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Schistosoma mansoni
cluster # 10024 cluster # 10024       Sequences # 13       consensus # 3


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10024#0 length = 879 sequences # 9  
consensus_10024#1 length = 607 sequences # 3  
consensus_10024#2 length = 469 sequences # 1  

consensusID : consensus_10024#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 879
fasta sequence
                              [TGTGGTCCAAAAATTGCTACCACACATTTATCTACTGATATTGCAGAATTTATTTTATTCGGAATCTTATGTGGTCTACACGTAAATGGTAAAAATGCTGAAAATGCTTTAAACTGTTTACTATATGCTGGAATTAAAACTTATCTATCTGTGGATATTATTGTGGCCAGACAAAATTTACGATCTGTTATAATTCTCAATTTCAAAATATACTCAAATTTGTAGATGTTACGAGTCCTTCGTTACACCGGTTGCGCACTTTCCTCAATGACTGTCATGAGAATTTAATGGGGATAGTTGGTCTTTTATTTGTTTCGTTGGGATCGAAATTCTATCGTTTACCAACTGAACAGTTAAGAATTGCATTGCACGATGGTTGTTGTGCTGCATTTGAACATTTGCCCGACCTCAAGCTAAACAGTCTTCTACGATCTATTCTTCGTCCCTTTATCCGTCAGTGTCCTAGGCAGCATTTTGAAACTGCCATCATTCCTTTGGTCCCTCCAATAATTGAAGCTGCTATTAAGAGAACTGGTGCAAGATGGAATGAATTAGTCGTGGCCGATGGACGTATCTGTGAAGACGAAAAAGCAATCGCAGCTGAACTTGTACTGGACAGATCGACTCGTCTGTTAAGTCGAACATGTTTAGATATATTGCGTTTGATTTACACTTTCAATGGGTATGAAATATCTGAACAATTTAATACTCCTAAGGAACATGATGGAGAGTGCGATGATGATAATGATGATGTAGACATGTCAGAAAGTATATGTGCAAATGGTCAGTCGGGTACAAATAGTTCGCTTGGCCATTTAACAAAATTNTTGGCAAATATGCACACTGTGTCATCGGAACCGGACTATAATGCACAGAATC]

[+] EMBL CD124681             [TGTGGTCCAAAAATTGCTACCACACATTTATCTACTGATATTGCAGAATTTATTTTATTCGGAATCTTATGTGGTCTACACGTAAATGGTAAAAATGCTGAAAATGCTTTAAACTGTTTACTATATGCTGGAATTAAAACTTATCTATCTGTGGATATTATTGTGGCCAGACAAAATTTACGATCTGTTATAACTCTCAATTTCAAGATATACTCAAATTTGTAGATGTTACGAGTCCTTCGTTACACCGGTTGCGCACTTTCCTCAATGACTGTCATGAGAATTTAATGGGGATAGTTGGTCTTTTATTTGTTTCGTTGGGATCGAAATTCTATCGTTTACCAACTGAACAGTTAAGAATTGCATTGCACGATGGTTGTTGTGCTGCATTTGAACATTTGCCCGACCTCAAGCTAAACAGTCTTCTACGATCTATTCTTCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD124784             [ GTGGTCCAAAAATTGCTACCACACATTTATCTACTGATATTGCAGAATTTATTTTATTCGGAATCTTATGTGGTCTACACGTAAATGGTAAAAATGCTGAAAATGCTTTAAACTGTTTACTATATGCTGGAATTAAAACTTATCTATCTGTGGATATTATTGTGGCCAGACAAAATTTACGATCTGTTATAATTCTCAATTTCAAAATATACTCAAATTTGTAGATGTTACGAGTCCTTCGTTACACCGGTTGCGCACTTTCCTCAATGACTGTCATGAGAATTTAATGGGGATAGTTGGTCTTTTATTTGTTTCGTTGGGATCGAAATTCTATCGTTTACCAACTGAACAGTTAAGAATTGCATTGCACGATGGTTGTTGTGCTGCATTTGAGCATTTGCCCGACCTCAAGCTAAACAGTCTTCTACGATCTATTCTTCGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD124791             [                                                                      GTGGTCTACACGTAAATGGTAAAAATGCTGAAAATGCTTTAAACTGTTTACTATATGCTGGAATTAAAACTTATCTATCTGTGGATATTATTGTGGCCAGACAAAATTTACGATCTGTTATAATTCTCAATTTCAAAATATACTCAAATTTGTAGATGTTACGAGTCCTTCGTCACACCGGTTGCGCACTTTCCTCAATGACTGTCATGAGAATTTAATGGGGATAGTTGGTCTTTTATTTGTTTCGTTGGGATCGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD163882             [                                                                                                                                                                                                                                                  cgactgacGTTGCGCACTTTCCTCAATGACTGTCATGAGAATTTAATGGGGATAGTTGGTCTTTTATNTGTTTCGTTGGGATCGAAATTCTATCGTTTACCAACTGAACAGTTAAGAATTGCATTGCACGATGGTTGTTGTGCTGCATTTGAACATTTGCCCGACCTCAAGCTAAACAGTCTTCTACGATCTATTCTTCGTCCCTTTATCCGTCAGTGTCCTAGGCAGCATTTTGAAACTGCCATCATTCCTTTGGTCCCTCCAATAATTGAAGCTGCTATTAAGAGAACTGGTGCAAGATGGAATGAATTAGTCGTGGCCGATGGACGTATCTGTGAAGACGAAAAAGCAATCGCAGCTGAACTTGTACTGGACAGATCGACTCGTCTGTTAAGTCGAACATGTTTAGATATATTGCGTTTGATTTACACTTTCAATGGGTATGAAATATCTGAACAATTTAATACTCCTAAGGAACATGATGGAGAGTGCGATGATGATAATGATGATGTAGACATGTCAGAAAGTATAT                                                                                                         ]
[+] EMBL CD163817             [                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTCCTCAATGACTGTCATGAGAATTTAATGGGGATAGTTGGTCTTTTATTTGTTTCGTTGGGATCGAAATTCTATCGTTTACCAACTGAACAGTTAAGTATTGCATTGCACGATGGTTGTTGTGCTGCATTTGAACATTTGCCCGACCTCAAGCTAAACAGTCTTCTACGATCTATTCTTCGTCCCTTTATCCGTCAGTGTCCTAGGCAGCATTTTGAAACTGCCATCATTCCTTTGGTCCCTCCAATAATTGAAGCTGCTATTAAGAGAACTGGTGCAAGATGGAATGAATTAGTCGTGGCCGATGGACGTATCTGTGAAGACGAAAAAGCAATCGCAGCTGAACTTGTACTGGACAGATCGACTCGTCTGTTAAGTCGAACATGTTTAGATATATTGCGTTTGATTTACACTTTCAATGGGTATGAAATATCTGAACAATTTAATACTCCTAAGGAACATGATGGAGAGTGCGATGATGATAATGATGATGTANACATGTCANANAGTATA                                                                                                          ]
[+] EMBL CD163860             [                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTCCTCAATGACTGTCATGAGAATTTAATGGGGATAGTTGGTCTTTTATTTGTTTCGTTGGGATCGAAATTCTATCGTTTACCAACTGAACAGTTAAGAATTGCATTGCACGATGGTTGTTGTGCTGCATTTGAACATTTGCCCGACCTCAAGCTAAACAGTCTTCTACGATCTATTCTTCGTCCCTTTATCCGTCAGTGTCCTAGGCAGCATTTTGAAACTGCCATCATTCCTTTGGTCCCTCCAATAATTGAGGCTGCTATTAAGAGAACTGGTGCAAGATGGAATGAATTAGTCGTGGCCGATGGACGTATCTGTGAAGACGAAAAAGCAATCGCAGCTGAACTTGTACTGGACAGATCGTCTCGTCTGTTAAGTCGAACATGTTTAGATATATTGCGTTTGATTTACACTTTCAATGGGTATGAAATATCTGAACAATTTAATACTCCTAAGGAACATGATGGAGAGTGCGATGATGATAATGATGATGTAGACATGTCAGAAAGTATA                                                                                                          ]
[+] EMBL CD163852             [                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTCCTCAATGACTGTCATGAGAATTTAATGGGGATAGTTGGTCTTTTATTTGTTTCGTTGGGATCGAAATTCTATCGTTTACCAACTGAACAGTTAAGAATTGCATTGCACGATGGTTGTTGTGCTGCATTTGAACATTTGCCCGACCTCAAGCTAAACAGTCTTCTACGATCTATTCTTCGTCCCTTTATCCGTCAGTGTCCTAGGCAGCATTTTGAAACTGCCATCATTCCTTTGGTCCCTCCAATAATTGAAGCTGCTATTAAGAGAACTGGTGCAAGATGGAATGAATTAGTCGTGGCCGATGGACGTATCTGTGAAGACGAAAAAGCAATCGCAGCTGAACTTGTACTGGACAGATCGACTCGTCTGTTAAGTCGAACATGTTTAGATATATTGCGTTTGATTTACACTTTCAATGGGTATGAAATATCTGAACAATTTAATACTCCTAAGGAACATGATGGAGAGTGCGATGATGATAATGATGATGTAGACATGTCAGAAAGTATATGTGCAAATGGTCAGTCG                                                                                        ]
[+] EMBL CD184949             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTCTATCGTTTACCAACTGAACAGTTAAGAATTGCATTGCACGATGGTTGTTGTGCTGCATTTGAACATTTGCCCGACCTCAAGCTAAACAGTCTTCTACGATCTATTCTTCGTCCCTTTATCCGTCAGTGTCCTAGGCAGCATTTTGAAACTGCCATCATTCCTTTGGTCCCTCCAATAATTGAAGCTGCTATTAAGAGAACTGGTGCAAGATGGAATGAATTAGTCGTGGCCGATGGACGTATCTGTGAAGACGAAAAAGCAATCGCAGCTGAACTTGTACTGGACAGATCGACTCGTCTGTTAAGTCGAACATGTTTAGATATATTGCGTTTGATTTACACTTTCCATGGGTATGAAATATCTGAACCATT                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL SMT14495             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ACTGGACAGATCGACTCGTCTGTNAAGTCGAACATGTTTAGATATATTCCNTTTAATTTACACTTTCAATGGGTATGAAATANCTNACCAATTTAATACTCCTAAGGAACATGATGGAGAGTNCGATGATGATAATNATGATGTAGACATGTCAGAAAGTATATGTCCAAATGGTCAGTCAGGTACAAATAGTTCGCTTGGCCATTTAACAAAATTNTTGGCAAATATGCACACTGTGTCATCGGAACCGGACTATAATGCACAGAATC]


>consensus_10024#0 TGTGGTCCAAAAATTGCTACCACACATTTATCTACTGATATTGCAGAATTTATTTTATTC GGAATCTTATGTGGTCTACACGTAAATGGTAAAAATGCTGAAAATGCTTTAAACTGTTTA CTATATGCTGGAATTAAAACTTATCTATCTGTGGATATTATTGTGGCCAGACAAAATTTA CGATCTGTTATAATTCTCAATTTCAAAATATACTCAAATTTGTAGATGTTACGAGTCCTT CGTTACACCGGTTGCGCACTTTCCTCAATGACTGTCATGAGAATTTAATGGGGATAGTTG GTCTTTTATTTGTTTCGTTGGGATCGAAATTCTATCGTTTACCAACTGAACAGTTAAGAA TTGCATTGCACGATGGTTGTTGTGCTGCATTTGAACATTTGCCCGACCTCAAGCTAAACA GTCTTCTACGATCTATTCTTCGTCCCTTTATCCGTCAGTGTCCTAGGCAGCATTTTGAAA CTGCCATCATTCCTTTGGTCCCTCCAATAATTGAAGCTGCTATTAAGAGAACTGGTGCAA GATGGAATGAATTAGTCGTGGCCGATGGACGTATCTGTGAAGACGAAAAAGCAATCGCAG CTGAACTTGTACTGGACAGATCGACTCGTCTGTTAAGTCGAACATGTTTAGATATATTGC GTTTGATTTACACTTTCAATGGGTATGAAATATCTGAACAATTTAATACTCCTAAGGAAC ATGATGGAGAGTGCGATGATGATAATGATGATGTAGACATGTCAGAAAGTATATGTGCAA ATGGTCAGTCGGGTACAAATAGTTCGCTTGGCCATTTAACAAAATTNTTGGCAAATATGC ACACTGTGTCATCGGAACCGGACTATAATGCACAGAATC



consensusID : consensus_10024#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 607
fasta sequence
                              [AGACACTGAAACTAGTTCATCCAACTTTACTTCCTGTATTACAACATACAGATGAAATTCAACTATGTTCATTGAATTCTCAATTTCAAAATATACTCAAATTTGTAGATGTTACGAGTCCTTCGTTACACCGGTTGCGCACTTTCCTCAATGACTGTCATGAGAATTTAATGGGGATAGTTGGTCTTTTATTTGTTTCGTTGGGATCGAAATTCTATCGTTTACCAACTGAACAGTTAAGAATTGCATTGCACGATGGTTGTTGTGCTGCATTTGAACATTTGCCCGACCTCAAGCTAAACAGTCTTCTACGATCTATTCTTCGTCCCTTTATCCGTCAGTGTCCTAGGCAGCATTTTGAAACTGCCATCATTCCTTTGGTCCCTCCAATAATTGAAGCTGCTATTAAGAGAACTGGTGCAAGATGGAATGAATTAGTCGTGGCCGATGGACGTATCTGTGAAGACGAAAAAGCAATCGCAGCTGAACTTGTACTGGACAGATCGACTCGCCTGTTAAGTCGAACATGTTTAGATATATTGCGTAAGCTGTTGATTTTTATCATCAACCAATTAAATGTTTGTTGTTACATTATTAACTATTTATC]

[-] EMBL CD128449             [ GACACTGAAACTAGTTCATCCAACTTTACTTCCTGTATTACAACATACAGATGAAATTCAACTATGTTCATTGAATTCTCAATTTCAAAATATACTCAAATTTGTAGATGTTACGAGTCCTTCGTTACACCGGTTGCGCACTTTCCTCAATGACTGTCATGAGAATTTAATGGGGATAGTTGGTCTTTTATTTGTTTCGTTGGGATCGAAATTCTATCGTTTACCAACTGAACAGTTAAGAATTGCATTGCACGATGGTTGTTGTGCTGCATTTGAACATTTGCCCGACCTCAAGCTAAACAGTCTTCTACGATCTATTCTTCGTCCC TTATCCGTCAGTGTCCTAGGCAGCATTTTG  ACTGCCATCATTCCTTT GTCCCTCCAATAA                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD128232             [aaACACTGAAACTAGTTCATCCAACTTTACTTCCTGTATTACAACATACAGATGAAATTCAACTATGTTCATTGAATTCTCAATTTCAAAATATACTCAAATTTGTAGATGTTACGAGTCCTTCGTTACACCGGTTGCGCACTTTCCTCAATGACTGTCATGAGAATTTAATGGGAATAGTTGGTCTTTTATTTGTTTCGTTGGGATCGAAATTCTATCGTTTACCAACTGAACAGTTAAGAATTGCATTGCACGATGGTTGTTGTGCTGCATTTGAACATTTGCCCGACCTCAAGCTAAACAGTCTTCTACGATCTATTCTTCGTCCCTTTATCCGTCAGTGTCCTAGGCAGCATTTTGAAACTGCCATCATTCCTTTGGTCC                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD161010             [                                                                                      CAAAATATACTCAAATTTGTAGATGTTACGAGTCCTTCGTTACACCGGTTGCGCACTTTCCTCAATGACTGTCATGAGAATTTAATGGGGATAGTTGGTCTTTTATTTGTTTCGTTGGGATCGAAATTCTATCGTTTACCAACTGAACAGTTAAGAATTGCATTGCACGATGGTTGTTGTGCTGCATTTGAACATTTGCCCGACCTCAAGCTAAACAGTCTTCTACGATCTATTCTTCGTCCCTTTATCCGTCAGTGTCCTAGGCAGCATTTTGAAACTGCCATCATTCCTTTGGTCCCTCCAATAATTGAAGCTGCTATTAAGAGAACTGGTGCAAGATGGAATGAATTAGTCGTGGCCGATGGACGTATCTGTGAAGACGAAAAAGCAATCGCAGCTGAACTTGTACTGGACAGATCGACTCGCCTGTTAAGTCGAACATGTTTAGATATATTGCGTAAGCTGTTGATTTTTATCATCAACCAATTAAATGTTTGTTGTTACATTATTAACTATTTATC]


>consensus_10024#1 AGACACTGAAACTAGTTCATCCAACTTTACTTCCTGTATTACAACATACAGATGAAATTC AACTATGTTCATTGAATTCTCAATTTCAAAATATACTCAAATTTGTAGATGTTACGAGTC CTTCGTTACACCGGTTGCGCACTTTCCTCAATGACTGTCATGAGAATTTAATGGGGATAG TTGGTCTTTTATTTGTTTCGTTGGGATCGAAATTCTATCGTTTACCAACTGAACAGTTAA GAATTGCATTGCACGATGGTTGTTGTGCTGCATTTGAACATTTGCCCGACCTCAAGCTAA ACAGTCTTCTACGATCTATTCTTCGTCCCTTTATCCGTCAGTGTCCTAGGCAGCATTTTG AAACTGCCATCATTCCTTTGGTCCCTCCAATAATTGAAGCTGCTATTAAGAGAACTGGTG CAAGATGGAATGAATTAGTCGTGGCCGATGGACGTATCTGTGAAGACGAAAAAGCAATCG CAGCTGAACTTGTACTGGACAGATCGACTCGCCTGTTAAGTCGAACATGTTTAGATATAT TGCGTAAGCTGTTGATTTTTATCATCAACCAATTAAATGTTTGTTGTTACATTATTAACT ATTTATC



consensusID : consensus_10024#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 469
fasta sequence
                              [AAATTATTGGCAAATATGCACACTGTGTCATCGGAACCGGACTATAATGCACAGAATCTTCCTTCAGATCCTTTGTTCTTACGTTCACTAACGAAAATTTTAGCTTGGCCTGATACTTCAATTTGCTCTAAAGCTGCTCAGTGGATATCAATTCTGGTTGAGATGCTGACCAATACCGTCACTCAGACTAATTGTGGTCCAAAAATTGCTACCACACATTTATCTACTGATATTGCAGAATTTATTTTATTCGGAATCTTATGTGGTCTACACGTAAATGGTAAAAATGCTGAAAATGCTTTAAACTGTTTACTATATGCTGGAATTAAAACTTATCTATCTGTGGATATTATTGGGGCCAGACAAAATTTACGATCTGGTATAATTCGTGTTTTAATGGATACATTAAATGGTGATAAAACTAAAGACGGACAGATACAACAGCACCTTCAAATTTTTGAGGAAAAAA]

[+] EMBL CD132868             [AAATTATTGGCAAATATGCACACTGTGTCATCGGAACCGGACTATAATGCACAGAATCTTCCTTCAGATCCTTTGTTCTTACGTTCACTAACGAAAATTTTAGCTTGGCCTGATACTTCAATTTGCTCTAAAGCTGCTCAGTGGATATCAATTCTGGTTGAGATGCTGACCAATACCGTCACTCAGACTAATTGTGGTCCAAAAATTGCTACCACACATTTATCTACTGATATTGCAGAATTTATTTTATTCGGAATCTTATGTGGTCTACACGTAAATGGTAAAAATGCTGAAAATGCTTTAAACTGTTTACTATATGCTGGAATTAAAACTTATCTATCTGTGGATATTATTGGGGCCAGACAAAATTTACGATCTGGTATAATTCGTGTTTTAATGGATACATTAAATGGTGATAAAACTAAAGACGGACAGATACAACAGCACCTTCAAATTTTTGAGGAAAAAA]


>consensus_10024#2 AAATTATTGGCAAATATGCACACTGTGTCATCGGAACCGGACTATAATGCACAGAATCTT CCTTCAGATCCTTTGTTCTTACGTTCACTAACGAAAATTTTAGCTTGGCCTGATACTTCA ATTTGCTCTAAAGCTGCTCAGTGGATATCAATTCTGGTTGAGATGCTGACCAATACCGTC ACTCAGACTAATTGTGGTCCAAAAATTGCTACCACACATTTATCTACTGATATTGCAGAA TTTATTTTATTCGGAATCTTATGTGGTCTACACGTAAATGGTAAAAATGCTGAAAATGCT TTAAACTGTTTACTATATGCTGGAATTAAAACTTATCTATCTGTGGATATTATTGGGGCC AGACAAAATTTACGATCTGGTATAATTCGTGTTTTAATGGATACATTAAATGGTGATAAA ACTAAAGACGGACAGATACAACAGCACCTTCAAATTTTTGAGGAAAAAA



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10024#0      TGTGGTCCAAAAATTGCTACCACACATTTATCTACTGATATTGCAGAATTTATTTTATTC 60
consensus_10024#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10024#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10024#0      GGAATCTTATGTGGTCTACACGTAAATGGTAAAAATGCTGAAAATGCTTTAAACTGTTTA 120
consensus_10024#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10024#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10024#0      CTATATGCTGGAATTAA---AACTTATCTATCTGTGGATATTATTGTGGCCAGACAAAAT 177
consensus_10024#1      --AGACACTGAAACTAGTTCATCCAACTTTACTTCCTGTATTACAACATACAGATGAAAT 58
consensus_10024#2      ---------------------------------------------------AAATTATTG 9
                                                                          * *  *   

consensus_10024#0      TTACGATCTGTTAT--AATTCTCAATTTCAAAATATACTCAAATTTGTAGATGTTACGAG 235
consensus_10024#1      TCAACTATGTTCATTGAATTCTCAATTTCAAAATATACTCAAATTTGTAGATGTTACGAG 118
consensus_10024#2      GCAAATATGCACACTGTGTCATCGGAACCGGACTATAAT-GCACAGAATCTTCCTTCAGA 68
                         *         *     *  **     *  * **** *   *        *  * *   

consensus_10024#0      TCCTTCGTTACACCGGTTGCGCACTTTCCTCAATGACTGTCATGAGAATTTAATGGGGAT 295
consensus_10024#1      TCCTTCGTTACACCGGTTGCGCACTTTCCTCAATGACTGTCATGAGAATTTAATGGGGAT 178
consensus_10024#2      TCCTTTGTTCTTACGTTCACTAACGAAAATTTTAGCTTGGCCTGATACTTCAA------- 121
                       ***** ***    ** *  *  **     *    *  ** * *** * ** **       

consensus_10024#0      AGTTGGTCTTTTATTTGTTTCGTTGGGATCGAAATTCTATCGTTTACCAACTGAACAGTT 355
consensus_10024#1      AGTTGGTCTTTTATTTGTTTCGTTGGGATCGAAATTCTATCGTTTACCAACTGAACAGTT 238
consensus_10024#2      --TTTGCTCTAAAGCTGCTCAGTGGATATC--AATTCTG--GTTGAGATGCTGACCAATA 175
                         ** *   *  *  ** *  ** *  ***  ******   *** *    **** ** * 

consensus_10024#0      AAG--AATTGCATTGCACGATGGTTGTTGTGCTGCATTTGAACATTTGCCCGACCTCAAG 413
consensus_10024#1      AAG--AATTGCATTGCACGATGGTTGTTGTGCTGCATTTGAACATTTGCCCGACCTCAAG 296
consensus_10024#2      CCGTCACTCAGACTA-ATTGTGGTCCAAAAATTGCTACCACACATTTATCTA--CTGATA 232
                         *  * *   * *  *   ****        ***      ******  *    ** *  

consensus_10024#0      CTAAACAGTCTTCTACGATCT-ATTCTTCGTCCCTTTATCCGTCAGTGTCCTAGGCAGCA 472
consensus_10024#1      CTAAACAGTCTTCTACGATCT-ATTCTTCGTCCCTTTATCCGTCAGTGTCCTAGGCAGCA 355
consensus_10024#2      TTGCAGAATTTATTTTATTCGGAATCTTATGTGGTCTACACGTAAATG-----GTAAAAA 287
                        *  * * * *  *    **  * ****      * **  *** * **     *  *  *

consensus_10024#0      TTTTGAAACTGCCATCATTCCTTTGGTCCCTCCAATAATTGAAGCTG------CTATTAA 526
consensus_10024#1      TTTTGAAACTGCCATCATTCCTTTGGTCCCTCCAATAATTGAAGCTG------CTATTAA 409
consensus_10024#2      TGCTGAAAATGCTTTAAACTGTTTACTATATGCTGGAATTAAAACTTATCTATCTGTGGA 347
                       *  ***** ***  * *    ***  *   * *   **** ** **       ** *  *

consensus_10024#0      GAGAACTGGTGCAAGATGGAATGAATTAGTCGTGGCCGATGGACGTATCTGTGAAGACGA 586
consensus_10024#1      GAGAACTGGTGCAAGATGGAATGAATTAGTCGTGGCCGATGGACGTATCTGTGAAGACGA 469
consensus_10024#2      TATTATTGGGGCCAGACAAAATTTAC-GATCTGGTATAATTCGTGTTTTAATGGATACAT 406
                        *  * *** ** ***   ***  *    **  *    **    ** *   ** * **  

consensus_10024#0      AAAAGCAATCGCAGCTGAACTTGTACTGGACAGATCGACTCGTCTGTTAAGTCGAACATG 646
consensus_10024#1      AAAAGCAATCGCAGCTGAACTTGTACTGGACAGATCGACTCGCCTGTTAAGTCGAACATG 529
consensus_10024#2      TAAA----TGGTGATAAAACTAAAGACGGACAGATACAACAGCACCT----TCAAATTTT 458
                        ***    * *      ****      ********  *   *    *    ** **  * 

consensus_10024#0      TTTAGATATATTGCGTTTGATTTACACTTTCAATGGGTATGAAATATCTGAACAATTTAA 706
consensus_10024#1      TTTAGATATATTGCGTAAGCTGTTGATTTTTATCATCAACCAATTAAATGTTTGTTGTTA 589
consensus_10024#2      TGAGGAAAAAA------------------------------------------------- 469
                       *   ** * *                                                  

consensus_10024#0      TACTCCTAAGGAACATGATGGAGAGTGCGATGATGATAATGATGATGTAGACATGTCAGA 766
consensus_10024#1      CATTATTAACTA--TTTATC---------------------------------------- 607
consensus_10024#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10024#0      AAGTATATGTGCAAATGGTCAGTCGGGTACAAATAGTTCGCTTGGCCATTTAACAAAATT 826
consensus_10024#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10024#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10024#0      NTTGGCAAATATGCACACTGTGTCATCGGAACCGGACTATAATGCACAGAATC 879
consensus_10024#1      -----------------------------------------------------
consensus_10024#2      -----------------------------------------------------
                                                                            




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)