cluster # 9827

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 9827 cluster # 9827 Sequences # 6 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9827#0 length = 1579 sequences # 6
consensusID : consensus_9827#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1579
fasta sequence
                              [AAAACTTGTCAGAAAGGATTCTTGCATTCTCATTTGCCAAATGTTGCCTAAACAGAGGACTTTCGGGCACAACATATACTCGCCAGATTCTTTATGGTGAAGATCGAATCCTATTGGTACAACCGGATGATACTGATGAACTTAAGATGTTGCATCTTAATGTTCCAGCATCCTATATTTCACAGAATTGGCCAGTTCTTCATGTTGTTGCAAGCAATGATGGTATGTACTTGGCAGTTGCAGGCTCTCATGGGCTAGTGCTGTATGATTTGCGCAATAAAAGGTGGCGTGTTTTTGGGGATGTTACTCAAGAGCAAAAGATTCAATGCAAAGGCTTGTTGTGGCTTGGCAAAATAGTTATTGTATGCAACTACATTGAATCATCAAATACGTATGAGCTTC-TCTTTTTCCCAAGATATCACCTTGATTATAGCTCATTACTTTACCGGAAATCACTTCTTGGTCGACCAATTGTCATGGATGTCTTCCAGGACTACATACTTGTTACCTACAGTCCATTTGATGTGCATATTTTCCATGTGGTGATATCAGGAGAATTGTCACCTGCTAGTAGTCCTGTTTTACAGCTTTCAACAGTCCGAGAACTTTCAATCATGAGTCCAAAGAGTCCACCTGTTTCGATGCGCTTCATTCCTGAACCAACTGATGAAGGAAAGCCGAAACATGATACTAATGGATCTTCTGACTTGTCCCAACAACCTTCAAGATGCCTAATCTTGCGGATGAATGGGGAACTTTCTGTGTTGGACATGGATGATGGACATGAACAATCACTTACTAATTCAGTTGAATTATTTTGGGTCACTTGTTCCCAATACGAAGAGAAGGGTAATCTTATCAAAGAGGTTTCATGGCTTGACTATGGCCATAAGGGGATGCAGGTGTGGTACCCATCCCATGGAGAAAATCCTTTTAAACAAGAAGATTTCTTGCAGCTGGATCCGGAGCTTGAATTTGACCGTGAGGTGTATCCGCTTGGTCTTCTTCCAAATGTTGGTGTAGTTGTT-GGTATTTCTCAGAGAATGTCCTTCTCGACTGCAGAGTTTCCATGCTTTGAACCTTCTCCTCAAGCCCAAACAATATTGCATTGTTTGCTGCGGCATCTCCTTCAGAGAGACAAACATGAAGAAGCTCTGCGTTTGGCAAACTTGTCTGCAGAGAAACCTCACTTCTCTAGATGTTTGGAATGGCTCCTGTTTACGGTATTTGATGCAGAGATATCAAGCCAAAGTGCTTCAAAAAACCAGCTTTCGCAGAAAAATGAACCTGCAAAGAAGTCTCTTCTAGACAAGACATGTGACCTACTTCGAAACTTTCCAGAATACATGGATGTTGTAGTCAGTGTTGCTAGGAAAACTGATGGTCGGCACTGGGCAGATCTTTTCCATGCAGCTGGACGATCCACAGAGATGTTTGAGGAATGCTTCCAACGGCGATGGTATAGGACTGCTGCTTGCTACATTCTGGTCATTGCGAAGCTGGAAGGCCCTGCTGTCAGTCAGTACTGTGCACTCCGTTTGCTACAATGCTTGTTACTATCCAGGCTACACTGGATGAA]

[+] EMBL CB632828             [AAAACTTGTCAGAAAGGATTCTTGCATTCTCATTTGCCAAATGTTGCCTAAACAGAGGACTTTCGGGCACAACATATACTCGCCAGATTCTTTATGGTGAAGATCGAATCCTATTGGTACAACCGGATGATACTGATGAACTTAAGATGTTGCATCTTAATGTTCCAGCATCCTATATTTCACAGAATTGGCCAGTTCTTCATGTTGTTGCAAGCAATGATGGTATGTACTTGGCAGTTGCAGGCTCTCATGGGCTAGTGCTGTATGATTTGCGCAATAAAAGGTGGCGTGTTTTTGGGGATGTTACTCAAGAGCAAAAGATTCAATGCAAAGGCTTGTTGTGGCTTGGCAAAATAGTTATTGTATGCAACTACATTGAATCATCAAATACGTATGAGCTTC TCTTTTTCCCAAGATATCACCTTGATTATAGCTCATTACTTTACCGGAAATCACTTCTTGGTCGACCAATTGTCATGGATGTCTTCCAGGACTACATACTTGTTACCTACAGTCCATTTGATGTGCATATTTTCCATGTGGTGATATCAGGAGAATTGTCACCTGCTAGTAGTCCTGTTTTACAGCTTTCAACAGTCCGAGAACTTTCAATCATGAGTCCAAAGAGTCCACCTGTTTCGATGCGCTTCATTCCTGAACCAACTGATGAAGGAAAGCCGAAACATGATACTAATGGATCTTCTGACTTGTCCCAACAACCTTCAAGATGCCTAATCTTGCGGATGAATGGGGAACTTTCTGTNGTGGACATGGATGATGGACATGAAACATCACTTACTAATTCAGTTGAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CB669903             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACTCAAGACCTTAAGATTCAATGCAAAGGCTTGTTGTGGCTTGGCAAAATAGTTATTGTATGCAACTACATTGAATCATCAAATACGTATGAGCTTC TCTTTTTCCCAAGATATCACCTTGATTATAGCTCATTACTTTACCGGAAATCACTTCTTGGTCGACCAATTGTCATGGATGTCTTCCAGGACTACATACTTGTTACCTACAGTCCATTTGATGTGCATATTTTCCATGTGGTGATATCAGGAGAATTGTCACCTGCTAGTAGTCCTGTTTTACAGCTTTCAACAGTCCGAGAACTTTCAATCATGAGTCCAAAGAGTCCACCTGTTTCGATGCGCTTCATTCCTGAACCAACTGATGAAGGAAAGCCGAAACATGATACTAATGGATCTTCTGACTTGTCCCAACAACCTTCAAGATGCCTAATCTTGCGGATGAATGGGGAACTTTCTGTGTTGGACATGGATGATGGACATGAACAATCACTTACTAATTCAGTTGAATTATTTTGGGTCACTTGTTCCCAATACGAAGAGAAGGGTAATCTTATCAAAGAGGTTTCATGGCTTGACTATGGCCATAAGGGGATGCAGGTGTGGTACCCATCCCATGGAGAAAATCCTTTTAAACAAGAAGATTTCTTGCAGCTGGATCCGGAGCTTGAATTTGACCGTGAGGTGTATCCGCTTGGTCTTCTTCCAAATGTTGGTGTAGTTGTT GGTATTTCTCAGAGAATGTCCTTCTCGACTGCAGAGTTTCCATGCTTTGAACCTTCTCCTCAAGCCCAAACAATATTGCATTGTTTGCTGCGGCATCTCCTTCAGAGAGACAAACATGAAGAAGCTCTGCGTTTGGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CB682875             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gacctTTCATCTTTTTCCCAAGATATCACCTTGATTATAGCTCATTACTTTACCGGAAATCACTTCTTGGTCGACCACTTGTGATGGATGTCTTCCAGGACTACATACTTGTTACCTACAGTCCATTTGATGTGCATATTTTCCATGTGGTGATATCAGGAGAATTGTCACCTGCTAGTAGTCCTGTTTTACAGCTTTCAACAGTCCGAGAACTTTCAATCATGAGTCCAAAGAGTCCACCTGTTTCGATGCGCTTCATTCCTGAACCAACTGATGAAGGAAAGCCGAAACATGATACTAATGGATCTTCTGACTTGTCCCAACAACCTTCAAGATGCCTAATCTTGCGGATGAATGGGGAACTTTCTGTGTTGGACATGGATGATGGACATGAACAATCACTTACTAATTCAGTTGAATTATTTTGGGTCACTTGTTCCCAATACGAAGAGAAGGGTAATCTTATCAAAGAGGTTTCATGGCTTGACTATGGCCATAAGGGGATGCAGGTGTGGTACCCATCCCATGGAGAAAATCCTTTTAAACAAGAAGATTTCTTGCAGCTGGATCCGGAGCTTGAATTTGACCGTGAGGTGTATCCGCTTGGTCTTCTTCCAAATGTTGGTGTAGTTGTT GGTATTTCTCAGAGAATGTCCTTCTCGACTGCAGAGTTTCCATGCTTTGAACCTTCTCCTCAAGCCCAAACAATATTGCATTGTTTGCTGCGGCATCTCCTTCAGAGAGACAAACATGAAGAAGCTCTGCGTTTGGCAAACTTGTCTGCAGAGAAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL C26664               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CCCAACAACCTTCAAGATGCCTAATCTTGCGGATGAATGGGGAACTTTCTGTGTTGGACATGGATGATGGACATGAACAATCACTTACTAATTCAGTTGAATTATTTTGGGTCACTTGTTCCCAATACGAAGAGAAGGGTAATCTTATCAAAGAGGTTTCATGGCTTGACTATGGCCATAAGGGGATGCAGGTGTGGTACCCATCCCATGGAGAAAATCCTTTTAAACAAGAAGATTTCTTGCAGCTGGATCCGGAGCTTGAATTTGACCGTGAGGTGTATCCGCTTGGTCTTCTTCCAAATGTTGGTGTAGTTGTTGGGTATTTCTCAGAGAATGTCCTTCTCGACTGCAGAGTTTCCATGCTTTGAACCTTCTCCTCAAGGCCAAACAATATTGCATTGTTTGCTGNGGna                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CB626616             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GAGGTCTCATGGCTTGACTATGGCCATAAGGGGATGCAGGTGTGGTACCCATCCCATGGAGAAAATCCTTTTAAACAAGAAGATTTCTTGCAGCTGGATCCGGAGCTTGAATTTGACCGTGAGGTGTATCCGCTTGGTCTTCTTCCAAATGTTGGTGTAGTTGTT GGTATTTCTCAGAGAATGTCCTTCTCGACTGCAGAGTTTCCATGCTTTGAACCTTCTCCTCAAGCCCAAACAATATTGCATTGTTTGCTGCGGCATCTCCTTCAGAGAGACAAACATGAAGAAGCTCTGCGTTTGGCAAACTTGTCTGCAGAGAAACCTCACTTCTCTAGATGTTTGGAATGGCTCCTGTTTACGGTATTTGATGCAGAGATATCAAGCCAAAGTGCTTCAAAAAACCAGCTTTCGCAGAAAAATGAACCTGCAAAGAAGTCTCTTCTAGACAAGACATGTGACCTACTTCGAAACTTTCCAGAATACATGGATGTTGTAGTCAGTGTTGCTAGGAAAACTGATGGTCGGCACTGGGCAGATCTTTTCCATGCAGCTGGACGATCCACAGAGATGTTTGAGGAATGCTTCCAACGGCGATGGTATAGGACTGCTGCTTGCTACATTCTGGTCATTGCGAAGCTGGAAGGCCCTGCTGTCAGTCAGTACTGTGCACTCCGTTTGCTACAATGCTTGTTACTATCCAGGCTACACTGGATGAA]
[+] EMBL CB626617             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GAGGCCTCATGGCTTGACTATGGCCATAAGGGGATGCAGGTGTGGTACCCATCCCATGGAGAAAATCCTTTTAAACAAGAAGATTTCTTGCAGCTGGATCCGGAGCTTGAATTTGACCGTGAGGTGTATCCGCTTGGTCTTCTTCCAAATGTTGGTGTAGTTGTT GGTATTTCTCAGAGAATGTCCTTCTCGACTGCAGAGTTTCCATGCTTTGAACCTTCTCCTCAAGCCCAAACAATATTGCATTGTTTGCTGCGGCATCTCCTTCAGAGAGACAAACATGAAGAAGCTCTGCGTTTGGCAAACTTGTCTGCAGAGAAACCTCACTTCTCTAGATGTTTGGAATGGCTCCTGTTTACGGTATTTGATGCAGAGATATCAAGCCAAAGTGCTTCAAAAAACCAGCTTTCGCAGAAAAATGAACCTGCAAAGAAGTCTCTTCTAGACAAGACATGTGACCTACTTCGAAACTTTCCAGAATACATGGATGTTGTAGTCAGTGTTGCTAGGAAAACTGATGGTCGGCACTGGGCAGATCTTTTCCATGCAGCTGGACGATCCACAGAGATGTTTGAGGAATGCTTCCAACGGCGATGGTATAGGACTGCTGCTTGCTACA                                                                                                 ]




>consensus_9827#0
AAAACTTGTCAGAAAGGATTCTTGCATTCTCATTTGCCAAATGTTGCCTAAACAGAGGAC
TTTCGGGCACAACATATACTCGCCAGATTCTTTATGGTGAAGATCGAATCCTATTGGTAC
AACCGGATGATACTGATGAACTTAAGATGTTGCATCTTAATGTTCCAGCATCCTATATTT
CACAGAATTGGCCAGTTCTTCATGTTGTTGCAAGCAATGATGGTATGTACTTGGCAGTTG
CAGGCTCTCATGGGCTAGTGCTGTATGATTTGCGCAATAAAAGGTGGCGTGTTTTTGGGG
ATGTTACTCAAGAGCAAAAGATTCAATGCAAAGGCTTGTTGTGGCTTGGCAAAATAGTTA
TTGTATGCAACTACATTGAATCATCAAATACGTATGAGCTTCTCTTTTTCCCAAGATATC
ACCTTGATTATAGCTCATTACTTTACCGGAAATCACTTCTTGGTCGACCAATTGTCATGG
ATGTCTTCCAGGACTACATACTTGTTACCTACAGTCCATTTGATGTGCATATTTTCCATG
TGGTGATATCAGGAGAATTGTCACCTGCTAGTAGTCCTGTTTTACAGCTTTCAACAGTCC
GAGAACTTTCAATCATGAGTCCAAAGAGTCCACCTGTTTCGATGCGCTTCATTCCTGAAC
CAACTGATGAAGGAAAGCCGAAACATGATACTAATGGATCTTCTGACTTGTCCCAACAAC
CTTCAAGATGCCTAATCTTGCGGATGAATGGGGAACTTTCTGTGTTGGACATGGATGATG
GACATGAACAATCACTTACTAATTCAGTTGAATTATTTTGGGTCACTTGTTCCCAATACG
AAGAGAAGGGTAATCTTATCAAAGAGGTTTCATGGCTTGACTATGGCCATAAGGGGATGC
AGGTGTGGTACCCATCCCATGGAGAAAATCCTTTTAAACAAGAAGATTTCTTGCAGCTGG
ATCCGGAGCTTGAATTTGACCGTGAGGTGTATCCGCTTGGTCTTCTTCCAAATGTTGGTG
TAGTTGTTGGTATTTCTCAGAGAATGTCCTTCTCGACTGCAGAGTTTCCATGCTTTGAAC
CTTCTCCTCAAGCCCAAACAATATTGCATTGTTTGCTGCGGCATCTCCTTCAGAGAGACA
AACATGAAGAAGCTCTGCGTTTGGCAAACTTGTCTGCAGAGAAACCTCACTTCTCTAGAT
GTTTGGAATGGCTCCTGTTTACGGTATTTGATGCAGAGATATCAAGCCAAAGTGCTTCAA
AAAACCAGCTTTCGCAGAAAAATGAACCTGCAAAGAAGTCTCTTCTAGACAAGACATGTG
ACCTACTTCGAAACTTTCCAGAATACATGGATGTTGTAGTCAGTGTTGCTAGGAAAACTG
ATGGTCGGCACTGGGCAGATCTTTTCCATGCAGCTGGACGATCCACAGAGATGTTTGAGG
AATGCTTCCAACGGCGATGGTATAGGACTGCTGCTTGCTACATTCTGGTCATTGCGAAGC
TGGAAGGCCCTGCTGTCAGTCAGTACTGTGCACTCCGTTTGCTACAATGCTTGTTACTAT
CCAGGCTACACTGGATGAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case