These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9719#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 576 fasta sequence [TCCCCGTTCCCGGAATTTCCGG-TCTA-CCACGCGTCCCTAAATTATAAGA-G-CTCTAT-TGTATCTTTTACTCCCTCCATCCC-AAATATAAGGCTCAACCACTCATAACAC-AAGACCAAGAAAATATTTAATCACATTCTTGGTTTGGATCACCTCGAT-GCATGAAA-GCAAGGAAGATGTGCCCCAGCCCGAACCGCTGCCCCTCAAATTCTTCCTGCCCCAGCCCAAACCGCTGCCCCTAAAATTCGAGATTTATTAAGGCTAATCTATTTGTTCCACTGCGGAGGAAGACGTACCGCCACCGCCACCGCGAGGAAGTCCGGTTGATGTGCCGCGCGAGCCTCCAGCCCCAGCCCGAACCGCTGCCCCTCGGATAGCTTGGTTACTGCTGTAATGTGAATTGCTTTATCGAGAATGTACTTGGAATGTGAATTGCTTTCTCCAGGATGTGAGATTGTCAATTGCTTGTGAGAATGTGTGTGTATATATAGATATATATGTCATTTTTCTCTTTTTTTTAGCTAAT-TTCA-TTTAAAC-AACAGTC-CCTT-TTGAATGTGGCGTGTATTTTATCTCTAAAAA] [+] EMBL BI803378 [TCCCCGTTCCCGGAATTTCCGG TCTA CCACGCGTCCCTAAATTATAAGA G CTCTAT TGTATC TTTACTCCCTCCATCCC AAATATAAGGCTCAACCACTCATAACAC AAGACC AGAAAATATTTAATCACATTCTTGGTTTGGATCACCTCGAT GCATGAAA GCAAGGAAGATGTGCCCCAGCCCGAACCGCTGCCCCTCAAATTCTTCCTGCCCCAGCCCAAACCGCTGCCCCTAAAATTCGAGATTTATTAAGGCTAATCTATTTGTTCCACTGCGGAGGAAGACGTACCGCCACCGCCACCGCGAGGAAGTCCGGTTGATGTGCCGCGCGAGCCTCCAGCCCCAGCCCGAACCGCTGCCCCTCGGATAGCTTGGTTACTGCTGTAATGTGAATTGCTTTATCGAGAATGTACTTGGAATGTGAATTGCTTTCTCCAGGATGTGAGATTGTCAATTGCTTGTGAGAATGTGTGTGTATATATAGATATATATGTCATTTTTCTCTTTTTTTTAGCTAAT TTCA TTTAAAC AACAGTC CCTT TTGAATGTGGCGTGTATTTTATCTCTAAAAA] [+] EMBL BI803739 [ cCCGGTTCAACCCACGCGTCCCTAAATTATAAGA G CTCTATGTGTATCTTTTACTCCCTCCATCCC AAATATAAGGCTCAACCACTCATAACACAAAGA CAAGAAAATATTTAATCACATTCTTGGTTTGGATCACCTCGAT GCATGAAA GCAAGGAAGATGTGCCCCAGCCCGAACCGCTGCCCCTCAAATTCTTCCTGCCCCAGCCC AACCGCTGCCCCTAAAATTCGAGATTTATTAAGGCTAATCTATTTGTTCCACTGCGGAGGAAGACGTACCGCCACCGCCACCGCGAGGAAGTCCGGTTGATGTGCCGCGCGAGCCTCCAGCCCCAGCCCGAACCGCTGCCCCTCGGATAGCTTGGTTACTGCTGTAATGTGAATTGCTTTATCGAGAATGTACTTGGAATGTGAATTGCTTTCTCCAGGATGTGAGATTGTCAATTGCTTGTGAGAATGTGTGTGTATATATAGATATATATGTCATTTTTCTCTTTTTTTTAGCTAAT TTCA TTTAAAC AACAGTC CCTT TTGAATGTGGCGTGTATTTTATCTCTAAAAA] [+] EMBL BI799186 [ AAGA GCCTCTAT TGTATCTTTTACTCCCTCCATCCCAAAATATAAGGCTCAACCACTCATAACACAAAGACCAAGAAAATATTTAATCACATTCTTGGTTTGGATCACCTCGATCGCATGAAACCCAAGGAAGATGTGCCCCAGCCCGAACCGCTGCCCCTCAAATTCTTCCTGCCCCAGCCCAAACCGCTGCCCCTAAAATTCGAGATTTATTAAGGCTAATCTATTTGTTCCACTGCGGAGGAAGACGTACCGCCACCGCCACCGCGAGGAAGTCCGGTTGATGTGCCGCGCGAGCCTCCAGCCCCAGCCCGAACCGCTGCCCCTCGGATAGCTTGGTTACTGCTGTAATGTGAATTGCTTTATCGAGAATGTACTTGGAATGTGAATTGCTTTCTCCAGGATGTGAGATTGTCAATTGCTTGTGAGAATGTGTGTGTATATATAGATATATATGTCATTTTTCTCTTTTTTTTAGCTAAT TTCA TTTAAACAAACAGTC AGTT TTGAATGTGGCGTGTATTTTATCTCTAAAAA] [+] EMBL BI799579 [ AAGAGG CTCTAT TGTATCTTTTACTCCCTCCATCCCAAAATATAAGGCTCAACCACTCATAACACAAAGACCAAGAAAATATTTAATCACATTCTTGGTTTGGATCACCTCGAT GCATGAAA GCAAGGAAGATGTGCCCCAGCCCGAACCGCTGCCCCTCAAATTCTTCCTGCCCCAGCCCAAACCGCTGCCCCTAAAATTCGAGATTTATTAAGGCTAATCTATTTGTTCCACTGCGGAGGAAGACGTACCGCCACCGCC CCGCGAGGAAGTCCGGTTGATGTGCCGCGCGAGCCTCCAGCCCCAGCCCGAACCGCTGCCCCTCGGATAGCTTGGTTACTGCTGTAATGTGAATTGCTTTATCGAGAATGTACTTGGAATGTGAATTGCTTTCTCCAGGATGTGAGATTGTCAATTGCTTGTGAGAATGTGTGTGTATATATAGATATATATGTCATTTTTCTCTTTTTTTTAGCTAATCTTCACTTTAAAC AAC GTC AGTT TTGAATGTGGCGTGTATTTTATCTCTAAAAA] [+] EMBL BI803914 [ AAGA GCCTCTAT TGTATCTTTTACTCCCTCCATCCC AAATATAAGGCTCAACCACTCATAACAC AAGACCAAGAAAATATTTAATCACATTCTTGGTTTGGATCACCTCGAT GCATGAAA GCAAGGAAGATGTGCCCCAGCCCGAACCGCTGCCCCTCAAATTCTTCCTGCCCCAGCCC AACCGCTGCCCCTAAAATTCGAGATTTATTAAGGCTAATCTATTTGTTCCACTGCGGAGGAAGACGTACCGCCACCGCCACCGCGAGGAAGTCCGGTTGATGTGCCGCGCGAGCCTCCAGCCCCAGCCCGAACCGCTGCCCCTCGGATAGCTTGGTTACTGCTGTAATGTGAATTGCTTTATCGAGAATGTACTTGGAATGTGAATTGCTTTCTCCAGGATGTGAGATTGTCAATTGCTTGTGAGAATGTGTGTGTATATATAGATATATATGTCATTTTTCTCTTTTTTTTA CTAAT TTCA TTTAAAC AACAGTC CCTTCTTGAAT TGGCGTGTATTTTATCTCTAAAAA] [+] EMBL BI803950 [ ATCTTTTACTCCCTCCATCCC AAATATAAGGCTCAACCACTCATAACAC AAGACCAAGAAAATATTTAATCACATTCTTGGTTTGGATCACCTCGAT GCATGAAA GCAAGGAAGATGTGCCCCAGCCCGAACCGCTGCCCCTCAAATTCTTCCTGCCCCAGCCC AACCGCTGCCCCTAAAATTCGAGATTTATTAAGGCTAATCTATTTGTTCCACTGCGGAGGAAGACGTACCGCCACCGCCACCGCGAGGAAGTCCGGTTGATGTGCCGCGCGAGCCTCCAGCCCCAGCCCGAACCGCTGCCCCTCGGATAGCTTGGTTACTGCTGTAATGTGAATTGCTTTATCGAGAATGTACTTGGAATGTGAATTGCTTTCTCCAGGATGTGAGATTGTCAATTGCTTGTGAGAATGTGTGTGTATATATAGATATATATGTCATTTTTCTCTTTTTTTTAGCTAAT TTCA TTTAAAC AACAGTCAGCTT TTGAATGTGGCGTGTATTTTATCTCTAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||