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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10097#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 13 consensus length = 1281 fasta sequence
[CATTGAAAATTCCACGTTTCATTTTAAAAAGTATTCATTCTATATCATCAGATGGTGAAATAATTCCTAATAGTCATTGGCATGAAGATGTTGAAAATCATGTTGTTTATTTTATGCAATGTTGTCGTGAAGATAAAACTTTACTGTTACGTGTACCACCATCAAAAGATGGTTTTTATTTAGCTAGTAGTTCTGGTCTATGTTCTAGTGTACCAGGGACTGTATTGGATAGAGAGAAAATTACTACCTATCTTACATCACCATTACATAGTAATAGTAATGCTATGAATAATAATCGTAAATCAACTGTATTAAGTGAAAAAGATATGTTATTATATCGTGAAACACTTGCTCAACGTGAAGGTCTTCTCTATTTATGCTATTATCATCCAGCTAAAGGAATTGATTATACTACATCAATACTTGGTACACGTTATTCTATAAGTCAAAATATTTCAGAAAAAGATATTGATGAAATAGCTAGACTATGTGGTTGTGCACCGAATGCATTTTGTTTATTAAATAAACAAGCTGAATGTATTTGTAAACCAGGTTATTACGGTGATGGACGTTACGTATGTGCACCAATTACCCCGCTAACAGATGAATGTGCTGACTTATGTGACCCATC-AGCTGTATGCGCTG-AACATTTGGGTGTTAGTTTAAAGAAAAAGCGGTTACTCAGTCATATGTGTATTTGTCGTCCAGGATTTGTTGGTGATGGTTTTTCATGTAAATCAGATTGTGTTGCACGAGAATGTCAACCATTCAGTAGATGTATACATAATATCCCAAGAGGTATCACTGAATGTGTTTGTATTGAAGGAACAATACTATCTGGTACACGTTGTCACTTGGATGTATATAAAACA-TTGGAACAAGAAAAAGACTTACCTCAATTCATTATAGATCATGATCATTGTCTTTCATCAGAAACACAATTAGCTTTAAGAACATTGAATCCACCAAAATACTTTTATATATTTGTCCCATCCAGTATAATTACAAGTTGCACAGATGTTAAAGAGCATATAGTTGTACGATCGAAACCTTTAACTATGAATGAACTTAAATATGCTACAGTTCAGTCACCTATTAAATTAATCACTGAAAATAATACTGTGATTGAAGTTTATCCCATGAATGGTACACTTATGATTGATGGTCACCTAGCTCAATTTGAAACTGTGAAATTTGTCAAT-GGCGAA-TTATA-CTATTTATCTAATCCATTAAAACG-TACAGTGTATATTTACAAACTGAACAGTTACGTTTTTATANTTG]
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[+] EMBL CD167519 [ gaTGTGTCGC CGAGAATGTCAACCATTCAGTAGATGTATACATAATATCCCAAGAGGTATCACTGAATGTG TTGTATTGAAGGAACAATACTATCTGGTACACG TGTCACTTGGATGTATATAAAACA TTGGA ]
[+] EMBL CD195664 [ TGTTGCACGAGAATGTCAACCATTCAGTAGATGTATACATAATATCCCAAGAGGTATCACTGAATGTGTTTGTATTGAAGGAACAATACTATCTGGTACACGTTGTCACTTGGATGTATATAAAACA TTGGAACAAGAAAAAGATTTACCTCAATTCATTATAGATCATGATCATTGTCTTTCATTAGAAACACAATTAGCTTTAAGAACATTGAATCCACCAAAATACTTTTATATATTTGTCCCATCCAGTATAATTACAAGTTGCACAGATGTCAAAGAGCATATAGTTGTACGGTC AAAACTTTACCTATGA ]
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[+] EMBL AI764831 [ AGATCATGATCATTGTCTTTCATCAGAAACACAATTAGCTTTAAGAACATTGAATCCACCAAAATACTTTTATATATTTGTCCCATCCAGTATAATTACAAGTTGCACAGATGTTAAAGAGCATATAGTTGTACGATCGAAACCTTTAACTATGAATGAACTTAAATATGCTACAGTTCAGTCACCTATTAAATTAATCACTGAAAATAATACTGTGATTGAAGTTTATCCCATGAATGGTACACTTATGATTGATGGTCACCTAGCTCAATTTG AACTGTGAAATTTGTCAAT GGCGAA TTATA CTATTTATCTAATCCATTAAAACG TACAGTGTATATTTACAAACTGAACAGTTACGTTTTTA ]
[+] EMBL AI764794 [ AGATCATGATCATTGTCTTTCATCAGAAACACAATTAGCTTTAAGAACATTGAATCCACCAAAATACTTTTATATATTTGTCCCATCCAGTATAATTACAAGTTGCACAGATGTTAAAGAGCATATAGTTGTACGATCGAAACCTTTAACTATGAATGAACTTAAATATGCTACAGTTCAGTCACCTATTAAATTAATCACTGAAAATAATACTGTGATTGAAGTTTATCCCATGAATGGTACACTTATGATTGATGGTCACCTAGCTCAATTTGAAACTGTGAAATTTGTCAATGGGCGAATTTTTACCTATTTATCTAATCCATTAAAACGTTACAGTNTATATTT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||