGCATAAA GGTCCAAAAATATTAAATTAATTGAGGATCTGTGCAGTTTTCTTCTTTTCTGGGGNCTCAGAAGATGGAATATATACAGAGAGAGGGGTTATAAGATAAATTTGGTCTACATGTTTATATATATACATATATGTACAAGTGAGATATAGTCATTTTTGTTCTTGGGTTTGGGGTATTTTGTTGATTTGTTNCCGAGTGAAACTGTAAAGAAGTGTTGAATTCATTGATTCTAAGTGGTGCCAAACCTCTGTAACGATCTGTCCCCTAGCTTAATTTTTTTTCTTTGGTTGGATTGTAAATTAAAAGCTACCATTTGCTTCTTGTTACGAGCTTTAAAGTGCAGTTATATTGTTAGGGCCGGCCTAGTACATGGATTGTTCTATCATCTTTGATATATGCAATGCAATTACCAGGTAGTGTAAATTTTTCACTGAATTACAAGTCAACTGATTTGTTAGGTTTGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||