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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10056#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 13 consensus length = 771 fasta sequence
[AGAGTATTTATCGGGTCATTTTGGGACCGACCACTGCGATATGACGCTAACCGTCACTTATTTGAG-TTGGAGTCACAGGACTTGTTTAAAGACCTCCGAAGTTTGCCTTCAAACGCGGCCATGCGCAAACTAAATGATATGATACGACGCGCAAGGCTAGCTAAAGTACATGCCTACCTAATTGGTCATCTTAAGAAAGAGATGCCTTCAATCGTTGG--AAAAAACAAAAAGAAGCAAGAACTTATTAACAATTTACAGCAGATATATGATACTATCTCACGTTTACACCATATATCTCCTGGCGACTTCCCTAAACTCTCTCATATGCAGAGTATTTTGAGTGAACAGGATTTTACCACCTTCCCCTCTCTTAAAGAAAGGCTTATTGAACAAGTTGACGTAATGTTAACCCAGGAGATCCCTAAATTAATGCAGATGATACCAATTGAACAATCAGCGGCTGTTCAACAGGGTACAAGTTTCATTAAGGGAGGAGCTTTCAACGATAGTGTAATTGATAGCCCATTTACGGCCGATGCTGATATGGCTATTAATCGTGGACGATATAGTGATAAGTCGACTTTAGAGGACGATAAAGATGAGCTCATAAAAGAATTTGAAAGTCTTCAACCAATTGATGGTCTTCTTTATGGAAGCGGACGATTAAAAGCGAAATTGATGGAATCTCATTTACCTAATATCACACTAAGTCGTATATGGAAACTTTCAGACATTGATAAAGATGGTTGTCTTGATATCGATGAATTCATT]
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[-] EMBL CD095154 [ TTTACACCATATATCTCCTGGCGACTTCCCTAAACTCTCTCATATGCAGAGTATTTTGAGTGAACAGGATTTTACCACCTTCCCCTCTCTTAAAGAAAGGCTTATTGAACAAGTTGACGTAATGTTAACCCAGGAGATCCCTAAATTAATGCAGATGATACCAATTGAACAATCAGCGGCTGTTCAACAGGGTACAAGTTTCATTAAGGGAGGAGCTTTCAACGATAGTGTAATTGATAGCCCATTTACGGCCGATGCTGATATGGCTATTAATCGTGGACGATATAGTGATAAGTCGACTTTAGAGGACGATAAAGATGAGCTCATAAAAGAATTTGAAAGTCTTCAACCAATTGATGGTCTTCTTTATGGAAGCGGACGATTAAAAGCGAAATTGATGGAATCTCATTTACCTAATATCACACTAAGTCGTATATGGAAACTTTCAGACATTGATAAAGTTGGTTGTCTTGATATCGATGAATTCATT]
[-] EMBL CD095218 [ CCTGGCGACTTCCCTAAACTCTCTCATATGCAGAGTATTTTGAGTGAACAGGATTTTACCACCTTCCCCTCTCTTAAAGAAAGGCTTATTGAACAAGTTGACGTAATGTTAACCCAGGAGATCCCTAAATTAATGCAGATGATACCAATTGAACAATCAGCGGCTGTTCAACAGGGTACAAGTTTCATTAAGGGAGGAGCTTTCAACGATAGTGTAATTGATAGCCCATTTACGGCCGATGCTGATATGGCTATTAATCGTGGACGATATAGTGATAAGTCGACTTTAGAGGACGATAAAGATGAGCTCATAAAAGAATTTGAAAGTCTTCAACCAATTGATGGTCTTCTTTATGGAAGCGGACGATTAAAAGCGAAATTGATGGAATCTCATTTACCTAATATCACACTAAGTCGTATATGGAAACTTTCAGACATTGATAAAGATGGTTGTCTTGATATCGATGAATTCATT]
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[+] EMBL CD130951 [ GACGTAATGTTAACCCAGGAGATCCCTAAATTAATGCAGATGATACCAATTGAACAATCAGCGGCTGTTCAACAGGGTACAAGTTTCATTAAGGGAGGAGCTTTCAACGATAGTGTAATTGATAGCCCATTTACGGCCGATGCTGATATGGCTATTAATCGTGGACGATATAGTGATAAGTCGACTTTAGAGGACGATAAAGATGAGCTCATAAAAGAATTTGAAAGTCTTCAACCAATTGATGGTCTTCTTTATGGAAGCGGACGATTAAAAGCGAAATTGATGGAATCTCATTTACCTAATATCACACTAAGTCGTATATGGAAACTTTCAGACATTGATAAAGATGGTTGTCTTGATATCGATGAATT ]
[+] EMBL BG932509 [ GAGGAGCTTTCAACGATAGTGTAATTGATAGCCCATTTACGGCCGATGCTGATATGGCTATTAATCGTGGACGATATAGTGATAAGTCGACTTTAGAGGACGATAAAGATGAGCTCATAAAAGAATTTGAAAGTCTTCAACCAATTGATGGTCTTCTTTATGGAAGCGGACGATTAAAAGCGAAATTGATGGAATCTCATTTACCTAATATCACACTAAGTCGTATATGGAAACTTTCAGACATTGATAAAGATGGTTGTCT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||