These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9722#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1024 fasta sequence [TACCCATCTCTGTCTCCGTGAGCCCTTCCTCCTCCGCTCCTCTCCTTTCCGCCGCCGCCACCGCGCGCTCTTCCTCCTCCGCTCCTCTCTCGCCCACCACCGCGCGCCCTTTCCTCCTCCGCTCCACTCCCACCCGTCGCCGCCACCGCGTGCCCTTCCTCCTGCACTCCGCTCCCACCCGCCACCACCGCGCGCCGTCGACACTCGGCGACCACGACGACGACGCCGGCCGAGAGAGCGGATCCACCGCCAACTCAGGATCCGGAGGCTCCTCCCCTCCCTCTGTACCCTCTCCTTCTCCCAGATCTAGCTGGAAGGGAGTGGTTGGCGCAGAGGAGGTGATGACGCGGTGGAGGAAGAGGATGAAGGGGAGGCGCGGTGGAGGAAAGGGTGGGGTGTGCCGATCAGCGACGGGGGTACACGAGAGCTCTGGATCTGTCGGGCGGCGGCGGTGCTCGGCAGTGCACGGGTGTCAGCGGTGGTCGGCGGTGCACGGGCGGAGAGACGTGCGA-GCAGCAGAGCTCGGTTGCGGGAGGCAGATGGCGGATCCGGCGGCGACTCGTTCAAGTCCTGCATTGGCAAGTTCTCCATCGGCAAGCCATTAGGCAATCCGGCAGCCCCAAGTCCTCGGATCGACGACGGCGTGGAGCTCCTTCCTCCGTGACGAGCTGCCGCCGTGGAGCTCCGTCCTCCACCGCCGTGGAGCTCCTTCCTTCGCATCGAGCCGCTGCCGGGAGCTCGGAGCCTTGGGTTCAGCAACCGCTGCTGTTCTTCTCGTGGTGAGGCAATGGGTGATGCATGCTGGGATTGAAACATTTTTTTTGTTCCGCAGGATCGACAGCATGGTTGGCAAAATTAATTTTGATTTTTGTGATGGTGAAATTGCA-CTGTGAGG-CCAACATATTTGAATCGATGCTTGAATTTGTGATTGTGGACTTGTATTTGTGATTTGGTGAGAAGAAGAGGATGCTTGAATTTGTAATTGAGGGCATATCTGAATCGGTTTGAATTTGAGTTTTAAAAA] [+] EMBL AK099457 [TACCCATCTCTGTCTCCGTGAGCCCTTCCTCCTCCGCTCCTCTCCTTTCCGCCGCCGCCACCGCGCGCTCTTCCTCCTCCGCTCCTCTCTCGCCCACCACCGCGCGCCCTTTCCTCCTCCGCTCCACTCCCACCCGTCGCCGCCACCGCGTGCCCTTCCTCCTGCACTCCGCTCCCACCCGCCACCACCGCGCGCCGTCGACACTCGGCGACCACGACGACGACGCCGGCCGAGAGAGCGGATCCACCGCCAACTCAGGATCCGGAGGCTCCTCCCCTCCCTCTGTACCCTCTCCTTCTCCCAGATCTAGCTGGAAGGGAGTGGTTGGCGCAGAGGAGGTGATGACGCGGTGGAGGAAGAGGATGAAGGGGAGGCGCGGTGGAGGAAAGGGTGGGGTGTGCCGATCAGCGACGGGGGTACACGAGAGCTCTGGATCTGTCGGGCGGCGGCGGTGCTCGGCAGTGCACGGGTGCCAGCGGTGGTCGGCGGTGCACGGGCGGAGAGACGTGCGA GCAGCAGAGCTCGGTTGCGGGAGGCAGATGGCGGATCCGGCGGCGACTCGTTCAAGTCCTGCATTGGCAAGTTCTCCATCGGCAAGCCATTAGGCAATCCGGCAGCCCCAAGTCCTCGGATCGACGACGGCGTGGAGCTCCTTCCTCCGTGACGAGCTGCCGCCGTGGAGCTCCGTCCTCCACCGCCGTGGAGCTCCTTCCTTCGCATCGAGCCGCTGCCGGGAGCTCGGAGCCTTGGGTTCAGCAACCGCTGCTGTTCTTCTCGTGGTGAGGCAATGGGTGATGCATGCTGGGATTGAAACATTTTTTTTGTTCCGCAGGATCGACAGCATGGTTGGCAAAATTAATTTTGATTTTTGTGATGGTGAAATTGCA CTGTGAGG CCAACATATTTGAATCGATGCTTGAATTTGTGATTGTGGACTTGTATTTGTGATTTGGTGAGAAGAAGAGGATGCTTGAATTTGTAATTGAGGGCATATCTGAATCGGTTTG ] [+] EMBL AK061871 [ CGCCGCCACCGCGCGCTCTTCCTCCTCCGCTCCTCTCTCGCCCACCACCGCGCGCCCTTTCCTCCTCCGCTCCACTCCCACCCGTCGCCGCCACCGCGTGCCCTTCCTCCTGCACTCCGCTCCCACCCGCCACCACCGCGCGCCGTCGACACTCGGCGACCACGACGACGACGCCGGCCGAGAGAGCGGATCCACCGCCAACTCAGGATCCGGAGGCTCCTCCCCTCCCTCTGTACCCTCTCCTTCTCCCAGATCTAGCTGGAAGGGAGTGGTTGGCGCAGAGGAGGTGATGACGCGGTGGAGGAAGAGGATGAAGGGGAGGCGCGGTGGAGGAAAGGGTGGGGTGTGCCGATCAGCGACGGGGGTACACGAGAGCTCTGGATCTGTCGGGCGGCGGCGGTGCTCGGCAGTGCACGGGTGTCAGCGGTGGTCGGCGGTGCACGGGCGGAGAGACGTGCGA GCAGCAGAGCTCGGTTGCGGGAGGCAGATGGCGGATCCGGCGGCGACTCGTTCAAGTCCTGCATTGGCAAGTTCTCCATCGGCAAGCCATTAGGCAATCCGGCAGCCCCAAGTCCTCGGATCGACGACGGCGTGGAGCTCCTTCCTCCGTGACGAGCTGCCGCCGTGGAGCTCCGTCCTCCACCGCCGTGGAGCTCCTTCCTTCGCATCGAGCCGCTGCCGGGAGCTCGGAGCCTTGGGTTCAGCAACCGCTGCTGTTCTTCTCGTGGTGAGGCAATGGGTGATGCATGCTGGGATTGAAACATTTTTTTTGTTCCGCAGGATCGACAGCATGGTTGGCAAAATTAATTTTGATTTTTGTGATGGTGAAATTGCA CTGTGAGG 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GCGGCGACTCGTTCAAGTCCTGCATTGGCAAGTTCTCCATCGGCAAGCCATTAGGCAATCCGGCAGCCCCAAGTCCTCGGATCGACGACGGCGTGGAGCTCCTTCCTCCGTGACGAGCTGCCGCCGTGGAGCTCCGTCCTCCACCGCCGTGGAGCTCCTTCCTTCGCATCGAGCCGCTGCCGGGAGCTCGGAGCCTTGGGTTCAGCAACCGCTGCTGTTCTTCTCGTGGTGAGGCCATGGGTGATGCATGCTGGGATTGAAACATTTTTTTTGTTCCGCAGGATCGACAGCATGGTTGGCAAAATTAATTTTGATTTTTGTGATGGTGAAATTGCACCTGTGAGGCCCAACATATTTGAATCGATGCTTGAATTTGTGATTGTGGACTTGTATTTGTGATTTGGTGAGAAGAAGAGGATGCTTGAATTTGTAATTGAGGGCATATC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||