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Schistosoma mansoni
cluster # 10050 cluster # 10050       Sequences # 13       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10050#0 length = 1350 sequences # 13  

consensusID : consensus_10050#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 13
consensus length = 1350
fasta sequence
                              [CGACAAAGTCCATCTTTAACAGCTAATCGTATCATACAGGGGTTTCCGTCTACTTTGCCGTCGAATAGCACTGAAGATGAACTACTGCCCTTATTTCCATTTGATGTGGAAAATCTAGACTTTGCTGATATATTAACAAATTTAGACCATATGCCAACCAGGACAGGTGATACGCTTTTGGTTTTTTATGTTGCTGCTGGTCAGTCAAAAGTTGGTGATATTCTTGCGAATATGAAAATTTGGCCAAGGCTGCCTGAAGCATTTCATCAGTTCTTAAGTGGTATCGGCTGTATCAAAAATATTTCTGATCATCCAGGTTGGACAGGGAA-CTTCAAACCAGTTATCGTACATCAAATGGACCC-TTGTAACGAGTCACTGTAATCAGACGAAAAATATACATGCTGACCACTGTCCAGATGGTATTCAATCAATTATATATTATGCTGATGCAATAACAGAATTAGCATGCATTTGTCCCACTAATCAATTTTATGGAAACGAAGAGAATCCTGATCAAAATTGTATATTAAAGAGTACACG-TTATCGCACTGCTAGCGAAATCATAACTAACATCACTCGTGGGACAAGTCAACGTGTAGTAGGTA-TGGGGGAAGTTGGGGCGGACCCGACTGGAGGTCGAGTGGCAGTTGTATGGCTCGAACGATGGGAAGATGGACCTATGCACTGTGAATCAGGAGTTGGAATGAACATCC-AGA-ATATGACTAGCAAGAATTTTGATTGCCCTGTCACAATTTATATTCATCCTTTAAGTTCCGGATTATGTAGAGTTGGCATCATGCGTCTTCAAGGAAGAACATTTGAAGCTGGTCCATTACAGAATGGATCTGTATTAAGTCAGCGTTGTCTTAGTAGTTTTGTAAGACAAACTGTTATAAACTTATCACGACGACGTCGTTTGGCTTCCGACTCATTTCAACCTCCTCATGTTCGACGAAGCCATGAATTATTCAGATTGGCAGAAGC-AAACCGTAAAATTGTTCGGGCTCAGCCATCATCATCTGGCAATAAAACTAGTACATACTCTTGTAACACAGCGAATATTGTGCGTAGTCTTTTTTTTTAGACAACCTCAAATTCATTCTAGCTAAAGCTTTTCATGTT-TTAACTGTAATATCCACTA-CTGTTGTGAACAAGGATTCCTTCACACTTACATATCAAACAGAATGTTTTTTTTCTTTTTATTTTCATAGTTTCTAATCTTACGTATTTAACACGTACCTAAA-TATACTTTTACATTTTAAAAAAGTTCATCTATAATTATGGTAATGATATATGAAACTTGCACGCTTACTACACCTTCAAAATCAATAATAGTTTGACTAAGTATAA]

[-] EMBL CD183263             [CGACAAAGTCCATCTTTAACAGCTAATCGTATCATACAGGGGTTTCCGTCTACTTTGCCGTCGAATAGCACTGAAGATGAACTACTGCCCTTATTTCCATTTGATGTGGAAAATCTAGACTTTGCTGATATATTAACAAATTTAGACCATATGCCAACCAGGACAGGTGATACGCTTTTGGTTTTTTATGTTGCTGCTGGTCAGTCAAAAGTTGGTGATATTCTTGCGAATATGAAAATTTGGCCAAGGCTGCCTGAAGCATTTCATCAGTTCTTAAGTGGTATCGGCTGTATCAAAAATATTTCAGATCtc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD183252             [CGACAAAGTCCATCTTTAACAGCTAATCGTATCATACAGGGGTTTCCGTCTACTTTGCCGTCGAATAGCACTGAAGATGAACTACTGCCCTTATTTCCATTTGATGTGGAAAATCTAGACTTTGCTGATATATTAACAAATTTAGACCATATGCCAACCAGGACAGGTGATACGCTTTTGGTTTTTTATGTTGCTGCTGGTCAGTCAAAAGTTGGTGATATTCTTGCGAATATGAAAATTTGGCCAAGGCTGCCTGAAGCATTTCATCAGTTCTTAAGTGGTATCGGCTGTATCAAAAATATTTCTGATCct                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD185635             [                                                                        GAAGATGAACTACTGCCCTTATTTCCATTTGATGTGGAAAATCTAGACTTTGCTGATATATTAACAAATTTAGACCATATGCCAACCAGGACAGGTGATACGCTTTTGGTTTTTTATGTTGCTGCTGGTCAGTCAAAAGTTGGTGATATTCTTGCGAATATGAAAATTTGGCCAAGGCTGCCTGAAGCATTTCATCAGTTCTTAAGTGGTATCGGCTGTATCAAAAATATTTCTGATCATCCAGGTTGGACAGGGAACCTTCAAACCAGTTATCGTACATCAAATGGACCCTTTGTAACGAGTCACTGTAATCAGACGAAAAATATACATGCTGACCACTGTCCAGATGGTATTCAATCAATTATATATTATGCTGATGCAATAACAGAATTAGCATGCATTTGTCCCACTAATCAATTTTATGGAAACGAAGAGAATCCTGATCAAAATTGTATATTAAAGAGTACACG TTATCGCACTGCTAGCGAAATCATAACTAACATCACTCGTGGGACAAGTCAACGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD201464             [                                                                                                                 TCTAGACTTTGCTGATATATTAACAAATTTAGACCATATGCCAACCAGGACAGGTGATACGCTTTTGGTTTTTTATGTTGCTGCTGGTCAGTCAAAAGTTGGTGATATTCTTGCGAATATGAAAATTTGGCCAAGGCTGCCTGAAGCATTTCATCAGTTCTTAAGTGGTATCGGCTGTATCAAAAATATTTCTGATCATCCAGGTTGGACAGGGAACCTTCAAACCAGTTATCGTACATCAAATGGACCCTTTGTAACGAGTCACTGTAATCAGACGAAGAATATACATGCTGACCACTGTCCAGATGGTATTCAATCAATTATATATTATGCTGATGCAATAACAGAATTAGCATGCATTTGTCCCACTAATCAATTTTATGGAAACGAAGAGAATCCTGATCAAAATTGTATATTAAAGAGTACACG TTATCGCACTGCTAGCGAAATCATAACTAACATCACTCGTGGGACAAGTCAACGTGTAGTAGGTATTGGGGGAAGTTGGGGCGGACCCGACTGGAGGTCGAGTGGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD156018             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGGACAGGGAACCTTCAAACCAGTTATCGTACATCAAATGGACCCTTTGTAACGAGTCACTGTAATCAGACGAAAGATATACATGCTGACCACTGTCCAGATGGTATTCAATCAATTATATATTATGCTGATGCAATAACAGAATTAGCATGCATTTGTCCCACTAATCAATTTTATGGAAACGAAGAGAATCCTGATCAAAATTGTATATTAAAGAGTACACG TTATCGCACTGCTAGCGAAATCATAACTAACATCACTCGTGGGACAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD161111             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACAGGGAA CTTCAAACCAGTTATCGTACATCAAATGGACCC TTGTAACGAGTCACTGTAATCAGACGAAAAATATACATGCTGACCACTGTCCAGATGGTATTCAATCAATTATATATTATGCTGATGCAATAACAGAATTAGCATGCATTTGTCCCACTAATCAATTTTATGGAAACGAAGAGAATCCTGATCAAAATTGTATATTAAAGAGTACACG TTATCGCACTGCTAGCGAAATCATAACTAACATCACTCGTGGGACAAGTCAACGTGTAGTAGGTA TGGGGGAAGTTGGGGCGGACCCGACTGGAGGTCGAGTGGCAGTTGTATGGCTCGAACGATGGGAAGATGGACCTATGCACTGTGAATCAGGAGTTGGAATGAACATCC AGA ATATGACTAGCAAGAATTTTGATTGCCCTGTCACAATTTATATTCATCCTTTAAGTTCCGGATTATGTAGAGTTGGCATCATGCGTCTTCAAGGAAGAACATTTGAAGCTGGTCCATTACAGAATGGATCTGTATTAAGTCAGCGTTGTCTTAGTAGTTTTGTAAGACAAACTGTTATAAACTTATCACGACGACGTCGTTTGGCTTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD082313             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            agacatCATGCATTTGTCCCACTAATCAATTTTATGTTAACGAAGAGAATCCTGCTCAAAATTGTATATTAAAGAGTACACG TTATCGCACTGCTAGCGAAATCATAACTAACATCACTCGTGGGACAAGTCAACGTGTAGTAGGTA TGGGGGAAGTTGGGGCGGACCCGACTGGAGGTCGAGTGGCAGTTGTATGGCTCGAACGATGGGAAGATGGACCTATGCACTGTGAATCAGGAGTTGGAATGAACATCC AGA ATATGACTAGCAAGAATTTTGATTGCCCTGTCACAATTTATATTCATCCTTTAAGTTCCGGATTATGTAGAGTTGGCATCATGCGTCTTCAAGGAAGAACATTTGAAGCTGGTCCATTACAGAATGGATCTGTATTAAGTCAGCGTTGTCTTAGTAGTTTTGTAAGACAAACTGTTATAAACTTATCACGACGACGTCGTTTGGCTTCCGACTCATTTCAACCTCCTCATGTTCGACGAAGCCATGAATTATTCAGATTGGCAGAAGC AAACCGTAAAATTGTTCGGGCTCAGCCATCATCATCTGGCAATAAAACTAGTACATACTCTTGTAACACAGCGAATATTGTGCGTAGTCTTTTTTTTTAGACAACCTCAAATTCATTCTAGCTAAAGCTTTTCATGTTNTAAACTGT ATATCCACTA CTGGTGTGAACAAGGATTNCTTCACACTTACATATCANACAGAATGTTNTTTTTCTTTTTATTTTCATAGNTTCTAATCTTACGTATTTAACACGTACCTAAANTATACT                                                                                                    ]
[+] EMBL SMAA18454            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGAATCCTGATCAAAATTGTATATTAAAGAGTACACG TTATCGCACTGCTAGCGAAATCATAACTAACATCACTCGTGGGACAAGTCAACGTGTAGTAGGTA TGGGGGAAGTTGGGGCGGACCCGACTGGAGGTCGAGTGGCAGTTGTATGGCTCGAACGATGGGAAGATGGACCTATGCACTGTGAATCAGGAGTTGGAATGAACtt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL BF936972             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATATTAAAGAGTACACGTTTATCGCACTGCTAGCGAAATCATAACTAACATCACTCGT GGACAAGTCAACGTGTAGTAGGTA TGGGGGAAGTTGGGGCGGACCCGACTGGAGGTCGAGTGGCAGTTGTATGGCTCGAACGATGGGAAGATGGACCTATGCACTGTGAATCAGGAGTTGGAATGAACATCCAAGA ATATGACTAGCAAGAATTTTGATTGCCCTGTCACAATTTATATTCATCCTTTAAGTTCCGGATTATGTAGAGTTGGCATCATGCGTCTTCAAGGAAGAACATTTGAAGCTGGTCCATTACAGAATGGATCTGTATTAAGTCAGCGTTGTCTTAGTAGTTTTGTAAGACAAACTGTTATAAACTTATCACGACGACGTCGTTTGGCTTCCGACTCATTTCAACCTCCTCATGTTCGACGAAGCCATGAATTATTCAGATTGGCAGAAGC AAACCGTAAAATTGTTCGGGCTCAGCCATCATCATCTGGCAATAAAACTAGTACATACTCTTGTAACACAGCGAATATTGTGCGTAGTC TTTTTTTTAGACAACCTCAAATTCATTCTAGCTAAAGCTTTTCATGTT TTAACTGTAATATCCACTA CTGTTGTGAACAAGGATTCCTTCACACTTACATATCAAACAGAATGTTTTTTTTCTTTTTATTTTCATAGTTTCTAATCTTACGTATTTAACACGTACCTAAA TATACTTTT                                                                                                 ]
[-] EMBL CD075915             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CGTGTAGTAGGTA T GGGGAAGTTGGGGCGGACCCGACTGGAGGTCGAGTGGCAGTTGTATGGCTCGAACGATGGGAAGATGGACCTATGCACTGTGAATCAGGAGTTGGAATGAACATCC AGANATATGACTAGCAAGAATTTTGATTGCCCTGTCACAATTTATATTCATCCTTTAAGTTCCGGATTATGTAGAGTTGGCATCATGCGTCTTCAAGGAAGAACATTTGAAGCTGGTCCATTACAGAATGGATCTGTATTAAGTCAGCGTTGTCTTAGTAGTTTTGTAAGACAAACTGTTATAAACTTATCACGACGACGTCGTTTGGCTTCCGACTCATTTCAACCTCCTCATGTTCGACGAAGCCATGAATTATTCAGATTGGCAGAAGC AAACCGTAAAATTGTTCGGGCTCAGCCATCATCATCTGGCAATAAAACTAGTACATACTCTTGTAACACAGCGAATATTGTGCGTAGTCTTTTTTTTTAGACAACCTCAAATTCATTCTAGCTAAAGCTTTTCATGTT TTAACTGTAATATCCACTA CTGTTGTGAACAAGGATTCCTTCACACTTACATATCAAACAGAATGTTTTTTTTCTTTTTATTTTCATAGTTTCTAATCTTACGTATTTAACACGTACCTAAA TATACTT                                                                                                   ]
[-] EMBL CD061767             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATGAACATCC AGA ATATGACTAGCAAGAATTTTGATTGCCCTGTCACAATTTATATTCATCCTTTAAGTTCCGGATTATGTAGAGTTGGCATCATGCGTCTTCAAGGAAGAACATTTGAAGCTGGTCCATTACAGAATGGATCTGTATTAAGTCAGCGTTGTCTTAGTAGTTTTGTAAGACAAACTGTTATAAACTTATCACGACGACGTCGTTTGGCTTCCGACTCATTTCAACCTCCTCATGTTCGACGAAGCCATGAATTATTCAGATTGGCAGAAGC AAACCGTAAAATTGTTCGGGCTCAGCCATCATCATCTGGCAATAAAACTAGTACATACTCTTGTAACACAGCGAATATTGTGCGTAGTCTTTTTTTTTAGGCAACCTCAAATTCATTCTAGCTAAAGCTTTTCATGTT TTAACTGTAATAT CACTACCTGTT                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL AI395296             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CGTCGTTTGCTTTCCGACTCATTTCAACCTCCTCATGTTCGACGAAGCCATGAATTATTCAGATTGGCAGAAGC AAACCGTAAAATTGTTCGGGCTCAGCCATCATCATCTGGCAATAAAACTAGTACATACTCTTGTAACACAGCGAATATTGTGCGTAGTCTTTTTTTTTAGACAACCTCAAATTCATTCTAGCTAAAGCTTTTCATGTT TTAACTGTAATATCCACTA CTGTTGTGAACAAGGATTCCTTCACACTTACATATCAAACAGAATGTTTTTTTTCTTTTTATTTTCATAGTTTCTAATCTTACGTATTTAACACGTACCTAAA TATACTTTTACATTTTAAAAAA                                                                                    ]
[-] EMBL AI395128             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAGCCATGAATT TTCAGATTGGCAG AGCAAAACCGTAAAATTGTTCGGGCTCAGCCATCATCATCTGGCAATAAAACTAGTACATACTCTTGTAACACAGCGAATATTGTGCGTAGTCTTTTTTTTTAGACAACCTCAAATTCATTCTAGCTAAAGCTTTTCATGTT TTAACTGTAATATCCACTA CTGTTGTGAACAAGGATTCCTTCACACTTACATATCAAACAGAATGTTTTTTTTCTTTTTATTTTCATAGTTTCTAATCTTACGTATTTAACACGTACCTAAA TATACTTTTACATTTTAATTCTGTTCATCTATAATTATGGTAATGATATATGAAACTTGCACGCTTACTACACCTTCAAAATCAATAATAGTTTGACTAAGTATAA]


>consensus_10050#0 CGACAAAGTCCATCTTTAACAGCTAATCGTATCATACAGGGGTTTCCGTCTACTTTGCCG TCGAATAGCACTGAAGATGAACTACTGCCCTTATTTCCATTTGATGTGGAAAATCTAGAC TTTGCTGATATATTAACAAATTTAGACCATATGCCAACCAGGACAGGTGATACGCTTTTG GTTTTTTATGTTGCTGCTGGTCAGTCAAAAGTTGGTGATATTCTTGCGAATATGAAAATT TGGCCAAGGCTGCCTGAAGCATTTCATCAGTTCTTAAGTGGTATCGGCTGTATCAAAAAT ATTTCTGATCATCCAGGTTGGACAGGGAACTTCAAACCAGTTATCGTACATCAAATGGAC CCTTGTAACGAGTCACTGTAATCAGACGAAAAATATACATGCTGACCACTGTCCAGATGG TATTCAATCAATTATATATTATGCTGATGCAATAACAGAATTAGCATGCATTTGTCCCAC TAATCAATTTTATGGAAACGAAGAGAATCCTGATCAAAATTGTATATTAAAGAGTACACG TTATCGCACTGCTAGCGAAATCATAACTAACATCACTCGTGGGACAAGTCAACGTGTAGT AGGTATGGGGGAAGTTGGGGCGGACCCGACTGGAGGTCGAGTGGCAGTTGTATGGCTCGA ACGATGGGAAGATGGACCTATGCACTGTGAATCAGGAGTTGGAATGAACATCCAGAATAT GACTAGCAAGAATTTTGATTGCCCTGTCACAATTTATATTCATCCTTTAAGTTCCGGATT ATGTAGAGTTGGCATCATGCGTCTTCAAGGAAGAACATTTGAAGCTGGTCCATTACAGAA TGGATCTGTATTAAGTCAGCGTTGTCTTAGTAGTTTTGTAAGACAAACTGTTATAAACTT ATCACGACGACGTCGTTTGGCTTCCGACTCATTTCAACCTCCTCATGTTCGACGAAGCCA TGAATTATTCAGATTGGCAGAAGCAAACCGTAAAATTGTTCGGGCTCAGCCATCATCATC TGGCAATAAAACTAGTACATACTCTTGTAACACAGCGAATATTGTGCGTAGTCTTTTTTT TTAGACAACCTCAAATTCATTCTAGCTAAAGCTTTTCATGTTTTAACTGTAATATCCACT ACTGTTGTGAACAAGGATTCCTTCACACTTACATATCAAACAGAATGTTTTTTTTCTTTT TATTTTCATAGTTTCTAATCTTACGTATTTAACACGTACCTAAATATACTTTTACATTTT AAAAAAGTTCATCTATAATTATGGTAATGATATATGAAACTTGCACGCTTACTACACCTT CAAAATCAATAATAGTTTGACTAAGTATAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)