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Schistosoma mansoni
cluster # 10039 cluster # 10039       Sequences # 13       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10039#0 length = 796 sequences # 13  

consensusID : consensus_10039#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 13
consensus length = 796
fasta sequence
                              [TTATACTTTATTTGGCAATATTAACCAAATGATCATTTACATGTAAGATTAACGGGAACTAATGTTTAGCACTCATTGAAGAATATTCAAGTAAGCGTTGGGAATTTTCATAACACAAAGGAACTAATGTTGATAAGCAGAAGGGTCCTTAAAATGTTATCACTAGTCAAAAGTGCAACGAATGTAATTCACCTGTGGAAGATTTTGGAAAATATATGGATAAAGTGAAGAATTTTAAGTTCCTTAACTTTAGGAATTGGGGTTTACAACTAATGACACAAGACTTAAGGCGAGAGTTATCCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGCTACTATGAAATGAACTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAAAATATTGTAAAGGCTCAAAGTGAGGTCAAGCAACACAAACTCTTTATAAATGATGGTTTGCAAAGTGACGTTAACAGAAGCTAATAATATCGTGCTTATTCAATAGGTTACTAAAAATATATCGTTTTTAGCTAGAGCTAACGAATAAATTCCTTTAGGTAGATCTAGTTAGAGAAACATTGAATGACAATAGGTATATTATAGGGATCAACCTGATCTATCGTTCGG-TCATTGAAAAAACCTAGCTTTATGTGGTTAATTACAAGAATCACATAAATAGATCTTATTTAATCTGTCACTTTCGACACATCCTATTTGCATAAATAAACATTTGTTTGAAACTTTCTTAACATATACTGGCTTAATATCAAGTCATAAACTGGATGTAATTGTCTTAAATA]

[+] EMBL CD091083             [TTATACTTTATTTGGCAATATTAACCAAATGATCATTTACATGTAAGATTAACGGGAACTAATGTTTAGCACTCATTGAAGAATATTCAAGTAAGCGTTGGGAATTTTCATAACACAAAGGAACTAATGTTGATAAGCAGAAGGGTCCTTAAAATGTTATCACTAGTCAAAAGTGCAACGAATGTAATTCACCTGTGGAAGATTTTGGAAAATATATGGATAAAGTGAAGAATTTTAAGTTCCTTAACTTTAGGAATTGGGGTTTACAACTAATGACACAAGACTTAAGGCGAGAGTTATCCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGCTACTATGAAATGAACTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAACATATTGTAAAGGCTCACAGTGAGGTCAAGCAACACAAACTCCTTATAAATGATGGTTTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD091110             [TTATACTTTATTTGGCAATATTAACCAAATGATCATTTACATGTAAGATTAACGGGAACTAATGTTTAGCACTCATTGAAGAATATTCAAGTAAGCGTTGGGGATTTTCATAACACAAAGGAACTAATGTTGATAAGCAGAAGGGTCCTTAAAATGTTATCACTAGTCAAAAGTGCAACGAATGTAATTCACCTGTGGAAGATTTTGGAAAATATATGGATAAAGTGAAGAATTTTAAGTTCCTTAACTTTAGGAATTGGGGTTTACAACTAATGACACAAGACTTAAGGCGAGAGTTATCCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGCTACTATGAAATGAACTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAAAATATTGTAAAGGCTCAAAGTGAGGTCAAGCAACACAAACTCTCTATAAATGATGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD091091             [TTATACTTTATTTGGCAATATTAACCAAATGATCATTTACATGTAAGATTAACGGGAACTAATGTTTAGCACTCATTGAAGAATATTCAAGTAGGCGTTGGGAATTTTCATAACACAAAGGAACTAATGTTGATAAGCAGAAGGGTCCTTAAAATGTTATCACTAGTCAAAAGTGCAACGAATGTAATTCACCTGTGGAAGATTTTGGAAAATATATGGATAAAGTGAAGAATTTTAAGTTCCTTAACTTTAGGAATTGGGGTTTACAACTAATGACACAAGACTTAAGGCGAGAGTTATCCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGCTACTATGAAATGAACTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAAAATATTGTAAAGGCTCAAAGTGAGGTCAAGCAACACAAACTCTTTATAAATGATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD091079             [TTATACTTTATTTGGCAATATTAACCAAATGATCATTTACATGTAAGATTAACGGGAACTAATGTTTAGCACTCATTGAAGAATATTCAAGTAAGCGTTGGGAATTTTCATAACACAAAGGAACTAATGTTGATAAGCAGAAGGGTCCTTAAAATGTTATCACTAGTCAAAAGTGCAACGAATGTAATTCACCTGTGGAAGATTTTGGAAAATATATGGATAAAGTGAAGAATTTTAAGTTCCTTAACTTTAGGAATTGGGGTTTACAACTAATGACACAAGACTTAAGGCGAGAGTTATCCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGCTACTATGAAATGAACTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD091118             [TTATACTTTATTTGGCAATATTAACCAAATGATCATTTACATGTAAGATTAACGGGAACTAATGTTTAGCACTCATTGAAGAATATTCAAGTAAGCGTTGGGAATTTTCATAACACAAAGGAACTAATGTTGATAAGCAGAAGGGTCCTTAAAATGTTATCACTAGTCAAAAGTGCAACGAATGTAATTCACCTGTGGAAGATTTTGGAAAATATATGGATAAAGTGAAGAATTTTAAGTTCCTTAACTTTAGGAATTGGGGTTTACAACTAATGACACAAGACTTAAGGCGAGAGTTATCCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGCTACTATGAAATGAACTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAAAATATTGTAAAGGCTCAAAGTGAGGTCAAGCAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD091108             [TTATACTTTATTTGGCAATATTAACCAAATGATCATTTACATGTAAGATTAACGGGAACTAATGTTTAGCACTCATTGAAGAATATTCAAGTAAGCGTTGGGAATTTTCATAACACAAAGGAACTAATGTTGATAAGCAGAAGGGTCCTTAAAATGTTATCACTAGTCAAAAGTGCAACGAATGTAATTCACCTGTGGAAGATTTTGGAAAATATATGGATCAAGTGAAGAATTTTAAGTTCCTTAACTTTAGGAATTGGGGTTTACAACTAATGACACAAGACTTAAGGCGAGAGTTATCCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGCTACTATGAAATGAACTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAGAATATTGTCAAGGCTCAAAGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD091103             [TTATACTTTATTTGGCAATATTAACCAAATGATCATTTACATGTAAGATTAACGGGAACTAATGTTTAGCACTCATTGAAGAATATTCAAGTAAGCGTTGGGAATTTTCATAACACAAAGGAACTAATGTTGATAAGCAGAAGGGTCCTTAAAATGTTATCACTAGTCAAAAGTGCAACGAATGTAATTCACCTGTGGAAGATTTTGGAAAATATATGGATAAAGTGAAGAATTTTAAGTTCCTTAACTTTAGGAATTGGGGTTTACAACTAATGACACAAGACTTAAGGCGAGAGTTATCCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGCTACTATGAAATGAACTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAAAATATTGTACAGGCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD091087             [TTATACTTTATTTGGCAATATTAACCAAATGATCATTTACATGTAAGATTAACGGGAACTAATGTTTAGCACTCATTGAAGAATATTCAAGTAAGCGTTGGGAATTTTCATAACACAAAGGAACTAATGTTGATAAGCAGAAGGGTCCTTAAAATGTTATCACTAGTCAAAAGTGCAACGAATGTAATTCACCTGTGGAAGATTTTGGAAAATATATGGATAAAGTGAAGAATTTTAAGTTCCTTAACTTTAGGAATTGGGGTTTACAACTAATGACACAAGACTTAAGGCGAGAGTTATCCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGCTACTATGAAATGAACTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAAAATATTGTAAAGGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD091082             [tcATACTTTATTTGGCAATATTAACCAAATGATCATTTACATGTAAGATTAACGGGAACTAATGTTTAGCACTCATTGAAGAATATTCAAGTAAGCGTTGGGAATTTTCATAACACAAAGGAACTAATGTTGATAAGCAGAAGGGTCCTTAAAATGTTATCACTAGTCAAAAGTGCAACGAATGTAATTCACCTGTGGAAGATTTTGGAAAATATATGGATAAAGTGAAGAATTTTAAGTTCCTTAACTTTAGGAATTGGGGTTTACAACTAATGACACAAGACTTAAGGCGAGAGTTATCCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGCTACTATGAAATGAACTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAAAATATTGTCAAGGCTCAAAGTGAGGTCAAGCAACACAAACTCTTTATAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD091105             [                                                                     CACTCATTGAAGAATATTCCCGTAGGCGTTGGGAATTTTCATAACACAAAGGAACTAATGTTGATAAGCAGAAGGGTCCTTAAAATGTTATCACTAGTCAAAAGTGCAACGAATGTAATTCACCTGTGGAAGATTTTGGAAAATATATGGATAAAGTGAAGAATTTTAAGTTCCTTAACTTTAGGAATTGGGGTTTACAACTAATGACACAAGACTTAAGGCGGGAGTTATCCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGCTACTATGAAATGAACTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAAAATATTGTAAAGGCTCAAAGTGAGGTCAAGCAACACAAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD164551             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGTTATCCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGTTACTATGAAATGAACTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAAAATATTGTAGAGGCTCAAAGTGAGGTCAAGCAACACAAACTCTTTATAAATGATGGTTTGCAAAGTGACGTTAACAGAAGCTAATAATATCGTGCTTATCCAATAGGTTACTAAAAATATATCGTTTTTAGCTAGAGCTAACGAATAAATTCCTTTAGGTAGATCTAGTTAGAGAAACATTGAATGACAATAGGTATATTATAGGGATCAACCTGATCTATCGTTCGGTTCATTGAAAAAACCTAGTTTTATGTGGTTAATTACAAGAATCTCATAAATAGATCTTATTTAATCTGTCACTTTCGACACA                                                                                            ]
[-] EMBL CD091123             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACAAACTCTTTATAAATGATGGTTTGCAAAGTGACGTTAACAGAAGCTAATAATATCGTGCTTATTCAATAGGTTACTAAAAATATATCGTTTTTAGCTAGAGCTAACGAATAAATTCCTTTAGGTAGATCTAGTTAGAGAAACATTGAATGACAATAGGTATATTATAGGGATCAACCTGATCTATCGTTCGG TCATTGAAAAAACCTAGCTTTGTGTGGTTAATTACAAGAATCACATAAATAGATCTTATTTAATCTGTCACTTTCGACACATCCTATTTGCATAAATAAACATTTGTTTGAAACTTTCTTAACATATACTGGCTTAATATCAAGTCATAAACTGGATGTAATTGTCTTAAATA]
[-] EMBL CD091116             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTTAACAGAAGCTAATAATATCGTGCTTATTCAATAGGTTACTGAAAATATATCGTTTTTAGCTAGAGCTAACGAATAAATTCCTTTAGGTAGAGCTAGTTAGAGAAACATTGAATGACAATAGGTATATTATAGGGATCAACCTGATCTATCGTTCGG TCATTGAAAAAACCTAGCTTTATGTGGTTAATTACAAGAATCACATAAATAGATCTTATTTAATCTGTCACTTTCGACACATCCTATTTGCATAAATAAACATTTGTTTGAAACTTTCTTAACATATACTGGCTTAATATCAAGTCATAAACTGGATGTAATTGTCTTAAGTA]


>consensus_10039#0 TTATACTTTATTTGGCAATATTAACCAAATGATCATTTACATGTAAGATTAACGGGAACT AATGTTTAGCACTCATTGAAGAATATTCAAGTAAGCGTTGGGAATTTTCATAACACAAAG GAACTAATGTTGATAAGCAGAAGGGTCCTTAAAATGTTATCACTAGTCAAAAGTGCAACG AATGTAATTCACCTGTGGAAGATTTTGGAAAATATATGGATAAAGTGAAGAATTTTAAGT TCCTTAACTTTAGGAATTGGGGTTTACAACTAATGACACAAGACTTAAGGCGAGAGTTAT CCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGCTACTATGAAATGAA CTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAAAATATTGTAAAGGCTCAAAGTGAGG TCAAGCAACACAAACTCTTTATAAATGATGGTTTGCAAAGTGACGTTAACAGAAGCTAAT AATATCGTGCTTATTCAATAGGTTACTAAAAATATATCGTTTTTAGCTAGAGCTAACGAA TAAATTCCTTTAGGTAGATCTAGTTAGAGAAACATTGAATGACAATAGGTATATTATAGG GATCAACCTGATCTATCGTTCGGTCATTGAAAAAACCTAGCTTTATGTGGTTAATTACAA GAATCACATAAATAGATCTTATTTAATCTGTCACTTTCGACACATCCTATTTGCATAAAT AAACATTTGTTTGAAACTTTCTTAACATATACTGGCTTAATATCAAGTCATAAACTGGAT GTAATTGTCTTAAATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)